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High frequency loss of heterozygosity on the long arms of chromosomes 13 and 14 in nasopharyngeal carcinoma in Southern China 被引量:1
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作者 邵建永 李宇红 +8 位作者 吴秋良 梁小曼 余杏娟 黄丽惜 侯景辉 黄晓明 曾益新 Ingemar Ernberg Li-Fu HU 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2002年第4期571-575,共5页
OBJECTIVE: To investigate the loss of heterozygosity (LOH) on chromosomal arms 13q and 14q in nasopharyngeal carcinoma (NPC) using 21 microsatellite polymorphic markers and to study whether there is a correlation betw... OBJECTIVE: To investigate the loss of heterozygosity (LOH) on chromosomal arms 13q and 14q in nasopharyngeal carcinoma (NPC) using 21 microsatellite polymorphic markers and to study whether there is a correlation between LOH and clinicopathologic parameters and/or Epstein-Barr virus (EBV) infection in NPC. METHODS: Sixty cases of NPC were studied using polymerase chain reaction based microsatellite analysis with genescan and genotyping techniques. RESULTS: LOH was detected on 13q in 78% of NPC tumors, high frequency LOH loci (more than 30%) clustered to 13q12.3-q14.3 and 13q32. On chromosome 14q, LOH was detected in 80% of NPC tumors; high frequency LOH loci clustered to 14q11-q13, 14q21-q24 and 14q32. High frequency LOH at 13q31-q32 correlated with a lower level of EBV infection; LOH on chromosome 14q was closely associated with poor differentiation of NPC tumor cells. CONCLUSION: Our results suggest that in NPC, LOH on chromosome 13q and 14q are common genetic events, and putative tumor suppressor genes (TSG) residing in these regions may be involved in tumorigenesis. 展开更多
关键词 Loss of Heterozygosity Adult Aged chromosomes human pair 13 chromosomes human pair 14 DNA Neoplasm Female Gene Frequency humans Male Microsatellite Repeats Middle Aged Nasopharyngeal Neoplasms Research Support Non-U.S. Gov't Statistics
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lncRNA MEG8通过调控miR-363-3p/PAX6轴促进非小细胞肺癌的肿瘤进展 被引量:1
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作者 林燕明 陈玉婷 +2 位作者 林慕文 李姝君 王永存 《山西医科大学学报》 CAS 2023年第4期416-424,共9页
目的探讨长非编码RNA母系表达基因8(lncRNA MEG8)通过调控miR-363-3p/人类配对盒基因6(PAX6)轴促进非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤进展。方法选取116例经确诊为NSCLC患者的肿瘤组织与癌旁正常组织标本,常规培养人NSCLC细胞株A549、H1299,采... 目的探讨长非编码RNA母系表达基因8(lncRNA MEG8)通过调控miR-363-3p/人类配对盒基因6(PAX6)轴促进非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤进展。方法选取116例经确诊为NSCLC患者的肿瘤组织与癌旁正常组织标本,常规培养人NSCLC细胞株A549、H1299,采用RT-qPCR法检测组织和细胞中lncRNA MEG8、miR-363-3p和PAX6 mRNA的表达。将A549、H1299细胞分别分为对照组(control组,空白培养基处理)、pcDNA组(转染pcDNA)、pcDNA-MEG8组(转染pcDNA-MEG8)、pcDNA-MEG8+miR-NC组(pcDNA-MEG8与miR-NC共转染)、pcDNA-MEG8+miR-363-3p mimic组(pcDNA-MEG8与miR-363-3p mimic共转染)。