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Molecular analysis of rice plants harboring a multi-functional T-DNA tagging system 被引量:3
1
作者 Yimian Ma Luo Liu +10 位作者 Chengguang Zhu Changhui Sun Bo Xu Jun Fang Jiuyou Tang Anding Luo Shouyun Cao Gupo Li Qian Qian Yongbiao Xue Chengcai Chu 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2009年第5期267-276,共10页
About 25,000 rice T-DNA insertional mutant lines were generated using the vector pCAS04 which has both promoter-trapping and activation-tagging function. Southern blot analysis revealed that about 40% of these mutants... About 25,000 rice T-DNA insertional mutant lines were generated using the vector pCAS04 which has both promoter-trapping and activation-tagging function. Southern blot analysis revealed that about 40% of these mutants were single copy integration and the average T-DNA insertion number was 2.28. By extensive phenotyping in the field, quite a number of agronomically important mutants were obtained. Histochemical GUS assay with 4,310 primary mutants revealed that the GUS-staining frequency was higher than that of the previous reports in various tissues and especially high in flowers. The T-DNA flanking sequences of some mutants were isolated and the T-DNA insertion sites were mapped to the rice genome. The flanking sequence analysis demonstrated the different integration pattern of the right border and left border into rice genome. Compared with Arabidopsis and poplar, it is much varied in the T-DNA border junctions in rice. 展开更多
关键词 rice mutant population promoter trap activation tag t-dna integration
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插入T-DNA片段构建部分水稻突变体株系 被引量:6
2
作者 程英豪 郑文明 +4 位作者 瞿礼嘉 顾红雅 任波 薛绍白 陈章良 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期313-321,共9页
通过农杆菌Agrobacterium tumefaciens介导,将T-DNA片段高效插入水稻中花11的基因组DNA中。利用二次枝梗种子和未成熟种子的盾片愈伤组织作为转化起始物,探索并优化了影响愈伤组织诱导率、再生率和转化率的试验条件,得到近10 000株转化... 通过农杆菌Agrobacterium tumefaciens介导,将T-DNA片段高效插入水稻中花11的基因组DNA中。利用二次枝梗种子和未成熟种子的盾片愈伤组织作为转化起始物,探索并优化了影响愈伤组织诱导率、再生率和转化率的试验条件,得到近10 000株转化植株。经PCR分析和Southern 杂交证明已将外源基因整合到水稻基因组中。当代转基因植株可抗0.2%的除草剂Basta。200余棵T0代转化株系出现白化苗、宽叶、狭叶、黄叶、高秆、矮化并杂草化、不育、白化穗、皱穗和抽穗延迟等突变表型,结实率普遍较低。对3个转基因水稻突变株的子代进行bar基因分析发现,bar基因在子代中呈现3∶1的分离规律。试验中发现了转基因子代的突变征状的分离与bar基因的分离相一致现象。对具有突变征状的转基因水稻植株进行T-DNA 边序分析发现这些突变很可能与T-DNA插入有关。 展开更多
关键词 水稻 突变体 t-dna标签 农杆菌介导 愈伤组织 除草剂抗性 转基因植株
