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Cloning and Sequence Analysis of HN and F Protein Genes from a Strain of Goose Paramyxovirus 被引量:2
1
作者 易春华 潘杰 +3 位作者 付薇 颜健华 徐贤坤 熊毅 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第4期75-78,共4页
[ Objective] The study was to clone HN and F genes from GX1 strain of goose paramyxovirus and analyze their sequences. [ Method] According to the full nucleotide sequence of GPV-SF02 strain of goose paramyxovirus, two... [ Objective] The study was to clone HN and F genes from GX1 strain of goose paramyxovirus and analyze their sequences. [ Method] According to the full nucleotide sequence of GPV-SF02 strain of goose paramyxovirus, two pairs of pdmers were designed to amplify the HN and F genes from GX1 strain of goose paramyxovirus isolated from diseased goose in Guangxi Zhuang Autonomous Region; the amplified products were ligated into pMD18-T vector and sequenced. [ Result ] HN and F genes of this strain tested were 1 716 and 1 662 bp in full nucleotide length, respectively; both showed the homologues of about 97.3% with GPV- SF02 strain, of 80.3% -97.5% with strains LaSota, F48E9 and JS, of just 84.8% with Miyadera strain. [ Conclusion] The results show that isolated strain BX1 matches to virulent APMV-1 strain, belonging to genotype Ⅶ of APMV-1 strain. 展开更多
关键词 Goose paramyxovirus HN protein gene f protein gene CLONING Sequence analysis
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Construction of Recombinant Expression Plasmids Containing H and F Protein Genes of Canine Distemper Virus Isolated from a Mink and Their Expression in Prokaryotic Cells
2
作者 Fengyan SU Cunfa LIU +2 位作者 Tiefeng WEN Ying ZONG Quankai WANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2013年第1期38-41,共4页
[Objective] This study aimed to construct the recombinant expression plasmids containing H and F protein genes of Canine distemper virus isolated from a mink and to express these two genes in prekaryotic cells as well... [Objective] This study aimed to construct the recombinant expression plasmids containing H and F protein genes of Canine distemper virus isolated from a mink and to express these two genes in prekaryotic cells as well as to study the