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玉米大斑病菌cDNA文库的构建及转录因子StMR1互作蛋白的筛选 被引量:1
1
作者 王秋月 段鹏亮 +3 位作者 李海笑 刘宁 曹志艳 董金皋 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期281-289,共9页
【目的】筛选玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)转录因子的互作蛋白,解析黑色素调控转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的分子机制。为解析玉米大斑病菌侵染过程中转录因子的调控网络,阐明病菌的致病机理提供参考。【方法】收集玉... 【目的】筛选玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)转录因子的互作蛋白,解析黑色素调控转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的分子机制。为解析玉米大斑病菌侵染过程中转录因子的调控网络,阐明病菌的致病机理提供参考。【方法】收集玉米大斑病菌菌丝和孢子不同萌发阶段作为试验材料,采用Gateway方法构建玉米大斑病菌cDNA文库,使用同源重组的方法构建转录因子StMR1的诱饵载体,采用酵母双杂交技术筛选其互作蛋白并进行一对一验证。【结果】构建的玉米大斑病菌文库插入的平均片段长度大于1000 bp,初级文库及次级文库的库容量为1.2×107和1.04×107CFU,重组率为100%,可以用于酵母双杂交筛选。成功构建可以用于筛库的诱饵载体pGBKT7-StMR1,经初筛与复筛得到3个互作蛋白,一对一验证短链脱氢酶、糖基转移酶、富含亮氨酸重复序列蛋白均与转录因子StMR1存在互作。【结论】成功构建了丰富度高且质量好的玉米大斑病菌cDNA文库并筛选到了与转录因子StMR1互作的蛋白。 展开更多
关键词 玉米大斑病菌 cdna文库 转录因子 酵母双杂交 互作蛋白
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白菜种子cDNA酵母文库的构建及BrTTG1互作蛋白的筛选及分析
2
作者 任延靖 张鲁刚 +2 位作者 赵孟良 李江 邵登魁 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期223-232,共10页
【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库... 【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库,通过gateway技术构建诱饵载体pGBKT7-TTG1并进行酵母双杂交筛库。【结果】酵母文库库容为1.2×10^(7)CFU,文库滴度是5.0×10^(7)CFU/mL,插入片段平均长度大于1000 bp,诱饵载体在酵母中无自激活活性。通过构建的诱饵载体pGBKT7-TTG1与构建的cDNA文库杂交,共获得了38个阳性互作蛋白,功能预测显示其中一个蛋白注释为MYB转录因子,注释为MYB73,序列分析结果显示该基因含有R2R3-MYB型抑制子保守基序C1和C2,推测该基因为白菜中参与种皮颜色形成的R2R3-MYB型抑制子,暗示着白菜中可能存在不同MYB转录因子参与的调控网络,影响着原花青素的形成。【结论】本研究构建了白菜种子组织的酵母双杂交cDNA文库,获得了38个TTG1阳性互作蛋白,首次挖掘到了可能影响白菜种皮颜色原花青素形成的R2R3-MYB型抑制子MYB73,为后期探究白菜种皮原花青素的调控网络奠定良好的基础。 展开更多
关键词 白菜种皮颜色 cdna文库 酵母双杂交 互作蛋白 MYB73 基因克隆 表达分析
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矢车菊不同颜色花瓣酵母cDNA文库的构建
3
作者 邓成燕 王佳颖 戴思兰 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期115-122,共8页
【目的】矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制尚不明晰。本研究采用Gateway技术构建了矢车菊6个不同花色品种花瓣的酵母cDNA文库,以期进一步通过酵母单杂交或双杂交技术筛选参与调控花瓣呈色的关键互作蛋白。【方法】... 【目的】矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制尚不明晰。本研究采用Gateway技术构建了矢车菊6个不同花色品种花瓣的酵母cDNA文库,以期进一步通过酵母单杂交或双杂交技术筛选参与调控花瓣呈色的关键互作蛋白。【方法】本研究以白色、粉色、红色、蓝色、紫色和墨色矢车菊花瓣为材料,提取总RNA后分离和纯化mRNA,合成双链cDNA后依次进行BP重组反应和LR重组反应,分别获得初级和次级文库。最后将次级文库质粒转化酵母Y187,获得矢车菊不同颜色花瓣的酵母cDNA文库。【结果】质量鉴定结果显示:初级文库的库容量为1.3×10^(7) CFU,重组率为100%,且插入片段长度均在1000 bp以上;次级文库的库容量为1.6×10^(7) CFU,重组率为100%,且插入片段长度均在1000 bp以上。酵母文库的滴度为3.5×10^(7) CFU/mL,随机挑选的24个单克隆经PCR检测后均扩增出明亮条带,重组率为100%,插入片段长度均大于1000 bp。【结论】本研究构建的矢车菊不同颜色花瓣酵母cDNA文库的质量较高,能满足酵母文库筛选的试验要求,为后续探究矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制提供了材料基础。 展开更多