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水稻小粒矮突变性状与T-DNA插入标签的共分离检测 被引量:3
3
作者 马玉银 张亚芳 +6 位作者 潘存红 李爱宏 吴旭江 左示敏 陈宗祥 吴昌银 潘学彪 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期571-577,共7页
从T-DNA水稻标签系中发现1个标签系中出现了小粒矮(sgd)突变性状的分离。为克隆该突变基因和进行基因功能研究,对该突变体进行了遗传分析。该标签系存在多个插入事件,且T3代发现目标突变性状分离系中,另一个非目标插入事件已经纯合,故特... 从T-DNA水稻标签系中发现1个标签系中出现了小粒矮(sgd)突变性状的分离。为克隆该突变基因和进行基因功能研究,对该突变体进行了遗传分析。该标签系存在多个插入事件,且T3代发现目标突变性状分离系中,另一个非目标插入事件已经纯合,故特异PCR检测不能确认小粒矮突变性状与T-DNA插入共分离。但通过TAIL-PCR方法,获得了插入点侧翼的水稻基因组序列,并证实该侧翼序列与小粒矮突变性状共分离。 展开更多
关键词 T—DNA标签技术 侧翼序列 共分离 水稻 小粒矮突变
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T-DNA标签在植物基因组中的应用 被引量:4
4
作者 杨奇志 郑继刚 +1 位作者 赵琦 孔建强 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2004年第1期40-45,共6页
随着大量被转化植物群体的获得 ,以及基因组测序技术的发展 ,T DNA标签逐渐被用于基因功能的确定 .本文重点介绍如何用T
关键词 t-dna标签 植物基因组 拟南芥 农杆菌 基因标签法
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T-DNA标签在植物基因克隆和功能分析中的应用 被引量:4
5
作者 侯雷平 李梅兰 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期1066-1070,共5页
在植物功能基因组学的研究中,插入突变已成为迅速识别和研究标签基因的一个有效遗传工具.本文介绍了T-DNA标签的概念及应用前提,详细论述了T-DNA标签在大规模植物基因功能分析中的应用以及使用启动子和增强子诱捕技术分离时空特异性启... 在植物功能基因组学的研究中,插入突变已成为迅速识别和研究标签基因的一个有效遗传工具.本文介绍了T-DNA标签的概念及应用前提,详细论述了T-DNA标签在大规模植物基因功能分析中的应用以及使用启动子和增强子诱捕技术分离时空特异性启动子和表达基因,另外还分析了利用其特殊形式激活标签进行基因克隆和功能分析的优越性,并展望了T-DNA标签的应用前景. 展开更多
关键词 植物 t-dna标签 突变体 基因克隆 功能分析
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水稻T-DNA插入启动子捕获系的初步筛选 被引量:1
6
作者 胡昌泉 刘华清 +2 位作者 李素一 潘大仁 王锋 《福建农业学报》 CAS 2011年第2期143-147,共5页
利用农杆菌介导法将含报道基因β-glucuronidase(GUS)无启动子的转化载体pCAMBIA1300GUSA-Hyg导入籼稻明恢86获得水稻启动子捕获系。水稻启动子捕获系潮酶素抗感分离比χ2分析表明:39个水稻启动子捕获系中有28个为单T-DNA位点插入。2 65... 利用农杆菌介导法将含报道基因β-glucuronidase(GUS)无启动子的转化载体pCAMBIA1300GUSA-Hyg导入籼稻明恢86获得水稻启动子捕获系。水稻启动子捕获系潮酶素抗感分离比χ2分析表明:39个水稻启动子捕获系中有28个为单T-DNA位点插入。2 653个水稻启动子捕获系报告基因GUS表达检测结果表明:83个水稻启动子捕获系在其不同时期、不同器官(包括根、茎、叶、花药、颖壳、胚、胚乳等组织)中检测到GUS表达。其中GUS活性在胚乳有表达的水稻启动子捕获系24个,占检测总数0.91%;GUS活性在花药中有表达的水稻启动子捕获系为19个,占检测总数0.72%。 展开更多
关键词 水稻 启动子捕获系 t-dna标签
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影响辣椒T-DNA标签突变体库构建的转化因素探讨 被引量:3
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作者 黄妤 张金谌 +1 位作者 戴雄泽 张学文 《湖南农业科学》 2008年第2期36-38,共3页
以辣椒自交系H8124无菌苗子叶和下胚轴为外植体,采用根癌农杆菌侵染转化法,将T-DNA标签导入辣椒,以探讨影响转化效率的主要因素,包括外源植物生长调节剂浓度、农杆菌类型、外植体材料、预培养时间、侵染时间等。结果表明,采用苗龄10-15 ... 以辣椒自交系H8124无菌苗子叶和下胚轴为外植体,采用根癌农杆菌侵染转化法,将T-DNA标签导入辣椒,以探讨影响转化效率的主要因素,包括外源植物生长调节剂浓度、农杆菌类型、外植体材料、预培养时间、侵染时间等。结果表明,采用苗龄10-15 d的子叶为外植体,预培养2 d后用农杆菌GV3101侵染5 min,外源植物生长调节剂为5.0mg/L 6-BA,辣椒的T-DNA转化可以获得较高的转化效率。 展开更多
