贵州黑山羊ADD1基因克隆、生物信息学及组织表达规律研究

为了分析贵州黑山羊ADD1基因编码区序列(coding sequence, CDS)信息及在组织中的表达规律,试验克隆了贵州黑山羊ADD1基因CDS并进行了生物信息学分析,同时分析了该基因在12月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达规律,以及在1,3,6,9,12月龄贵州黑山羊皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达时序情况。结果表明:贵州黑山羊ADD1基因CDS大小为2 304 bp,编码767个氨基酸,与山羊ADD1基因序列相似性较高,与禽类的相似性较低;ADD1蛋白中的主要氨基酸为丝氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)、谷氨酸(Glu)和亮氨酸(Leu),含量分别为9.0%、8.7%、8.5%、8.2%,分子质量为84.05 ku,分子式为C_(3682)H_(5840)N_(1036)S_(24),理论等电点为5.74,为不稳定蛋白和亲水蛋白,主要定位在细胞核中,与ADD蛋白家族(ADD2和ADD3)、加帽蛋白(capping actin protein, CAPG)、肌侵蛋白(myotrophin, MTPN)、X盒结合蛋白1(X-box binding protein 1,XBP1)、固醇调节元件结合蛋白1(sterol-regulatory element-binding protein 1,SREBP1)等蛋白存在相互作用,二级结构和三级结构中主要含有α螺旋和无规则卷曲;ADD1基因在12月龄贵州黑山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、皮下脂肪、背最长肌和腿肌组织中均有表达,皮下脂肪中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),其次在心脏、背最长肌、肝脏和腿肌中表达量较高,在脾脏中表达量最低。ADD1基因在1,3月龄贵州黑山羊脂肪、背最长肌和腿肌组织中的表达量均较低。在脂肪组织中6月龄时最高,极显著高于其他月龄(P<0.01);3月龄时最低,极显著低于其他月龄(P<0.01)。在背最长肌中9,12月龄较高,二者差异不显著(P>0.05),但均极显著高于其他月龄(P<0.01);6月龄表达量最低,与1月龄差异不显著(P>0.05),但二者均极显著低于其他月龄(P<0.01)。在腿肌中9月龄时最高,极显著高于其他月龄(P<0.01);12月龄最低,与1月龄差异不显著(P>0.05),但二者均极显著低于其他月龄(P<0.01)。说明ADD1基因在贵州黑山羊各组织中的表达具有广谱性和差异性。

网络最大流问题求解的符号ADD增广路径算法

本文通过对网络及网络最大流问题的符号代数判定图(ADD)描述,将网络中的结点和边用ADD隐式表示,并利用Gabow的容量变尺度算法的主要思想,将一般网络最大流问题化为一系列的单位容量网络最大流问题,结合Hachtel等的单位容量网络最大流问题的求解算法,给出了网络最大流问题求解的符号ADD增广路径算法,简称为符号ADD算法。与Dinic算法、Karzanov算法相比,本文算法的空间复杂度得到了改善。实验结果表明,本文算法是切实有效的,且可处理更大规模的问题。

基于ArcGIS的Python Add-In开发浅析

ArcGIS将Python与Desktop中的Python Add-In(加载项)组合,为用户提供了一种简单的扩展开发Desktop功能的解决方案。本文简要介绍这一技术流程,从而引导GIS工作人员灵活定制插件。

基于ArcGIS Add-in转化生产生态系统分类数据工具的设计与实现

基于已有生态系统分类数据成果的转化生产是快速获取生态系统分类数据的有效手段。为解决当前ArcGIS软件基础功能无法满足快速化和批量化数据转化生产要求的问题,本文在Visual Studio 2012开发环境下,采用C#语言,基于ArcGIS Add-in插件式开发技术,设计并实现了生态系统分类数据生产辅助工具。结果表明,该工具在减少作业量的同时,能够保证数据生产的质量,有效提高了项目的生产效率。

H-FABP、MC4R、ADD1基因多态性在3个猪群中分布及其与肌内脂肪和背膘的相关研究

具有不同遗传特性的猪种具有不同的肉质性状,尤其是地方品种和引进品种间在肉质性状上存在极大的差异。在已有的研究中,HFABP,MC4R,ADD1基因同肌内脂肪或背膘相关。利用梅山猪、苏太猪和杜×长×大猪为试验动物,研究上述3个基因的多态性分布和多态性同肌内脂肪和背膘的相关性。结果表明:3个基因的多态性分布在不同猪种间存在极显著的差异,这种差异可能是肌内脂肪(IMF)或背膘(BF)不同的主要原因之一。相关分析表明:HFABP和ADD1基因多态性同IMF有显著的相关,但是同BF没有显著的相关;MC4R基因的多态性同IMF和BF都有显著相关性。说明:HFABP和ADD1基因多态性有可能应用到提高IMF同时不影响BF的育种实践中。

