一种异步BSP模型及其程序优化技术

基于 BSP模型 ,该文提出了异步计算模型 (CSA- BSP) .该模型更准确地描述了并行机的性能参数 ,引导用户编写高效率的并行程序 ;在 CSA- BSP模型下 ,两个进程异步执行的位置至多相差 p- 1个超步 ;基于程序的执行时间 ,作者分析了 BSP、A- BSP和 CSA- BSP程序的效率 ,得出 CSA - BSP程序的效率是最高的 .在曙光并行机上 ,用“红黑格法”和“矩阵乘法”进行了验证 ,和 BSP模型相比 ,这两个 CSA- BSP程序的效率分别提高 2 0 %和 37% ;同时 ,其进程执行时间的和最大可以降低 8% .因此 ,按照 CSA- BSP模型编程对于提高程序效率和改善系统的吞吐率 ,都有良好的效果 .

滋肾化痰方对肿瘤骨转移患者血清BSP指数及生活质量的影响

目的:探讨滋肾化痰方联合唑来膦酸对肿瘤骨转移患者生活质量的改善及对血清BSP指数的影响。方法:采用前瞻性、随机对照研究方法,将60例肿瘤骨转移患者按照1:1随机分为中西医结合组和西药组。中西医结合组给予滋肾化痰方和唑来膦酸联合治疗,西药组单独给予唑来膦酸治疗。采用EORTCQLQ-SF-36生活质量调查问卷评分,检测血清BSP指数,对骨疼痛程度进行评分比较。结果:在躯体功能、角色功能、情绪功能、物理症状及整体健康状况方面评分中西医结合组比西药组下降明显,与西药组评分比较差异有统学计学意义(P<0.05),中西医结合组血清BSP指数比西药组下降明显,两组比较差异有统学计学意义(P<0.05)。中西医结合组疼痛缓解程度明显优于西药组,与西药组评分比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:滋肾化痰方联合唑来膦酸具有明显改善骨转移癌患者生活质量、降低血清BSP指数、减轻骨疼痛程度的作用。

左归丸对骨质疏松症大鼠GPR48、ATF4、BSP表达影响的实验研究

目的:通过研究摘除卵巢致肾虚骨质疏松症大鼠血清中GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达,探讨摘除卵巢致肾虚骨质疏松症的病理机制,并研究左归丸防治疗效及其作用机制。方法:摘除雌性大鼠双侧卵巢的方法复制肾虚骨质疏松症模型,采用具有补肾作用的左归丸对实验大鼠治疗12周,以盖天力片作为阳性对照组,正常大鼠、假手术组作为标准对照组,模型大鼠作为空白对照组,用ELISA法检测肾虚骨质疏松症大鼠血清GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达。结果:ELISA方法检测表明:正常大鼠血清中存在GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达。模空组大鼠血清中GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达水平有明显的下降。左归丸组、盖天力组用药12周后,与模空组相比较,左归丸组可显著上调血清中GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达水平。结论:1正常大鼠血清中存在GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达;2血清中GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达异常变化可能是导致骨质疏松症发生的机理之一;3左归丸能够调控GPR48、ATF4、BSP的蛋白表达,表明左归丸对骨质疏松症有一定的防治作用。

益肾化痰法对乳腺癌骨转移患者血液PTHrP、FGF-β、BSP水平的影响及作用机制分析

目的:分析益肾化痰法方对乳腺癌骨转移患者血清血液PTHrP、FGF-β、BSP水平的影响及作用机制。方法:以河南中医药大学第三附属医院收治的乳腺癌骨转移患者90例为研究对象,采取数字表随机分组法分为观察组与对照组各45例,对照组实施常规乳腺癌骨转移治疗方法,观察组以对照组为基础使用益肾化痰方,对比两组患者血液PTHrP、FGF-β、BSP水平改变与差异及不良反应发生率。结果:干预前两组的PTHrP细胞阳性率无明显差异,P>0.05,干预后两组患者阳性率均降低,但观察组阳性率(69.42±3.12)%低于对照组(77.53±4.01)%,两组相比P<0.05;干预前两组患者的FGF–β细胞阳性指数无明显差异,P>0.05,干预后两组的细胞阳性指数均下降,但观察组的阳性指数(5.02±0.94)分低于对照组(6.80±0.82)分,两组相比P<0.05;干预前两组的BSP细胞阳性率无明显差异,P>0.05,干预后两组患者阳性率均降低,但观察组阳性率(61.31±6.45)%低于对照组(70.40±6.10)%,两组相比P<0.05;观察组患者的治疗不良反应发生率低于对照组(28.98%VS 53.33%),两组相比P<0.05。结论:乳腺癌骨转移患者常规治疗基础上加用益肾化痰方能够有效改善患者的血液PTHrP、FGF-β、BSP水平,对抗骨转移症状,并降低不良反应发生率,其机制与益肾化痰方改善肾虚骨髓空虚及药物有效成份可抑制骨破坏增加骨形成及改善免疫功能有关。

