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An efficient method for constructing a random insertional mutant library for forward genetics in Nannochloropsis oceanica
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作者 Zhongyi ZHANG Hang LIU +5 位作者 Xiaohui PAN Yanan ZONG Leili FENG Lixian LIU Li GUO Guanpin YANG 《Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期216-225,共10页
Insertional mutation,phenotypic evaluation,and mutated gene cloning are widely used to clone genes from scratch.Exogenous genes can be integrated into the genome during non-homologous end joining(NHEJ)of the double-st... Insertional mutation,phenotypic evaluation,and mutated gene cloning are widely used to clone genes from scratch.Exogenous genes can be integrated into the genome during non-homologous end joining(NHEJ)of the double-strand breaks of DNA,causing insertional mutation.The random insertional mutant library constructed using this method has become a method of forward genetics for gene cloning.However,the establishment of a random insertional mutant library requires a high transformation efficiency of exogenous genes.Many microalgal species show a low transformation efficiency,making constructing random insertional mutant libraries difficult.In this study,we established a highly efficient transformation method for constructing a random insertional mutant library of Nannochloropsis oceanica,and tentatively tried to isolate its genes to prove the feasibility of the method.A gene that may control the growth rate and cell size was identified.This method will facilitate the genetic studies of N.oceanica,which should also be a reference for other microalgal species. 展开更多
关键词 Nannochloropsis oceanica genetic transformation random insertional mutant library zeocin pretreatment forward genetics
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Interaction between diet and genetics in patients with inflammatory bowel disease
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作者 Daniéla Oliveira Magro Ligia Yukie Sassaki Júlio Maria Fonseca Chebli 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2024年第12期1644-1650,共7页
In this editorial,we comment on the article by Marangoni et al,published in the recent issue of the World Journal of Gastroenterology 2023;29:5618-5629,about“Diet as an epigenetic factor in inflammatory bowel disease... In this editorial,we comment on the article by Marangoni et al,published in the recent issue of the World Journal of Gastroenterology 2023;29:5618-5629,about“Diet as an epigenetic factor in inflammatory bowel disease”.The authors emphasized the role of diet,especially the interaction with genetics,in promoting the inflam-matory process in inflammatory bowel disease(IBD)patients,focusing on DNA methylation,histone modifications,and the influence of microRNAs.In this editorial,we explore the interaction between genetics,gut microbiota,and diet,in an only way.Furthermore,we provided dietary recommendations for patients with IBD.The Western diet,characterized by a low fiber content and deficiency the micronutrients,impacts short-chain fatty acids production and may be related to the pathogenesis of IBD.On the