reactogenieity of the expressed products. [ Method ] RT-PCR amplification was used to obtain H and F protein genes; TA cloning and subclonlng techniques were used to construct the cloning plasmids(pMD-18T-H and pMD-18T-F) and recombinant expression plasmids(pET28a-H and pET28a-F) ; SDS-PAGE and Western-blotting were adopted to verify whether the target proteins were successfully expressed. [ Result] The recombinant expression plasmids pET28a-H and pET28a-F containing H and F protein genes of Canine distemper virus isolated from a mink were successfully constructed, and both the expressed H and F proteins with respectively relative molecular mass of 31 400 and 38 200 produced positive reac- tion with the CDV standard positive serum. [ Conclusion] The H and F proteins expressed in prokaryotic cells were the same with the natural ones in terms of reac- togenicity, which can be utilized for diagnosis of a CDV's infection or for an epidemiological investigation. Meanwhile, they also provide a basis for developing ge- netically engineered subunit vaccines. 展开更多
关键词 Canine distemper virus H protein gene f protein gene Expression in prokaryotic ceils
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Association Analysis of SP-SNPs and Avirulence Genes in Puccinia striiformis f. sp. tritici, the Wheat Stripe Rust Pathogen 被引量:2
3
作者 Chongjing Xia Meinan Wang +3 位作者 Anmin Wan Derick A. Jiwan Deven R. See Xianming Chen 《American Journal of Plant Sciences》 2016年第1期126-137,共12页
Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst) is one of the pathogenic fungi on wheat, caused stripe rust that is a great threat for wheat production all over the world. Intensive efforts have been made to study genetics ... Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst) is one of the pathogenic fungi on wheat, caused stripe rust that is a great threat for wheat production all over the world. Intensive efforts have been made to study genetics of wheat resistance to this disease, but few on avirulence of the pathogen due mainly to the nature of obligate biotrophism and the lack of systems for studying its genetics and molecular manipulations. To overcome these limitations, a natural Pst population comprising 352 