以罗氏沼虾转录组数据为数据来源,通过研究罗氏沼虾转录组的密码子使用参数(如有效密码子的数量和相关密码子碱基的具体组成信息等),并且采用Codon W 1.4.4深入开展了统计和计算.研究结果显示,同义密码子第三位核苷酸和表达基因密码子G...以罗氏沼虾转录组数据为数据来源,通过研究罗氏沼虾转录组的密码子使用参数(如有效密码子的数量和相关密码子碱基的具体组成信息等),并且采用Codon W 1.4.4深入开展了统计和计算.研究结果显示,同义密码子第三位核苷酸和表达基因密码子GC含量均值分别为0.40和0.45.从整体上看,ENC的平均值等于52.72,其中绝大部分的ENC值小于35.采用高频密码子的研究方法获得GAU、GAA、UUU、AAU、CCA等5个高频密码子.通过最优码子分析法确定16个最优密码子,编码10个氨基酸,最优密码子除UUG外均以A/T结尾.而且把它和大肠杆菌、酵母、果蝇以及人类等6种生物的密码子使用频率开展比较,结果表明,与大肠杆菌和果蝇存在较大差异,而与酵母最为接近.研究结果可为罗氏沼虾功能基因和分子育种等提供理论基础.展开更多
一、引言短沟对虾(Penaeus semisulcatus De Haan),由于它体形与斑节对虾较相似,故在雷州半岛西部沿海的渔农群众常误称为斑节对虾。本种分布于我国南海、北部湾,资源较丰富,尤以雷州半岛西部的产量最多,主要栖息水深为20—50米、底质...一、引言短沟对虾(Penaeus semisulcatus De Haan),由于它体形与斑节对虾较相似,故在雷州半岛西部沿海的渔农群众常误称为斑节对虾。本种分布于我国南海、北部湾,资源较丰富,尤以雷州半岛西部的产量最多,主要栖息水深为20—50米、底质为泥沙或沙泥的海区。性情温和、感觉迟钝,群体分散。产卵期为3—6月。它是对虾属中个体较大者,体长一般为150—210毫米、体重为60—130克,在虾池中收捕的最大个体体长240毫米、体重达300克(而墨吉对虾和长毛对虾的体长一般为130—180毫米、体重为40—80克)。目前市场上的销价高于墨吉对虾和长毛对虾。具有个体大、食性杂。展开更多
文摘以罗氏沼虾转录组数据为数据来源,通过研究罗氏沼虾转录组的密码子使用参数(如有效密码子的数量和相关密码子碱基的具体组成信息等),并且采用Codon W 1.4.4深入开展了统计和计算.研究结果显示,同义密码子第三位核苷酸和表达基因密码子GC含量均值分别为0.40和0.45.从整体上看,ENC的平均值等于52.72,其中绝大部分的ENC值小于35.采用高频密码子的研究方法获得GAU、GAA、UUU、AAU、CCA等5个高频密码子.通过最优码子分析法确定16个最优密码子,编码10个氨基酸,最优密码子除UUG外均以A/T结尾.而且把它和大肠杆菌、酵母、果蝇以及人类等6种生物的密码子使用频率开展比较,结果表明,与大肠杆菌和果蝇存在较大差异,而与酵母最为接近.研究结果可为罗氏沼虾功能基因和分子育种等提供理论基础.
文摘一、引言短沟对虾(Penaeus semisulcatus De Haan),由于它体形与斑节对虾较相似,故在雷州半岛西部沿海的渔农群众常误称为斑节对虾。本种分布于我国南海、北部湾,资源较丰富,尤以雷州半岛西部的产量最多,主要栖息水深为20—50米、底质为泥沙或沙泥的海区。性情温和、感觉迟钝,群体分散。产卵期为3—6月。它是对虾属中个体较大者,体长一般为150—210毫米、体重为60—130克,在虾池中收捕的最大个体体长240毫米、体重达300克(而墨吉对虾和长毛对虾的体长一般为130—180毫米、体重为40—80克)。目前市场上的销价高于墨吉对虾和长毛对虾。具有个体大、食性杂。