土壤微生物总DNA的提取和纯化

本文建立了从土壤中提取总DNA的方法 ,并通过改进使适合于对革兰氏阳性菌的提取。用 9种性质不同的土壤进行验证 ,均提取到了DNA ,每克干土的DNA提取量从 3 30 μg～1 3 41 μg,通过透析袋回收进行纯化 ,纯化回收率达到 65 34% ,纯化后的土壤DNA可以直接扩增出 1 6SrDNA。 9种土壤的提取率从 60 5 1 %～ 93 45 % ,可以从每g干土添加

甲基对硫磷降解菌假单胞菌WBC-3的筛选及其降解性能的研究

从农药污染土样中分离出的一株细菌具有彻底降解甲基对硫磷的能力。该菌经生理生化特性分析和 1 6SrDNA序列同源性分析 ,鉴定为假单胞菌属 ,命名为Pseudomonassp .WBC 3。该菌在pH7～ 8、温度 2 3℃～ 3 0℃范围内均生长良好 ,对甲基对硫磷的耐受浓度在单纯无机盐培养基中可达到 80 0mg L ,在含有 0 1 %葡萄糖的培养基中可达到 2 0 0 0mg L。该菌能够以甲基对硫磷作为唯一碳源、氮源 ,将其彻底降解作为生长基质 ,对于 3 0 0mg L甲基对硫磷的降解速度达 1 5mg L·h ,于 2 2h后达到其稳定生长期。该菌对于多种有机磷农药及部分芳烃类化合物具有生化代谢能力。从该菌的细胞周质组分中纯化出的有机磷水解酶在SDS PAGE胶上显示为分子量约为 3 3 5× 1 0 3 的条带。

辣椒内生细菌BS-1和BS-2在植物体内的定殖及鉴定

以抗利福平为标记 ,用浸种、涂叶和灌根方法接种 ,测定菌株在植物体内的定殖。结果表明 ,来自辣椒体内的BS_2和BS_1菌株不仅可在辣椒体内定殖 ,也可在番茄、茄子、黄瓜、甜瓜、西瓜、丝瓜、小白菜等植物体内定殖 ,BS_2菌株还可在水稻、小麦及豇豆等植物体内定殖 ,BS_2菌株的内生定殖宿主范围比BS_1菌株的广 ;另外BS_2菌株可在辣椒和白菜体内较长期定殖。用常规方法、Biolog及 1 6SrRNA序列比较 ,两菌株鉴定为枯草芽杆菌内生亚种 (Bacillussubtilissubsp .endophyticus)。

枯草芽孢杆菌JA抗菌物特性的研究及抗菌肽的分离纯化

枯草芽孢杆菌JA分泌物中具有抑菌作用的粗提液通过DEAE SepharoseFF、SOURCE 1 5PHE、Sephacry1S 2 0 0HR和反相HPLC多步柱层析分离纯化后 ,获得 3种对水稻纹枯和小麦赤霉病菌均有抑菌作用的抗菌肽AFP1、AFP2和AFP3。MALDI TOF质谱法测得其分子量分别为 1 4 6 2 6 4 5D、1 4 76 390D和 1 4 90 5 30D。氨基酸组成分析结果表明 ,AFP1和AFP3由苏氨酸、异亮氨酸、酪氨酸、脯氨酸等多种氨基酸组成。目标产物热稳定性好、对蛋白酶有一定的耐受性 。

养殖大菱鲆溃疡症病原菌的分离鉴定及系统发育分析

2004年夏季山东海阳一带养殖大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)暴发溃疡病。症状主要表现为体表病灶部位出血、肌肉溃烂、眼球凸出等,解剖可见鳃丝贫血,肝脏充血,肾脏和胆囊肿大,肠壁充血并呈透明状,从出现发病症状起,大约一周后开始出现死亡。从病鱼体表溃疡部位及内脏分离出优势菌并命名为H1,经人工感染证实H1即为引起本次养殖大菱鲆体表溃疡症的病原菌。对病原菌进行鉴定揭示该菌革兰氏染色阴性,菌体呈短杆状,极生单鞭毛。综合该菌在形态、生理生化、API20NE与API20E自动鉴定结果、16S rDNA同源性等方面的特性,确认H1为哈维氏弧菌(Vibrio harveyi),该菌对呋喃妥因、菌必治等多种抗生素敏感。哈维氏弧菌是海水养殖鱼类的常见致病菌,但作为养殖大菱鲆的病原菌属首次报道。