isolates representative of a diverse virulence spectrum was genotyped using 97 secreted protein-single nucleotide polymorphism (SP-SNP) markers to identify candidate avirulence genes using association analysis. Among avirulence genes corresponding to 19 resistance genes, significantly associated SP-SNP markers were detected for avirulence genes AvYr1, AvYr2, AvYr6, AvYr7, AvYr8, AvYr44, AvYrExp2, AvYrSP, and AvYrTye. These results indicate that association analysis can be used to identify markers for avirulence genes. This study has laid the foundation for developing more SP-SNPs for mapping avirulence genes using segregating populations that can be generated through sexual reproduction on alternate hosts of the pathogen. 展开更多
关键词 Puccinia striiformis f. sp. tritici Wheat Stripe Rust Avirulence genes Secreted proteins Single Nucleotide Polymorphism Association Analysis
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鹅副粘病毒F蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:36
4
作者 刘华雷 王永坤 +3 位作者 严维巍 朱国强 周继宏 李玉峰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第6期404-407,共4页
鹅副粘病毒分离株YG97经 10日龄鸡胚增殖后纯化 ,提取病毒的基因组RNA ,采用RT_PCR一次性扩增出与预期设计的 1.7kb大小相符的特异性条带。将扩增产物提纯后克隆入pGEMR_T载体 ,经转化、筛选及酶切鉴定后 ,初步获得了含鹅副粘病毒F基因... 鹅副粘病毒分离株YG97经 10日龄鸡胚增殖后纯化 ,提取病毒的基因组RNA ,采用RT_PCR一次性扩增出与预期设计的 1.7kb大小相符的特异性条带。将扩增产物提纯后克隆入pGEMR_T载体 ,经转化、筛选及酶切鉴定后 ,初步获得了含鹅副粘病毒F基因的阳性克隆。将所获得的阳性重组质粒进一步进行了序列鉴定。序列分析表明扩增的F基因片段的长度为16 95bp ,共编码 5 5 3个氨基酸 ,F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112 R_R_Q_K_P_F117,与NDV的强毒株特征相符 ,同时也与鹅副粘病毒分离株致病性实验结果相符。同源性分析表明 ,与国内标准强毒株F48E9的核苷酸同源性为 86 % ,与国内外其它毒株的核苷酸同源性在 82 %~ 89%之间 。 展开更多
关键词 副粘病毒 f蛋白基因 克隆 序列分析
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新城疫病毒(长春株)F蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:24
5
作者 王兴龙 金宁一 +6 位作者 丁壮 金扩世 罗坤 郭志儒 王宏伟 欧阳红生 殷震 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期109-113,共5页
新城疫病毒(NDV)长春株在鸡胚增殖后纯化,提取RNA,然后利用特异性引物,经RT-PCR一次性扩增出了NDV长春株的全长F基因。将该F基因插入pKS(-)后,进行了序列测定。序列分析表明,该F基因核苷酸长度为175... 新城疫病毒(NDV)长春株在鸡胚增殖后纯化,提取RNA,然后利用特异性引物,经RT-PCR一次性扩增出了NDV长春株的全长F基因。将该F基因插入pKS(-)后,进行了序列测定。序列分析表明,该F基因核苷酸长度为1758bp,编码553个氨基酸,序列中有6个糖基化位点,13个半胱氨酸残基,裂解位点区(112~117)氨基酸序列为Gly-Arg-Gln-Gly-Arg-Leu,与所有弱毒株在这一区域的序列(Gly-Arg/Lys-Gln-Gly/Ser-Arg-Leu)相符,证明长春株为弱毒株。同源性分析表明,长春株F基因与目前国外发表的其他NDVF基因相比,核苷酸序列同源性在88%~99%之间。 展开更多