关键词 矢车菊 花色 酵母 cdna文库 GATEWAY技术
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橡胶树棒孢霉落叶病菌酵母单杂交cDNA文库及CcCas5启动子诱饵载体的构建
4
作者 胡国豪 杨子平 +2 位作者 刘铜 张荣意 侯巨梅 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期205-212,共8页
为了筛选出与CcCas5启动子结合的转录因子,本研究构建了橡胶树棒孢霉落叶病菌的酵母单杂交cDNA表达文库和CcCas5启动子诱饵载体,并对3-氨基-1,2,4-三唑(3-amino-1,2,4-triazole,3-AT)的最佳抑制浓度进行了筛选。结果显示,构建的酵母单杂... 为了筛选出与CcCas5启动子结合的转录因子,本研究构建了橡胶树棒孢霉落叶病菌的酵母单杂交cDNA表达文库和CcCas5启动子诱饵载体,并对3-氨基-1,2,4-三唑(3-amino-1,2,4-triazole,3-AT)的最佳抑制浓度进行了筛选。结果显示,构建的酵母单杂交cDNA表达文库总容量为3.49×10^(6)cfu,插入片段主要分布于750~2000 bp之间,重组率为95.8%;克隆了CcCas 5基因2600 bp的启动子序列,预测获得真菌主要的10大类转录因子的结合位点165个;构建了分别携带1500 bp和1000 bp启动子序列的酵母单杂交启动子诱饵载体,10 mmol/L的3-AT能抑制pHis2.1-pCcCas5-1000和pHis2.1-pCcCas5-1500的背景表达。试验结果为通过酵母单杂交筛选与CcCas5启动子结合的转录因子和进一步研究转录因子对CcCas5表达的调控作用奠定基础。 展开更多
关键词 橡胶树 多主棒孢 CcCas5 启动子 酵母单杂交 cdna文库
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灰霉菌胁迫下番茄叶片cDNA文库构建及SlbZIP1互作蛋白筛选鉴定
5
作者 马燕 韩玉龙 +3 位作者 吴兴兴 李爽 丁小雨 杨玉婷 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第18期35-41,共7页
为筛选番茄在灰霉菌侵染下与bZIP转录因子SlbZIP1(Solyc01g008730.2.1)互作的蛋白,以感病番茄Moneymaker为材料,提取接种灰霉菌胁迫处理后0、24、48、72、96 h的番茄叶片的总RNA,通过三框法构建cDNA酵母文库,计算文库库容量、重组效率... 为筛选番茄在灰霉菌侵染下与bZIP转录因子SlbZIP1(Solyc01g008730.2.1)互作的蛋白,以感病番茄Moneymaker为材料,提取接种灰霉菌胁迫处理后0、24、48、72、96 h的番茄叶片的总RNA,通过三框法构建cDNA酵母文库,计算文库库容量、重组效率。同时,以SlbZIP1为诱饵,利用构建的文库探索其在灰霉菌侵染过程中的互作蛋白,并对其中可能参与病原菌防御反应的潜在蛋白在酵母中进行互作验证。结果表明,酵母文库库容达到1.5×10^(6)CFU,重组效率为98%。酵母双杂交共计筛选到14个与SlbZIP1互作的潜在蛋白。进一步互作验证表明,SlbZIP1与谷氧还蛋白SlGRXC9、SlGRXC6、bZIP转录因子SlTGA2.2及钙调蛋白SlCaM1均存在互作。上述结果可为进一步阐明SlbZIP1对腐生型真菌病害的抗病分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 灰霉菌 cdna文库 bZIP转录因子 互作蛋白
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麦根腐平脐蠕孢cDNA文库的构建及BsTup1互作蛋白筛选
6
作者 李长水 耿月华 +5 位作者 姚萌 赵炳森 谢顺培 徐超 马庆周 张猛 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期218-227,共10页