白腐真菌吸附铅的研究

含重金属废水的传统处理方法有化学沉淀法、离子交换法、吸附法、电解法和膜分离法等，它们虽然也能达到一定的净化效果，但因过程繁琐并易造成二次污染而不够理想，尤其是金属离子浓度较低时，往往操作费用和原材料成本相对过高。近年来采用生物吸附法去除废水中的重金属...

一株多菌灵降解细菌的分离、鉴定及系统发育分析

从被多菌灵污染的湖南红壤土中分离到一株能以多菌灵为唯一碳源和能源生长的菌株 1_1 ,该菌在含酵母膏多菌灵 (5 0 0mg L)的无机盐培养基中与无酵母膏的多菌灵 (5 0 0mg L)无机盐培养基中 ,2 4d对多菌灵的降解率分别为 95 5 6 %和 1 9 1 6 %。根据表型特征、G +C含量及 1 6SrDNA序列分析将菌株 1_1鉴定为 β Proteobacteria中的Ral stoniasp .(罗尔斯通氏菌 )。

江苏部分地区食源性和人源沙门氏菌的多重耐药性研究

从江苏省部分地区收集了117个沙门氏菌分离株,其中食物源和人源菌株分别有81株和36株。16种抗生素敏感性试验表明,有111个分离株对2种或2种以上的抗生素有耐药性,人源沙门氏菌分离株的抗生素耐药率比食物源的高,单一抗生素以链霉素耐药率(92.3%,108/117)最高。对5种或5种以上抗生素耐药的分离株有59株(50.4%),其中对特定六种抗生素:氨苄青霉素、氯霉素、链霉素、磺胺、四环素和卡那霉素耐药(ACSSuTK,R型)的菌株有12株。设计18对耐药基因和I类整合子保守区的引物,对36株有不同来源和耐药特征的多重耐药菌株进行耐药基因和I类整合子的检测,PCR扩增结果与抗生素敏感性表型一致。有30株细菌携带有I类整合子,大小为0.3、0.6、1.0、1.2和1.6kb,其中1.6kb(aadA5-dfr17)大小的整合子在25株细菌中分布(24/36)。接合试验表明,氨苄青霉素、氯霉素、链霉素、甲氧苄氨嘧啶和四环素的耐药特性是由接合性质粒携带。结果显示,耐药基因多数由I类整合子和质粒携带,可以通过接合试验发生转移,可移动的DNA成分可能在耐药特性的转移和分布中起到重要作用。

新城疫病毒HN和F基因遗传变异相关性的研究

选取国内1999-2005年发生的NDV毒株，经CEF蚀斑纯化和SPF鸡胚增殖，对其融合蛋白（F）和血凝素．神经氨酸酶（HN）基因分别进行克隆测序，结合在GenBank中发表的具有F和HN基因的NDV序列，利用DNAStar软件，对其不同毒株的F或HN基因片段和全长、F和HN基因全长分别进行遗传变异的研究，利用统计学软件SPSS8．0进行同源性相关分析。结果表明：不同NDV毒株F或HN基因片段与其全长之间，核甘酸r≥0．973，氨基酸：0．911≤r≤0．968，遗传变异高度相关，但F与HN基因全长之间核甘酸的遗传变异呈现弱相关（r=0．312）。国内NDV野毒株之间HN核甘酸高度同源（同源率97％以上），而与LaSota同源率仅为79．2％-80．7％，且显示出明显的地域性。

