TCR DNA疫苗在自身免疫病中的研究进展

自身免疫病(AID)是由于机体对自身抗原失去耐受,免疫系统攻击自身组织或细胞引起组织器官或细胞损伤,并出现一定临床表现的疾病。研究证明,在AID的治疗中,致病性T细胞可以被TCR疫苗选择性抑制或杀伤,应用前景很广阔。本文从TCR疫苗的作用机制、相关疾病以及疫苗的安全性等方面,对其在AID领域的研究现状进行简要综述。

高通量TCR免疫组库技术在艾滋病中的应用及前景分析

T细胞受体(TCR)免疫组库是机体所有TCR的总和,TCR免疫组库的多样性与HIV识别和免疫逃逸密切相关。高通量免疫组库测序技术能够检测分析TCR组库的所有序列,真实反映所有TCR的遗传信息,全面揭示TCR组库的复杂性和多样性。通过高通量测序技术分析TCR免疫组库变化可监测HIV患者诊疗情况、疾病进展及预后,同时有助于疫苗研发、病毒库清除及临床疗效评价,从而为丰富HIV/AIDS防治思路和靶点提供依据。

单细胞TCR测序在肿瘤免疫治疗中的应用

T细胞受体(TCR)序列可作为分辨T细胞特异性的唯一标签,因其多样性的特征,在特定时间内个体循环系统中所有TCR构成的TCR组库可以反映个体的抗肿瘤免疫状态。单细胞TCR测序技术能够在单细胞水平上检测编码TCR双链的基因序列和表达量等信息,包括获得TCR的α链和β链的配对信息,从而在细胞水平上更为准确地探索TCR组库的异质性,还可结合其他技术将TCR序列与基因组、转录组、蛋白质组等多组学信息成套配对,精准展现细胞水平上的多角度信息。因该技术具有高通量、高分辨率的优势而被广泛应用于肿瘤免疫治疗相关研究,为探索TME中T细胞功能、发展T细胞受体工程化T细胞(TCR-T)疗法、预测免疫检查点抑制剂(ICI)疗效等提供重要依据,成为重要的筛选工具,期待该技术的发展使更多肿瘤患者受益。

基于TCR模型的台风极值降雨强度预测

近些年台风带来的强降雨与洪水灾害给沿海城市造成严重的经济损失和人员伤亡,极端降雨环境多数是在台风作用下产生的,且极值降雨强度是城市防洪排涝、排水规划和工程设计的雨量计算依据。为更加合理准确地预测极值降雨,文章引入热带气旋降雨(tropical cyclone rainfall,TCR)模型,利用蒙特卡罗(Monte Carlo)技术模拟香港地区的极值降雨强度。对比相关规范与历史数据,该方法能较好地预测极值降雨强度,为后续台风降雨灾害危险性分析和排水工程建设研究提供一定的参考。

基于双模块卷积神经网络的TCR-多肽结合位点预测

TCR(T细胞受体)-多肽结合位点的准确预测对免疫治疗和相关药物发现具有重要意义。文章综合多个文献及数据库整理了一个TCR-多肽结合位点数据集,并引入了一种基于卷积神经网络的预测方法Propep-TCR。该方法综合考虑了输入TCR的序列特征和结构特征,通过采用残基可变滑动窗口方法提取每个目标残基的特征向量。为解决数据集中正负样本不平衡的问题,还采用了改进的损失函数和过采样技术。实验结果表明,Propep-TCR可以成功预测出TCR序列中的潜在结合位点,取得了优于传统算法的性能,其预测准确度达到0.98,AUROC达到了0.95。

一款全能竞赛战驹是如何炼成的?——捷安特巅峰“十”代TCR系列公路车大揭秘

熟悉捷安特(Giant)的车友们对于TCR一定不会陌生,TCR是Total Compact Road(全能紧凑公路车)的缩写,为追求最快的GC选手(在多日赛特别是大环赛上竞争总冠军的车手)而生。1997年,初代TCR一经推出就亮相环法赛场,虽然当时人们对这种从未出现过的压缩车架有争议。