CCK-8法检测培养24,48,72 h各组细胞增殖能力;细胞划痕实验检测细胞迁移能力;流式细胞术检测细胞凋亡;采用Western blot检测凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2、Caspase-3和PAX6蛋白的表达。双荧光素酶报告基因实验分别验证MEG8和miR-363-3p、miR-363-3p和PAX6的关系。RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验检测lncRNA MEG8、miR-363-3p和PAX6之间的结合。结果与正常组织相比,肿瘤组织中lncRNA MEG8、PAX6 mRNA高表达,miR-363-3p呈现低表达(均P<0.05)。与control组和pcDNA组相比,pcDNA-MEG8组培养48,72 h A549和H1299细胞增殖能力、细胞迁移率、PAX6、Bcl-2蛋白表达显著升高(P<0.05),细胞凋亡率和Bax、Caspase-3蛋白显著降低(P<0.05)。与pcDNA-MEG8组和pcDNA-MEG8+miR-NC组相比,pcDNA-MEG8+miR-363-3 mimic组培养48,72 h A549和H1299细胞增殖能力、细胞迁移率、PAX6、Bcl-2蛋白表达显著降低(P<0.05),miR-363-3p表达、细胞凋亡率、Bax、Caspase-3蛋白表达显著升高(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验结果显示,与miR-NC+MEG8-WT共转染组相比,miR-363-3p mimic+MEG8-WT共转染组荧光素酶活性显著降低(P<0.05);与miR-NC+MEG8-MUT共转染组相比,miR-363-3p mimic+MEG8-MUT共转染组荧光素酶活性无显著差异(P>0.05)。与miR-NC+PAX6-WT共转染组相比,miR-363-3p mimic+PAX6-WT共转染组荧光素酶活性显著降低(P<0.05);与miR-NC+PAX6-MUT共转染组相比,miR-363-3p mimic+PAX6-MUT共转染组荧光素酶活性无显著性差异(P>0.05)。RIP实验结果显示,与IgG处相比,lncRNA MEG8和miR-363-3p、miR-363-3p和PAX6均主要富集在Ago2处,IgG处与Ago2处的lncRNA MEG8、miR-363-3p和PAX6RNA相对表达水平均具有统计学差异(P<0.05),提示lncRNA MEG8和miR-363-3p、miR-363-3p和PAX6能靶向结合。结论过表达lncRNA MEG8可能通过下调miR-363-3p并促进PAX6蛋白的表达,进而促进NSCLC的进展。 展开更多
关键词 母系表达基因8 miR-363-3p/人类配对盒基因6 非小细胞肺癌 细胞凋亡 细胞增殖 细胞迁移
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微小RNA-375通过靶向PAX6对宫颈癌HeLa细胞顺铂敏感性的影响 被引量:4
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作者 蒋莉莎 陆义红 +1 位作者 水丽君 邓敏 《临床肿瘤学杂志》 CAS 北大核心 2018年第6期501-507,共7页
目的探讨微小RNA-375(miR-375)和人类配对盒基因6(PAX6)在宫颈癌顺铂耐药株HeLa cisR中的表达及耐药逆转作用并初步探讨可能机制。方法采用实时定量PCR(QPCR)检测28例正常宫颈组织、30例宫颈癌组织(14例顺铂敏感和16例顺铂不敏感)和不... 目的探讨微小RNA-375(miR-375)和人类配对盒基因6(PAX6)在宫颈癌顺铂耐药株HeLa cisR中的表达及耐药逆转作用并初步探讨可能机制。方法采用实时定量PCR(QPCR)检测28例正常宫颈组织、30例宫颈癌组织(14例顺铂敏感和16例顺铂不敏感)和不同顺铂敏感性细胞HeLa、HeLa cisR中miR-375、PAX6 mRNA水平,采用脂质体法向HeLa和HeLa cisR细胞转染含miR-375模拟物(mimics)的寡核苷酸探针(过表达组)和阴性对照NC(阴性对照组),以不行任何转染的为空白对照组。采用QPCR检测转染后HeLa和HeLa cisR细胞中miR-375和PAX6 mRNA水平,采用MTT法检测不同浓度顺铂(1、3、10、30、100μmol/L)处理后的增殖情况并计算半数抑制浓度(IC_(50))以评价顺铂敏感性,Western blotting检测PAX6蛋白水平,双荧光素酶报告基因试验评价miR-375对PAX6的靶向调控作用。结果宫颈癌组织中的miR-375水平低于正常宫颈组织(0.714±0.341 vs.1.006±0.299),PAX6 mRNA水平高于正常宫颈组织(1.855±0.928 vs.1.011±0.257),miR-375水平与PAX6 mRNA水平呈负相关(r=-0.416,P<0.05)。与化疗敏感组相比,化疗不敏感组的miR-375水平降低,而PAX6 mRNA水平升高(P<0.05)。HeLa cisR细胞的miR-375水平低于HeLa细胞(0.365±0.098 vs.1.032±0.135),而PAX6 mRNA水平高于HeLa细胞(3.154±0.957 vs.1.067±0.168),差异均有统计学意义(P<0.05)。与其余两组相比,过表达组转染后的miR-375水平升高,PAX6蛋白和mRNA水平均降低,差异有统计学意义(P<0.05)。miR-375过表达可降低顺铂IC_(50)(P<0.05),先转染miR-375 mimics 24 h后再转染过表达PAX6的pCMV-PAX6质粒后细胞的IC_(50)与未转染细胞的差异无统计学意义(P>0.05)。结论 miR-375通过靶向PAX6参与了宫颈癌细胞的顺铂耐药,miR-375有望成为逆转宫颈癌顺铂耐药的靶点。 展开更多