关键词 新城疫病毒 f蛋白基因 RT-PCR 序列分析
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半番鸭源禽1型副粘病毒FM01株的分离鉴定与F蛋白基因分析 被引量:16
6
作者 程龙飞 傅光华 +2 位作者 黄瑜 施少华 彭春香 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期499-502,共4页
从表现类似新城疫症状的病死半番鸭中分离到1株病毒FM01株,经血凝及血凝抑制试验证实为禽1型副粘病毒。以SPF鸡胚测定其平均致死时间为113.4h,对1d雏鸡脑内接种致病指数为0.23,表明为温和型毒株。利用RT-PCR技术一次性扩增其F蛋白全基因... 从表现类似新城疫症状的病死半番鸭中分离到1株病毒FM01株,经血凝及血凝抑制试验证实为禽1型副粘病毒。以SPF鸡胚测定其平均致死时间为113.4h,对1d雏鸡脑内接种致病指数为0.23,表明为温和型毒株。利用RT-PCR技术一次性扩增其F蛋白全基因,克隆到pMD18-T质粒载体,测序后获得F基因全序列,并推导出其相应的氨基酸序列。FM01株的F蛋白基因完整的编码区全长1662bp,编码553个氨基酸,其裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,具有温和型毒株特有的氨基酸序列结构。与常见新城疫毒株的核苷酸同源性在88.4%~99.6%之间,氨基酸同源性在89.2%~99.1%之间。 展开更多
关键词 半番鸭源 禽1型副粘病毒 分离鉴定 f蛋白基因 克隆 序列分析
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鹅源副粘病毒NA-1株F蛋白基因的克隆及其载体的构建 被引量:15
7
作者 左玉柱 乔木 +4 位作者 王学理 向华 黄海楠 常爽 丁壮 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期436-438,共3页
鹅源副粘病毒分离株 NA- 1经 1 1日龄鸡胚增殖后收集尿囊液 ,浓缩 ,提取病毒基因组总 RNA,采用 RT- PCR方法 ,一次性扩增出与预期大小相符的特异性条带。将扩增产物提纯回收后克隆入 p MD1 8- T载体 ,经转化、筛选及酶切鉴定后 ,对阳性... 鹅源副粘病毒分离株 NA- 1经 1 1日龄鸡胚增殖后收集尿囊液 ,浓缩 ,提取病毒基因组总 RNA,采用 RT- PCR方法 ,一次性扩增出与预期大小相符的特异性条带。将扩增产物提纯回收后克隆入 p MD1 8- T载体 ,经转化、筛选及酶切鉴定后 ,对阳性克隆进行了序列测定和序列分析。测序后拼接的 F基因长 1 6 72 bp,包含完整的开放阅读框 ( 1 6 6 2bp) ,编码 5 5 3个氨基酸 ,F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为 1 1 2 R- R- Q- K- R- F1 1 7,与 NDV的强毒株特征相符 ,同时也与鹅副粘病毒分离株致病性试验结果相符。根据 NDV基因分型标准 ,鹅源副粘病毒 NA- 1株归属基因 型 NDV。将 F基因克隆入转座载体 p Fast Bac ,得到重组转座载体 PFF,将 PFF转化大肠杆菌 DH1 0 Bac,提取质粒 ,得到阳性重组穿梭载体 re- Bacm id。 展开更多
关键词 鹅副粘病毒病 f蛋白基因 RT-PCR 克隆 序列分析
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新城疫病毒(青岛株)F蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:8
8
作者 王兴龙 金宁一 +6 位作者 丁壮 金扩世 米志强 郭志儒 李太元 吕杰 殷震 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期113-116,共4页
参考新城疫病毒 ( NDV)长春株的 F基因序列设计了 1对特异性引物 ,应用 RT-PCR对 NDV青岛株(野毒 )的 F基因进行了扩增 ,扩增产物克隆后测序。扩出的 F基因核苷酸长度为 792 bp,编码 2 6 1个氨基酸 ,包括完整的 F2片段和部分 F1片段。... 参考新城疫病毒 ( NDV)长春株的 F基因序列设计了 1对特异性引物 ,应用 RT-PCR对 NDV青岛株(野毒 )的 F基因进行了扩增 ,扩增产物克隆后测序。扩出的 F基因核苷酸长度为 792 bp,编码 2 6 1个氨基酸 ,包括完整的 F2片段和部分 F1片段。裂解位点区 ( 1 1 2~ 1 1 7aa)氨基酸序列为 Arg-Arg-Gln-Arg-Arg-Phe,与国外发表的强毒株序列相符 ,证明青岛株为强毒株。根据该基因推导的氨基酸序列 ,与国内外发表的 NDVF蛋白氨基酸序列相比 ,同源性为 88.1 %~ 94 .3%。 展开更多