other hand,the consumption of the Mediter-ranean diet and dietary fibers are associated with reduced risk of IBD flares,particularly in Crohn’s disease(CD)patients.According to the dietary guidance from the International Organization for the Study of Inflammatory Bowel Diseases(IOIBD),the regular consumption of fruits and vegetables while reducing the consumption of saturated,trans,dairy fat,additives,processed foods rich in maltodextrins,and artificial sweeteners containing sucralose or saccharine is recommended to CD patients.For patients with ulcerative colitis,the IOIBD recommends the increased intake of natural sources of omega-3 fatty acids and follows the same restrictive recommendations aimed at CD patients,with the possible inclusion of red meats.In conclusion,IBD is a complex and hetero-geneous disease,and future studies are needed to elucidate the influence of epigenetics on diet and microbiota in IBD patients. 展开更多
关键词 DIET genetics MICRORNAS Gastrointestinal microbiome Inflammatory bowel diseases Crohn’s disease
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A Theory of Bio-Quantum Genetics
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作者 Jianzhong Zhao 《Journal of Quantum Information Science》 CAS 2024年第1期15-27,共13页
The physical mechanism of heredity or inheritance of genes is a quantum mechanical and/or quantum computational process. A theory of bio-quantum genetics is established in this paper. Principle of Bio-quantum Genetics... The physical mechanism of heredity or inheritance of genes is a quantum mechanical and/or quantum computational process. A theory of bio-quantum genetics is established in this paper. Principle of Bio-quantum Genetics is suggested. I propose and define the soft-genes of genetics controlling the processes of heredity or inheritance of genes. This research deals with the quantum mechanisms of Mendel plant heredity and family inheritance as examples of bio-quantum genetics, deepening our understanding of heredity or inheritance. I believe that more contributions will be made to promote researches of bio-quantum genetics or quantum biology at large. 展开更多
关键词 Bio-Quantum genetics Quantum Mechanics GENES Soft Genes Quantum Mechanism of Mendel Plant Heredity Quantum Mechanism of Family Inheritance
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The Practice and Exploration of Applying EBM to Bilingual Teaching of Medical Genetics at OSBCM
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作者 Rong Liu Huaming Zuo 《Open Journal of Applied Sciences》 2024年第4期983-990,共8页
In the process of teaching medical genetics of undergraduate clinical medicine, the practice and exploration of applying EBM to the bilingual teaching of OSBCM medical genetics are carried out. Using CBL and PBL as th... In the process of teaching medical genetics of undergraduate clinical medicine, the practice and exploration of applying EBM to the bilingual teaching of OSBCM medical genetics are carried out. Using CBL and PBL as the carrier can make up for the shortcomings of a single teaching mode, synthesize the advantages of multiple teaching modes. It starts from integrating the basic theoretical knowledge