单细胞TCR测序分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征

目的:采用单细胞测序的方法,分析SARS-CoV-2感染患者不同感染时期免疫组库特征,探讨其可能的发病机制。方法:利用NCBI数据库获得数据,设置对照组、进展组和康复组。使用RStudio、Origin、Hipliot和Excel软件对单细胞测序数据进行分析。结果:TCR在识别抗原和清除病毒的过程中发挥重要作用,免疫组库特征在不同感染时期有很大差异。细胞的克隆数量均超过26.92%。α链CDR3长度分布集中在14个氨基酸上,而β链集中在15个氨基酸上。V和J区基因片段使用频率不同,TRAV13-1、TRAJ20、TRBV20-1、TRBJ2-1等基因的使用频率差异有统计学意义(P<0.05)。进一步V-J基因组合分析显示,对照组和进展组、对照组和康复组的单链V-J对使用频率差异均有统计学意义(P<0.05)。对照组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV19-J34-TRBV4-1-J2-1,进展组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV12-1-J30-TRBV19-1-J2-1,康复组αβ双链V-J对使用频率最高的是TRAV12-2-J52-TRBV7-9-J1-5。结论:本研究分析免疫组库T细胞的全局特征,有助于理解SARSCoV-2感染患者的发病机制,使患者在感染初期及时得到有效的治疗。

CRISPR/Cas9敲除内源TCR增强TCR-T细胞对HPV16阳性宫颈癌SiHa细胞的杀伤

目的:基于CRISPR/Cas9基因编辑技术制备无内源TCR的TCR-T细胞并鉴定其在体外杀伤HPV16阳性宫颈癌SiHa细胞的功能。方法:培养健康志愿者外周血CD8^(+)T细胞和Jurkat细胞,CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除CD8+T、Jurkat细胞的TCR基因,制备过表达转基因TCR的重组慢病毒,在敲除内源性TCR的CD8^(+)T和Jurkat细胞中用慢病毒过表达转基因TCR制备TCR-T细胞,多色FCM检测TCR-T细胞中TCR和CD3的表达水平,荧光素酶活性实验检测TCR-T细胞对HPV16阳性SiHa细胞的杀伤效率。结果:CRIPSR/Cas9基因编辑技术高效地敲除了外周血CD8^(+)T细胞和Jurkat细胞中的TRAC和TRBC基因,敲除效率分别为(81.4±4.5)%、(98.5±0.07)%,制备的无内源TCR的TCR-T细胞高效表达转基因TCR,在外周血CD8^(+)T和Jurkat细胞中表达率为(66.0±17.8)%、(97.3±2.6)%,敲除内源TRAC和TRBC基因有效增强CD8^(+)T和Jurkat细胞膜表达转基因TCR(均P<0.01),敲除内源TCR增强TCR-T细胞特异性杀伤HPV16阳性的SiHa细胞[(71.4±1.0)%vs(35.1±2.0)%,P<0.01)]。结论:无内源TCR的TCR-T细胞显著增强转基因TCR的表达和对HPV16阳性宫颈癌SiHa细胞的靶向杀伤能力,为提高TCR-T细胞的临床疗效提供了实验依据。

Hepatology International|表达靶向HBV抗原的TCR-T细胞治疗肝移植后复发的肝细胞癌患者具有良好的安全性和可行性:Ⅰ期临床试验结果

来自广州中山医科大学第三附属医院的Yang与来恩生物医药有限公司的Koh等研究了表达靶向HBV抗原的TCR-T细胞治疗肝移植后复发的肝细胞癌(HCC)患者的疗效,发表了临床Ⅰ期试验结果。该研究临床Ⅰ期试验共有6例符合条件的HCC复发患者入组.