关键词 新城疫病毒 f蛋白基因 RT-PCR 序列分析 基因克隆 青岛株
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丙型肝炎病毒F蛋白的原核表达及初步应用 被引量:8
9
作者 蒋春梅 刁振宇 +6 位作者 崔国兴 钱万红 邓小昭 许可 丁伟良 谈永飞 张云 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期134-137,共4页
目的构建丙型肝炎病毒(HCV)F基因的原核表达载体,并在大肠杆菌TG1中进行表达,用以检测丙肝患者体内抗体,并制备抗血清。方法提取患者血清中的HCVRNA,并进行基因分型。取鉴定为HCV1b型的病毒,用RT-PCR扩增HCVF蛋白基因的序列。将扩增产... 目的构建丙型肝炎病毒(HCV)F基因的原核表达载体,并在大肠杆菌TG1中进行表达,用以检测丙肝患者体内抗体,并制备抗血清。方法提取患者血清中的HCVRNA,并进行基因分型。取鉴定为HCV1b型的病毒,用RT-PCR扩增HCVF蛋白基因的序列。将扩增产物插入pGEM-T载体中,测序正确后,用EcoRI、BamHI双酶切后,再插入表达载体pGEX-4T-2中,转化大肠杆菌TG1,在IPTG诱导下表达GST-F蛋白。用亲和层析法纯化GST-F蛋白免疫BALB/c小鼠制备抗血清。并用纯化的GST-F蛋白进行ELISA法检测丙肝患者血清抗F蛋白抗体。结果在细菌裂解液中检测到重组的融合蛋白,经GlutathioneSepharose4B亲和层析柱纯化获得较高纯度的GST-F融合蛋白。应用Westernblot方法检测证实,用纯化的GST-F蛋白免疫BALB/c小鼠得到了特异性的抗体。用纯化的GST-F蛋白进行ELISA检测120例丙肝患者血清抗F蛋白抗体,82例呈阳性。结论通过上述方法制备的融合蛋白纯度较高,免疫小鼠获得的抗体具有良好的特异性。用纯化的目的蛋白检测丙肝患者血清抗F蛋白的抗体的阳性率为68%,与国外的报道接近,说明在HCV感染的自然病程中有F蛋白的产生,为研究HCVF蛋白及与HCV相关疾病的诊断和治疗提供了条件。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 f蛋白 基因克隆 蛋白表达 抗体制备
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番鸭源新城疫病毒F蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:4
10
作者 程龙飞 黄瑜 +3 位作者 傅光华 李文杨 施少华 彭春香 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期578-580,共3页
利用RT-PCR技术对番鸭源新城疫病毒FP1/02株的F蛋白基因进行分段扩增、定向克隆到pMD 18-T SimpleVector质粒载体,然后测定其核苷酸序列,拼接出F基因全序列,并推导出其相应的氨基酸序列.FP1/02株的F蛋白基因全长1690 bp,编码553个氨基酸... 利用RT-PCR技术对番鸭源新城疫病毒FP1/02株的F蛋白基因进行分段扩增、定向克隆到pMD 18-T SimpleVector质粒载体,然后测定其核苷酸序列,拼接出F基因全序列,并推导出其相应的氨基酸序列.FP1/02株的F蛋白基因全长1690 bp,编码553个氨基酸,其裂解位点的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,具有强毒株特有的氨基酸序列结构特征.核苷酸序列分析结果表明,FP1/02株与其他不同源新城疫病毒毒株之间的核苷酸序列同源性为87.2%~93.3%. 展开更多
关键词 番鸭 新城疫病毒f蛋白基因 克隆 序列分析
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甜樱桃SFB4与SFB4’基因的鉴别 被引量:13
11
作者 朱墨 张开春 +1 位作者 姜立杰 张晓明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期97-100,共4页
本研究以最近发现的李属花粉决定子候选基因“S单元型特异F-box蛋白基因(SFB)”为基 础,根据甜樱桃SFB4基因设计引物,从自交不亲和‘雷尼’和‘佳红’以及自交亲和的‘斯坦拉’总 DNA中分别扩增出SFB4和SFB4’基因的部分序列。经... 本研究以最近发现的李属花粉决定子候选基因“S单元型特异F-box蛋白基因(SFB)”为基 础,根据甜樱桃SFB4基因设计引物,从自交不亲和‘雷尼’和‘佳红’以及自交亲和的‘斯坦拉’总 DNA中分别扩增出SFB4和SFB4’基因的部分序列。经测序结果发现:SFB4’基因比SFB4基因缺失了4 个碱基TAAA。根据这个缺失差异,设计了一对引物BFP200和BFP201,这对引物只能扩增SFB4’基因, 而不能扩增SFB4基因,从而利用SFB基因区分开了甜樱桃自交不亲和的S4和自交亲和的S4’单元型。 展开更多
关键词 李属 S单元型特异f-box蛋白基因(SfB) 单元型