ADD1基因PCR-SSCPs标记与猪肌内脂肪含量及背膘厚的关系

采用PCR SSCPs方法在苏太猪脂肪细胞定向分化因子 1(ADD1)基因第 347和 374位点发现单核苷酸多态性(SNP) ,分别为ADD1第 90和 99位氨基酸密码子的第 3位碱基 ,但这两个位点碱基的替换均没有引起氨基酸序列的变化。通过对 10 0头苏太猪肥育猪背最长肌中肌内脂肪含量的相关分析 ,发现杂合子AB肌内脂肪含量最高 ,极显著地高于AA纯合子 (P <0 0 1) ,BB纯合子肌内脂肪含量介于AB和AA之间 ,并有高于AA纯合子的趋势 (P =0 11)。各基因型间背膘厚没有显著差异。提示ADD1基因该位点上的PCR SSCPs可能作为选择肌内脂肪含量 。

基于ADD正实网络的车辆ISD悬架优化设计与性能研究

利用无源车辆ISD(inerter spring damper)悬架系统可有效抑制车身低频振动的特性,结合经典加速度驱动阻尼(acceleration driven damping,ADD)控制可抑制车身中高频振动的特点,提出基于ADD正实网络的车辆ISD悬架综合优化设计方法,将车辆ISD悬架的宽频域振动抑制问题转化为基于ADD网络综合的正实优化控制问题。分别构建一阶和二阶正实网络的悬架动态模型,基于鱼群算法优化悬架结构参数,仿真分析ADD控制与正实网络的耦合作用机理和正实网络阶次对悬架性能的影响。结果表明:悬架的隔振性能随正实网络阶次的升高而提升,ADD网络综合的方法可以有效的实现车辆ISD悬架的宽频域的振动抑制,进一步拓展车辆ISD悬架主动控制的思路。

西藏牦牛ADD1基因第2外显子的PCR-SSCP检测及序列分析

利用PCR-SSCP和DNA测序方法对帕里牦牛、工布江达牦牛、类乌齐牦牛、康布牦牛、桑日牦牛、巴青牦牛、江达牦牛、斯布牦牛、嘉黎牦牛、桑桑牦牛、丁青牦牛等西藏11个牦牛类群共483头牦牛的ADD1基因(被认为是极可能影响肉质的候选基因)第2外显子序列进行遗传多态性分析。结果表明,66 bp处碱基T缺失和256 bp处A→G突变,共有AA、AB、BB 3种基因型;其中帕里牦牛只有AA基因型,江达牦牛只有AB基因型,康布牦牛、嘉黎牦牛、巴青牦牛、桑日牦牛、斯布牦牛均缺少BB基因型,丁青牦牛、类乌齐牦牛缺少AB型,均存在严重偏态;桑桑牦牛、工布江达牦牛中存在AA、AB、BB 3种基因型。除江达牦牛外,其它10个牦牛类群中AA为优势基因型,A基因为优势等位基因,分布较高。除帕里牦牛、巴青牦牛外,其它9个牦牛类群均处于中度多态(0.25<PIC<0.50),遗传变异较大。

ADDplus-带翼可调节置换系统在治疗下颈椎骨折脱位合并脊髓损伤中的应用

目的探讨德国百优ADD plus-带翼可调节置换系统在颈椎前路减压、植骨融合、内固定治疗下颈椎骨折脱位合并脊髓损伤中的应用价值。方法采用ADD plus-带翼可调节置换器对12例下颈椎骨折脱位合并脊髓损伤患者进行前路切开复位、减压、植骨融合内固定手术治疗。结果全部患者获得12～24个月的随访。内固定、减压、植骨融合术后4个月获得牢固的骨性融合,调节器体内位置良好,无松动断裂,颈椎椎间高度和生理曲度纠正,术后患者感觉、运动功能得到不同程度的恢复。术后1例出现低钠血症,其余患者无术后并发症。结论采用ADD plus-带翼可调节置换器行颈椎前路切开复位、内固定减压、植骨融合术治疗下颈椎骨折脱位合并脊髓损伤,可使颈椎损伤节段获得早期稳定复位、减压及充分融合,改善明显感觉和运动功能。ADD plus-带翼可调节置换系统操作安全、简单、材料生物相容性好、内固定效果确定,为早期行颈椎前路手术创造了良好的条件。