大鼠正畸牙根吸收修复早期BMP-2与BSP表达的研究

目的观察SD大鼠正畸牙根吸收早期修复过程中牙周组织骨形成蛋白-2(BMP-2)、骨涎蛋白(BSP)的表达。方法选取48只雄性SD大鼠,正畸加力14 d后拆除矫治器,在装置拆除后分别在0、1、3、5、7、10、14、28 d处死,HE染色观察牙周组织形态学变化,用免疫组织化学法检测BMP-2、BSP的表达。结果 BMP-2、BSP的表达在矫治器拆除后开始升高,BMP-2在第1天时达到最高,BSP在第3天时达到最高,然后逐渐下降,到第28天时降至对照组水平。结论 BMP-2、BSP的浓度在牙周组织中选择性地表达升高,反映了矫治器拆除后牙周组织的修复过程活跃。

三阴性乳腺癌术后骨转移与血清PRL、IL-1β以及BSP表达之间的关联探索

为了分析三阴性乳腺癌切除术后骨转移与血清泌乳素(PRL)、白细胞介素(IL)-1β及骨唾液酸蛋白(BSP)关系,回顾分析三阴性乳腺癌患者的病例。结果显示,术后,发生骨转移患者的血清PRL、IL-1β及BSP水平均显著升高,血清PRL、IL-1β及BSP水平在不同年龄骨转移患者中存在显著差异,且PRL与IL-1β,IL-1β与BSP,PRL与BSP水平间均呈正相关。结果说明,三阴性乳腺癌切除后发生骨转移与年龄因素有关,血清PRL、IL-1β及BSP与三阴性乳腺癌切除后骨转移呈正相关。

MMP-9、BSP与LRP在乳腺癌组织中表达的研究

目的:探讨基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、骨唾液蛋白(BSP)与肺耐药蛋白(LRP)在正常乳腺组织及乳腺癌组织中的表达状况。方法:应用免疫组化SP法检测60例正常乳腺组织及60例乳腺癌组织中MMP-9、BSP与LRP的表达。结果:乳腺癌组织中MMP-9、BSP与LRP的阳性表达率分别为75.0%、78.3%、68.3%。正常乳腺组织中MMP-9、BSP与LRP的阳性表达率分别为21.7%、15.0%、10.0%。二者的差异有显著的统计学意义(P<0.05)。乳腺癌组织中MMP-9、BSP与LRP的表达呈正相关。结论:MMP-9、BSP与LRP在乳腺癌组织中高表达,与乳腺癌的浸润和转移相关。

一种改进的基于BSP的大图计算模型

伴随大数据的涌现,云存储和计算技术近年得到长足发展.图数据是一种重要而普遍的大数据,在生物信息学、社会网络、化学信息学等领域都有众多应用.因此,大图计算作为大数据分析应用的典型代表,正成为云端负载的重要组成部分.目前,高可扩展性的图计算主要依赖于高性能计算解决方案,需要进行环状(或网状)计算机网络之上的高效全集合通信.然而,在通用计算集群和云计算基础设施上实现基于环状计算机网络的算法时,低效的网络通信将导致巨大的系统延迟.因此,这就要求那些基于云端的大数据计算平台和系统具备十分良好的水平可扩展性.但是,大图的幂律分布和缺乏局部性使得设计一套高度可扩展的大图计算系统变得更具挑战.为此,文中提出了一种面向通用计算集群的可扩展大图计算模型.专注于水平扩展能力,设计了一种新颖的基于分离器-合并器BSP的图计算方法,能够提供原生的负载平衡,仅需很低的通信开销.从而,图数据规模的增大可以通过增加计算节点数量得以解决.最后,在一个图数据通用测试集上,通过大量实验验证了所提模型和方法的有效性和高效性;结果显示,相比经典的以顶点为中心的BSP大图计算模型和其他主流大图计算系统,所提改进的基于BSP的大图计算模型能够提供更好的水平可扩展性.