【目的】深入探究麦根腐平脐蠕孢(Bipolaris sorokiniana)生长发育及致病力的分子作用机制,并鉴定BsTup1的互作蛋白。【方法】利用麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)孢子和不同时期的菌丝体为材料,构建酵母双杂交cDNA文库,以BsTup1基因为... 【目的】深入探究麦根腐平脐蠕孢(Bipolaris sorokiniana)生长发育及致病力的分子作用机制,并鉴定BsTup1的互作蛋白。【方法】利用麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)孢子和不同时期的菌丝体为材料,构建酵母双杂交cDNA文库,以BsTup1基因为诱饵来筛选酵母双杂交文库,确定与BsTup1相互作用的蛋白。【结果】1)利用SMART(switching mechanism at 5′end of the RNA transcript)技术首次成功构建了麦根腐平脐蠕孢(B.sorokini-ana)分生孢子和菌丝体的混合cDNA文库。文库鉴定结果表明,构建的cDNA文库库容为4.8×10^(7) cfu·mL^(-1),文库插入片段重组率达100%且平均大小为1000 bp。2)构建了pGBKT7-BsTup1诱饵载体,无自激活活性。3)使用诱饵蛋白载体pGBKT7-BsTup1对麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)酵母双杂交cDNA文库进行筛选,经测序、序列比对和酵母回转验证,获得38个与BsTup1相互作用的候选蛋白。【结论】成功构建了麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)的cDNA文库,并鉴定出38个与BsTup1相互作用的候选蛋白。 展开更多
关键词 麦根腐平脐蠕孢 SMART技术 cdna文库 酵母双杂 BsTup1
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cDNA文库的构建及其在兽医研究中的应用
7
作者 孙浩 李文龙 +3 位作者 杨靖卿 迟雪 孙佳音 刘东旭 《现代畜牧科技》 2024年第10期139-141,共3页
cDNA文库是一个包含特定组织或细胞类型全套基因表达信息的克隆集合,是进行基因表达分析和功能研究的重要工具。构建高质量的cDNA文库对于捕获全面的转录信息至关重要,这涉及样本的选择、处理、cDNA的合成和文库的构建等一系列步骤的优... cDNA文库是一个包含特定组织或细胞类型全套基因表达信息的克隆集合,是进行基因表达分析和功能研究的重要工具。构建高质量的cDNA文库对于捕获全面的转录信息至关重要,这涉及样本的选择、处理、cDNA的合成和文库的构建等一系列步骤的优化。该文介绍了cDNA文库的概念、构建技术及其在兽医学中的应用,并对技术进展和未来的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 cdna文库 兽医学 疾病诊断 应用研究
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cDNA文库构建策略及其分析研究进展 被引量:81
8
作者 晏慧君 黄兴奇 程在全 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第1期1-6,共6页
cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。经典cDNA文库存在克隆的片段短等缺点,而全长cDNA文库则能提供完整的mRNA信息,从... cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。经典cDNA文库存在克隆的片段短等缺点,而全长cDNA文库则能提供完整的mRNA信息,从而克隆cDNA全长;对文库进行均一化处理即均一化cDNA文库,可以增加克隆低丰度mRNA的机会;差减cDNA文库在研究生物体某一时期基因差异表达上具有重要的意义;改进的固相cDNA很大程度上提高了建库的效率和质量。本文以阐述基本原理为主,介绍几种近年来常用的cDNA构建的方法及其优缺点。 展开更多
关键词 cdna文库 cdna全长 基因克隆 均一化cdna文库 差减cdna文库 固相cdna文库 快速扩增cdna末端(RACE)
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应用cDNA微矩阵基因芯片筛选运动性心肌肥大相关基因的初步研究 被引量:23
9
作者 田振军 张志琪 +2 位作者 唐量 郭进 刘健 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期122-126,共5页
目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按... 目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按微矩阵 (12× 12点× 16亚矩阵 ,点间距离 375 μm)点制于硅烷化玻片上 ,制备成cDNA芯片。将等量抽提纯化的运动组和对照组小鼠心肌组织mRNA ,分别与掺入的荧光分子Cy3和Cy5经逆转录合成cDNA荧光探针 ,混合后再与cD NA芯片杂交 ,通过芯片扫描仪对荧光信号图像进行扫描 ,经计算机分析比较运动组和安静对照组心肌组织中基因表达谱的变化。结果 :在 2 2 0 1条待研究基因中 ,两组小鼠心肌组织间存在差异表达的基因。具有显著表达差异的基因有 71条 ,其中上调基因有 37条 ,下调基因有 34条。结果显示 :cDNA芯片技术筛选运动性心肌肥大相关基因具有高通量、高敏度、高效率、大规模和并行性等优点。 展开更多