关键词 辣椒 t-dna标签 转化效率
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水稻T-DNA插入突变技术研究 被引量:2
8
作者 吕亚慈 《衡水学院学报》 2009年第1期45-47,共3页
随着水稻基因组全序列的测定完成,功能基因组学已成为重点研究内容.农杆菌介导的T-DNA标签法是近年发展起来的一种有效的分子生物学技术.它具有程序简便,转化效率高,大规模转化等特点.阐述了T-DNA标签法及其改进后的激活标签技术和增强... 随着水稻基因组全序列的测定完成,功能基因组学已成为重点研究内容.农杆菌介导的T-DNA标签法是近年发展起来的一种有效的分子生物学技术.它具有程序简便,转化效率高,大规模转化等特点.阐述了T-DNA标签法及其改进后的激活标签技术和增强子技术的特点,并介绍了T-DNA插入突变在水稻突变体库的建立中所取得的研究进展,从而表明T-DNA插入突变技术是水稻功能基因组研究的一个有效途径. 展开更多
关键词 水稻 t-dna标签 激活标签技术 捕获标签技术 功能基因组
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T-DNA标签法在水稻功能基因组研究中的应用
9
作者 唐忠海 覃静萍 +2 位作者 储成才 彭国平 饶力群 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2005年第6期1-3,共3页
农杆菌介导的T-DNA标签法是近年发展的一种有效的分子生物学技术。综述了T-DNA标签法的特点及其在水稻功能基因组研究中应用的进展。
关键词 T—DNA标签 功能基因组 水稻
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应用T-DNA标签进行基因功能分析的步骤和方法
10
作者 侯雷平 李梅兰 《黑龙江农业科学》 2008年第4期14-16,共3页
概述了应用T-DNA标签进行基因功能分析的步骤及获得突变体后标签基因的分离方法,对应用T-DNA标签进行基因功能分析研究具有一定的参考价值。
关键词 t-dna标签 分析步骤 基因克隆 功能分析
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适于杨树功能基因组研究的T-DNA激活标签构建 被引量:2
11
作者 王曙光 栾维江 +2 位作者 乔桂荣 孙宗修 卓仁英 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2007年第4期586-590,共5页
With the completion of the Populus genome sequence in 2006,the study on functional genomics in Populus has become a major task.Establishment of Populus mutant population is an essential approach for forestry functiona... With the completion of the Populus genome sequence in 2006,the study on functional genomics in Populus has become a major task.Establishment of Populus mutant population is an essential approach for forestry functional genomics study.The activation tagging is a promising and powerful method to construct mutant library of Populus and to further discover new gene and elucidate its function now.A novel T-DNA activation tagging pCAS05 was constructed for forest functional genomics in this study.We could select conveniently and easily transgenic plants by spraying Basta because bar gene is constructed in this vector as a selection marker.Moreover,we could also construct a large scale mutant library in Populus by this activation tagging because of effectively selection of bar gene. 展开更多
关键词 杨树 t-dna激活标签 功能基因组学 BAR基因
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T-DNA标签技术及其在植物功能基因组研究中的应用
12
作者 杨永智 《青海大学学报(自然科学版)》 2006年第6期34-39,共6页