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小麦F-box蛋白基因的电子克隆和生物信息学分析 被引量:4
12
作者 王俊生 李俐俐 +2 位作者 杨欢 谭光轩 殷贵鸿 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2013年第2期15-19,25,共6页
为探讨F-box蛋白在小麦发育过程中的调节作用,利用电子克隆技术获得了一个小麦F-box蛋白基因,采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,... 为探讨F-box蛋白在小麦发育过程中的调节作用,利用电子克隆技术获得了一个小麦F-box蛋白基因,采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,小麦F-box蛋白由362个氨基酸组成,在N端和C端分别存在一个F-box保守结构域和一个DUF295保守结构域(功能未知),该蛋白质二级结构中以α-螺旋(23.48%)、扩展束(25.41%)和无规则卷曲(47.24%)为主,在94-115位点处可能存在一个由内向外的跨膜区,N端不存在信号肽序列,亚细胞定位于细胞质中;该F-box蛋白与二穗短柄草、玉米和水稻的F-box蛋白相似性较高,进化距离较近。 展开更多
关键词 小麦 f—box蛋白基因 电子克隆 生物信息学
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我国新城疫强毒株F糖蛋白基因的体外合成及其抗原性研究 被引量:4
13
作者 沈正达 龚振华 +8 位作者 蒋正军 胡永浩 尹燕博 孙淑芳 蔡丽娟 汪清 马洪超 宗瑞谦 赵晋军 《中国兽医科技》 CSCD 1997年第7期18-20,共3页
将我国新城疫强毒株F48E9在SPF鸡胚增殖后提取RNA,用自行设计的一对寡聚核苷酸引物进行RT-PCR,合成了F糖蛋白基因片段。将此片段与pUC19质粒重组,转化大肠杆菌JM109,从阳性克隆中提取重组质粒,再用P... 将我国新城疫强毒株F48E9在SPF鸡胚增殖后提取RNA,用自行设计的一对寡聚核苷酸引物进行RT-PCR,合成了F糖蛋白基因片段。将此片段与pUC19质粒重组,转化大肠杆菌JM109,从阳性克隆中提取重组质粒,再用PCR法扩增,获得了同样大小的DNA片段。经用特异性抗体探针检测。 展开更多
关键词 新城疫病毒 f糖蛋白基因 体外合成 抗原性
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鹅副粘病毒F蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:4
14
作者 刘华雷 王永坤 +3 位作者 严维巍 朱国强 周继宏 李玉峰 《江苏农业研究》 CSCD 2000年第3期46-49,共4页
鹅副粘病毒分离株 YG97经 1 0日龄鸡胚增殖后纯化 ,提取病毒基因组 RNA,采用 RT-PCR一次性扩增出与预期设计的 1 .7kb大小相符的特异性条带。将扩增产物提纯后克隆入 p GEMR -T载体 ,经转化、筛选及酶切鉴定后 ,初步获得了含鹅副粘病毒 ... 鹅副粘病毒分离株 YG97经 1 0日龄鸡胚增殖后纯化 ,提取病毒基因组 RNA,采用 RT-PCR一次性扩增出与预期设计的 1 .7kb大小相符的特异性条带。将扩增产物提纯后克隆入 p GEMR -T载体 ,经转化、筛选及酶切鉴定后 ,初步获得了含鹅副粘病毒 F基因的阳性克隆 ,并进行了序列测定。序列分析表明 :扩增的 F基因片段的长度为 1 695bp,共编码553个氨基酸 ,F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为 1 1 2 R-R-Q-K-R-F1 1 7,与 NDV的强毒株特征相符 ,同时也与鹅副粘病毒分离株致病性试验结果相符。同源性分析表明 :与国内标准强毒株 F48E9的核苷酸同源性为 86%,与国内外部分发表的其他 NDV毒株的核苷酸同源性在 84 %~ 89%之间 ,说明该毒株相对于经典的 NDV在 展开更多
关键词 鹅副粘病毒 f蛋白基因 PCR 序列分析 基因克隆
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丙型肝炎病毒F蛋白反式激活基因2的表达纯化及多克隆抗体制备 被引量:3
15
作者 王丹琼 郭江 +4 位作者 成军 张健康 赵龙凤 洪源 张黎颖 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期798-800,共3页