BSP模型下基于边聚簇的大图划分与迭代处理

近年来随着互联网的普及和相关技术的日益成熟,大规模图数据处理成为新的研究热点.由于传统的如Hadoop等通用云平台不适合迭代式地处理图数据,研究人员基于BSP模型提出了新的处理方案,如Pregel,Hama,Giraph等.然而,图处理算法需要按照图的拓扑结构频繁交换中间计算结果而导致巨大的通信开销,这严重地影响了基于BSP模型的系统的处理性能.首先从降低消息通信的角度分析当前主流BSP系统的处理方案,然后提出了一种基于边聚簇的垂直混合划分策略(EC-VHP),并建立代价收益模型分析其消息通信优化的效果.在EC-VHP的基础上,提出了一个点-边计算模型,并设计了简单Hash索引和多队列并行顺序索引机制,进一步提高消息通信的处理效率.最后,在真实数据集和模拟数据集上的大量实验,验证了EC-VHP策略和索引机制的正确性和有效性.

基于实时嵌入式系统的BSP构建技术

文章主要介绍嵌入式系统BSP的文件体系结构及相关的BSP开发方法。

集群系统中BSP模型上的并行FFT设计

在并行计算模型中 ,BSP模型由于具有编程简单、独立于体系结构和执行性能可预测等特点而在总体上优于其它模型。NOWs正成为并行计算领域的一个新的发展热点 ,以太网构成的微机集群系统是NOWs的一种重要实现形式。文中研究了集群系统中BSP模型上的并行算法设计 ,以FFT算法为例 ,进行了设计和分析 ,并给出了测试结果。

左归丸含药血清对骨髓间充质干细胞GPR48、BSP表达影响的实验研究

目的:通过左归丸含药血清对大鼠骨髓间充质干细胞GPR48、BSP、BGP的实验研究,探究左归丸对治疗骨质疏松症的疗效机制。从而为"肾藏精"这一理论提供实验依据。方法:将SPF级大鼠分为正常组、左归丸组、诱导液组、阳性药物组骨疏康组、福善美,对大鼠进行灌胃5天。制备含药血清,并观察左归丸含药血清对骨髓间充质干细胞的影响。结果:与正常组和阳性药物组及诱导液组相比,左归丸组的蛋白表达水平明显上升。结论:1G蛋白偶联受体GPR48的变化可能引起骨质疏松症的发生;2左归丸能够有效治疗骨质疏松,这种作用可能通过G蛋白偶联受体GPR48信号通路来实现。

益肾化痰方对乳腺癌骨转移模型小鼠血液PTHr P、TGF-β、BSP水平的影响及作用机制

目的分析益肾化痰方对乳腺癌骨转移模型小鼠血液甲状旁腺激素相关蛋白(PTHr P)、转化生长因子β(TGF-β)、骨唾液酸蛋白(BSP)水平的影响及作用机制。方法雌性小鼠共90只,随机分为对照组、肾虚组及治疗组,各30只。对照组正常饲养,肾虚组及治疗组小鼠皮下注射醋酸氢化可的松注射液,制成肾虚模型。肾虚模型制成3 d后将三组小鼠腹腔注射硫喷妥钠和腿部肌肉注射氯胺酮,使用29G注射器将8×105个肿瘤细胞注射入小鼠左心室制作骨转移模型。对照组与肾虚组小鼠给予等量生理盐水灌胃,治疗组小鼠使用益肾化痰方浓缩药液灌胃。对比三组小鼠血液PTHr P、TGF-β、BSP水平。结果 PTHr P情况:三组总阳性率无明显差异,肾虚组的强阳性率与阳性细胞的平均百分比高于对照组(P <0. 05),治疗组的强阳性率与阳性细胞的平均百分比低于肾虚组(P <0. 05); FGF–β情况:肾虚组的细胞染色率与阳性系数高于对照组与治疗组(P <0. 05); BPS情况:肾虚组的细胞染色率、强阳性率高于对照组但低于治疗组(P <0. 05)。提示肾虚组的PTHr P、TGF-β、BSP水平高于对照组,但治疗后PTHr P、TGF-β、BSP得到控制。结论使用益肾化痰方可通过充盛肾精,充壮骨髓与促进成骨细胞生殖分化、抑制肿瘤因子生长、提高机体免疫功能等方式对抗乳腺癌骨转移症状。

嵌入式系统中BSP的作用及其相关联环节的分析

在嵌入式技术的设计与应用中,板级支持软件包BSP是嵌入式技术应用中软硬件结合层面的一个关键环节,其形式与作用随不同的软硬件环境产生的差异发生变化。如何为嵌入式操作系统"屏蔽"应用环境的差异是BSP的主要任务。从分析嵌入式技术定义、系统组成以及研发等几个方面,对BSP的作用及其关联环节进行分析,为嵌入式技术的应用提供帮助。

基于OMAP3530的Windows Embedded Compact 7 BSP的开发与移植

介绍了TI公司的OMAP3530双核处理器和基于该处理器设计的开发板,描述了BSP的一般概念及开发方法。通过实例说明了在嵌入式系统开发中如何实现Windows Embedded Compact 7 BSP的开发和移植。

基于BSP的并行事务处理模型

BSP模型独立于并行体系结构 ,既可作为并行计算模型 ,又可作为并行程序设计模型 .提出了基于 BSP模型的 H- V事务模型 ,适用于长、短事务和长短事务混杂的情况 .给出了在无共享结构下实现并行事务处理的进程结构 .该结构不仅实现了事务内及事务间并行性 ,而且使系统具有可用性 ( availability)和可扩充性 ( scalability) .而后给出了适用于该模型的基于时间戳的多版本并发控制协议 ,最后描述了事务在超步结构下的运行过程 .性能测试表明 ,使用该模型进行事务处理时可获得良好的事务响应时间和加速比 .