关键词 宫颈癌 微小RNA-375 增殖 顺铂耐药 人类配对盒基因6
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中国一先天性无虹膜家系PAX6基因新致病突变位点的筛查及验证 被引量:1
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作者 刘宇莹 刘琼 +3 位作者 万文苹 杨鸽 夏昆 金学民 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期602-606,共5页
背景先天性无虹膜是临床上罕见的先天性遗传性眼病。研究显示,配对盒转录因子6基因(PAX6)与先天性无虹膜症密切相关,但不同患者中PAX6基因的突变位点不同。目的对中国一常染色体显性遗传先天性无虹膜家系进行PAX6基因突变位点分析... 背景先天性无虹膜是临床上罕见的先天性遗传性眼病。研究显示,配对盒转录因子6基因(PAX6)与先天性无虹膜症密切相关,但不同患者中PAX6基因的突变位点不同。目的对中国一常染色体显性遗传先天性无虹膜家系进行PAX6基因突变位点分析。方法于2014年8月在郑州大学第一附属医院收集一汉族先天性无虹膜家系,采集该家系9名成员及同期100名健康体检者的外周静脉血10ml,采用标准酚一氯仿提取法提取基因组DNA,对PCR扩增产物进行测序、对比及突变分析。采用实时荧光定量PCR法验证和比较该家系中患病者与该家系表型正常者和健康对照者淋巴细胞中PAX6mRNA的相对含量。结果该家系共3代9名成员,遗传方式符合常染色体显性遗传。家系中共5例患病者,成年患病者均表现为虹膜缺失和白内障,儿童患病者表现为无虹膜;其他4名家系成员表型正常。测序结果显示,家系患病者均存在11号染色体PAX6基因10号外显子的移码突变,第796位核糖核苷酸G缺失(C.796delG),产生提前终止密码子,而家系正常成员及100名对照者均无此突变。实时荧光定量PCR结果显示,家系中患病者淋巴细胞中PAX6mRNA表达水平比家系中正常成员约低50%,差异有统计学意义(Z=-2.449,P=0.016)。结论PAX6基因C.796delG为此先天性无虹膜家系的致病突变位点,扩增了PAX6基因突变谱。 展开更多
关键词 先天性无虹膜/遗传性 人类第11号染色体/基因 配对盒转录因子/基因 碱基序列 码突变 家系 中国人/基因
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16号染色体短臂散发性结直肠癌相关基因的精细定位
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作者 黄力 张放 +3 位作者 郑海涛 裘国强 贺林 彭志海 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期573-576,共4页
目的对散发性结直肠癌16号染色体短臂杂合缺失区间(LOH)进行精细定位,以期发现新的肿瘤相关基因.方法用覆盖16号染色体短臂的5个微卫星标记对83例散发性结直肠癌进行杂合缺失分析,初步定位候选区域后再用另5个微卫星标记对这一区域进行... 目的对散发性结直肠癌16号染色体短臂杂合缺失区间(LOH)进行精细定位,以期发现新的肿瘤相关基因.方法用覆盖16号染色体短臂的5个微卫星标记对83例散发性结直肠癌进行杂合缺失分析,初步定位候选区域后再用另5个微卫星标记对这一区域进行精细定位.PCR扩增相应位点的基因组DNA,并用ABI 377自动测序仪进行电泳.用Genescan 3.7 和Genotype 3.7软件进行遗传位点扫描及杂合缺失分析.杂合缺失与临床病理参数的关系比较采用χ2检验.结果 16号染色体短臂的平均杂合缺失率为24.58%,仅有一高频缺失位点D16S404,杂合缺失率达52.73%.对其精细定位后发现,最小杂合缺失区间应位于D16S406和D16S3126之间,约1.1 cM.而这一区间的杂合缺失与Dukes分期、肿瘤分化及淋巴结转移等无关.结论通过散发性结直肠癌16号染色体短臂杂合缺失的精细定位研究,发现了D16S406~D16S3126之间精度达1.1 cM的肿瘤相关基因候选区域.在这一区间内可能的肿瘤抑制基因为USP7基因,相邻的候选肿瘤抑制基因有EMP2.对这2个基因的深入研究可能明确新的散发性结直肠癌相关基因. 展开更多
关键词 结肠直肠肿瘤 基因 肿瘤抑制 染色体 16 杂合子丢失
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中国一先天性无虹膜家系的遗传分析及PAX6基因突变位点的检测 被引量:4
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作者 张陆希 杨鸽 +3 位作者 贾竞 万文萃 杨鑫 金学民 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期721-725,共5页
背景先天性无虹膜是双眼发病的遗传性疾病,目前的研究表明先天性无虹膜患者配对盒转录因子6(PAX6)基因突变位点具有多样性。目的通过目标序列捕获测序结合一代测序验证技术对1个中国先天性无虹膜家系进行基因突变位点的筛查和遗传分... 背景先天性无虹膜是双眼发病的遗传性疾病,目前的研究表明先天性无虹膜患者配对盒转录因子6(PAX6)基因突变位点具有多样性。目的通过目标序列捕获测序结合一代测序验证技术对1个中国先天性无虹膜家系进行基因突变位点的筛查和遗传分析。方法采用横断面研究方法,本研究组于2016年3月纳入在郑州大学第一附属医院确诊的1个中国汉族先天性无虹膜家系,并对该家系成员进行致病突变基因检测。该家系全体成员均接受神经系统、口服葡萄糖耐量试验等全身体格检查以及眼科相关检查。采集现存家系所有成员前臂静脉血10ml以提取基因组DNA,以先证者基因组DNA为模板行前房角发育异常致病基因的目标基因定点捕获测序分析,经与各基因库比对筛选出候选致病基因位点,采用PCR法对该家系成员行致病基因位点DNA片段扩增,采用Sanger测序技术在该家系除先证者以外的2例患病者和表型正常成员中进行候选致病基因验证。