目的通过生物信息学方法与实验验证挖掘结肠癌发生发展中的关键基因,预测可用于诊断结肠癌(colorectal cancer,CRC)的生物标志物。方法从TCGA数据库中获取结肠癌转录组数据,用edgR,Deseq2和limma3个R包分析癌组织与癌旁组织的差异性,将...目的通过生物信息学方法与实验验证挖掘结肠癌发生发展中的关键基因,预测可用于诊断结肠癌(colorectal cancer,CRC)的生物标志物。方法从TCGA数据库中获取结肠癌转录组数据,用edgR,Deseq2和limma3个R包分析癌组织与癌旁组织的差异性,将得到的差异基因进行Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析。通过STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络后,置于Cytoscape软件中进行可视化及核心基因筛选。利用R包对核心基因进行Kaplan-Meier单因素生存分析,通过qRT-PCR对13对结肠癌及配对癌旁组织中各核心基因的表达进行检测。结果研究共获得1645个差异基因,其中712个上调,933个下调。上调基因主要富集在类风湿性关节炎、IL-17信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Wnt信号通路、Hippo信号通路。下调基因主要富集在矿物质吸收、神经活性配体-受体相互作用、CAMP信号通路、胆汁分泌、碳酸氢盐在肾单位近曲小管重吸收等通路。研究共获得10个核心基因:CXCL8、CXCL1、CXCL12、CXCL5、CSF2、CXCL2、CXCL3、CXCL11、CCL19和CCL13。生存分析显示CXCL8、CXCL5、CSF2、CCL13、CCL19、CXCL12与结肠癌预后相关,qRT-PCR检测结果证实CXCL8、CXCL5和CSF2结肠癌及癌旁组织中的表达有明显差异。结论结肠癌发生发展过程中CXCL8、CXCL5和CSF2基因存在表达变化,可能在结肠癌的发生发展中起关键作用。展开更多
目的研究血清中25(OH)D水平对隐匿型原发性卵巢功能不全(occult primary ovarian insufficiency,oPOI)患者妊娠结局的影响。方法回顾性分析2018年9月至2022年12月在广东省妇幼保健院生殖中心行辅助生殖治疗的218例患者的临床资料。将符...目的研究血清中25(OH)D水平对隐匿型原发性卵巢功能不全(occult primary ovarian insufficiency,oPOI)患者妊娠结局的影响。方法回顾性分析2018年9月至2022年12月在广东省妇幼保健院生殖中心行辅助生殖治疗的218例患者的临床资料。将符合纳入标准的对照组和oPOI组患者按孕产妇的年龄节点分为≤35岁和>35岁,比较各组的25(OH)D浓度及妊娠结局的差异,随后对oPOI患者进行维生素D补充,追踪助孕结局。结果在≤35岁患者中,oPOI组的25(OH)D水平及妊娠率显著低于对照组(41.62±11.90 vs 63.04±16.26,42.37±4.62 vs 53.33±1.97,P<0.05),在>35岁患者中,25(OH)D水平及妊娠率均无显著性差异。在≤35岁oPOI患者中,25(OH)D干预组的血清25(OH)D浓度和优质胚胎率显著高于25(OH)D未干预组,差异具有统计学意义(42.13±12.91 vs 78.26±23.91,55.74±25.16 vs 80.39±29.05,P<0.05),但两组间的获卵数、受精率、临床妊娠率和着床率均没有显著差异;在>35岁的oPOI患者中,25(OH)D干预组与未干预组的血清25(OH)D浓度、获卵数、受精率、优质胚胎率、临床妊娠率和着床率均未见显著差异。结论≤35岁的女性不孕患者中,oPOI患者的维生素D水平低于其他因素不孕的患者,给予维生素D补充后可改善oPOI患者25(OH)D水平及优质胚胎率,但未改变oPOI患者的妊娠结局。展开更多
目的通过分析影像学和实验室检查与慢性乙肝患者肝硬化临床分期的关系,探讨影像学和实验室检查对慢性乙肝患者肝硬化临床分期的价值。方法回顾性收集2018年10月至2021年9月就诊的慢性乙肝患者240例,分别按照两期分期法和Child-Pugh评分...目的通过分析影像学和实验室检查与慢性乙肝患者肝硬化临床分期的关系,探讨影像学和实验室检查对慢性乙肝患者肝硬化临床分期的价值。方法回顾性收集2018年10月至2021年9月就诊的慢性乙肝患者240例,分别按照两期分期法和Child-Pugh评分进行分组,比较在不同的分期方法下,瞬时弹性成像测量的肝硬度值(liver stiffness measurement,LSM)、磁共振磁敏感加权成像的肝肌信号强度比(liver to muscle ratio,LMR)、纤维化-4指数(fibrosis 4 score,FIB-4)、天冬氨酸转氨酶和血小板比率指数(aspartate aminotransferase to platelet ratio index,APRI)的组间差异,分析LSM、LMR、FIB-4、APRI与不同分期方法的相关性,并绘制LSM、LMR、FIB-4、APRI判断临床肝硬化与Child-Pugh评分B级、C级的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)。结果使用两期分期法进行分组和Child-Pugh评分进行分组时,3组间的LSM、LMR、FIB-4、APRI均存在显著差异(P<0.05)。LSM、FIB-4、APRI与不同的分期方法均具有显著的正相关性,LMR与不同的分期方法均具有显著的负相关性(P<0.05)。使用两期法进行分组时,LSM、LMR、FIB-4、APRI判断临床肝硬化的受试者工作特征曲线下面积(area under the ROC,AUROC)分别为0.805、0.587、0.789、0.704,差异均有统计学意义(P<0.05)。使用Child-Pugh评分进行分组时,LSM、LMR、FIB-4、APRI判断Child-Pugh评分B级、C级的AUROC分别为0.924、0.691、0.921、0.940,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论影像学和实验室检查(LSM、LMR、FIB-4、APRI)与肝硬化临床分期密切相关,在诊断肝硬化临床分期中具有一定的价值,可以作为辅助检查帮助临床工作者更好地识别和诊断肝硬化的临床分期。展开更多