关键词 cdna芯片 cdna微矩阵基因芯片 基因 差异表达 运动性心肌肥大
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一步法扩增IBDV上海株全长基因组cDNA 被引量:2
10
作者 孙建和 陆苹 +1 位作者 赵渝 李晖 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期194-197,共4页
为了研究鸡传染性法氏囊病病毒 (IBDV)上海株的全部核苷酸序列 ,应用蛋白酶K消化、割胶纯化获得了高纯度的dsRNA ,应用随机引物合成了cDNA的第一链。参照基因库中相关IBDV毒株的基因序列 ,设计合成了两对引物 ,一步扩增出IBDV上海株全... 为了研究鸡传染性法氏囊病病毒 (IBDV)上海株的全部核苷酸序列 ,应用蛋白酶K消化、割胶纯化获得了高纯度的dsRNA ,应用随机引物合成了cDNA的第一链。参照基因库中相关IBDV毒株的基因序列 ,设计合成了两对引物 ,一步扩增出IBDV上海株全长基因组cDNA的A片段和B片段。为了验证获得的A片段和B片段的正确性 ,以扩增出的A片段为模板 ,成功扩增出IBDV的VP2 基因 ,并应用T载体进行了克隆和测序 ,测序结果显示 ,其与国内外数株IBDV毒株的同源性很高 ,表明本文建立的扩增IBDV全长基因组cDNA的一步法正确。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 全长基因组 cdna VP2基因 基因克隆 一步法扩增 IBDVD上海株
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丹参功能基因组学研究Ⅰ——cDNA芯片的构建 被引量:28
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作者 崔光红 黄璐琦 +3 位作者 唐晓晶 邱德有 王学勇 付桂芳 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1137-1141,共5页
目的:构建丹参cDNA芯片,为基因表达谱研究提供条件。方法:采用CTAB法提取丹参根总RNA,采用Pharmacia公司QuichprepTMMicro mRNA Purifi Cation Kit分离mRNA后,通过在cDNA分子两端加上EcoRⅠ/NotⅠ接头,在T4多核苷酸激酶的作用下磷酸化,... 目的:构建丹参cDNA芯片,为基因表达谱研究提供条件。方法:采用CTAB法提取丹参根总RNA,采用Pharmacia公司QuichprepTMMicro mRNA Purifi Cation Kit分离mRNA后,通过在cDNA分子两端加上EcoRⅠ/NotⅠ接头,在T4多核苷酸激酶的作用下磷酸化,与表达载体λZAP Express Predigested Vector连接,然后用包装蛋白在体外包装连接产物,感染E.coliXL1-Blue MRF’构建成cDNA文库。挑取分离良好的噬菌斑进行PCR扩增,经过电泳检测、纯化、再次电泳检测后得到的克隆用于芯片点制。以丹参actin基因作为阳性对照,不含DNA的点样液和Poly A为阴性对照。结果:cDNA文库插入片段长度为500~2 500 bp。共得到4 354个克隆用于芯片点制。单色荧光(Cy3)杂交显示,阳性对照均出现杂交信号,阴性点没有杂交信号。整张芯片背景清晰,漏点少,杂交点为完整的圆形,芯片质量完好。结论:该芯片的制作为首张有关道地药材的cDNA芯片,为丹参功能基因组的研究提供了强有力的工具。 展开更多
关键词 丹参 cdna芯片 功能基因组学
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与绵羊KAP6-1相似的6个绒山羊全长cDNA的克隆与序列分析 被引量:37
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作者 尹俊 扈庭茂 +3 位作者 李金泉 张春兰 郭志成 周欢敏 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第5期502-507,共6页
用SMARTTM技术构建了绒山羊体侧部皮肤组织的cDNA文库 ,随机挑选克隆提取质粒 ,用M13正向测序引物对插入片段进行测序 ,得到 6 36个cDNA序列。与GenBank数据库比对 ,有 4 1个序列与绵羊角蛋白关联蛋白(KeratinAssociatedProtein ,KAP6 ... 用SMARTTM技术构建了绒山羊体侧部皮肤组织的cDNA文库 ,随机挑选克隆提取质粒 ,用M13正向测序引物对插入片段进行测序 ,得到 6 36个cDNA序列。与GenBank数据库比对 ,有 4 1个序列与绵羊角蛋白关联蛋白(KeratinAssociatedProtein ,KAP6 1)cDNA高度同源。 4 1个序列可归为 6个不同的cDNA ,GenBank登陆号分别为AY310 74 9、AY310 75 0、AY310 75 1、AY310 75 2、AY310 75 3和AY310 75 4。与绵羊KAP6 1基因组基因比较 ,推测这 6个序列为全长cDNA ,分别为编码 82、84、71、71、83和 83个氨基酸的碱性蛋白质 ,甘氨酸和酪氨酸的含量大于 6 0 % ,它们之间核苷酸序列的一致性大于 5 5 4 % ,读码框氨基酸序列的一致性大于 79 8%。与其他物种KAP6s比较 ,绒山羊的 6个cDNA和绵羊的KAP6 1cDNA的序列一致性最高 ,为 81 9%~ 98 8% ,不同物种KAP6 1之间氨基酸序列一致性大于 5 0 %。 展开更多
