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Identification of a NF-кB site in the negative regulatory element (ε-NRAII) of human ε-globin gene and its binding protein NF-кB p50 in the nuclei of K562 cells
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作者 HonCH HuanJ 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2002年第1期79-82,共4页
The developmental control of the human e-globin gene expression is mediated by transcription regulatory elements in the 5' flanking DNA of this gene. Sequence analysis has revealed a DNA motif (GGGGAATTTGCT) simil... The developmental control of the human e-globin gene expression is mediated by transcription regulatory elements in the 5' flanking DNA of this gene. Sequence analysis has revealed a DNA motif (GGGGAATTTGCT) similar to NF-кB consensus sequence resides in the negative regulatory element (-3028bp~ -2902bp, termed ε-NRAII) 5' to the cap site of this gene. NRF DNA fragment (-3010bp~ -2986bp) containing the NF-кB motif similar sequence was synthesized and used in electrophoresis mobility shift assay (EMSA) and competitive analysis. Data showed that a protein factor from nuclear extracts of K562 cells specifically interacted with NRF DNA fragment. The synthetic NF DNA fragment (containing NF-кB consensus sequence) could competed for the protein binding, but MNF DNA fragment (mutated NF-кB motif) could not, suggesting that the binding protein is a member of NF-кB/Rel family. Western blot assay demonstrated that the molecular weight of NF-кB protein in the nuclei of K562 cells is 50ku. We suggested that NF-кB p50 may play an important role in the regulation of human c-globin gene expression. 展开更多
关键词 human ε-globin gene negative regulatory element NE-кB p50.
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Identification of a NF-кB site in the negative regulatory element (ε-NRAII) of human ε-globin gene and its binding protein NF-кB p50 in the nuclei of K562 cells
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作者 CHUN Hui HOU, JIAN HUANG, Ruo LAN QIAN Group of Globin Gene Expression and Regulation, State Key Labortory of Molecular Biology, Institute of Biochemistry and Cell Biology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 2002年第1期79-82,共4页
The developmental control of the human e-globin gene expression is mediated by transcription regulatory elements in the 5’ flanking DNA of this gene. Sequence analysis has revealed a DNA motif (GGGGAATTTGCT) similar ... The developmental control of the human e-globin gene expression is mediated by transcription regulatory elements in the 5’ flanking DNA of this gene. Sequence analysis has revealed a DNA motif (GGGGAATTTGCT) similar to NF-кB consensus sequence resides in the negative regulatory element (-3028bp~ -2902bp, termed ε-NRAII) 5’ to the cap site of this gene. NRF DNA fragment (-3010bp~ -2986bp) containing the NF-кB motif similar sequence was synthesized and used in electrophoresis mobility shift assay (EMSA) and competitive analysis. Data showed that a protein factor from nuclear extracts of K562 cells specifically interacted with NRF DNA fragment. The synthetic NF DNA fragment (containing NF-кB consensus sequence) could competed for the protein binding, but MNF DNA fragment (mutated NF-кB motif) could not, suggesting that the binding protein is a member of NF-кB/Rel family. Western blot assay demonstrated that the molecular weight of NF-кB protein in the nuclei of K562 cells is 50ku. We suggested that NF-кB p50 may play an important role in the regulation of human c-globin gene expression. 展开更多
关键词 human ε-globin gene negative regulatory element NE-кB p50.