1580mm热轧带钢35kVTCR型静止型动态无功补偿装置(SVC)介绍

1580mm热轧带钢35kV电源供电系统主要负荷为9台6000kW交-交变频主传动轧机、2台1200kW直流传动立辊轧机、1台1500kW直流传动转鼓式飞剪,为了控制轧机注入系统的谐波电流量,抑制电压波动,提高功率因数,保证轧钢过程稳定、节能、提高轧机效率,并保证轧机供电设备本身及其他用电设备的安全运行,在供电母线安装一套SVC无功补偿装置,进行电能质量治理。

TCR基因多样性评估肝细胞癌患者免疫力的临床研究

目的 探讨特异性T细胞受体(TCR)基因的多样性对原发性肝细胞癌患者免疫力水平的评估。方法 4例原发性肝细胞癌患者采用抗PD-1单克隆抗体HX008联合贝伐珠单抗或仑伐替尼治疗,分别于患者治疗前和治疗后对外周血中的TCR进行高通量基因测序,同时进行血常规、凝血系列、肝功、肾功、离子、血糖、AFP、心肌酶谱以CT检查,监测不良事件的发生。结果 两例患者治疗后出现免疫力升高,治疗前、后免疫力健康值分别为0.029767(差)、0.126303(良)和0.044906(差)、0.132530(良),最大TCR克隆占比分别为29.76%,9.85%和1.62%,2.63%。两例患者治疗后出现免疫力降低,治疗前、后免疫力健康值分别为0.107826(良)、0.178684(优)和0.067897(中)、0.169535(优),最大TCR克隆占比分别为3.48%、2.72%和5.15%、3.56%。结论 TCR基因的多样性可以客观准确地评估原发性肝癌患者的免疫状态、机体对疾病与治疗的反应,为开发新的免疫治疗靶点以及预后监测指标提供实验基础及研究依据。

CD4^(-)CD8^(-)TCRγδ^(+)T细胞大颗粒淋巴细胞白血病合并纯红细胞再生障碍性贫血1例并文献复习

本文回顾性分析2021年3月山东大学附属威海市立医院收治的1例CD4^(-)CD8^(-)TCRγδ^(+)T细胞大颗粒淋巴细胞白血病(T-cell large granular lymphocyte leukemia,T-LGLL)合并纯红细胞再生障碍性贫血(Pure red cell aplasia,PRCA)患者的临床资料,并复习相关文献,以提高对CD4^(-)CD8^(-)TCRγδ^(+)T-LGLL合并PRCA的认知,从而减少临床中的误诊及漏诊。

基于TCR组库分析流程的非小细胞肺癌特征分析

目的·探究非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)免疫相关特征,发掘V-J基因中的肿瘤潜在标志物,为建立T细胞受体(T-cell receptor,TCR)-抗原识别预测模型提供基础。方法·收集704例NSCLC样本,用于构建一套系统的TCR组库分析流程,涵盖从原始数据到质控、过滤、TCR序列的识别和提取等上游分析部分,以及组库克隆分布、克隆分型、V-J基因共享性、互补决定区3(CDR3)分布特征以及克隆追踪等下游分析流程。使用Shannon-Weiner指数、Chao1等指数分析样本克隆分布。根据克隆扩增数目进行克隆分型,以探索不同分型间的差异。选取2例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)样本进行去克隆扩增权重V-J基因共享分析,以探究低频克隆型对V-J基因共享性的影响。最后,通过分析V基因及高频克隆型CDR3分布特征和克隆追踪分析,监测肿瘤免疫前后克隆型频率的变化,寻找潜在的肿瘤标志物。结果·①NSCLC不同组织间克隆分布和克隆分型均存在显著差异,且在不同年龄与性别间存在显著差异。②在V-J基因共享性分析中发现了特定高共享V-J基因,同时在CDR3分布特征分析中存在非正态分布的高克隆V基因与氨基酸高频克隆型。③高频克隆型克隆追踪分析中,观察到NSCLC中高表达或新表达的高频克隆型,提示这些克隆型可作为潜在的肿瘤相关抗原或新抗原结合CDR3参考序列。④通过去克隆扩增权重V-J基因共享分析,发现原本低表达的TRBJ2-5基因表达频率显著增加,提示该基因可能为肿瘤免疫反应的潜在低频关键基因。结论·TRAV21和TRBV6.5基因在NSCLC中高克隆扩增,可作为潜在肿瘤标志物。