综述了T-DNA转移和整合机理的研究进展,植物T-DNA标签的种类和特点及其在功能基因组研究中的应用。
关键词 T—DNA T—DNA标签 植物功能基因组学 突变
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T-DNA标签在转基因水稻基因组中的整合特点 被引量:1
13
作者 李述田 田颖川 何朝族 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第10期912-917,共6页
利用热不对称交错PCR (TAIL PCR) ,对 2 0 0个含T DNA插入的转基因水稻株系进行分析 ,获得了 15 9个T DNA右边界侧翼序列 .其中 ,92个序列含有T DNA右边界和侧邻的水稻基因组序列 ,78个序列与已公布的水稻BAC/PAC克隆有 97%~ 10 0 %的... 利用热不对称交错PCR (TAIL PCR) ,对 2 0 0个含T DNA插入的转基因水稻株系进行分析 ,获得了 15 9个T DNA右边界侧翼序列 .其中 ,92个序列含有T DNA右边界和侧邻的水稻基因组序列 ,78个序列与已公布的水稻BAC/PAC克隆有 97%~ 10 0 %的同源性 ,从而可作为T DNA标签定位在水稻的 12条染色体上 .结合先前定位的 16 9个T DNA标签 ,对T DNA在水稻基因组中的整合特点进行了分析 .结果发现 ,在T DNA右边界和侧邻的水稻基因组序列的连接处 ,14 6 %的T DNA标签含有 3~ 74bp的填充序列 .在不含填充序列的连接处 ,2 1 3%的T DNA标签 ,在整合后的T DNA右边界与侧翼的水稻基因组序列之间显示出 3~ 5bp的微同源性 .填充序列和微同源性的存在 ,揭示了T DNA在水稻基因组中的整合既存在双链断裂修补机制 ,又存在单链裂缝修补机制 .T DNA倾向于整合到富含A/T核苷酸的基因组区域 ,即主要在基因的 5′和 3′端调控区以及内含子中 . 展开更多
关键词 水稻(Oryza SATIVA L.)基因组 t-dna标签 整合特点
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质粒拯救型T-DNA标签质粒的构建 被引量:1
14
作者 张金谌 张学文 戴雄泽 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第34期11016-11018,共3页
[目的]为了高效率地获得转基因植物的旁邻序列。[方法]以pUC18及pWM101为出发质粒,通过用限制性内切酶EcoRⅠ和HindⅢ双酶切质粒pUC18,得到含大肠杆菌复制起点及氨苄青霉素抗性基因的pUC18大片断,并将这段DNA整合到pWM101的T-DNA之中构... [目的]为了高效率地获得转基因植物的旁邻序列。[方法]以pUC18及pWM101为出发质粒,通过用限制性内切酶EcoRⅠ和HindⅢ双酶切质粒pUC18,得到含大肠杆菌复制起点及氨苄青霉素抗性基因的pUC18大片断,并将这段DNA整合到pWM101的T-DNA之中构建重组质粒。[结果]该质粒利用根癌农杆菌转化植物后,可利用潮霉素筛选转化细胞,拯救质粒则可转化大肠杆菌后,以氨苄青霉素进行筛选。[结论]该研究为以后的用T-DNA标签研究植物功能奠定了基础。 展开更多
关键词 PUC18 pWM101 t-dna标签 重组构建
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甜瓜T-DNA插入突变体的构建
15
作者 许荣华 姜陆 +1 位作者 宁雪飞 李冠 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1048-1053,共6页
【目的】构建激活标签载体并将其转入甜瓜中,获得甜瓜T-DNA插入突变体,为甜瓜功能基因组学的研究奠定基础。【方法】用PCR法扩增目的 DNA片段,经EcoRI和Sac I顺序酶切,将目的片段连接到p CAMBIA2301载体上,构建含4×35s Enhancer DN... 【目的】构建激活标签载体并将其转入甜瓜中,获得甜瓜T-DNA插入突变体,为甜瓜功能基因组学的研究奠定基础。【方法】用PCR法扩增目的 DNA片段,经EcoRI和Sac I顺序酶切,将目的片段连接到p CAMBIA2301载体上,构建含4×35s Enhancer DNA片段的激活标签载体。以甜瓜品种‘伽师’为材料,利用农杆菌介导的转化体系转化甜瓜愈伤组织,获得甜瓜T-DNA插入突变体。【结果】获得4株T0代甜瓜转化幼苗,通过Kan筛选和PCR鉴定甜瓜转化幼苗的DNA中是否含有目的基因,证明其中3株甜瓜转化幼苗为转基因植株。【结论】获得了突变植株,为甜瓜重要性状基因发掘奠定基础。 展开更多
关键词 甜瓜 激活标签 t-dna插入突变体
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基因克隆技术 被引量:14
16
作者 周国岭 杨光圣 傅廷栋 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期584-592,共9页
综述了基因克隆常用技术包括图位克隆法、转座子或T DNA标签法、同源序列法、表达序列标签(EST)法和差异表达基因分离方法的原理、应用。
关键词 基因克隆 图位克隆 转座子标签 t-dna标签 同源序列 EST 差异表达基因
