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上饶早梨‘六月雪’和‘黄皮消’全基因组重测序分析
被引量:
3
1
作者
洪森荣
曾清华
+4 位作者
谭鑫
陈永华
郑亚娇
徐迎昕
邱梦琴
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期227-235,共9页
以上饶早梨Pyrus pyrifolia 2个品种‘六月雪’‘Liuyuexue’和‘黄皮消’‘Huangpixiao’试管苗为材料,进行全基因组重测序分析。结果表明:2个样本的总单核苷酸多态位点(SNP)数量分别为6 171 357和6 140 603个,编码区内无义突变位点(ns...
以上饶早梨Pyrus pyrifolia 2个品种‘六月雪’‘Liuyuexue’和‘黄皮消’‘Huangpixiao’试管苗为材料,进行全基因组重测序分析。结果表明:2个样本的总单核苷酸多态位点(SNP)数量分别为6 171 357和6 140 603个,编码区内无义突变位点(nsSNP)分别为335 659和332 280个。对nsSNP的常见变异(common variant, CV)分析发现,共有2 282个nsSNP关联了2 067个基因。2个样本的总插入缺失位点(INDEL)分别为800 388和799 603个,其中15 509和15 274个位于编码区,共5 115个差异INDEL关联到了3 682个基因,烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus)耐药蛋白N,抗病蛋白等关键基因发生变异。差异nsSNP和差异INDEL富集得到的基因本体术语(GO terms)一致。本实验结果可为上饶早梨2个品种‘六月雪’和‘黄皮消’ SNP和INDEL相关标记的开发、优异基因的挖掘提供参考。
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关键词
园艺学
上饶早梨
'六月雪’
'
黄皮消’
全基因组重测序分析
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职称材料
复方六月雪对HepG2.2.15细胞HBV DNA的抑制作用
被引量:
16
2
作者
张士军
焦杨
+2 位作者
林兴
莫国艳
黄仁彬
《中药药理与临床》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期59-61,共3页
目的:观察复方六月雪体外抗乙型肝炎病毒(HBV)的作用。方法:采用MTT法检测复方六月雪对HepG2.2.15细胞的半数毒性浓度(TC50)和最大无毒浓度(TC0);在最大无毒浓度(TC0)基础上观察不同浓度药物作用于HepG2.2.15细胞,分别在第72h和144h收...
目的:观察复方六月雪体外抗乙型肝炎病毒(HBV)的作用。方法:采用MTT法检测复方六月雪对HepG2.2.15细胞的半数毒性浓度(TC50)和最大无毒浓度(TC0);在最大无毒浓度(TC0)基础上观察不同浓度药物作用于HepG2.2.15细胞,分别在第72h和144h收集细胞培养上清液,采用实时荧光定量PCR法检测上清液HBV DNA的含量。结果:TC50为3.070mg/ml,TC0为0.945mg/ml,复方六月雪对HepG2.2.15细胞毒性较低。无毒浓度下的复方六月雪在HepG2.2.15细胞培养中可有效地抑制细胞HBVDNA的复制。结论:CLYX在体外有显著的抗HBV的作用,且毒性较低。
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关键词
复方
六月雪
抗乙型肝炎病毒
HBV
DNA
HEPG2.2.15细胞
荧光定量PCR
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职称材料
题名
上饶早梨‘六月雪’和‘黄皮消’全基因组重测序分析
被引量:
3
1
作者
洪森荣
曾清华
谭鑫
陈永华
郑亚娇
徐迎昕
邱梦琴
机构
上饶师范学院生命科学学院
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期227-235,共9页
基金
2014年度江西省高等学校科技落地计划项目(KJLD14086)
文摘
以上饶早梨Pyrus pyrifolia 2个品种‘六月雪’‘Liuyuexue’和‘黄皮消’‘Huangpixiao’试管苗为材料,进行全基因组重测序分析。结果表明:2个样本的总单核苷酸多态位点(SNP)数量分别为6 171 357和6 140 603个,编码区内无义突变位点(nsSNP)分别为335 659和332 280个。对nsSNP的常见变异(common variant, CV)分析发现,共有2 282个nsSNP关联了2 067个基因。2个样本的总插入缺失位点(INDEL)分别为800 388和799 603个,其中15 509和15 274个位于编码区,共5 115个差异INDEL关联到了3 682个基因,烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus)耐药蛋白N,抗病蛋白等关键基因发生变异。差异nsSNP和差异INDEL富集得到的基因本体术语(GO terms)一致。本实验结果可为上饶早梨2个品种‘六月雪’和‘黄皮消’ SNP和INDEL相关标记的开发、优异基因的挖掘提供参考。
关键词
园艺学
上饶早梨
'六月雪’
'
黄皮消’
全基因组重测序分析
Keywords
horticulture
early pear(Pyrus pyrifolia)in Shangrao
‘Liuyuexue’
‘Huangpixiao’
whole genome re-sequencing analysis
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
复方六月雪对HepG2.2.15细胞HBV DNA的抑制作用
被引量:
16
2
作者
张士军
焦杨
林兴
莫国艳
黄仁彬
机构
广西医科大学药理学教研室
出处
《中药药理与临床》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期59-61,共3页
基金
广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻0322024-5E)
文摘
目的:观察复方六月雪体外抗乙型肝炎病毒(HBV)的作用。方法:采用MTT法检测复方六月雪对HepG2.2.15细胞的半数毒性浓度(TC50)和最大无毒浓度(TC0);在最大无毒浓度(TC0)基础上观察不同浓度药物作用于HepG2.2.15细胞,分别在第72h和144h收集细胞培养上清液,采用实时荧光定量PCR法检测上清液HBV DNA的含量。结果:TC50为3.070mg/ml,TC0为0.945mg/ml,复方六月雪对HepG2.2.15细胞毒性较低。无毒浓度下的复方六月雪在HepG2.2.15细胞培养中可有效地抑制细胞HBVDNA的复制。结论:CLYX在体外有显著的抗HBV的作用,且毒性较低。
关键词
复方
六月雪
抗乙型肝炎病毒
HBV
DNA
HEPG2.2.15细胞
荧光定量PCR
Keywords
Compound Liuyuexue (复方
六月雪
)
anti-HBV
HBV DNA
HepG2.2.15 cell
FQ-PCR
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
上饶早梨‘六月雪’和‘黄皮消’全基因组重测序分析
洪森荣
曾清华
谭鑫
陈永华
郑亚娇
徐迎昕
邱梦琴
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
下载PDF
职称材料
2
复方六月雪对HepG2.2.15细胞HBV DNA的抑制作用
张士军
焦杨
林兴
莫国艳
黄仁彬
《中药药理与临床》
CAS
CSCD
北大核心
2007
16
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引证文献
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