结果该家系共3代9名成员,I1去世,现存8位成员,包括患病者3例(112及其子代Ⅲ1、Ⅲ2)和表型正常者5人,符合常染色体显性遗传模式。所有家系成员未发现神经系统异常,口服葡萄糖耐量试验结果均呈阴性。3例患病者视力均明显下降且不能矫正,眼压平均值为21mmHg(1mmHg=0.133kPa),患者均存在虹膜完全缺如、角膜基质层混浊、眼球水平震颤、黄斑中心凹发育不良症状。此外,Ⅱ2患者存在左眼上睑下垂、右眼先天性白内障表现,Ⅲ2同时存在双眼先天性白内障、双侧晶状体不全脱位。先证者目标序列捕获测序分析及数据库比对显示,所有患病者PAX6基因第6号外显子上碱基替换e.183C〉A,经Sanger测序验证后证实突变基因与表型共分离。结论PAX6基因c.183C〉A突变是该先天性无虹膜家系的致病突变位点。 展开更多
关键词 无虹膜/遗传性 人类第11号染色体/基因 配对盒转录因子6/基因 家系谱 中国人 目标序列捕获测序 无义突变
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18q11.2杂合微缺失(含GATA6基因缺失)1例并文献复习 被引量:2
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作者 李卓光 杜彩琪 +5 位作者 张偲 黄廉静 张米妮 应艳琴 梁雁 罗小平 《精准医学杂志》 2019年第5期388-392,397,共6页
目的分析1例罕见的18q11.2杂合微缺失(含GATA 6缺失)患儿的临床资料及其基因检测情况,以提高对18q11.2缺失综合征的认识。方法对2018年5月我院儿科收治的1例18q11.2杂合微缺失患儿的临床资料及基因检测结果总结分析,并对相关文献资料进... 目的分析1例罕见的18q11.2杂合微缺失(含GATA 6缺失)患儿的临床资料及其基因检测情况,以提高对18q11.2缺失综合征的认识。方法对2018年5月我院儿科收治的1例18q11.2杂合微缺失患儿的临床资料及基因检测结果总结分析,并对相关文献资料进行复习。结果患儿,男,12岁2月龄,因“生长落后伴血糖升高4年”就诊。出生体质量2500 g;2月龄时诊断为“法洛四联症”,并先后于2岁及5岁时行姑息性手术、根治术;6岁时诊断为“甲状腺功能减低症”;8岁时诊断为“糖尿病”。身高131.3 cm(-2.78 SDS),体质量29000 g(低于第3百分位),BMI 16.8 kg/m^2;心前区可闻及Ⅱ~Ⅲ级收缩期杂音;双睾约1 mL,阴毛、腋毛未见。骨龄(BA)10岁,胰岛素样生长因子1(64.40μg/L)低于正常,垂体内分泌功能检测提示部分性生长激素缺乏(GH峰值5.88μg/L);空腹血糖、糖化血红蛋白正常,C肽(0.42μg/L)低于正常,抗胰岛素自身抗体、抗谷氨酸脱羧酶抗体阴性。全外显子基因组测序发现患儿chr18:19746826-21390514区域存在杂合缺失,患儿父母该区域均未见缺失。缺失区域共存在13个OMIM基因:LAMA 3、GATA 6-AS 1、LOC 101927571、RBBP 8、CABLES 1、TMEM 241、RIOK 3、C 18 orf 8、NPC 1、ANKRD 29、GATA 6、MIR 4741、CTAGE 1。结论本文首次报道了18q11.2的chr18:19746826-21390514区域杂合微缺失的病例,通过相关文献的复习,推测患儿大部分临床表型(法洛四联症、甲状腺功能减低症、糖尿病等)主要与GATA 6杂合缺失相关。 展开更多
关键词 染色体 18对 染色体缺失 GATA6转录因子 突变 法洛四联症 甲状腺功能减退症 糖尿病
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小干扰RNA-Pax6对人晶状体上皮细胞生物学行为和上皮-间质转化的抑制作用
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作者 郑宇星 杨筱曦 +3 位作者 易果果 吴淑端 冯志贞 夏朝霞 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期499-506,共8页
目的探讨沉默人类同源配对盒基因6(Pax6)对人晶状体上皮细胞(LECs)的生物学行为和上皮-间质转化(EMT)的作用。方法将SRA01/04人LECs分为小干扰RNA-Pax6(siRNA-Pax6)组和siRNA阴性对照(siRNA-NC)组,siRNA-Pax6组细胞转染siRNA-Pax6,siRNA... 目的探讨沉默人类同源配对盒基因6(Pax6)对人晶状体上皮细胞(LECs)的生物学行为和上皮-间质转化(EMT)的作用。方法将SRA01/04人LECs分为小干扰RNA-Pax6(siRNA-Pax6)组和siRNA阴性对照(siRNA-NC)组,siRNA-Pax6组细胞转染siRNA-Pax6,siRNA-NC组细胞转染无序siRNA。转染后24、48、72 h采用细胞计数试剂盒8法检测细胞存活率;转染后48 h,采用流式细胞术检测细胞凋亡比例和不同细胞周期细胞比例;转染后24 h,采用细胞划痕实验检测细胞迁移率;转染后48 h,采用实时荧光定量PCR检测细胞内Pax6、α-晶状体蛋白A(CRYAA)、α-晶状体蛋白B(CRYAB)、转录因子Sox2及EMT相关分子平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、钙黏附蛋白E(E-cadherin)mRNA相对表达量,采用Western blot法检测各组细胞中Pax6蛋白相对表达量。结果2个组转染后不同时间点细胞存活率总体比较差异均有统计学意义(F_(分组)=4.776,P<0.05;F_(时间)=13.535,P<0.05),其中转染后48 h和72 h,siRNA-Pax6组细胞存活率均明显低于siRNA-NC组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。