大港孔店油田水驱油藏微生物群落的分子分析

通过多聚酶链式反应 温度梯度凝胶电泳(PCR TGGE)和构建16SrRNA基因克隆文库两种方法对比研究了大港油田孔二北断块注水井和采油井的微生物群落结构。16SrDNAV3区PCR扩增产物的TGGE图谱分析表明,这两个油井的微生物群落结构差异很大。注水井样品的TGGE图谱中有6条主要条带,而采油井样品中只有一个条带占绝对优势。同时,建立了两个样品的16SrRNA基因克隆文库,从中分别挑选了10 8和5 0个克隆进行限制性酶切片段长度多样性分析(ARDRA)。注水井样品有33个操作分类单元(OTU) ,其中6个OTU是优势类型;而采油井样品只有8个OTU ,有1个OTU在文库中占绝对优势。克隆文库和TGGE的研究结果一致,均表明注水井样品的微生物多样性比采油井丰富很多。每个OTU的代表克隆序列分析结果表明,注水井样品中的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲和放线菌纲,尤其是红细菌亚纲( 4 7% )。采油井样品的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲,尤其是假单胞菌属( 6 2 % )。

华东地区致初生仔猪腹泻大肠杆菌的O血清型和毒力因子

从江苏、江西、安徽等 7个省疑似黄、白痢直肠棉拭及病死猪的十二指肠和肠系膜淋巴结中分离鉴定出 339株病原性大肠杆菌。经O血清型鉴定 ,除 77株未能定型、4 1株自凝外 ,测定出 2 2 1个分离株的O血清型 ,这些分离株覆盖了 6 4个血清型 ,以O1 0 7、O1 0 1 、O2 0 、O93、O1 1 和O1 49为主 ,共 99株 ,占定型菌株的 4 4 80 %。这些血清型与已报道的常见血清型间存在一定差异。运用黏附素单抗对以上菌株进行F4、F5、F6、F1 8、F4 1 5种黏附素检测 ,共 97个分离株表达黏附素 (2 8 6 1 % ) ,而表达两种和 3种黏附素的菌株分别有 2 2株和 8株 ,它们分别占表达黏附素菌株的2 2 6 8%和 8 2 5 % ,其中单独表达F4、F6、F5 +F4 1黏附素菌株分别有 1 8、30、1 5株 ,分别占表达黏附素菌株的1 8 5 6 %、30 93%和 1 5 4 6 % ;同时运用多重PCR对其中 1 4 5个分离株进行毒素基因 (STa、STb、LT、SLT 2e)的检测 ,拥有STa和STb毒素基因的菌株分别占检测菌株的 5 1 72 %和 37 2 4 %。F6、F4、F5 +F4 1和STa。

原生质体紫外诱变选育灵芝新菌种的研究

对灵芝原生质体进行了紫外诱变处理 ,经过粗筛和精筛后 ,从中选出多糖含量和产量明显高于原始菌株的两株诱变株 430 2 0 #和 430 2 6#。经过 1 0代PDA斜面继代培养及其摇瓶试验和连续 3次 3t罐的中试试验 ,表明所得诱变株为比原始菌株更优秀的稳定高产、高多糖含量的灵芝生产菌株。本研究为选育适合发酵的灵芝生产菌种提供了一种快速。

T90-1木霉菌的筛选和对草莓灰霉病菌作用机制的研究

木霉菌 (Trichoderma)作为一种重要的生防因子 ,可以产生几丁质酶降解植物的多种病原真菌细胞壁。利用低能离子束注入木霉菌使其产生变异 ,再通过初筛选和复筛选两个过程 ,获得T90_1木霉菌株 ,并用草莓灰霉病菌(BotrytiscinereaPers.)来检验T90_1防治真菌病害的能力。发现该菌株通过侵染、缠绕等多种重寄生方式 ,并分泌降解病原真菌细胞壁的物质 ,使病原菌原生质外渗 ,改变细胞内有序的代谢状况 ,从而抑制或杀死病原菌。初步揭示该菌株抗真菌的相关机制。