山羊ADD1基因部分序列的克隆与分析

提取湘东黑山羊基因组总DNA，用所设计的3对引物以聚合酶链式反应扩增山羊ADD1（Adipocyte Determination and Differentiation factor-1）基因，并进行克隆测序。序列分析表明所克隆的山羊ADD1基因包含exon 2～8、intron 2～7序列，将序列提交GenBank，获2个登录号：DQ480338、DQ487874；对编码序列（exon 2～8）与牛、人同区域进行Blast对比，同源性分别达到了96．14％和83．82％，所翻译氨基酸序列与牛属同源性更高达97．9％；此外，通过不同引物的测序结果比较，分别在exon6的第42处和intron6的第82处发现了一个碱基突变（C→T）和碱基插入／缺失（G／-），前者属于沉默突变，未引起氨基酸的变化。

基于Python的ArcGIS Add-In开发及案例应用

在分析Python语言优越性的基础上,系统梳理了ArcGIS中按钮、工具、选项框、菜单、工具条、工具选项板、应用扩展等Add-In的内涵、依存关系及其存储形式,提出了面向任务的ArcGISAdd-In开发技术流程,并利用开发实例对开发过程进行论证。实验表明,利用Python对ArcGISAdd-In进行定制开发,能有效解决实际生产中空间数据处理的动态和多样性需求,其方法和过程具有一定的参考价值。

九龙牦牛H-FABP与ADD1基因的表达谱研究

为了研究心脏型脂肪酸结合蛋白（Heart fatty acid—binding protein，H—FABP）与脂肪细胞决定和分化因子1（Adipocyte determination and differentiation factor-1，ADD1）在九龙牦牛肉质形成中的作用，试验以九龙牦牛为研究对象，利用半定量RT—PCR检测其在九龙牦牛不同组织和不同发育阶段的表达差异，获得其组织表达和时序表达谱。结果表明：检测到H—FABP基因在九龙牦牛的心脏、脾脏、背最长肌和脂肪组织中表达，在肝脏和肾脏中未表达；ADDl基因仅在九龙牦牛的背最长肌和脂肪中表达，在心脏、肝脏、脾脏和肾脏中均未表达。时序表达谱分析结果显示，H—FABP与ADD1基因在0．5岁牦牛背最长肌中的表达丰度显著高于3．5～5．5岁和9岁以上的牦牛（P〈0．05），3．5—5．5岁牦牛背最长肌中的表达丰度显著高于9岁以上的牦牛。

山羊ADD1基因exon13～18、intron13～17序列的克隆分析

提取湘东黑山羊基因组总DNA,用所设计的引物以聚合酶链式反应扩增山羊ADD1基因,并进行克隆测序。通过对克隆所得片段的测序结果分析,得到了山羊ADD1基因外显子（exon）13～18、内含子（intron）13～17序列,并将序列提交GenBank,获两个序列号：DQ483057、DQ455606;对编码序列（exon 13～18）与牛、人同区域进行Blast对比,同源性分别达到了97.43%和86.12%。聚类分析结果表明,在6个物种中,牛与山羊ADD1基因的同源性最高,其它几个物种间同源系数相差不大,在83%至89%之间。

ADD1基因Gly460Trp多态性与原发性高血压发病相关性的Meta分析

目的 系统评价ADD1基因Gly460Trp多态性与原发性高血压发病风险的相关性。方法 查计算机检索PubMed、Embase、CBM、VIP、Wanfang Data和CNKI，查找关于ADD1基因Gly460Trp多态性与原发性高血压发病相关性的病例对照研究，检索时限均为各数据库建库至2015年8月。由两名评价员同时进行文献筛选及资料提取，采用Stata 12.0软件进行Meta分析。结果 共纳入文献43篇，包括12 309例原发性高血压患者，13 833例对照。Meta分析结果显示，ADD1基因Gly460Trp多态性与原发性高血压之间的相关性在等位基因模型（T vs. G：OR=1.10，95%CI：1.03～1.17）、显性基因模型（TT+GT vs. GG：OR=1.10，95%CI：1.00～1.20)、隐性基因模型（TT vs. GG+GT：OR=1.17，95%CI：1.07～1.29）和纯合子模型（TT vs. GG：OR=1.20，95%CI：1.06～1.35）中有统计学意义，尤其是在亚洲人群中。结论 本Meta分析表明，ADD1基因Gly460Trp位点多态性与原发性高血压发病风险有相关性，尤其是亚洲人群。