of medicine and clinical practice knowledge, improving students’ bilingual level of medical genetics, cultivating students’ literature retrieval ability, and promoting early clinical, multi-clinical and repeated clinical consciousness for medical students. Therefore, it is more conducive to cultivate students’ ability to learn independently, accurately analyze and solve problems, improve medical students’ clinical thinking ability and scientific research awareness, improve medical students’ ability of international communication, and lay a solid foundation for improving medical students’ future post competence, innovative spirit and lifelong learning ability. 展开更多
关键词 Medical genetics Evidence Based Medicine Organ-System-Based Curriculum Model Problem Based Learning Case-Based Learning
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皮南杂交牛H1至H4代数量性状遗传分析及优种筛选
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作者 杜瑞卿 张志峰 +6 位作者 王建钦 孙志和 陈岭 李巧珍 齐香萍 白跃宇 姚伦广 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2025年第1期11-19,共9页
为了改良皮南杂交牛的种质性能,选择2000—2020年20年间出生的H1(横交固定一代)至H4代14030头牛进行选种育种培养,观察体重、体尺、外貌评分等36个个体表型性状指标,记录每头牛上三代亲缘关系;对获得数据经整理和检验后,进行选择指数(C... 为了改良皮南杂交牛的种质性能,选择2000—2020年20年间出生的H1(横交固定一代)至H4代14030头牛进行选种育种培养,观察体重、体尺、外貌评分等36个个体表型性状指标,记录每头牛上三代亲缘关系;对获得数据经整理和检验后,进行选择指数(CBI)计算,对不同性别、不同分类(核心牛群和良种牛群)的群体进行正态分布概率遗传参数分析和判别分析筛选。结果:从H3代的核心母牛群和公牛群中筛选出28头各指标综合表现好的种子公牛和母牛,从H4代的核心母牛群和公牛群中筛选出56头各指标综合表现好的种子公牛和母牛;CBI指数大于116.40的有100头;核心公牛的表型值比核心母牛的表型值高,但是核心母牛的遗传力、选择系数R比核心公牛的大;同类型的牛群其一代比一代的遗传力大,核心牛群的遗传力均值在0.4~0.5;从H3和H4代核心牛群中选出的优秀种牛群,H4代选择系数R比H3代大。本研究结果对选种育种具有重要参考价值和指导意义,选择系数R值增大说明所选的优秀种牛群下一代比本代在多个观察表型性状指标上可能有较大改善;本研究提出的群体正态分布概率遗传参数分析法和判别分析法,在理论和实际效果方面都具有重要意义。 展开更多
关键词 皮南杂交牛 数量性状遗传分析 选择指数 遗传参数
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基于线粒体COⅠ基因的江苏湖泊鳙群体遗传多样性分析
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作者 李大命 刘燕山 +4 位作者 唐晟凯 张增 王超群 穆欢 王华 《水产科技情报》 2025年第1期1-6,共6页
为掌握江苏湖泊鳙群体的遗传资源状况,利用COⅠ基因序列研究了6个湖泊(太湖、滆湖、长荡湖、高邮湖、洪泽湖和骆马湖)鳙群体的遗传多样性及遗传结构。结果显示,在分析的630 bp COⅠ基因片段中,碱基A+T含量(55.3%)高于C+G含量(44.7%)。22... 为掌握江苏湖泊鳙群体的遗传资源状况,利用COⅠ基因序列研究了6个湖泊(太湖、滆湖、长荡湖、高邮湖、洪泽湖和骆马湖)鳙群体的遗传多样性及遗传结构。结果显示,在分析的630 bp COⅠ基因片段中,碱基A+T含量(55.3%)高于C+G含量(44.7%)。223条COⅠ序列检测出14个变异位点,定义9个单倍型,6个群体的单倍型多样性为0.494~0.665,核苷酸多样性为0.0009~0.0019,总体单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.576和0.0012,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特点,表明6个湖泊鳙群体遗传多样性较低。分子方差分析结果显示,遗传变异主要来自于群体内(99.39%),总遗传分化指数为0.0061,群体间遗传分化指数为-0.0228~0.0445,遗传距离为0.0012~0.0027,表明群体间没有明显的遗传分化。单倍型系统发育树和网络结构图显示,单倍型在6个群体中混杂分布,未形成特定的湖泊分支。中性检验和歧点分布分析表明,整个鳙群体经历过显著的种群扩张。结果表明,江苏湖泊鳙群体的遗传多样性较低,遗传结构趋于同质化,需要采取措施提高鳙的遗传多样性。 展开更多
关键词 COⅠ基因 遗传多样性 遗传结构 增殖放流
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一种农杆菌介导的糜子高效遗传转化方法
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作者 夏启玉 降彦苗 +5 位作者 刘亚男 李海权 程汝宏 郭安平 刘国庆 赵辉 《热带作物学报》 北大核心 2025年第1期44-50,共7页
糜子(Panicum miliaceum L.)是我国传统的粮食作物,截至目前,针对糜子遗传转化方法的研究仍较少,本研究旨在建立农杆菌介导的糜子高效遗传转化方法。以糜子品种冀黍5号的成熟种子为外植体,在CIM和MSD诱导培养基上分别诱导糜子的胚性愈伤... 糜子(Panicum miliaceum L.)是我国传统的粮食作物,截至目前,针对糜子遗传转化方法的研究仍较少,本研究旨在建立农杆菌介导的糜子高效遗传转化方法。以糜子品种冀黍5号的成熟种子为外植体,在CIM和MSD诱导培养基上分别诱导糜子的胚性愈伤,以其作为转化受体材料,用含植物表达载体的农杆菌侵染60min并共培养6d,转接至含0.025g/L潮霉素的筛选培养基上筛选出抗性愈伤,接着在含0.015g/L潮霉素的分化培养基上分化,最后在含0.015g/L潮霉素的生根培养基上生根成苗,用载体特异性引物对再生植株进行PCR检测,鉴定其是否为阳性转基因植株。根据多个批次的转化实验统计糜子的抗性再生植株的筛选效率和转化效率。结果表明:CIM和MSD诱导培养基均能诱导出糜子胚性愈伤,但CIM培养基诱导的糜子胚性愈伤效果更好;糜子胚性愈伤在被农杆菌侵染及与农杆菌共培养后,经在含潮霉素的培养基上筛选、分化和生根后获得多株抗性再生糜子植株,3次试验获得的糜子抗性再生植株的PCR鉴定阳性率为100%,平均转化效率为30%以上。本研究成功建立了农杆菌介导的糜子遗传转化方法,操作简单,转化效率高,成本低廉,且转化不受季节限制,能规模化开展,为糜子的遗传改良提供有效的技术手段。 展开更多