枯草芽孢杆菌JA产生的脂肽类抗生素-iturin A的纯化及电喷雾质谱鉴定

枯草芽孢杆菌JA产生的抗生素对植物病原真菌具有广谱抗性,明确抗生素的种类是进一步研究的基础。用6mol/L盐酸沉淀JA菌株的去菌体培养基,再用甲醇抽提获得抗生素的粗提物。利用反相HPLC系统,将粗提物过DiamonsilC18柱,收集有抗小麦赤霉病等病原真菌活性的化合物1、2。运用电喷雾质谱法(ESI/MS)测得其分子量分别为1042.4D和1056.5D。再利用碰撞诱导解离(CID)技术获得化合物的典型结构特征离子碎片,结果表明分子量为1042.4D的化合物一级结构为Pro-Asn-Tyr-βAA-Asn-Tyr-Asn-Gln(βAA为14个碳原子的氨基脂肪酸),属于脂iturin A。化合物1、2为相差一个亚甲基(-CH2)的iturinA同系物。研究结果提供了一种从枯草芽孢杆菌发酵液中快速分离纯化和鉴定脂肽类抗生素iturin A的新方法。

烟碱降解细菌的分离、鉴定及其降解性能的初步研究

从福建三明地区的土壤中分离得到一株能够高效降解烟碱的菌株 ,编号为DN2。该菌经常规的形态、生理生化分析以及 16SrDNA序列同源性分析 ,鉴定为Ochrobactrumintermedium ,属于α_变形杆细菌纲。该菌在 30℃～4 0℃和pH 6 . 0～ 9. 0范围内具有较高的降解活性 ,其最适值分别为 30℃和 6 5 ,烟碱的耐受浓度在无机盐培养基中可达到 4 0 0 0mg L。该菌能够以烟碱为唯一碳源生长 ,对于 5 0 0mg L烟碱的降解速率为 15mg L·h ,36h烟碱降解率为97. 6 5 %。该菌在烟草工业和环境保护上可能具有应用前景。

一株新的胡萝卜软腐欧文氏菌的分离和鉴定

从大白菜软腐组织中分离出一株软腐病细菌BC1,经过形态观察、生理生化特性分析、致病性检测和 16SrDNA序列分析 ,该分离物被鉴定为胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜亚种 (Erwiniacarotovorasubsp .carotovora ,Ecc)的一个新菌株 ,编号为BC1。这是首次从 16SrDNA序列水平上对在我国分布的软腐欧文氏菌进行鉴定。EccBC1的 16SrDNA序列与其它软腐欧文氏菌株的 16SrDNA序列之间同源性达 98 7%～ 99 3% ,而且在系统发育树中独立于Ecc其它菌株。序列分析结果表明 ,EccBC1具有至少 2种不同的 16SrDNA序列 ,它们都在第 4 5 9位和 4 73位 (相对于大肠杆菌 16SrDNA序列 )发生碱基突变 ,同一基因中两个突变位点之间彼此互补 ,处于 16SrRNA螺旋H17颈部 ,而且这两处碱基变异只存在于BC1菌株中。通过与其它软腐欧文氏菌亚种和菌株 16SrDNA序列进行比对分析 ,还进一步鉴定出一些BC1菌株特异的 16SrDNA碱基突变位点。本文报道的EccBC1两个 16SrDNA序列在GenBank中的登录号分别为AY30 90 6 8和AY30 90 6 9。

一株拮抗番茄叶霉病菌的放线菌筛选、鉴定及发酵条件研究

菌株xjy是一株从新疆棉田土壤中筛选出的对番茄叶霉病菌(Fulviafulva)有较强拮抗作用的放线菌,其对23种常见植物病原真菌和6种细菌有较好的抑制效果,抗菌谱广。其形态特征、培养特性、生理生化特性、细胞壁组分与放线菌中的淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)相同,16SrDNA序列同源性达99.6%。研究发现该菌的摇瓶发酵配方和培养条件为:大豆粉2%、葡萄糖2%、NaCl0.8%、CaCO30.2%、(NH4)2SO40.32%,起始pH7.0、28℃、180r/mim、摇瓶培养6d,这些结果为该菌株今后的应用、抗生素的分离提纯和产业化提供了实验依据。