目的构建丙型肝炎病毒(HCV)F蛋白反式激活基因2(FTP2)的原核表达载体并诱导其表达,制备多克隆抗体并探讨其在临床病理组织中表达的意义。方法通过PCR获得HCVFTP2基因,将其克隆至原核表达载体pET32a(+)上,构建重组表达载体,在大肠埃希菌B... 目的构建丙型肝炎病毒(HCV)F蛋白反式激活基因2(FTP2)的原核表达载体并诱导其表达,制备多克隆抗体并探讨其在临床病理组织中表达的意义。方法通过PCR获得HCVFTP2基因,将其克隆至原核表达载体pET32a(+)上,构建重组表达载体,在大肠埃希菌BL21中诱导表达。表达产物经SDS-PAGE及Western blotting验证后进行大量表达并纯化。将纯化的重组蛋白免疫家兔获得多克隆抗体,并将此抗体作为诊断试剂观察其在正常肝组织和临床病理组织中的表达情况。结果以pET32a(+)-FTP2表达载体转化BL21菌后,经IPTG诱导,成功获得大量重组蛋白,分子量约为25kD。将此重组蛋白免疫新西兰兔获得多克隆抗体,经抗体间接ELISA检测证明,多克隆抗体效价>1:128000,免疫组化显示多克隆抗体能够与丙型肝炎、肝硬化、肝细胞癌等临床病理组织产生FTP2抗原反应。结论成功表达了HCV的FTP2蛋白并制备了其多克隆抗体,证实FTP2与丙型肝炎、肝硬化的发病机制密切相关。 展开更多
关键词 肝炎病毒 f蛋白反式激活基因2 原核表达
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鹅副粘病毒GX1株的HN和F蛋白基因的克隆和序列分析 被引量:4
16
作者 易春华 潘杰 +3 位作者 付薇 颜健华 徐贤坤 熊毅 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第25期11900-11902,共3页
[目的]克隆鹅副粘病毒GX1株HN基因与F基因,并进行序列分析。[方法]根据Genbank已发表的鹅副粘病毒GPV—SF02株基因组核苷酸序列设计2对引物,对从广西发病鹅分离到的鹅副粘病毒毒GX1株的HN和F基因进行PCR扩增,将扩增产物与pMD18-T载... [目的]克隆鹅副粘病毒GX1株HN基因与F基因,并进行序列分析。[方法]根据Genbank已发表的鹅副粘病毒GPV—SF02株基因组核苷酸序列设计2对引物,对从广西发病鹅分离到的鹅副粘病毒毒GX1株的HN和F基因进行PCR扩增,将扩增产物与pMD18-T载体连接并测序。[结果]该株副粘病毒株的HN基因和F基因核苷酸序列全长分别为1716和1662bp,与GPV—SFO2株的同源性均在97.3%左右,与LaSota株、F48E9株、JS株的同源性为80.3%~97.5%,与Miyadera株的同源性仅84.8%。[结论]分离株GX1株与禽Ⅰ型副粘病毒(APMV-1)强毒株特征相符,属于APMV-1基因Ⅶ型。 展开更多
关键词 鹅副粘病毒 HN蛋白基因 f蛋白基因 克隆 序列分析
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鼻咽癌细胞中表达上调的新基因NAG23(FBXO30)的克隆与分析 被引量:6
17
作者 李忠花 曹利 +7 位作者 向娟娟 张必成 向秋 唐珂 周鸣 李小玲 李伟芳 李桂源 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第9期906-910,共5页
目的:分离位于6号染色体长臂鼻咽癌高频等位基因不平衡位点D6S1581(6q25.3-27)附近与鼻咽癌相关的新基因。方法:运用差异RT-PCR检测定位于D6S1581附近的11个表达序列标签(expressedsequencetags,EST)在正常人鼻咽上皮细胞和鼻咽癌细胞... 目的:分离位于6号染色体长臂鼻咽癌高频等位基因不平衡位点D6S1581(6q25.3-27)附近与鼻咽癌相关的新基因。方法:运用差异RT-PCR检测定位于D6S1581附近的11个表达序列标签(expressedsequencetags,EST)在正常人鼻咽上皮细胞和鼻咽癌细胞系中的表达水平,并对其中一个表达上调的EST在鼻咽癌组织和正常鼻咽组织中的表达情况进行分析。用Northern杂交验证其表达差异并检测其在多脏器中的表达及其所代表基因的转录本大小。利用生物信息学资源克隆并获得其全长cDNA,对该序列进行初步分析。结果:获得了一个位于6q25.3-27的在鼻咽癌中表达上调的新基因,命名为NAG23(FBXO30)(GenBank收录编号:AF248640)。该基因在68.9%的鼻咽癌活检组织中表达上调,cDNA全长3301bp,预测其开放阅读框编码一个含390个氨基酸的胞浆蛋白,该蛋白含一个F-box基序。结论:NAG23基因是一个在鼻咽癌中表达上调的新基因,很可能编码一新的F-box蛋白。NAG23可能参与了鼻咽癌的发生发展。 展开更多
关键词 鼻咽肿瘤 基因克隆 f-BOX蛋白 NAG23基因
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FBXO39基因对肿瘤细胞代谢分子的影响 被引量:2
18
作者 刘智勇 上官聪 +3 位作者 吴道兵 刘晓雯 赵婷 李丹 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第3期202-207,共6页