关键词 糜子 农杆菌 遗传转化 转化效率
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需求不确定下的两阶段应急物流选址-路径研究
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作者 王庆荣 王雪娜 +1 位作者 朱昌锋 李裕杰 《灾害学》 北大核心 2025年第1期160-166,共7页
针对灾后应急救援在需求不确定和资源受限方面的问题,以多级应急物流网络为背景,构建了一个需求不确定下的两阶段应急选址-路径规划模型。该模型以总成本最小和救援车辆运输总距离最短为目标,采用三角模糊数刻画受灾点的不确定需求,并... 针对灾后应急救援在需求不确定和资源受限方面的问题,以多级应急物流网络为背景,构建了一个需求不确定下的两阶段应急选址-路径规划模型。该模型以总成本最小和救援车辆运输总距离最短为目标,采用三角模糊数刻画受灾点的不确定需求,并采用基于可信性的模糊机会约束规划方法,以消除约束条件中的不确定参数。模型第一阶段调用Gurobi求解器,求解得到应急配送中心选址结果和对受灾点的分配方案;第二阶段将选址及分配结果作为输入进行路径规划,并提出一种改进的自适应遗传算法(IAGA)对算例进行求解。然后采用自适应遗传算法(AGA)与之对比,并进行灵敏度分析。结果表明:IAGA在目标值、收敛速度和运行时间等方面均优于AGA,证明了IAGA具有一定的可行性和有效性,且可以为决策者提供较优的应急选址-路径规划方案,从而提升灾后救援的效率。 展开更多
关键词 应急物流 选址-路径问题 Gurobi 模糊需求 改进的自适应遗传算法
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A Preliminary Study on Conservation Genetics of Three Endangered Orchid Species 被引量:16
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作者 李昂 罗毅波 +1 位作者 熊治廷 葛颂 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第2期250-252,共3页
采用随机扩增多态DNA(RAPD)分析研究了中国 3种珍稀濒危兰科植物硬叶兜兰 (PaphiopedilummicranthumTangetWang)、麻栗坡兜兰 (P .malipoenseS .C .ChenetTsi)和独花兰 (ChangnieniaamoenaChien)的遗传多样性与群体遗传结构。 12个RAPD... 采用随机扩增多态DNA(RAPD)分析研究了中国 3种珍稀濒危兰科植物硬叶兜兰 (PaphiopedilummicranthumTangetWang)、麻栗坡兜兰 (P .malipoenseS .C .ChenetTsi)和独花兰 (ChangnieniaamoenaChien)的遗传多样性与群体遗传结构。 12个RAPD引物在 2种兜兰中共扩增出 131条带。对 4个硬叶兜兰群体的检测表明其物种水平的多态条带百分率 (PPB)为 71.6 % ,Nei的基因多样度 (h)为 0 .2 171,Shannon多样性指数 (I)为 0 .330 1;4个群体的平均多样性水平为PPB =45 .2 % ,h =0 .145 7,I =0 .2 2 0 4,低于远交兰花的平均水平。在总遗传变异中 ,群体间遗传变异占 2 0 .31% ,略高于远交物种的平均水平。在物种水平上 ,麻栗坡兜兰的PPB为 49.5 % ,h为 0 .1174,I为0 .176 4,均大大低于硬叶兜兰。对 11个独花兰群体采用 16个RAPD引物共扩增出 119条带。物种水平PPB =76 .5 % ,h =0 .1941,I=0 .30 5 8;在群体水平上 ,上述 3个指标的平均值则分别为 37.2 %、0 .1197和 0 .1810 ,均低于远交兰花的平均水平。群体间的遗传变异占 45 .2 7% ,遗传分化明显高于远交物种的平均水平。导致 3个物种遗传多样性偏低而群体间遗传分化较高的主要原因在于人为的过度采挖和生境的片断化。 展开更多
关键词 PAPHIOPEDILUM Changnienia amoena RAPDS conservation genetics
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2株鹅源呼肠孤病毒的分离鉴定及血清学相关性研究
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作者 梁昭平 杨惠湖 +6 位作者 李雨泽 黄剑标 林俊杰 王一侨 罗浩健 梅堃 黄淑坚 《中国家禽》 北大核心 2025年第1期71-81,共11页
为了解当前流行的鹅源呼肠孤病毒(Goose reovirus,GRV)的分子特征及血清学相关性,研究将RT-PCR检测GRV阳性的病鹅肝脏组织悬液接种鹅胚成纤维细胞进行病毒分离,通过RT-PCR、测序获取病原全基因组序列并进行分析,并将分离病原接种ST、LMH... 为了解当前流行的鹅源呼肠孤病毒(Goose reovirus,GRV)的分子特征及血清学相关性,研究将RT-PCR检测GRV阳性的病鹅肝脏组织悬液接种鹅胚成纤维细胞进行病毒分离,通过RT-PCR、测序获取病原全基因组序列并进行分析,并将分离病原接种ST、LMH和Vero细胞,探究其在不同细胞上的生长特性,通过交叉中和试验确定病原与其他水禽源呼肠孤病毒间的血清学相关性。结果显示:从病鹅肝脏组织中分离到2株GRV,命名为GD208和GD225,两分离株间核苷酸同源性较低;GD208株与参考株GRV-GD2020遗传距离较近,核苷酸相似性为99.1%~99.6%;GD225株与2018年之后报道的新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)XT18、DE150、QR等毒株遗传距离较近,核苷酸相似性为95.3%~98.9%;GD208株和GD225株在LMH细胞中增殖效果较好,TCID50分别为10-3.7/0.1 mL和10-5.0/0.1 mL;GD208株仅能被同源血清及番鸭呼肠孤病毒(MDRV)阳性血清中和,GD225株可被同源血清、NDRV、MDRV和GD208株阳性血清中和。结果表明,试验分离到两株不同基因型和血清型的GRV,其分子特征和抗原相关性与其他禽源呼肠孤病毒存在一定差异,该结果可为GRV感染的防控提供参考。 展开更多