文摘目的通过生物信息学方法与实验验证挖掘结肠癌发生发展中的关键基因,预测可用于诊断结肠癌(colorectal cancer,CRC)的生物标志物。方法从TCGA数据库中获取结肠癌转录组数据,用edgR,Deseq2和limma3个R包分析癌组织与癌旁组织的差异性,将得到的差异基因进行Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析。通过STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络后,置于Cytoscape软件中进行可视化及核心基因筛选。利用R包对核心基因进行Kaplan-Meier单因素生存分析,通过qRT-PCR对13对结肠癌及配对癌旁组织中各核心基因的表达进行检测。结果研究共获得1645个差异基因,其中712个上调,933个下调。上调基因主要富集在类风湿性关节炎、IL-17信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Wnt信号通路、Hippo信号通路。下调基因主要富集在矿物质吸收、神经活性配体-受体相互作用、CAMP信号通路、胆汁分泌、碳酸氢盐在肾单位近曲小管重吸收等通路。研究共获得10个核心基因:CXCL8、CXCL1、CXCL12、CXCL5、CSF2、CXCL2、CXCL3、CXCL11、CCL19和CCL13。生存分析显示CXCL8、CXCL5、CSF2、CCL13、CCL19、CXCL12与结肠癌预后相关,qRT-PCR检测结果证实CXCL8、CXCL5和CSF2结肠癌及癌旁组织中的表达有明显差异。结论结肠癌发生发展过程中CXCL8、CXCL5和CSF2基因存在表达变化,可能在结肠癌的发生发展中起关键作用。
文摘目的研究血清中25(OH)D水平对隐匿型原发性卵巢功能不全(occult primary ovarian insufficiency,oPOI)患者妊娠结局的影响。方法回顾性分析2018年9月至2022年12月在广东省妇幼保健院生殖中心行辅助生殖治疗的218例患者的临床资料。将符合纳入标准的对照组和oPOI组患者按孕产妇的年龄节点分为≤35岁和>35岁,比较各组的25(OH)D浓度及妊娠结局的差异,随后对oPOI患者进行维生素D补充,追踪助孕结局。结果在≤35岁患者中,oPOI组的25(OH)D水平及妊娠率显著低于对照组(41.62±11.90 vs 63.04±16.26,42.37±4.62 vs 53.33±1.97,P<0.05),在>35岁患者中,25(OH)D水平及妊娠率均无显著性差异。在≤35岁oPOI患者中,25(OH)D干预组的血清25(OH)D浓度和优质胚胎率显著高于25(OH)D未干预组,差异具有统计学意义(42.13±12.91 vs 78.26±23.91,55.74±25.16 vs 80.39±29.05,P<0.05),但两组间的获卵数、受精率、临床妊娠率和着床率均没有显著差异;在>35岁的oPOI患者中,25(OH)D干预组与未干预组的血清25(OH)D浓度、获卵数、受精率、优质胚胎率、临床妊娠率和着床率均未见显著差异。结论≤35岁的女性不孕患者中,oPOI患者的维生素D水平低于其他因素不孕的患者,给予维生素D补充后可改善oPOI患者25(OH)D水平及优质胚胎率,但未改变oPOI患者的妊娠结局。
文摘目的通过分析影像学和实验室检查与慢性乙肝患者肝硬化临床分期的关系,探讨影像学和实验室检查对慢性乙肝患者肝硬化临床分期的价值。方法回顾性收集2018年10月至2021年9月就诊的慢性乙肝患者240例,分别按照两期分期法和Child-Pugh评分进行分组,比较在不同的分期方法下,瞬时弹性成像测量的肝硬度值(liver stiffness measurement,LSM)、磁共振磁敏感加权成像的肝肌信号强度比(liver to muscle ratio,LMR)、纤维化-4指数(fibrosis 4 score,FIB-4)、天冬氨酸转氨酶和血小板比率指数(aspartate aminotransferase to platelet ratio index,APRI)的组间差异,分析LSM、LMR、FIB-4、APRI与不同分期方法的相关性,并绘制LSM、LMR、FIB-4、APRI判断临床肝硬化与Child-Pugh评分B级、C级的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)。结果使用两期分期法进行分组和Child-Pugh评分进行分组时,3组间的LSM、LMR、FIB-4、APRI均存在显著差异(P<0.05)。LSM、FIB-4、APRI与不同的分期方法均具有显著的正相关性,LMR与不同的分期方法均具有显著的负相关性(P<0.05)。使用两期法进行分组时,LSM、LMR、FIB-4、APRI判断临床肝硬化的受试者工作特征曲线下面积(area under the ROC,AUROC)分别为0.805、0.587、0.789、0.704,差异均有统计学意义(P<0.05)。使用Child-Pugh评分进行分组时,LSM、LMR、FIB-4、APRI判断Child-Pugh评分B级、C级的AUROC分别为0.924、0.691、0.921、0.940,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论影像学和实验室检查(LSM、LMR、FIB-4、APRI)与肝硬化临床分期密切相关,在诊断肝硬化临床分期中具有一定的价值,可以作为辅助检查帮助临床工作者更好地识别和诊断肝硬化的临床分期。