16S rDNA技术在鼻咽癌患者和正常人咽部细菌组成中的比较研究

目的比较分析鼻咽癌患者和正常人咽部标本中的细菌种类和比例,探讨细菌感染和鼻咽癌的关系。方法选择1 1例初次确诊的鼻咽癌患者以及1 1例与鼻咽癌患者年龄和性别匹配的健康对照者,两组1年内均未使用抗生素、化疗等药物。提取咽拭子中的细菌总DNA,针对1 6 S rDNA保守区设计通用引物进行PCR扩增,PCR产物克隆到T载体,在转化的白色克隆中随机挑选1 0 0个左右进行测序。将获得的1 6 S rDNA序列与网上已公布的1 6 S rDNA序列进行Blast比对,分析克隆群中细菌的种类和比例。结果1 1例鼻咽癌患者中9例结核分枝杆菌和奈瑟菌占优势菌群;另2例排第四和第五位,而在1 1例健康对照者中未发现结核分枝杆菌和奈瑟菌。鼻咽癌患者与健康对照者的菌群分布明显不同。结论用1 6 S rDNA技术发现鼻咽癌患者与正常人咽部细菌组成存在较大的差异,结核分枝杆菌和奈瑟菌感染可能与鼻咽癌相关。

新疆蒙古族和哈萨克族传统乳制品中乳酸菌多样性的比较

传统发酵乳制品是新疆少数民族不可或缺的一类食品,为了研究同一地区不同民族传统乳制品中乳酸菌种类的差异性,从新疆和布克赛尔县采集了17份哈萨克族酸奶和8份蒙古族酸奶,通过传统培养和16S rDNA基因序列分析方法共分离得到42株乳酸菌,有30株分离自哈萨克族样品,12株分离自蒙古族样品,其中优势菌群均为Pediococcus acidilactici(乳酸片球菌)。除了优势菌群,两种样品中都分离出了Lactobacillus plantarum(植物乳杆菌)和Enterococcus durans(耐久肠球菌)。哈萨克族样品中还分离出了Lactobacillus fermentum(发酵乳杆菌)、Lactobacillus paracasei(类干酪乳杆菌)、Lactobacillus crustorum(面包乳杆菌),而蒙古族样品中分离出了Weissella cibaria(食窦魏斯氏菌)。

桶装胀罐番茄酱中腐败菌分离纯化及鉴定研究

从胀罐番茄酱中分离出12株菌,并对这12株菌进行传统形态学、生理生化特性鉴定,得出在这12株菌株中有4株芽孢杆菌,3株酵母菌,3株链球菌,2株霉菌。经过反证实验得出导致番茄酱胀袋的主要微生物是芽孢杆菌,酵母菌和霉菌,并通过16S rDNA序列分析及构建系统发育树对优势菌群芽孢杆菌鉴定为4个种,分别为:枯草芽孢杆菌,短小芽孢杆菌,凝结芽孢杆菌和蜡样芽孢杆菌。确定了导致桶装番茄酱胀袋的腐败菌。

细菌型豆豉发酵菌株的鉴定

为了明确细菌型豆豉发酵菌株的身份,首先采用形态及生理生化方法进行鉴定,接着提取该菌株的基因组DNA,并根据芽孢杆菌属16S rDNA序列两端的保守性片段设计引物,然后用PCR方法扩增出16S rDNA部分序列,纯化、测序,最后经BLAST搜索进行序列比对和构建系统进化树。结果表明,菌株BBDC3为革兰氏阳性芽孢杆菌,生理生化特征与枯草芽孢杆菌相符;扩增出的16S rDNA部分序列长为1344bp,与序列号为EF488171的枯草芽孢杆菌16S rDNA序列的相似度最高,为99%;系统进化树中,菌株BBDC3与枯草芽孢杆菌AB018487在同一分支。因此,菌株BBDC3属于枯草芽孢杆菌。

土霉素降解菌的筛选及其降解条件优化

利用富集培养的方法,将采自葫芦岛市某畜禽养殖堆肥场周边土壤样品进行分离纯化并筛选出土霉素优势降解菌株(命名为YH1),通过形态观察,菌落边缘不整呈灰白色中心凸起似草帽状,采用16S rDNA基因序列分析该菌株为短波单胞菌属(Brevundimonas sp.),并对培养条件与降解特性进行优化,该菌株在温度30℃、pH值为6.0、土霉素质量浓度300mg/L、装液量80mL时,降解率最高可达到70.34%.此外,添加不同的碳源或氮源和金属离子对菌株降解能力均有影响,其中加入2g/L可溶性淀粉,麦芽糖时可提高菌株的降解率,添加1g/L的Fe^(3+)和Cu^(2+)时可提高菌株的降解率;而Cd^(2+)、Mn^(2+)可明显抑制其降解率.