关键词 鹅源呼肠孤病毒 遗传进化 细胞培养特性 交叉中和
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k-center问题的算法研究综述
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作者 王晓峰 华盈盈 +2 位作者 王军霞 彭庆媛 何飞 《郑州大学学报(工学版)》 CAS 北大核心 2025年第1期42-50,97,共10页
k-center问题是设施选址的基础问题,同样是NP难问题,在分配、紧急服务等领域也有着实际的应用。随着问题规模的扩大,原有的算法已不再适用,需要进一步优化或者改进。为了找到求解该问题的高效算法,对现有算法进行研究。对各类求解k-cen... k-center问题是设施选址的基础问题,同样是NP难问题,在分配、紧急服务等领域也有着实际的应用。随着问题规模的扩大,原有的算法已不再适用,需要进一步优化或者改进。为了找到求解该问题的高效算法,对现有算法进行研究。对各类求解k-center问题的算法进行梳理,将求解算法划分为精确算法、启发式算法、元启发式算法、近似算法等,从算法原理、改进思路、性能和精度等方面进行对比综述。精确算法在求解小规模k-center问题时可在多项式时间内得到最优解,但是算法效率低,不适用于大规模问题;启发式算法可以在多项式时间内给出相对最优解,但是没有理论保证,无法衡量与最优解的关系;元启发式算法可对目前存在的智能优化算法进行改进,给出相对最优解,但是解的质量无法保证;利用近似算法得到的解具有近似比保证,有较大的理论研究价值,但是实用价值较弱。目前求解k-center问题的元启发式算法已取得一定的研究成果,但是在求解时间、求解规模、算法效率等方面仍待突破,这将是未来k-center问题的研究重点。 展开更多
关键词 k-center问题 精确算法 近似算法 蜂群优化 遗传算法
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A Preliminary Study on Conservation Genetics of Endangered Vatica guangxiensis (Dipterocarpaceae) 被引量:10
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作者 李巧明 许再富 何田华 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第2期246-249,共4页
运用 2 0个 10碱基随机引物 ,对中国龙脑香科 (Dipterocarpaceae)特有的珍稀濒危植物版纳青梅 (VaticaguangxiensisX .L .Mo)进行了RAPD多态性分析。 3个自然居群和 1个迁地保护居群 (分布于云南和广西 )共扩增出2 31个位点 ,多态位点... 运用 2 0个 10碱基随机引物 ,对中国龙脑香科 (Dipterocarpaceae)特有的珍稀濒危植物版纳青梅 (VaticaguangxiensisX .L .Mo)进行了RAPD多态性分析。 3个自然居群和 1个迁地保护居群 (分布于云南和广西 )共扩增出2 31个位点 ,多态位点所占比例 (PPB)为 5 3.6 8% ;观察等位基因数na =1.5 36 8,有效等位基因数ne =1.2 878,Nei基因多样性指数h为 0 .16 86 ,居群内的遗传多样性水平较低。基于AMOVA和POPGENE的结果均表明居群内的遗传变异大于居群间的遗传变异。居群内的遗传变异为 5 5 .0 9% ,居群间的变异为 44 .91% (AMOVA) ;基因分化系数Gst为 0 .3746 (POPGENE) ,表明居群间存在高水平的遗传分化。研究结果对该濒危植物的保护有重要意义。考虑到低水平的遗传多样性和高水平的居群分化 ,通过居群间种子和幼苗的交换来促进基因流是可行的保护方案。迁地保护居群 (ML)不具最高的遗传多样性 ,表明为了保护此濒危物种的全部遗传变异 。 展开更多
关键词 Vatica guangxiensis RAPD genetic diversity conservation biology
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Compound Genetics Annealing Optimal Algorithm for Realization of Locus Deduction of a Plane Link 被引量:1
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作者 林晓通 林晓辉 +1 位作者 黄卫 王宁生 《Journal of Southeast University(English Edition)》 EI CAS 2002年第4期310-314,共5页
A compound algorithm of genetic annealing is designed for optimizing the luffing mechanism locus of a plane link by means of random optimal algorithm, genetic and annealing algorithm. The computing experiment shows th... A compound algorithm of genetic annealing is designed for optimizing the luffing mechanism locus of a plane link by means of random optimal algorithm, genetic and annealing algorithm. The computing experiment shows that the algorithm has much better steady convergence performance of optimal process and can hunt out the global optimal solution by biggish probability for objective function of multi peak value. 展开更多
关键词 genetic annealing algorithm luffing mechanism optimal algorithm
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Study on the Acute Toxicity and Genetics Toxicity of Bensulfuronk-methyl on Danio rerio 被引量:11
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作者 姜罡丞 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第4期128-131,共4页