关键词 绒山羊 KAP6-1 全长cdna
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凋亡相关新基因 TFAR19 的 cDNA 克隆、表达和功能研究 被引量:26
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作者 刘红涛 王玉刚 +5 位作者 张颍妹 宋泉声 狄春晖 陈光慧 汤建 马大龙 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1998年第5期6-10,共5页
利用RDA技术从人白血病细胞TF-1中克隆成功一个与凋亡相关的新基因TFAR19。序列分析表明,TFAR19cDNA全长559bp,其中25—399bp编码125个氨基酸的蛋白质。mRNA斑点杂交分析表明TFAR19... 利用RDA技术从人白血病细胞TF-1中克隆成功一个与凋亡相关的新基因TFAR19。序列分析表明,TFAR19cDNA全长559bp,其中25—399bp编码125个氨基酸的蛋白质。mRNA斑点杂交分析表明TFAR19在50种组织中均有不同程度的表达。在大肠杆菌中表达并纯化了重组TFAR19蛋白质,制备了多克隆抗体,WesternBlot发现TFAR19蛋白在凋亡的TF-1细胞中高表达。瞬时转染TFAR19正义基因后,TF-1细胞去细胞因子后凋亡速度增加。研究表明它能抑制胃癌细胞株803细胞和Hela细胞的生长,促进它们的去血清所致的凋亡。 展开更多
关键词 TF-1细胞 凋亡 cdna 免疫学
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Gateway~技术构建交链孢菌JH505 cDNA文库 被引量:12
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作者 龙松华 张宁 +2 位作者 邱德文 黎定军 黄炜 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期963-965,共3页
Gateway○R技术构建cDNA文库,利用λ噬菌体的位点特异性重组,避免使用限制性内酶切割cDNA,能够解决常规方法构建cDNA文库的技术缺陷。首次应用Gateway○R技术构建交链孢菌cDNA文库,经检测cDNA入门文库的滴度达到1×107cfumL,文库总... Gateway○R技术构建cDNA文库,利用λ噬菌体的位点特异性重组,避免使用限制性内酶切割cDNA,能够解决常规方法构建cDNA文库的技术缺陷。首次应用Gateway○R技术构建交链孢菌cDNA文库,经检测cDNA入门文库的滴度达到1×107cfumL,文库总容量为9×107cfu,平均插入片段为1510bp。通过LR重组把入门文库转换为表达文库,表达文库的滴度为1.58×106cfu/mL,文库总容量为6.32×106cfu,平均插入片段大小为1680bp。表达文库的构建为进一步克隆植物激活蛋白基因打下了基础。 展开更多
关键词 GATEWAY技术 交链孢菌 激活蛋白 cdna入门文库 cdna表达文库
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利用SMART技术构建锯缘青蟹精巢和卵巢的cDNA文库 被引量:19
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作者 贾锡伟 王艺磊 +1 位作者 张子平 李少菁 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期547-550,共4页
采用RDP试剂(改进自ChomczynskiandSacchi1987)提取锯缘青蟹精巢和卵巢的总RNA,经oligotex试剂盒纯化得到mRNA.利用SMART(switchingmechanismat5'endofRNAtranscript)技术,构建成精巢和卵巢的全长cDNA文库.在构建好的文库中,精巢的... 采用RDP试剂(改进自ChomczynskiandSacchi1987)提取锯缘青蟹精巢和卵巢的总RNA,经oligotex试剂盒纯化得到mRNA.利用SMART(switchingmechanismat5'endofRNAtranscript)技术,构建成精巢和卵巢的全长cDNA文库.在构建好的文库中,精巢的文库含有约1.45×106的重组子,卵巢的文库含有约为1.75×106的重组子.插入cDNA长度为500bp~3kb,说明两文库均具有良好的质量,为进一步筛选、克隆精巢与卵巢特异表达基因奠定了基础. 展开更多
关键词 SMART技术 精巢 卵巢 cdna文库 锯缘青蟹 养殖
