上饶早梨‘六月雪’和‘黄皮消’全基因组重测序分析

以上饶早梨Pyrus pyrifolia 2个品种‘六月雪’‘Liuyuexue’和‘黄皮消’‘Huangpixiao’试管苗为材料,进行全基因组重测序分析。结果表明:2个样本的总单核苷酸多态位点(SNP)数量分别为6 171 357和6 140 603个,编码区内无义突变位点(nsSNP)分别为335 659和332 280个。对nsSNP的常见变异(common variant, CV)分析发现,共有2 282个nsSNP关联了2 067个基因。2个样本的总插入缺失位点(INDEL)分别为800 388和799 603个,其中15 509和15 274个位于编码区,共5 115个差异INDEL关联到了3 682个基因,烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus)耐药蛋白N,抗病蛋白等关键基因发生变异。差异nsSNP和差异INDEL富集得到的基因本体术语(GO terms)一致。本实验结果可为上饶早梨2个品种‘六月雪’和‘黄皮消’ SNP和INDEL相关标记的开发、优异基因的挖掘提供参考。

复方六月雪对HepG2.2.15细胞HBV DNA的抑制作用

目的:观察复方六月雪体外抗乙型肝炎病毒(HBV)的作用。方法:采用MTT法检测复方六月雪对HepG2.2.15细胞的半数毒性浓度(TC50)和最大无毒浓度(TC0);在最大无毒浓度(TC0)基础上观察不同浓度药物作用于HepG2.2.15细胞,分别在第72h和144h收集细胞培养上清液,采用实时荧光定量PCR法检测上清液HBV DNA的含量。结果:TC50为3.070mg/ml,TC0为0.945mg/ml,复方六月雪对HepG2.2.15细胞毒性较低。无毒浓度下的复方六月雪在HepG2.2.15细胞培养中可有效地抑制细胞HBVDNA的复制。结论:CLYX在体外有显著的抗HBV的作用,且毒性较低。