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微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用
被引量:
9
1
作者
何小燕
白俊杰
+4 位作者
刘小林
樊佳佳
何小平
李胜杰
叶星
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2009年第8期55-62,共8页
【目的】探讨微卫星DNA标记在大口黑鲈(Micropterus salmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据。【方法】选择12个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家...
【目的】探讨微卫星DNA标记在大口黑鲈(Micropterus salmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据。【方法】选择12个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。【结果】所选的12个微卫星DNA多态位点在102个子代中的平均等位基因数(A)为3,平均观测杂合度(Ho)为0.594 8,平均期望杂合度(He)为0.545 7,平均多态信息含量(PIC)为0.475 9。Cervus3.0亲权分析表明,在置信度为95%时,使用12个和10个位点,模拟和实际分析的判别成功率分别为96%和98%,87%和91%;而置信度为99%时,分别为78%和92%,64%和86%;在置信度为99%和95%时,判别准确率皆在90%以上。从12个位点中挑选10个多态信息含量高的微卫星DNA位点,即可将102个子代完全准确地聚为5个群体。亲权分析结果与聚类分析结果一致。【结论】所选用的12个微卫星位点可用于大口黑鲈亲权鉴定研究,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。
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关键词
微卫星
大口黑鲈(Micropterussalmodies)
亲权分析
聚类分析
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职称材料
题名
微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用
被引量:
9
1
作者
何小燕
白俊杰
刘小林
樊佳佳
何小平
李胜杰
叶星
机构
西北农林科技大学动物科技学院
中国水产科学研究院珠江水产研究所
大连水产学院生命科学与技术学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2009年第8期55-62,共8页
基金
国家科技支撑项目(2006BAD01A1209)
国家科技基础条件平台工作项目(2005DKA21103)
广东省科技计划项目(2007B020708008)
文摘
【目的】探讨微卫星DNA标记在大口黑鲈(Micropterus salmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据。【方法】选择12个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。【结果】所选的12个微卫星DNA多态位点在102个子代中的平均等位基因数(A)为3,平均观测杂合度(Ho)为0.594 8,平均期望杂合度(He)为0.545 7,平均多态信息含量(PIC)为0.475 9。Cervus3.0亲权分析表明,在置信度为95%时,使用12个和10个位点,模拟和实际分析的判别成功率分别为96%和98%,87%和91%;而置信度为99%时,分别为78%和92%,64%和86%;在置信度为99%和95%时,判别准确率皆在90%以上。从12个位点中挑选10个多态信息含量高的微卫星DNA位点,即可将102个子代完全准确地聚为5个群体。亲权分析结果与聚类分析结果一致。【结论】所选用的12个微卫星位点可用于大口黑鲈亲权鉴定研究,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。
关键词
微卫星
大口黑鲈(Micropterussalmodies)
亲权分析
聚类分析
Keywords
microsatellite
largemouth bass(Micropterus salmodies)
parentage analysis
cluster analysis
分类号
S965.211.6 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用
何小燕
白俊杰
刘小林
樊佳佳
何小平
李胜杰
叶星
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2009
9
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职称材料
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