与siRNA-NC组比较,siRNA-Pax6组G_(0)/G_(1)期细胞比例明显增加,S期细胞比例明显减少,差异均有统计学意义(t=9.971、-5.063,均P<0.05)。siRNA-Pax6组细胞迁移率为(19.73±6.07)%,低于siRNA-NC组的(70.56±2.97)%,差异有统计学意义(t=-7.245,P<0.05)。siRNA-Pax6组细胞中Sox2和α-SMA mRNA相对表达量低于siRNA-NC组,E-cadherin mRNA相对表达量高于siRNA-NC组,差异均有统计学意义(t=-23.254、-5.294、6.062,均P<0.01)。siRNA-Pax6组细胞中CRYAA和CRYAB mRNA相对表达量明显高于siRNA-NC组,差异均有统计学意义(t=5.521、8.270,均P<0.01)。siRNA-Pax6组细胞中Pax6 mRNA相对表达量为0.27±0.01,低于siRNA-NC组的1.00±0.05,差异有统计学意义(t=-14.456,P<0.001);siRNA-Pax6组细胞中Pax6蛋白相对表达量为0.24±0.05,低于siRNA-NC组的1.14±0.10,差异有统计学意义(t=-4.458,P<0.001)。结论沉默Pax6可抑制人LECs的增生及EMT过程,维持人LECs内正常晶状体蛋白的表达。 展开更多
关键词 小干扰RNA 人类同源配对盒基因6 后发性白内障 人晶状体上皮细胞 上皮-间质转化
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认识人类配对盒基因Pax6,一个控制眼和大脑发育的关键基因 被引量:4
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作者 David Wan-ChengLi 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期577-587,共11页
人类配对盒基因6(Pax6)是控制眼和大脑发育的关键基因。Pax6基因突变或表达水平改变导致一系列的眼部疾病。作为转录因子,Pax6在胚胎发育早期多个不同组织原基表达,单独或与其他转录因子共同作用,直接或间接调控不同下游基因的表... 人类配对盒基因6(Pax6)是控制眼和大脑发育的关键基因。Pax6基因突变或表达水平改变导致一系列的眼部疾病。作为转录因子,Pax6在胚胎发育早期多个不同组织原基表达,单独或与其他转录因子共同作用,直接或间接调控不同下游基因的表达来调控眼、大脑、垂体、鼻及胰脏的发育。Pax6存在4种异构体,其功能受多种翻译后修饰的调控。全面认识Pax6的结构与功能及其与各种疾病的关系有助于眼科医师研究其突变或表达改变而引起的相关眼病的病理机制,为相关疾病的防治提供新的思路。 展开更多
关键词 配对盒基因6 转录因子 眼部异常基因 突变 基因表达调控 脑发育 眼发育
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shRNA靶向PAX6对乳腺癌MCF-7细胞增殖、凋亡及上皮间质转化的影响 被引量:1
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作者 唐鑫 汪俊谷 何新斌 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2015年第11期967-971,共5页
目的探讨短发夹RNA(shRNA)靶向沉默人类配对盒基因(PAX6)对乳腺癌MCF-7细胞增殖、凋亡及上皮间质转化(EMT)的影响。方法根据Gen Bank数据库中PAX6序列,设计、合成互补并特异性编码其shRNA序列的寡核苷酸,克隆至线性化pSUPER.puro质粒载... 目的探讨短发夹RNA(shRNA)靶向沉默人类配对盒基因(PAX6)对乳腺癌MCF-7细胞增殖、凋亡及上皮间质转化(EMT)的影响。方法根据Gen Bank数据库中PAX6序列,设计、合成互补并特异性编码其shRNA序列的寡核苷酸,克隆至线性化pSUPER.puro质粒载体中,将pSuper.puro PAX6 shRNA质粒(转染组)和阴性对照质粒pSuper.puro luciferase shRNA(阴性对照组)分别转染人MCF-7细胞,建立稳定低表达PAX6的MCF-7细胞株,同时设未行转染的MCF-7细胞为空白对照组。经实时定量PCR验证后,噻唑蓝(MTT)法检测各组转染24、48、72、96 h后的增殖抑制率,流式细胞术检测各组转染后的细胞凋亡和细胞周期情况,采用Western blotting检测各组转染96 h后的EMT相关标记分子(E-钙粘蛋白、纤连蛋白和波形蛋白)水平。结果转染组的PAX6水平均低于阴性对照组和空白对照组(P<0.05);与其余两组相比,转染组的增殖抑制率、凋亡率及促凋亡基因Bax、Bad mRNA水平均升高,而抑制凋亡基因Bcl-2 mRNA水平降低,且细胞周期的G_0/G_1期细胞比例升高,但S期和G_2/M期细胞比例均降低,以上差异均有统计学意义(P<0.05);转染组的钙粘蛋白水平升高,而纤连蛋白和波形蛋白水平均降低,与其余两组的差异均有统计学意义(P<0.05)。结论通过shRNA抑制PAX6基因表达可抑制乳腺癌细胞增殖并诱导凋亡和细胞周期阻滞,对EMT过程有一定抑制效果,为乳腺癌的基因沉默靶向治疗提供了依据。 展开更多
关键词 短发夹RNA 人类配对盒基因6 乳腺癌 增殖 凋亡 上皮间质转化
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8q24.13q24.23微重复病儿1例的临床及遗传学分析
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作者 邱惠国 陈波 《安徽医药》 CAS 2023年第12期2487-2489,共3页