[Objective] The aim was to study the effect of bensulfuron-methyl herbicide on acute toxicity and genetics toxicity of Danio redo. [ Method] Median lethal concentration was calculated by acute toxicity test, and analy... [Objective] The aim was to study the effect of bensulfuron-methyl herbicide on acute toxicity and genetics toxicity of Danio redo. [ Method] Median lethal concentration was calculated by acute toxicity test, and analyzing the herbicide whether existing in potential toxicity to aquatic organisms or not. Based on the study of acute toxicity, genetics toxicity was carried out, by calculating the micronucleus rate to judge bensulfuron-methyl herbicide whether existing in potential toxicity or not. [ Result ] The LD5o (24 h and 48 h) of bensulfuron-methyl herbicide are 0.698 ml/L and 0.637 ml/L respectively, the safe concentration was 0.159 ml/L. The results on the effects of micronucleus (MN) in erythrocytes of Danio redo induced by bensulfuron-methyl at different times and different concentrations showed that the MN rate of control group was 0.010 3%, the highest MN rate of experimental group reached to 0. 372%, it also indicated that bensulfuron-methyl herbicide had genetics toxicity to Danio redo. At the same detection time, there was dose-effect relationship of MN rate in erythrocytes between treatment and control groups with different concentrations. In the same treatment group, the MN rate in erythrocytes reached to peak value at 24 h, and decreased at 48 h and 72 h with the infection time was prolonged. [ Conclusion ] The study provides some basis for scientifically selecting and reasonably using herbicide. 展开更多
关键词 Danio rerio BENSULFURON-METHYL MICRONUCLEUS Acute toxicity genetics toxicity
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结合0.1K前景和16K背景芯片快速解析小麦新品系的基因组结构和重要性状遗传基础
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作者 李笑笑 相明杰 +9 位作者 刘胜杰 王晓婷 李杰 郑炜君 吴建辉 曾庆东 康振生 张传量 王长发 韩德俊 《麦类作物学报》 CAS 北大核心 2025年第1期52-62,共11页
为探索并建立基于小麦0.1K前景和16K背景芯片快速解析基因组结构和重要性状遗传基础的方法,对小麦新品系西农302及其亲本西农865和百农矮抗58分别进行苗期分小种和田间成株期抗病性鉴定,分析西农302及其亲本的抗条锈病特征,并利用小麦16... 为探索并建立基于小麦0.1K前景和16K背景芯片快速解析基因组结构和重要性状遗传基础的方法,对小麦新品系西农302及其亲本西农865和百农矮抗58分别进行苗期分小种和田间成株期抗病性鉴定,分析西农302及其亲本的抗条锈病特征,并利用小麦16K背景芯片对西农302及其亲本进行基因分型,根据亲本间16K芯片基因型的差异SNP位点,分别统计西农302来自双亲的基因组区段,确定西农302的基因组结构;利用小麦0.1K前景芯片对西农302及其亲本进行基因分型,确定西农302所含有的抗条锈病性基因/QTL位点,明确西农302的抗条锈病遗传基础,同时分析西农302所含有的其他重要性状相关优异等位基因/QTL。结果表明,西农302在苗期对中国流行的条锈病生理小种CYR32和CYR34均表现出微弱的抗性(IT=6),但在田间条件下表现出高水平成株期抗条锈性(IT=1,DS<5);西农865和百农矮抗58对西农302的遗传贡献率分别为64.28%和30.22%;西农302聚合了双亲的多个优异基因/QTL位点,同时含有多抗基因Lr27/Yr30/Sr2/Pbc1及其上位性互作基因YrFDC12/PbcFDC12、抗条锈病位点QYrak58.nwafu-7BL和QYrqin.nwafu-2AL、抗赤霉病位点QFhb.hbaas-5AS和QFhb.hbaas-5AL、矮秆基因Rht-2、Rht-8和QPht/Sl.cau-2D.1以及千粒重位点QGl-4A等重要性状相关基因/QTL。这说明0.1K前景选择和16K背景选择SNP芯片可以应用于小麦新品种(系)的基因组结构和重要性状遗传基础的解析;西农865和百农矮抗58对西农302的遗传贡献率存在显著差异,西农865的遗传贡献率约为百农矮抗58的2倍;西农302聚合了双亲的抗条锈病、抗赤霉病、矮秆和千粒重等多个重要性状相关优异基因/QTL。 展开更多
关键词 小麦 新品系 SNP 芯片 遗传构成
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青稞分蘖角度的QTL定位
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作者 杨景发 余鑫莲 +4 位作者 姚有华 姚晓华 王蕾 吴昆仑 李新 《作物学报》 CAS 北大核心 2025年第1期260-272,共13页