用Add-in提高VC 6.0集成开发环境的查错能力研究

用VC 6.0集成开发环境设计程序时,若同一复合类型的声明在多个文件中出现且不一致,可能导致程序运行错误,但该开发环境不能发现这样的问题.为此,用该开发环境开发了运行于该开发环境之中又能与该开发环境进行交互的Add-in程序.通过对该开发环境中正在开发的其他活动项目的所有源文件和头文件的自动分析,当发现存在复合类型的重复声明时,根据安装选项指定的方式提示程序员检查程序,提高了VC 6.0集成开发环境的查错能力.

基于COM Add-ins技术的Excel成绩统计插件开发

COM Add-ins技术是O ffice 2000/XP提供的一种新技术,该技术基于COM技术来扩展O ffice软件的功能。讨论了在Excel下COM Add-ins技术的实现方法,然后给出了用该技术实现成绩统计功能的具体步骤和主要代码。

ADD1基因多态性位点与猪肌内脂肪含量、嫩度及背膘厚的关联性研究

将82头藏猪和84头其他品种猪屠宰后测定背膘厚,采集背部最长肌测定肌内脂肪含量和嫩度。采集血样提取DNA,利用PCR-RFLP分析ADD1基因的基因型,发现藏猪和其他猪种中均能检测到三种基因型AA、AB和BB。三种基因型的肌内脂肪含量和嫩度存在差异(P<0.05),而背膘厚不存在差异(P>0.05)。ADD1基因在藏猪和其他猪种中存在多态性位点,可以作为肌内脂肪选育的标记辅助选择位点。

脂肪细胞定向和分化因子1(ADD1)基因的研究进展

脂肪细胞定向和分化因子1(ADD1)是重要的核转录因子。ADD1不但是脂肪分化过程中重要的转录因子,同时还可以调控与脂肪代谢相关酶基因的表达。在人类和老鼠的研究发现ADD1基因与肝脏、脾脏等非脂肪组织的脂肪沉积有明确的连锁关系。实验研究提示:ADD1基因可能是影响动物肉质性状和屠体性状的候选基因。

Beta-adducin(Add2)基因rs3755351多态性与高血压遗传易感的相关性研究

目的探讨Beta-adducin（Add2）基因的rs3755351单核苷酸多态性与福建和广东人群中高血压发病的相关性。方法应用MassARRAY-IPLEX技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱平台（Matrix-assisted laser desorption/ionization time of fight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS）对广东和福建940例高血压患者和944名健康查体者对照进行Add2基因rs3755351位点的基因分型。用χ2检验统计分析病例组和对照组基因型和等位基因的频率;采用非条件Logistic回归分析,计算比值比（OR）和95%CI,评价多态性位点与高血压遗传易感性的相关性。结果 Add2基因rs3755351多态位点有AA,AC和CC三种基因型,在隐性模型中,Add2基因的rs3755351多态位点AA、AC-CC基因型在福建高血压人群中的分布频率为10.5%和89.5%,与对照组（14.2%、85.8%）相比差异有统计学意义（P〈0.05）,与AC或CC基因型相比,携带AA基因型能显著降低患高血压的发病危险（OR=0.65,95%CI：0.43~0.99,P=0.044）;rs3755351的AA、AC和CC基因型在广东高血压人群中的分布频率为15.1%、53.0%和31.8%,与对照组（12.4%、52.4%和35.2%）相比差异无统计学意义（P〉0.05）。结论 Add2基因的rs3755351多态位点与福建人群的高血压遗传易感性相关,与AC或CC基因型相比,携带AA基因型能显著降低患高血压的发病危险;rs3755351在广东人群中未发现与高血压的遗传易感性相关。

用Add-in减少VC6.0中goto语句使用错误的研究

用VC 6.0设计程序时,在有返回值的函数中,若使用了goto语句却未返回一个值,将导致程序陷入死循环,但VC 6.0不能发现这样的错误.为此,用VC 6.0开发了运行于其中、又能与其进行交互的Add-in程序.它对VC 6.0中活动项目的所有源文件和头文件进行自动分析,当发现使用了goto语句的函数可能出现这样的错误时,提示程序员检查程序,从而提高了VC 6.0的查错能力.