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人SCF基因5′旁侧-1190~- 853 AT富集区功能研究 被引量:4
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作者 聂怡玲 谭文斌 +5 位作者 朱敏 罗赛群 郭小珊 成光杰 胡维新 彭兴华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期315-318,共4页
已有的报告基因和EMSA实验研究表明 ,人干细胞生长因子 (SCF)基因 5′旁侧AT富集区- 1 1 90~ - 853在HeLa和MCF 7细胞中均能增强下游基因转录 ,可能为一个核基质结合区(MAR) ,对人SCF基因的转录发挥调控作用 .为进一步研究该AT富集区... 已有的报告基因和EMSA实验研究表明 ,人干细胞生长因子 (SCF)基因 5′旁侧AT富集区- 1 1 90~ - 853在HeLa和MCF 7细胞中均能增强下游基因转录 ,可能为一个核基质结合区(MAR) ,对人SCF基因的转录发挥调控作用 .为进一步研究该AT富集区的功能 ,将人SCF基因 5′旁侧 - 1 1 90~ - 853AT富集区分别克隆入SV40或CMV启动子前后紧接着CAT报告基因 ,瞬时转染Jurkat,HepG2和 3T3细胞 ,检测CAT报告基因的瞬时表达活性 .结果表明 :人SCF基因 5′旁侧- 1 1 90~ - 853AT富集区在Jurkat和HepG2细胞中 ,对分别由SV40和CMV启动子引导的CAT基因表达均有抑制作用 ;但在 3T3细胞中对SV40启动子的转录活性表现出增强作用 ,对CMV启动子的转录活性无明显影响 .这些结果提示 ,人SCF基因 5′旁侧 - 1 1 90~ - 853AT富集区转录调控具有组织细胞特异性 。 展开更多
关键词 人干细胞因子基因 调控元件 启动子 报告基因检测 SCF
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人vigilin基因5'端调控区域的研究 被引量:1
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作者 曾星 《生物化学杂志》 CSCD 1997年第4期385-390,共6页
在克隆了人基因组全长vigilin基因的基础上,对其5端转录调控区域再克隆,获得Vig-CG5-7E克隆,再用限制酶ApaⅠ和EcoRⅠ切除3端约4kb部分,得到Vig-CG5-7E3AE克隆,并对该克隆进行双向... 在克隆了人基因组全长vigilin基因的基础上,对其5端转录调控区域再克隆,获得Vig-CG5-7E克隆,再用限制酶ApaⅠ和EcoRⅠ切除3端约4kb部分,得到Vig-CG5-7E3AE克隆,并对该克隆进行双向测序分析.结果表明:克隆Vig-CG5-7E用ApaⅠ酶消化后,用cDNA上游开始的20个碱基组成的寡聚核苷酸做探针进行分子杂交,可见一条小于0.1kb杂交带,根据物理图谱分析,位于Vig-CG5-7E3AE克隆的ApaⅠ端,从而推断该克隆含有转录调控元件,5端序列分析得到二个TATA盒,一个CAAT盒和一个GC盒以及二个可能的Ap-1和Ap-2结合位点. 展开更多
关键词 vigilin基因 调控序列 分子遗传学
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人类Pax-5基因外显子1B的5'侧翼区碱基序列分析
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作者 刘茂林 Mizanur Rahman +1 位作者 平林泰彦 佐佐木毅 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期318-321,共4页
目的:探讨Pax- 5基因表达在B细胞分化发育的调节机制。方法:利用分子克隆及亚克隆技术对Pax-5基因外显子1B的5’侧翼区分离克隆。用双链双脱氧终止法进行核苷酸序列测定,并对侧序资料进行序列程序分析。结果:整段碱基序列(6671 hp... 目的:探讨Pax- 5基因表达在B细胞分化发育的调节机制。方法:利用分子克隆及亚克隆技术对Pax-5基因外显子1B的5’侧翼区分离克隆。用双链双脱氧终止法进行核苷酸序列测定,并对侧序资料进行序列程序分析。结果:整段碱基序列(6671 hp)分析表明:无TATA盒共同序列存在,近段启动子包括3个CAT盒,1个SP1和1个E盒;上游进一步推测的调节位点显示6个LMO2COM,5个NFAT,2个LPOLYA-B,3个GATA1,2个AP4,10个AZF1,1个ETS1-B,1个GATA3,1个NKX25,2个RORA1,1个LYFI,2个Ikaros2,2个ICF11,1个GATA-C和1个FREAC7确定在序列上。结论:Pax-5基因外显子1B的5’侧翼区与Pax-5表达的调节有关,且对保证B细胞谱系和B细胞发育起重要调节作用。 展开更多