分蘖角度是青稞株型的主要构成因素,在提高青稞产量与抗倒伏性中发挥着极为重要的作用。为解析青稞分蘖角度的遗传机制,本研究以青稞品种‘达章紫’(株型松散)和‘昆仑10号’(株型紧凑)为亲本构建的RIL群体为材料,基于高密度遗传图谱,... 分蘖角度是青稞株型的主要构成因素,在提高青稞产量与抗倒伏性中发挥着极为重要的作用。为解析青稞分蘖角度的遗传机制,本研究以青稞品种‘达章紫’(株型松散)和‘昆仑10号’(株型紧凑)为亲本构建的RIL群体为材料,基于高密度遗传图谱,在多环境中进行青稞分蘖角度的QTL定位,并利用RIL群体衍生的剩余杂合系,对鉴定到的主效QTLqTA7H-1进行精细定位。在青稞7条染色体上共检测到9个控制分蘖角度的QTL,解释表型变异为6.41%~33.57%,其中,qTA3H-1和qTA7H-1为多环境共检测的主效QTL,平均加性效应分别为5.42°(增效)和-3.87°(减效);在减效QTL qTA7H-1初定位区间筛选到4个剩余杂合体,自交衍生F8:9近等基因系,在置信区间内加密设计14对分子标记对RHL群体极端单株进行检测,利用获得的5种交换类型单株,将qTA7H-1进一步界定在PC08(32,252,397)与PA10(41,790,765)约9.54Mb的物理区间内。本研究初步揭示调控青稞分蘖角度的遗传因子,为开展分蘖角度性状的遗传改良与分子设计育种奠定了基础。 展开更多
关键词 青稞 分蘖角度 QTL定位 主效位点
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基于SSR标记的青海蚕豆品种亲缘关系分析与指纹图谱构建
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作者 郑栋 周仙莉 +3 位作者 滕长才 侯万伟 张红岩 刘玉皎 《作物学报》 CAS 北大核心 2025年第1期79-90,共12页
为明确青海蚕豆育成品种、高代品系和骨干亲本的群体结构与亲缘关系,本研究利用46对多态性和稳定性好、重复性高的SSR引物对36个青海蚕豆主栽品种(品系)进行群体遗传学分析并构建了指纹图谱。结果表明,通过毛细管电泳检测,在46对引物中... 为明确青海蚕豆育成品种、高代品系和骨干亲本的群体结构与亲缘关系,本研究利用46对多态性和稳定性好、重复性高的SSR引物对36个青海蚕豆主栽品种(品系)进行群体遗传学分析并构建了指纹图谱。结果表明,通过毛细管电泳检测,在46对引物中检测到262个等位位点,各引物检测的多态性等位位点数(Na)为2~15,平均等位位点数为5.696个,平均每个位点检测到的有效等位基因数为2.988个,范围为1.180~9.257;Shannon指数的变化范围为0.287~2.444,均值为1.210;多态性信息含量(polymorphism information content, PIC)值变化范围为0.141~0.883,均值为0.553,揭示了青海蚕豆品种丰富的遗传多样性。系统聚类将36份材料划分为4个亚群,第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ亚群分别包括24、4、7、1份材料;群体结构与主坐标分析将材料划分为2个亚群,亚群Ⅰ和亚群Ⅱ分别包括17和19份材料,与聚类分类结果有一定程度的交叉重合,厘清了青海蚕豆主栽品种的群体遗传结构与亲缘关系。在此基础上,筛选出4对核心引物,构建了36份材料的指纹图谱,并将相关信息储存在二维码中。青海蚕豆主栽品种指纹图谱的构建不仅为青海蚕豆品种鉴定提供了有效工具,也为今后青海蚕豆品种亲本选配和新品种权保护提供了技术支撑。 展开更多
关键词 蚕豆 青海 主栽品种 SSR标记 亲缘关系 指纹图谱
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儿童药物难治性癫痫的遗传学及临床特征分析
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作者 左然然 孙素真 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2025年第6期756-762,共7页
背景目前儿童药物难治性癫痫(DRE)在儿童癫痫中的占比维持在30%左右,且常合并精神发育迟滞,影响患儿生活质量,因此DRE的诊疗仍然是神经病学的重大挑战。目的分析儿童DRE的遗传学特点及临床特征,为临床进行基因检测提供理论依据。方法回... 背景目前儿童药物难治性癫痫(DRE)在儿童癫痫中的占比维持在30%左右,且常合并精神发育迟滞,影响患儿生活质量,因此DRE的诊疗仍然是神经病学的重大挑战。目的分析儿童DRE的遗传学特点及临床特征,为临床进行基因检测提供理论依据。方法回顾性选取2020—2022年于河北省儿童医院住院治疗且完善基因检测的95例DRE患儿为研究对象,根据基因检测结果分为基因突变阳性组(44例)和基因突变阴性组(51例)。收集患儿的一般资料(包括性别、发病年龄、用药情况、发热惊厥史、癫痫家族史等)、临床特征(发作类型、癫痫综合征、发育情况)、辅助检查[基因检测、视频脑电图(VEEG)检查、神经影像学检查],分析DRE的遗传病因及临床特征。结果95例DRE患儿中,男55例(57.9%)、女40例(42.1%),中位发病年龄为1.00(0.50,4.00)岁,用药数量为3(2,4)种;基因突变阳性组患儿发病年龄小于基因突变阴性组(Z=-5.322,P=0.001);两组患儿性别、发热惊厥史、癫痫家族史、用药数量比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。38例(40.0%)的患儿确诊为癫痫综合征,其中76.3%(29/38)在新生儿或婴儿期发病;基因突变阳性组患儿癫痫综合征占比高于基因突变阴性组(χ^(2)=12.065,P=0.001)。临床发作类型多样,最常见的为2种及以上发作类型,占52.6%(50/95),其次为单一局灶性发作,占33.7%(32/95);两组DRE患儿发作类型比较,差异无统计学意义(χ^(2)=2.920,P=0.404)。57例患儿完善了发育筛查,其中43例(75.4%)在发病后出现不同程度的发育迟缓,33例(76.7%)表现为全面性发育迟缓;基因突变阳性组患儿发育迟缓占比高于基因突变阴性组(χ^(2)=5.728,P=0.017)。44例患儿检出变异基因,阳性检出率为46.3%,其中以离子通道类变异为主,SCN1A为最常见的单基因突变。90例(94.7%)患儿VEEG检查异常,以局灶性癫痫放电为主;基因突变阳性组患儿高峰失律占比高于基因突变阴性组(χ^(2)=7.425,P=0.006)。25例(26.3%)患儿存在结构性病因,其中基因突变阳性组12例,基因突变阴性组13例;两组DRE患儿结构性病因比较,差异无统计学意义(χ^(2)=0.039,P=0.844)。结论遗传因素为儿童DRE的重要病因,提示发病年龄小、发育迟缓与遗传性病因有关,应积极早期完善基因检测,有助于早期诊断DRE并精准治疗。 展开更多
关键词 药物难治性癫痫 儿童 遗传学 基因检测 癫痫综合征 临床特征 全面性发育迟缓
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肠道菌群与骨质疏松性骨折 被引量:1
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作者 赵文生 李孝林 +5 位作者 彭昌华 邓佳 盛浩 陈洪卫 张朝驹 何川 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第6期1296-1304,共9页