FBXO39是F-box蛋白家族中的一员,研究表明该蛋白是一个新的候选肿瘤-睾丸抗原,可能与人类肿瘤的发生密切相关。为了探讨FBXO39基因的生物学功能,实验中首先检测了FBXO39在不同肿瘤细胞系中的表达水平,并通过分子克隆技术构建了FBXO39的... FBXO39是F-box蛋白家族中的一员,研究表明该蛋白是一个新的候选肿瘤-睾丸抗原,可能与人类肿瘤的发生密切相关。为了探讨FBXO39基因的生物学功能,实验中首先检测了FBXO39在不同肿瘤细胞系中的表达水平,并通过分子克隆技术构建了FBXO39的真核表达载体,进而利用高通量的PCR array代谢组学分析方法在低表达FBXO39的MCF7细胞中筛选受FBXO39调节的代谢相关基因,最后采用定量PC R实验在低表达FBXO39的Ntera2细胞中验证筛选出来的代谢基因。结果显示,在MCF7和Ntera2肿瘤细胞中,6个代谢基因(ALDH9A1、MCT1、DLAT、HMGCS、FASN、GLUL)的表达受FBXO39的正向调控,表明FBXO39可能通过上调这些基因的表达参与肿瘤细胞的代谢过程。 展开更多
关键词 f-BOX蛋白 fBXO39基因 真核表达载体 肿瘤代谢 PCR ARRAY
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鸵鸟源新城疫病毒TN株F基因的克隆与序列分析 被引量:2
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作者 文明 伍祥龙 +3 位作者 唐源 温贵兰 汪德生 周碧君 《中国兽药杂志》 2007年第12期16-19,共4页
应用PCR技术对1株鸵鸟源新城疫病毒TN株融合蛋白基因(F基因)进行扩增,将其克隆到pMD18-T载体后进行序列测定,并与国内外NDV毒株对应序列进行比较分析.结果表明,TN株F基因的长度为1 662 bp,可编码553个氨基酸,其裂解位点的氨基酸序列为11... 应用PCR技术对1株鸵鸟源新城疫病毒TN株融合蛋白基因(F基因)进行扩增,将其克隆到pMD18-T载体后进行序列测定,并与国内外NDV毒株对应序列进行比较分析.结果表明,TN株F基因的长度为1 662 bp,可编码553个氨基酸,其裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,为1株新城疫弱毒株;与贵州省其他禽源(包括肉鸡、蛋鸡、越南斗鸡、七彩山鸡和鸽子等)毒株间的核苷酸同源性为84.0%~89.6%,氨基酸同源性为87.5%~92.1%;与国内外NDV代表株(Lasota株、B1株、F48E9株、CH2000株和TW2000株)的核苷酸同源性为84.4%~98.6%,氨基酸同源性为88.3%~98.0%.经系统发生树分析,TN株与NDV弱毒株Lasota株和B1株在同一分支上,属于基因II型NDV. 展开更多
关键词 鸵鸟 新城疫病毒 融合蛋白基因 序列分析
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沙田柚F-box蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 郭丹妮 刘玉洁 +4 位作者 张渝 顾金燕 覃信梅 李惠敏 秦新民 《湖北农业科学》 2016年第14期3723-3726,3729,共5页
采用生物信息学方法,对沙田柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.]F-box蛋白基因编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因全长为1 427 bp(Gen Bank登录号为KR36... 采用生物信息学方法,对沙田柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.]F-box蛋白基因编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,该基因全长为1 427 bp(Gen Bank登录号为KR363148),开放阅读框(ORF)全长为1 101 bp,共编码366个氨基酸,编码蛋白质的分子质量43.09 ku,理论等电点5.15。沙田柚F-box蛋白基因编码蛋白含有一个植物F-box蛋白家族的保守结构域,为亲水性非分泌不稳定蛋白,不跨膜运动,共有30个可能的磷酸化位点。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与甜橙(Citrus sinensis,KDO71185)和克莱门柚(Citrus clementina,XP_006425495)F-box蛋白的同源性分别为99%、98%。系统进化树表明,沙田柚F-box蛋白基因与与甜橙(Citrus sinensis,KDO71185)和克莱门柚(Citrus clementina,XP_006425495)亲缘关系很近,属于同一进化分支。 展开更多
关键词 沙田柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.cv.Shatian Yu.] f-box蛋白基因 序列分析
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