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家蝇防御素基因的cDNA克隆及序列分析 被引量:23
16
作者 王来城 王金星 +1 位作者 王来元 赵小凡 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第3期408-413,共6页
Defensin is a kind of cationic, inducible antimicrobial peptide found in a large range of living organisms that contributes to host defense by disrupting the cytoplasmic membrane of microorganisms. With their broad an... Defensin is a kind of cationic, inducible antimicrobial peptide found in a large range of living organisms that contributes to host defense by disrupting the cytoplasmic membrane of microorganisms. With their broad antimicrobial spectrum and strong pharmaceutical effects, antimicrobial peptides, including defensins, represent a source of novel antibiotic agents. A novel full-length 430 base pairs cDNA of an insect defensin was cloned using polymerase chain reaction (PCR) from the cDNA library of houseflies (Musca domestica) that had been challenged by E. coli and Staphylococcus aureus. Sequence analysis revealed that the open reading frame of the cDNA encoded a 92-amino acid peptide, which contained an NH 2-terminal signal sequence (1-22) followed by a propeptide and the mature peptide (53-92). The sequence identity with other insect defensin is between 51% and 73%. The mature peptide, with a predicted molecular weight of 4\^0 kDa, and pI of 8\^69, has 1 negative charged amino acid and 4 positice ones. The putative housefly defensin is characterized by 6 invariant cysteine residues forming 3 disulfide bonds, Cys1-Cys4, Cys2-Cys5 and Cys3-Cys6. These results suggest that the novel full-length cDNA of the defensin gene, denominated Mdde, has been successfully cloned from houseflies. 展开更多
关键词 家蝇 防御素基因 cdna 克隆 序列分析 昆虫 免疫防御系统
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RACE法分离团头鲂生长抑素全长cDNA及其序列测定 被引量:20
17
作者 俞菊华 夏德全 +3 位作者 杨弘 贺艳辉 陈勇军 吴婷婷 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期533-539,共7页
生长抑素具有抑制脑垂体GH释放的作用,是调控鱼类生长的主要激素之一。本研究采用RT和RACE(rapid amplification of cDNA ends)法,分离和测定了团头鲂脑中生长抑素PSSI cDNA的全长核苷酸序列,并对该基因进行了结构和系统进化分析。3’R... 生长抑素具有抑制脑垂体GH释放的作用,是调控鱼类生长的主要激素之一。本研究采用RT和RACE(rapid amplification of cDNA ends)法,分离和测定了团头鲂脑中生长抑素PSSI cDNA的全长核苷酸序列,并对该基因进行了结构和系统进化分析。3’RACE扩增得到700bp左右的片段,5’RACE分离得到500bp左右的片段,把3’片段与5’片段拼接得到全长cDNA。cDNA全长735bp[不含poly(A)],5’端非翻译区有100nt,3’端290bP[不包含poly(A)],阅读框(open reading frame,ORF)345bp。该序列与金鱼PSSI cDNA序列同源性为90%,主要差异在5’端非翻译区。团头鲂生长抑素mRNA阅读框编码114个氨基酸,包括一些酶切位点,产生26个氨基酸的大分子态生长抑素,进一步加工成与人等结构相似的14个氨基酸的生长抑素;团头鲂生长抑素前体氨基酸序列与金鱼、虹鳟、鲶鱼、鮟鱇、蛙、牛、鼠、鸡、猴、人等的比较发现,它与金鱼的同源性最高达95%,与鮟鱇最低50%,与人68%。这说明生长抑素基因在长期的进化中相当保守,同时,也因为鱼类生活环境多样导致基因变异较大。 展开更多