背景:骨质疏松性骨折是骨质疏松症最严重的并发症,既往的研究已经证实了肠道菌群对骨骼组织具有调节作用,肠道菌群与骨质疏松性骨折有着重要关系,但是二者之间的因果关系尚不清楚。目的:使用孟德尔随机化(MR)方法探索肠道菌群与骨质疏... 背景:骨质疏松性骨折是骨质疏松症最严重的并发症,既往的研究已经证实了肠道菌群对骨骼组织具有调节作用,肠道菌群与骨质疏松性骨折有着重要关系,但是二者之间的因果关系尚不清楚。目的:使用孟德尔随机化(MR)方法探索肠道菌群与骨质疏松性骨折之间的因果关系。方法:从IEU Open GWAS数据库和芬兰数据库R9中分别获得了肠道菌群和骨质疏松性骨折的GWAS数据集,以肠道菌群作为暴露因素,骨质疏松性骨折作为结局变量,采用随机效应逆方差加权法、MR-Egger回归、加权中位数法、简单模型法以及加权模型法进行孟德尔随机化分析来评估肠道菌群与骨质疏松性骨折之间是否存在因果关系,通过敏感性分析来检验结果的可靠性和稳健性,并进行反向孟德尔随机化分析来进一步验证正向孟德尔随机化分析中确定的因果关系。结果与结论:①此孟德尔随机化分析结果表明,肠道菌群与骨质疏松性骨折之间存在因果关系。放线菌目(OR=1.562,95%CI:1.027-2.375,P=0.037)、放线菌科(OR=1.561,95%CI:1.027-2.374,P=0.037)、放线菌属(OR=1.544,95%CI:1.130-2.110,P=0.006)、丁酸球菌属(OR=1.781,95%CI:1.194-2.657,P=0.005)、粪球菌属-2(OR=1.550,95%CI:1.068-2.251,P=0.021)、Family ⅩⅢ UCG-001属(OR=1.473,95%CI:1.001-2.168,P=0.049)、产甲烷短杆菌属(OR=1.274,95%CI:1.001-1.621,P=0.049)、罗氏菌属(OR=1.429,95%CI:1.015-2.013,P=0.041)的丰度升高,会增加患者骨质疏松性骨折的风险;②拟杆菌纲(OR=0.660,95%CI:0.455-0.959,P=0.029)、拟杆菌目(OR=0.660,95%CI:0.455-0.959,P=0.029)、克里斯滕森氏菌科(OR=0.725,95%CI:0.529-0.995,P=0.047)、瘤胃球菌科(OR=0.643,95%CI:0.443-0.933,P=0.020)、肠杆菌属(OR=0.558,95%CI:0.395-0.788,P=0.001)、直肠真杆菌属(OR=0.631,95%CI:0.435-0.916,P=0.016)、毛螺菌科-UCG008(OR=0.738,95%CI:0.546-0.998,P=0.048)、瘤胃梭菌属-9(OR=0.492,95%CI:0.324-0.746,P=0.001)的丰度升高,会降低患者骨质疏松性骨折的风险。③文章通过孟德尔随机化方法发现了16种与骨质疏松性骨折相关的肠道菌群,即以肠道菌群为暴露因素,骨质疏松性骨折为结局变量,8种肠道菌群与骨质疏松性骨折呈正向因果关联,另外8种肠道菌群与骨质疏松性骨折呈负向因果关联。④此研究结果不仅为临床上骨质疏松性骨折的早期预测及潜在治疗靶点确定了新的生物标志物,还为骨组织工程中研究通过肠道菌群改善骨质疏松性骨折的发生与预后提供了实验基础和理论依据。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 肠道菌群 骨质疏松性骨折 因果关系 遗传学 全基因组关联研究 单核苷酸多态性 工具变量 风险因素
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Prenatal ultrasonography and genetic analysis of fetal cleidocranial dysplasia:A case report
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作者 Feng Wang Pei-Feng Dai Wen-Juan Gao 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2025年第10期28-34,共7页
BACKGROUND Cleidocranial dysplasia(CCD)is an infrequent clinical condition with an autosomal dominant inheritance pattern.It is characterized by abnormal clavicles,patent sutures and fontanelles,supernumerary teeth,an... BACKGROUND Cleidocranial dysplasia(CCD)is an infrequent clinical condition with an autosomal dominant inheritance pattern.It is characterized by abnormal clavicles,patent sutures and fontanelles,supernumerary teeth,and short stature.Approximately 60%-70%of patients with CCD have mutations in the RUNX family transcription factor 2 gene.However,prenatal diagnosis of CCD is difficult when the family history is unknown.CASE SUMMARY We report a rare case of fetal CCD with an unknown family history,confirmed by prenatal ultrasonography and genetic testing at a gestational age of 16 weeks.The genetic reports indicated that the fetus carried pathogenic mutations in the RUNX family transcription factor 2 gene(c.674G>A).After careful consideration,the pregnant woman and her family decided to continue the pregnancy.CONCLUSION Definitive prenatal diagnosis of CCD should include family history,ultrasound diagnosis,and genetic analysis,especially if family history is unknown. 展开更多
关键词 Cleidocranial dysplasia Genetic analysis Ultrasonic diagnosis PRENATAL Case report
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