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植物功能基因组研究方法及进展 被引量:7
17
作者 高泽发 陈绪清 +3 位作者 杨凤萍 梁荣奇 张立全 张晓东 《生物学杂志》 CAS CSCD 2005年第6期1-4,共4页
随着植物功能基因组研究的深入,T-DNA标签、转座子标签、反义RNA技术、基因敲除、基因陷阱和TILLING技术等多种研究方法获得了建立,并随着植物功能基因组学的不断发展而进一步完善。综述了各类研究方法的原理,并对这些方法的优缺点进行... 随着植物功能基因组研究的深入,T-DNA标签、转座子标签、反义RNA技术、基因敲除、基因陷阱和TILLING技术等多种研究方法获得了建立,并随着植物功能基因组学的不断发展而进一步完善。综述了各类研究方法的原理,并对这些方法的优缺点进行了比较与分析。 展开更多
关键词 t-dna标签 转座子标签 反义RNA技术 基因敲除 基因陷阱 TILLING技术
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水稻穗形态建成基因PMM1的遗传分析与初步定位 被引量:5
18
作者 李雪梅 何宗顺 +2 位作者 余四斌 陈国兴 吴昌银 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期10-15,共6页
在水稻粳稻品种中花11T-DNA插入突变体库中鉴定了3个穗形态突变体,它们均表现为植株半矮、叶夹角变小、一次枝梗轮生、复粒、粒长变短、粒宽变宽等突变表型。基因双突变杂交F1表型考查证明这3个突变体为等位突变体,T-DNA标签共分离检测... 在水稻粳稻品种中花11T-DNA插入突变体库中鉴定了3个穗形态突变体,它们均表现为植株半矮、叶夹角变小、一次枝梗轮生、复粒、粒长变短、粒宽变宽等突变表型。基因双突变杂交F1表型考查证明这3个突变体为等位突变体,T-DNA标签共分离检测表明这3个突变体的表型与T-DNA插入无关。通过与籼稻品种珍汕97配置3个杂交组合,由经典的孟德尔遗传分离比显示,突变性状受1对隐性基因(panicle morphological mutant 1,PMM1)控制。采用基因图位克隆的方法,已将基因PMM1定位在第4染色体长臂上的RM3866-1和X4(InDel)标记之间,其两侧物理图距为147kb左右。 展开更多
关键词 水稻 穗形态突变体 t-dna标签 遗传分析 基因定位 图位克隆
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激活标签法及其在植物基因工程上的应用 被引量:4
19
作者 郑继刚 李成梅 +1 位作者 肖英华 李雅轩 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期471-474,共4页
激活标签法是新近发展起来的一种用于基因分离和鉴定的方法。它通过诱变使特定内源基因发生过量表达,而产生显性功能获得型突变,从而对基因进行鉴定和分析。因为具有独特的性质已使其成为发现新基因和进行基因功能分析的有效工具。本文... 激活标签法是新近发展起来的一种用于基因分离和鉴定的方法。它通过诱变使特定内源基因发生过量表达,而产生显性功能获得型突变,从而对基因进行鉴定和分析。因为具有独特的性质已使其成为发现新基因和进行基因功能分析的有效工具。本文综述了激活标签法的原理、研究现状和在植物基因工程上的应用。 展开更多
关键词 植物 拟南芥 T—DNA 激活标签 激活标签法 基因工程
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化学诱导激活型拟南芥突变体库的构建及分析 被引量:25
20
作者 张健 徐金相 +12 位作者 孔英珍 纪振动 王兴春 安丰英 李超 孙加强 张素芝 杨晓辉 牟金叶 刘新仿 李家洋 薛勇彪 左建儒 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1082-1088,共7页
利用化学诱导激活XVE(LexA-VP16-ER)系统构建了一个包含40000余个独立转化株系的拟南芥突变体库,并对其中的18000余个株系进行了初步的遗传学和表型分析鉴定。卡那霉素抗性分离比表明,51.6%的株系为单位点插入株系,T-DNA插入的平均拷贝... 利用化学诱导激活XVE(LexA-VP16-ER)系统构建了一个包含40000余个独立转化株系的拟南芥突变体库,并对其中的18000余个株系进行了初步的遗传学和表型分析鉴定。卡那霉素抗性分离比表明,51.6%的株系为单位点插入株系,T-DNA插入的平均拷贝数为每株系1.38个。部分T1代和T2代植株表现出了可见的形态变异,包括下胚轴长度、根长度、植株大小和颜色、叶子颜色和形态、开花时间、种皮颜色及结实情况等。对数个代表性突变株系表型及T-DNA插入位点侧翼序列进行了分析,结果表明突变体的表型是由于T-DNA的插入造成的,而且这些突变体中包括前人发现的AP2和AGAMOUS的等位基因。由于T-DNA标记或相邻的基因可被XVE系统诱导性的激活,或被T-DNA破坏导致功能缺失,该突变体库可以用于大规模筛选鉴定功能缺失性和功能获得性突变体。 展开更多
关键词 拟南芥 诱导性激活 突变体 T—DNA XVE
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