目的明确1例8q24.13q24.23微重复胎儿的遗传学病因及其来源,并对该胎儿做产前诊断。方法采集2020年3月厦门大学附属第一医院行无创产前筛查的1对夫妻外周血及胎儿羊水细胞行染色体G显带分析;孕妇外周血行无创产前筛查;胎儿羊水细胞行染... 目的明确1例8q24.13q24.23微重复胎儿的遗传学病因及其来源,并对该胎儿做产前诊断。方法采集2020年3月厦门大学附属第一医院行无创产前筛查的1对夫妻外周血及胎儿羊水细胞行染色体G显带分析;孕妇外周血行无创产前筛查;胎儿羊水细胞行染色体微阵列分析。结果父亲染色体核型正常,母亲和胎儿染色体核型46,XX,dup(8)(8q24.13q24.23);孕妇无创产前筛查:8号染色体长臂8q24.13q24.23存在11.3 Mb的重复(chr8:g.126215101-139315100dup)。染色体微阵列分析:arr[GRCh37]8q24.13q24.23(126646442-137947833)x3。结论8q24.13q24.23微重复为偏良性的拷贝数变异(CNV),建议孕妇继续妊娠。 展开更多
关键词 染色体重复 染色体 8对 DNA拷贝数变异 8q24.13q24.23 染色体微阵列分析 分子遗传学诊断
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微RNA-132-3p靶向第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源物调控葡萄膜黑色素瘤细胞增殖与凋亡
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作者 许志波 《安徽医药》 CAS 2023年第3期592-596,I0002,共6页
目的 研究微RNA(miR)-132-3p在葡萄膜黑色素瘤细胞增殖、凋亡中的作用及其作用机制。方法 该研究起止时间为2018年2月至2019年7月。定量聚合酶链反应(qPCR)检测正常葡萄膜上皮细胞ARPE-19和葡萄膜黑色素瘤细胞SP6.5、M23中miR-132-3p表... 目的 研究微RNA(miR)-132-3p在葡萄膜黑色素瘤细胞增殖、凋亡中的作用及其作用机制。方法 该研究起止时间为2018年2月至2019年7月。定量聚合酶链反应(qPCR)检测正常葡萄膜上皮细胞ARPE-19和葡萄膜黑色素瘤细胞SP6.5、M23中miR-132-3p表达。SP6.5细胞中转染miR-132-3p干扰质粒(anti-miR-132-3p)、第10号染色体上缺失的磷酸酶和张力蛋白同源物(PTEN)过表达质粒(pcDNA3.1-PTEN)或共转染anti-miR-132-3p和PTEN干扰质粒(si-PTEN),MTT法和流式细胞术分别检测细胞增殖与凋亡,蛋白质印迹法检测PTEN、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、周期素依赖激酶抑制剂p21(P21)、B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)和Bcl-2相关X蛋白(Bax)蛋白表达,生物信息学预测结合双萤光素酶报告实验分析miR-132-3p与PTEN的靶向关系。结果 与ARPE-19细胞相比,SP6.5、M23细胞中miR-132-3p表达量(0.26±0.02比0.94±0.09、0.81±0.08)明显升高(P<0.05)。与anti-miR-132-3p阴性对照(anti-miR-NC)组相比,anti-miR-132-3p组24 h、48 h、72 h的细胞活性(0.51±0.05比0.30±0.03、0.97±0.09比0.45±0.05、1.40±0.14比0.76±0.07)、cyclin D1、Bcl-2蛋白表达量显著降低(P<0.05),细胞凋亡率[(8.03±0.68)%比(21.51±2.06)%]、P21、Bax水平明显提高(P<0.05),与过表达PTEN相同。miR-132-3p与PTEN之间有靶向调控关系。抑制PTEN能逆转抑制miR-132-3p对SP6.5细胞增殖的抑制作用及对细胞凋亡的促进作用。结论 miR-132-3p通过直接靶向PTEN调控葡萄膜黑色素瘤细胞增殖与凋亡。 展开更多
关键词 微RNAs 染色体 10对 黑色素瘤 葡萄膜肿瘤 细胞周期蛋白D1 周期素依赖激酶抑制剂p21 BCL-2相关X蛋白质 磷酸酶和张力蛋白同源物 增殖 凋亡
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SCREENING FOR A 21-CHROMOSOME ABNORMALITY IN PREIMPLANTED EMBRYOS OF ELDERLY WOMEN
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作者 Fang-YinMeng Xiao-hongLi 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2004年第4期285-285,共1页
关键词 Chromosome Aberrations chromosomes human pair 21 Fertilization in Vitro Preimplantation Diagnosis ADULT Down Syndrome FEMALE humans In Situ Hybridization Fluorescence Maternal Age PREGNANCY Pregnancy High-Risk Research Support Non-U.S. Gov't
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原发性肝癌p53基因高频缺失的双色荧光原位杂交证据 被引量:16
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作者 方嬿 黄必军 +1 位作者 梁启万 李辉梅 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期306-309,T003,共5页