马立克氏病病毒感染鸡TCR1与TCR2T细胞动态变化观察

为深入探讨鸡马立克氏病Ｔ细胞受体亚群的变化与疾病发生与发展的相互关系，本实验以马立克氏病强毒株人工感染１日龄ＳＰＦ雏鸡，在不同的感染期，以流式细胞仪分析脾脏、胸腺、外周血淋巴细胞中ＴＣＲ１＋Ｔ和ＴＣＲ２＋Ｔ细胞的动态变化。结果表明，感染鸡脾脏中ＴＣＲ１＋Ｔ细胞异常增高，而ＴＣＲ２＋Ｔ细胞在脾脏和外周血中表现为暂短的升高，其后迅速下降。

专业型城市轻骑新选择:绿源首款锂电折叠电动自行车TCR

随着城市不断拓展,庞大的城市框架让公交地铁系统和城市路网更为发达。但同时,我们仍会面临“最后一公里”的代步问题。另外,代驾行业的兴起也催生了小型电动自行车的高速发展。近日,绿源电动车推出首款锂电折叠自行车TCR,定位于专业型城市轻骑,普通人不用花大价钱就能买到代驾小哥“同款”。

弥漫大B细胞淋巴瘤相关抗原特异TCR基因修饰T细胞TCRζ链基因的表达

目的:分析DLBCL相关抗原特异TCR基因修饰T细胞经肿瘤细胞刺激活化前后TCRζ链基因表达水平的变化。方法:利用SYBRGreenⅠ荧光定量PCR,相对定量检测TCR基因修饰T细胞活化前后TCRζ链基因的表达情况,β2微球蛋白基因(β2M)为内参照,根据相对定量公式:2-△Ct×100%和2-△△Ct,计算TCR基因修饰T细胞活化前后TCRζ链基因的相对表达水平及其差异情况。结果:与未转染T细胞的TCRζ基因mRNA表达量(1.74±0.28)%相比,TCR转基因修饰T细胞TCRζ基因mRNA的表达水平没有发生明显的变化,表达量为(1.78±0.22)%;而经效/靶细胞(TCR基因修饰T细胞/Toledo细胞)混合培养后,活化的TCR基因修饰T细胞的TCRζ基因mRNA表达水平为(11.54±1.98)%,明显高于未刺激培养之前的TCR基因修饰T细胞和未转染T细胞的TCRζ基因的表达水平(P<0.05),分别增长了(6.59±0.80)倍和(6.48±0.36)倍。结论:TCR转基因修饰T细胞受到抗原的刺激而活化,TCRζ链基因的表达相应增加。

系统性红斑狼疮T细胞TCR/CD3信号转导异常的研究进展

T细胞受体/CD3复合体(TCR/CD3)与抗原呈递细胞(APC)表面的组织相容复合物(MHC)-抗原肽发生交连是T细胞特征性识别抗原,活化细胞、传导信号并发生抗原特异免疫反应的重要起始途。系统性红斑狼疮T细胞TCR/CD3信号传导异常是T细胞免疫功能障碍的基础。本文就系统性红斑狼疮T细胞TCR/CD3信号转导异常的研究进展作一综述。

慢性乙型肝炎患者外周血淋巴细胞TCRαβ和TCRγδ的表达研究

目的检测慢性乙型肝炎患者外周血淋巴细胞TCRαβ和TCRγδ的表达,评价慢性乙型肝炎患者的细胞免疫状态,并初步探究随病情发展TCRαβ和TCRγδ表达率的变化趋势。方法流式细胞术测定38例慢性乙型肝炎、14例乙型肝炎肝硬化患者淋巴细胞中TCRαβ、TCRγδ的表达率。结果TCRαβ在慢性乙型肝炎患者中的表达率明显低于正常对照组(P<0.01)。慢性乙型肝炎各组之间TCRαβ的表达率比较:重度组和乙型肝炎肝硬化组表达率显著低于轻度组(P<0.01,P<0.01),乙型肝炎肝硬化组显著低于中度组(P<0.05)。而TCRγδ在慢性乙型肝炎各组之间比较以及与正常对照组相比,无显著性差异(P>0.05)。结论慢性乙型肝炎患者外周血淋巴细胞中TCRαβ表达能力显著低于正常人,并随病情进展,其表达能力逐渐降低,提示慢性乙型肝炎患者外周血T细胞免疫功能下降。