关键词 RACE法 分离鉴定 团头鲂 生长抑素 cdna 序列测定
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粉尘螨Ⅰ类变应原(Der fⅠ)的cDNA克隆及序列分析 被引量:45
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作者 郝敏麒 徐军 钟南山 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期213-215,共3页
目的获得我国广州地区粉尘螨 类变应原 (Der f ) c DNA片段 ,为构建 DNA疫苗或表达重组蛋白打下基础。方法挑取经选择鉴定的活粉尘螨 ,提取总 RNA,采用 RT- PCR的方法扩增 Der f 片断 ,进行克隆、测序和分析。结果获得长度为 6 32个碱... 目的获得我国广州地区粉尘螨 类变应原 (Der f ) c DNA片段 ,为构建 DNA疫苗或表达重组蛋白打下基础。方法挑取经选择鉴定的活粉尘螨 ,提取总 RNA,采用 RT- PCR的方法扩增 Der f 片断 ,进行克隆、测序和分析。结果获得长度为 6 32个碱基对的核苷酸片断 ,序列分析结果和 Genebank上去除内含子后的基因序列 (em b| X6 5 196 .1| )同源性为99% ,其中有 6个碱基不同 ,推导的编码氨基酸序列同源性为 10 0 %。结论我们首次获得广州地区的 Der f 的 c DNA克隆 ,该克隆 c DNA序列与 Genebank上已公布的 Der f 序列高度同源。 展开更多
关键词 粉尘螨 变应原 cdna 克隆 序列分析
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利用Lfy cDNA转化猕猴桃的研究 被引量:22
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作者 郭卫东 沈向 +1 位作者 李嘉瑞 郑学勤 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期116-117,共2页
利用促进早实性状的LfycDNA转化猕猴桃,建立了猕猴桃遗传转化体系。经过点杂交检测初步证实,采用农杆菌菌株LBA4404介导的叶盘法转化猕猴桃,将LfycDNA导入猕猴桃基因组中。
关键词 猕猴桃 LFY cdna 遗传转化
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草鱼肠道cDNA文库构建及部分ESTs分析 被引量:18
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作者 张学俊 屈刚 +6 位作者 朱文漓 张黎 王娟 吴江 刘汉元 陈放 徐恒 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期251-258,共8页
本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料,采用非均一化的Oligo-dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量至少为2.3×105,重组率达95%,平均插入片断长度大于1000bp。挑取cDNA克隆进行... 本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料,采用非均一化的Oligo-dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量至少为2.3×105,重组率达95%,平均插入片断长度大于1000bp。挑取cDNA克隆进行5’端测序,总共进行了1571个成功反应,其中1411条ESTs长度大于100bp,初步拼接得到939个单基因簇(Unigene),其中包括188个重叠群(Contigs),751个单拷贝EST(Singletons)。使用BLAST软件将这些序列同GenBank等数据库进行比对、查询和注释,结果显示418条序列有相关同源性,其他的521(55.5%)条序列没有明显的同源性(E-valu 1.00E-10),但是也同时揭示出在这些ESTs中能够发现新功能基因的相当可能性。本研究结果对草鱼以及其他鲤科鱼类的消化系统功能基因的筛选和发现具有指导意义。此外,草鱼肠道cDNA文库的构建和EST测序工作将为草鱼基因组计划的实施奠定基础。 展开更多
关键词 草鱼 肠道 cdna文库 EST 测序
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