目的 :探讨原发性肝癌 (HCC)中p5 3基因的缺失频率、方式、特点及其临床意义。方法 :以p5 3基因及 17号染色体着丝粒DNA为探针 ,应用间期双色荧光原位杂交 (interphasedual,FISH)技术。结果 :肝癌中p5 3基因的缺失频率为 68 0 % (68/ 10... 目的 :探讨原发性肝癌 (HCC)中p5 3基因的缺失频率、方式、特点及其临床意义。方法 :以p5 3基因及 17号染色体着丝粒DNA为探针 ,应用间期双色荧光原位杂交 (interphasedual,FISH)技术。结果 :肝癌中p5 3基因的缺失频率为 68 0 % (68/ 10 0 ) ,而配对正常肝组织中则未见有p5 3缺失 ;p5 3缺失方式多样且往往伴随 17号染色体多倍体 (r=0 5 94,P <0 0 1) ;p5 3缺失与肝癌病人的性别、年龄、HBV感染及临床分期无显著相关 (P >0 0 5 ) ,但与血清甲胎蛋白 (AFP)水平、肿瘤大小则显著相关 (P <0 0 5 ) ;有无p5 3缺失病人之间 2年存活率差异非常显著 (χ2 =11 463 ,P <0 0 1)。结论 :p5 3基因在原发性肝癌中存在高频缺失并往往伴随 17号染色体的多倍体 ;双色FISH技术为评估基因的缺失提供了特异、敏感、直观的分子细胞遗传学证据。 展开更多
关键词 原发性肝癌 P53基因 高频缺失 原位杂交
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乳腺癌17号染色体多体对HER2检测的影响及其临床病理学意义 被引量:6
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作者 王富文 应学翔 +2 位作者 夏晓天 林燕苹 何萍青 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期36-41,共6页
目的:探讨乳腺癌17号染色体多体对人类表皮生长因子受体2(epidermal growth factor receptor 2,HER2)检测结果的影响及其临床病理学意义。方法:采用荧光原位杂交(fluorescencein situhybridization,FISH)双色法检测71例原发性浸润性乳... 目的:探讨乳腺癌17号染色体多体对人类表皮生长因子受体2(epidermal growth factor receptor 2,HER2)检测结果的影响及其临床病理学意义。方法:采用荧光原位杂交(fluorescencein situhybridization,FISH)双色法检测71例原发性浸润性乳腺癌中HER2基因和17号染色体拷贝数目情况。采用HER2绝对拷贝数标准和HER2/chromosome 17比值标准,判定HER2的FISH检测结果;基于FISH检测结果,结合免疫组织化学法(immunohistochemistry,IHC)检测的HER2蛋白表达情况及相关临床病理参数进行分组对比分析。结果:无论按照HER2绝对拷贝数标准(14/71,19.7%)或HER2/chromosome17比值标准(2/71,2.8%),所有FISH检测结果示HER2基因扩展可疑的病例都为17号染色体多体;与HER2基因扩增阴性者相比,单纯17号染色体多体组在肿瘤分级、淋巴结转移以及激素受体表达上差异无统计学意义(P均>0.05);而与HER2基因扩增阳性组相比,单纯17号染色体多体组表现出更低的肿瘤分级(50.0%vs81.5%,P=0.025)、更高的淋巴结阴性率(55.6%vs25.9%,P=0.045)以及更高的雌激素受体(estrogen receptor,ER)阳性率(83.3%vs41.7%,P=0.005)和孕激素受体(progestogen receptor,PR)阳性率(87.5%vs44.4%,P=0.003)。结论:相比于HER2基因扩增组,单纯17号染色体多体组更倾向于HER2基因扩增阴性;17号染色体多体会影响HER2检测结果,是FISH检测中导致可疑结果产生的主要原因。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 染色体 17对 原位杂交 荧光 基因 ERBB-2 染色体多体
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成人Silver-Russell综合征1例并文献复习 被引量:3
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作者 卢佩颖 谷卫 +1 位作者 庞晓虹 单鹏飞 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期335-338,共4页
Silver-Russell综合征是罕见遗传性疾病,临床表现异质性大,故诊断困难。1例成人女性Silver-Russell 综合征患者,以身材矮小、肢体不对称伴右侧肥胖、第五手指弯斜和髋关节脱位为主要临床表现,染色体检测提示(46,XX)。患者10岁... Silver-Russell综合征是罕见遗传性疾病,临床表现异质性大,故诊断困难。1例成人女性Silver-Russell 综合征患者,以身材矮小、肢体不对称伴右侧肥胖、第五手指弯斜和髋关节脱位为主要临床表现,染色体检测提示(46,XX)。患者10岁时曾行右下肢延长手术。入院时肢体不对称伴右侧肥胖影响肢体功能,入院后行右侧臀部和大腿整形术,术后运动功能好转。 展开更多
关键词 综合征 染色体畸变 染色体缺失 染色体 7对 外科 整形 病例报告
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低形态学评分卵裂期胚胎的X、Y及18号染色体分析 被引量:2
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作者 罗海宁 杨清秀 +4 位作者 杜湧瑞 鲁振宇 姚汝强 王毅娜 张云山 《天津医药》 CAS 北大核心 2011年第4期292-294,386,共4页