关键词 Pax-5基因 5′侧翼区序列 启动子 推测调节位点 基因表达
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人体β-珠蛋白基因5’旁侧调控元件与不同发育时期调控因子的相互作用
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作者 陈士友 蒋俶 钱若兰 《实验生物学报》 CSCD 1996年第4期379-384,共6页
人β-珠蛋白基因主要在成年期的骨髓中表达,在胎儿肝,成年肝和K 562细胞中则处于关闭状态。凝胶电泳阻抑法分析发现,在人胎儿肝,成年肝及K 562细胞的核蛋白抽提物中存在着不同的与β-珠蛋白基因5'旁侧调控元件(-372到-194 bp)相结... 人β-珠蛋白基因主要在成年期的骨髓中表达,在胎儿肝,成年肝和K 562细胞中则处于关闭状态。凝胶电泳阻抑法分析发现,在人胎儿肝,成年肝及K 562细胞的核蛋白抽提物中存在着不同的与β-珠蛋白基因5'旁侧调控元件(-372到-194 bp)相结合的红系组织特异性的调控因子。竟争试验的结果表明,成年肝和K 562细胞中的调控因子与β-珠蛋白基因5'旁侧调控元件相互作用的方式具有一定的相似性,这两种细胞的调控因子既结合于负调控区(NCR 2)也结合于正调控区,说明两种细胞中β-珠蛋白基因的关闭机制可能是相似的。胎儿肝的核蛋白因子只结合于负调控区,推测在胎儿期存在独特的关闭机制。 展开更多
关键词 细胞 Β-珠蛋白基因 调控元件 调控因子
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bax嵌合基因克隆及其在人舌癌细胞的表达
7
作者 马英红 陈俊杰 +3 位作者 高家让 王若菡 彭文珍 杨绍华 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2002年第1期1-4,共4页
目的 :构建能在人舌癌细胞中高效表达Bax蛋白的bax嵌合基因。方法 :将RT PCR获得bax基因编码序列克隆至原核表达载体pGEX 5T ,再将baxcDNA插入人α1(Ⅰ )胶原基因顺式作用元件 (CIP)与报告基因CAT之间 ,构成 pSV CIP bax CAT嵌合基因 ;... 目的 :构建能在人舌癌细胞中高效表达Bax蛋白的bax嵌合基因。方法 :将RT PCR获得bax基因编码序列克隆至原核表达载体pGEX 5T ,再将baxcDNA插入人α1(Ⅰ )胶原基因顺式作用元件 (CIP)与报告基因CAT之间 ,构成 pSV CIP bax CAT嵌合基因 ;用阳离子脂质体DOSPER将此嵌合基因转染至人舌鳞癌细胞Tca8113;用免疫狭缝印迹和ELISA方法分析报告基因CAT和目的基因bax在细胞中的表达。结果 :bax基因编码序列及嵌合基因限制性酶谱正确 ;CAT表达的ELISA检测证实 ,转染是成功的 ,且CIP在Tca8113细胞中有促进其下游基因表达的作用 (为对照组的 15倍 ) ;免疫狭缝印迹和ELISA证实 ,转染细胞能高效表达Bax蛋白 (为对照组的 8倍 )。结论 :bax嵌合基因 pSV CIP bax CAT能在人舌癌细胞中高效表达Bax蛋白 ,为进一步研究bax基因对舌癌细胞生长与凋亡的影响奠定了基础。 展开更多
关键词 BAX基因 人胶原基因调节元件 报造基因CAT 人舌鳞癌细胞 嵌合基因 克隆
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人IL-2Rα链基因负调控元件结合蛋白的分离纯化
8
作者 张玉健 邢光新 +4 位作者 莽锐 程小款 衡凤燕 吴宁华 沈 琲 《基础医学与临床》 CSCD 1999年第6期80-85,共6页
淋巴细胞表面高亲和力IL-2R的出现受IL-2Ra基因的诱导表达控制,而IL-2Ra链基因的表达受到严格的时空的调控。在IL-2Ra基因上游除存在正调控元件外还存在负调控元件(-391TCATCCCAGG-381,NRE)及其下游不完全反转重复序列(-153CCTGG... 淋巴细胞表面高亲和力IL-2R的出现受IL-2Ra基因的诱导表达控制,而IL-2Ra链基因的表达受到严格的时空的调控。在IL-2Ra基因上游除存在正调控元件外还存在负调控元件(-391TCATCCCAGG-381,NRE)及其下游不完全反转重复序列(-153CCTGGTTTGA-143NIRS)。本组曾通过紫外交联实验发现Jurkat细胞有一种蛋白质与NIRS和NRE特异结合。本文利用肝素-亲和柱层析及序列特异DNA亲和层析认1010Jurkat细胞中获得了分子量约为75kD的NRE特异结合蛋白。EMSA实验表明,纯化后的蛋白与NRE所形成的结合物能被NIRS及HIVLTR的负调控元件所竞争,提示该NRE结合蛋白不仅可能参与IL-2Ra基因的转录调控,而且可能在HIV基因表达过程中起某种作用。 展开更多
关键词 IL-2Rα链 负调控元件 结合蛋白 DNA 亲和层析
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