骨皮质切开术辅助大鼠正畸牙移动中OPNmRNA、BSPmRNA、OCNmRNA表达的研究

目的:观察骨桥蛋白(OPN),骨涎蛋白(BSP),骨钙蛋白(OCN)在大鼠骨皮质切开术辅助正畸牙移动过程中的表达情况。方法:选取健康雄性Wistar大鼠65只,60只大鼠随机分成3组:组Ⅰ:选择性骨皮质切开术;组Ⅱ:传统的牙齿移动;组Ⅲ:混合组,剩余5只作为空白对照组(不作任何处理)。用镍钛螺旋拉簧施加约60g力近中移动上颌实验侧第一磨牙,在第一磨牙颊腭侧行骨皮质打孔术式,分别在加载第7、14、21、28、42天颈椎脱臼处死取材,进行SYBR Green实时荧光定量PCR技术,对Ct值进行分析。结果:混合组中的成骨细胞相关细胞因子:OPN(骨桥蛋白),Bone sialoprotein(BSP骨涎蛋白),Osteocalcin(OCN骨钙蛋白)的表达早期增加暗示了同化合成反应的增加。结论:正畸牙齿移动初期骨皮质切开术加速了牙齿移动,改变了早期骨代谢状态,成骨活跃,支持区域性骨代谢加速学说。

^(40)Ar—^(39)Ar法国际标准样BSP—1角闪石的测定

利用RGA—10质谱计和析氢仪联合装置对BSP—1角闪石进行了K—Ar及^(40)Ar—^(39)Ar年龄测定,坪年龄为2054±2Ma;谱线平坦,^(40)Ar^(?)保存性很好,K/Ca和CI/K比值稳定;^(40)Ar—^(39)Ar等时年龄为2053Ma,^(40)Ar/^(36)Ar初始值为294.2,与大气Ar丰度一致。国内外13个实验室参加了该角闪石K和^(40)Ar^(?),的定值分析,其结果为:K=0.725±0.003(%),^(40)Ar^(?)=109.06±0.26(10^(-6)cc-STP/g),由此求出的K—Ar年龄为2060±8Ma,与坪年龄、等时年龄吻合。这些结果表明,BSP—1角闪石结晶时未捕获大气Ar,结晶以来未受过热扰动,保持着良好的^(40)K、^(40)Ar^(?)封闭体系,是很理想的^(40)Ar—^(39)Ar法的国际标准样。

可生物素化H-2K^d-BSP融合蛋白的原核表达和纯化

目的构建可生物素化的H-2Kd-BSP融合基因的表达载体,原核表达H-2Kd-BSP融合蛋白,以制备H-2Kd-肽四聚体。方法采用RT-PCR技术从小鼠SP2/0细胞中克隆小鼠MHC-Ⅰ类分子H-2Kd基因的胞外区,拼接上依赖BirA酶的可生物素化序列(BSP)后,插入pET-22b高效表达载体多克隆位点,诱导表达后对表达产物进行纯化,用Western印迹法分析鉴定纯化融合蛋白。结果成功构建pET-H-2Kd原核表达载体,测序证实H-2Kd-BSP融合基因序列正确。pET-H-2Kd原核表达载体可在大肠杆菌BL21中高效诱导表达H-2Kd-BSP融合蛋白,表达量占菌体总蛋白的36%,主要以包涵体形式表达;经反复洗涤纯化,纯化蛋白纯度可达90%以上。纯化蛋白可被H-2Kd分子特异性单克隆抗体SF1-1.1所识别。结论可生物素化H-2Kd-BSP融合蛋白的原核表达和纯化为进一步制备H-2Kd-肽四聚体奠定了实验基础。

VxWorks系统的BSP设计与实现

BSP(Board Support Packet)是介于硬件和实时操作系统VxWorks之间的底层软件开发包,为VxWorks系统提供了标准的硬件接口函数,保证了VxWorks系统能够运行在不同的硬件平台上。介绍了BSP的概念,并以嵌入式微处理器MPC8280构成的硬件平台为例详细介绍了BSP的开发过程。