目的:分析低形态学评分的D3卵裂期胚胎X、Y及18号染色体的非整倍体情况。方法:收集体外受精-胚胎移植术后剩余的废弃胚胎,胚胎固定后采用荧光原位杂交技术检测细胞核内的X、Y及18号染色体。结果:共收集废弃胚胎60个,其中正常胚胎29个,1... 目的:分析低形态学评分的D3卵裂期胚胎X、Y及18号染色体的非整倍体情况。方法:收集体外受精-胚胎移植术后剩余的废弃胚胎,胚胎固定后采用荧光原位杂交技术检测细胞核内的X、Y及18号染色体。结果:共收集废弃胚胎60个,其中正常胚胎29个,18号染色体异常胚胎12个,X/Y染色体异常胚胎8个,18、X/Y染色体均异常胚胎11个。观测到荧光信号的细胞核有233个,其中正常细胞核115个(49.4%),异常细胞核118个(50.6%)。18号染色体非整倍体率40.8%,X/Y染色体非整倍体率33.5%,差异无统计学意义(χ2=2.65,P>0.05)。18号染色体三体发生率(21.9%)与X/Y染色体三体发生率(12.0%)差异有统计学意义(χ2=11.58,P<0.01)。结论:D3形态评分低的胚胎有相当大的比例存在染色体异常,通用的胚胎形态学评分系统能够在一定程度上反映胚胎的染色体情况。 展开更多
关键词 胚胎发育 染色体 X 染色体 Y 染色体 18对 染色体畸变 原位杂交 荧光
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晚裂胚胎性染色体及18号染色体非整倍体分析 被引量:4
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作者 石洁 杨清秀 +1 位作者 罗海宁 张云山 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2012年第4期265-267,I0002,共4页
目的:分析晚裂胚胎性染色体及18号染色体数目异常情况。方法:应用荧光原位杂交技术检测晚裂胚胎X、Y及18号染色体的非整倍体情况,并与低评分的双原核(2PN)胚胎进行比较。结果:共收集85个胚胎,其中晚裂胚胎45个(不考虑形态学评分),成功固... 目的:分析晚裂胚胎性染色体及18号染色体数目异常情况。方法:应用荧光原位杂交技术检测晚裂胚胎X、Y及18号染色体的非整倍体情况,并与低评分的双原核(2PN)胚胎进行比较。结果:共收集85个胚胎,其中晚裂胚胎45个(不考虑形态学评分),成功固定269个核;低形态学评分的2PN胚胎40个,成功固定243个核,用CEPX/Y、CEP18染色体探针对85个胚胎共512个核进行荧光原位杂交。晚裂胚胎组的染色体数目异常率为45.7%,其中性染色体异常率为34.5%,18号染色体异常率为38%;2PN胚胎组的染色体异常率为48.5%,其中性染色体异常率为32%,18号染色体异常率为39%。2组性染色体和18号染色体的异常率差异均无统计学意义。结论:晚裂胚胎性染色体及18号染色体数目有较高的异常发生率,与低形态学评分的2PN胚胎一样,均不适合宫腔内移植。 展开更多
关键词 原位杂交 荧光 性染色体 染色体 18对 非整倍性 双原核胚胎
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散发神经鞘瘤22号染色体杂合子丢失发生的研究 被引量:3
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作者 林亦海 卞留贯 +4 位作者 薛跃华 孙青芳 赵卫国 沈建康 罗其中 《中国微侵袭神经外科杂志》 CAS 2007年第10期454-456,共3页
目的探讨散发神经鞘瘤病人22号染色体(CHR22)杂合子丢失(LOH)情况及其与肿瘤增殖的关系。方法选取4个与NF2基因密切相关的多态性微卫星标记物,应用PCR方法研究54例神经鞘瘤的LOH情况。采用Ki-67和增殖细胞核抗原(PCNA)评估增殖指数。结... 目的探讨散发神经鞘瘤病人22号染色体(CHR22)杂合子丢失(LOH)情况及其与肿瘤增殖的关系。方法选取4个与NF2基因密切相关的多态性微卫星标记物,应用PCR方法研究54例神经鞘瘤的LOH情况。采用Ki-67和增殖细胞核抗原(PCNA)评估增殖指数。结果23例(42.6%)CHR22发生LOH,听神经鞘瘤发生率显著性高于脊神经鞘瘤(χ2=5.14,P<0.05)。发生LOH者增殖指数明显高于无LOH者(Pki-67=0.0079,PPCNA=0.0021)。结论在散发神经鞘瘤中,CHR22LOH是常发事件;听神经瘤与脊神经鞘瘤LOH发生率有显著性差异,CHR22LOH与神经鞘瘤的增殖活动性有关。 展开更多
关键词 神经鞘瘤 杂合子丢失 染色体 22对
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F11R基因多态性与精神分裂症的关系 被引量:1
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作者 陶然 史杰萍 +3 位作者 郭英君 贺晨 张小娟 于雅琴 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期196-198,共3页
目的 :探讨 1号染色体上 F11R基因多态性与精神分裂症的关系。方法 :采用聚合酶链式反应 -限制性内切酶片段长度多态性 (PCR- RFL P)的方法对 12 8例精神分裂症患者、 114例健康对照 1号染色体 F11R基因上的一个 SNP进行基因型检测 ,应... 目的 :探讨 1号染色体上 F11R基因多态性与精神分裂症的关系。方法 :采用聚合酶链式反应 -限制性内切酶片段长度多态性 (PCR- RFL P)的方法对 12 8例精神分裂症患者、 114例健康对照 1号染色体 F11R基因上的一个 SNP进行基因型检测 ,应用 SPSS统计学软件数据处理 ,并进行统计学分析。结果 :等位基因 A和 G的频数分布在病例组和对照组中无统计学意义 (χ2 =0 .4 98,P>0 .0 5 ) ;AA和 AG两种基因型频数分布在病例组和对照组中也无统计学意义 (χ2 =0 .5 33,P>0 .0 5 )。结论 :1号染色体上的 F11R基因可能不是精神分裂症的易感基因。 展开更多
关键词 精神分裂症 多态现象(遗传学) 染色体 1对 F11R基因
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