不同毒株猪细小病毒VP2基因的克隆与序列分析

应用PCR扩增了猪细小病毒NJ-1株、NJ-2株、7909株和Vaccine株的VP2基因，分别克隆于pGEM-T Easy载体中，测定其核苷酸序列，并推导出相应的氨基酸序列，对其核苷酸和氨基酸序列进行分析和同源性比较。所测4个序列中，NJ-1株、NJ-2株和7909株序列均为1437bp，共编码479个氨基酸；而Vaccine序列为657bp，比其他毒株缺失780bp，共编码219个氨基酸。将所得4个序列与GenBank中NADL-2株、Kresse株、China株及VR-1株相应的核苷酸及氨基酸进行同源性比较。发现其核苷酸和氨基酸的同源性分别在97．7％～99．9％和97．2％～99．2％之间，具有高度同源性；通过绘制系统进化树可知，分离自国内的China株、NJ-1株、NJ-2株、7909株及Vaccine株亲缘性最为相近。与其他毒株的亲缘关系较远。