三重PCR检测鱼类致病性嗜水气单胞菌

【目的】建立一种能够快速准确地检测致病性嗜水气单胞菌的PCR方法。【方法】根据嗜水气单胞菌的16S rRNA、气溶素基因(aer)和丝氨酸蛋白酶基因(ahp)的保守序列设计了3对引物,然后进行了PCR反应条件的优化、特异性和敏感性的检测并与普通的细菌分离鉴定进行了临床样本和人工攻毒样本检出率的比较。【结果】该方法特异性好,只对致病性嗜水气单胞菌呈阳性扩增;敏感性高,最低可检测100fg的细菌DNA模版。对临床疑似黄鳝(Monopterus albus)样本的检出率为81.8%,高于细菌分离的40.9%;对人工攻毒鲫鱼(Carassius auratus)样本的检出率为87.5%,高于细菌分离的67.5%。【结论】本方法的成功建立,实现在同一反应管中同时对16SrRNA、aer和ahp的检测,避免了只针对aer或ahp单个毒力基因的PCR检测方法可能存在的漏检和误检,为致病性嗜水气单胞菌的诊断、大规模检疫、流行病学调查等提供了一种快速、准确而有效的检测方法。

猪源大肠杆菌(ETEC、STEC、AEEC)毒力基因及其与O抗原型的关系

【目的】揭示从我国部分地区仔猪腹泻或水肿病病猪体内分离到的300个大肠杆菌分离株所属病原型(pathotype)、毒力基因及其与O血清型的关系。【方法】O血清型采用常规的凝集试验进行测定,毒力基因采用PCR方法检测。【结果】通过对这300个分离株的O血清型及其毒素、紧密素和黏附素基因进行鉴定,结果显示除50株未定型、17株自凝外,测定出233个分离株的血清型,这些分离株覆盖了45个血清型,其中以O149、O107、O139、O93和O91为主,共133株,占定型菌株的57.1%;拥有estⅠ、estⅡ、elt、stx2e和eaeA基因的菌株分别为102(34.0%)、190(63.3%)、81(27.0%)、57(19.0%)和54(18.0%)株;分离株中有51株K88基因阳性(其中菌毛表达率为100%),75株F18基因阳性(其中菌毛表达率为50.7%),在K88菌株中,O149血清型与estⅠ或estⅡ+elt密切相关,在F18菌株中,O107血清型与estⅠ或estⅡ、O139血清型与stx2e紧密相关。依其毒力特征可将这些分离株分为以下6种类型:ETEC、STEC、AEEC、ETEC/STEC、AEEC/ETEC和AEEC/ETEC/STEC,分别拥有190、24、36、32、17和1个菌株,占分离株的63.3%、8.0%、12.0%、10.7%、5.7%和0.3%。通过分析这些分离株的O血清型、毒素类型和黏附素型之间的相关性:猪源ETEC以O149、O107、O93和O98等血清型为主,O149:K88菌株主要与estⅡ或estⅡ+elt肠毒素相关,O107:F18菌株主要与estⅡ相关,O93和O98血清型菌株主要与estⅡ肠毒素相关;STEC菌株以O139:F18血清型为主,拥有stx2e;AEEC菌株拥有紧密素,无明显优势血清型;ETEC/STEC菌株以O107:F18和O116:F18血清型为主,主要与estⅠ+stx2e或estⅡ+stx2e密切相关,ETEC/AEEC菌株以O91和O107血清型为主,全部拥有肠毒素estⅠ和紧密素基因。【结论】我国至少存在6种病原型的猪肠道致病性大肠杆菌,其中ETEC为我国部分地区猪大肠杆菌病的主要病原,同时其病原型日益复杂。

防治马铃薯环腐病有益内生细菌的分离和筛选

1 998～ 2 0 0 0年 ,从大同、太原和内蒙古自治区等地采集健康块茎中分离到 1 3 3株内生细菌 ,通过离体抑菌作用测定、田间和温室实验 ,初步筛选出 5个具有促生或潜在防治马铃薯环腐病的内生细菌 ,其中 1 1 8菌株定殖、促生和拮抗三种作用兼备 。