不同传染性腔上囊病病毒株结构蛋白表达差异性研究

目的 :了解不同传染性腔上囊病病毒株 (ICBDV)结构蛋白表达的差异。 方法 :将在不同时间、地域 ,从鸭、麻雀及传染性腔上囊病发病鸡群中获得的 18株 ICBDV,分别用 SPF鸡、鸡胚和鸡胚成纤维细胞增生 ,经氯仿处理后 ,采用聚乙二醇沉淀、超速离心和不连续蔗糖密度梯度离心的方法纯化病毒 ,并对纯化病毒进行 SDS- PAGE分析。 结果 :病毒主要分布于 40 %蔗糖层 ;鸡源、鸭源、麻雀源 ICBDV在 SDS- PAGE中均出现 5条特异的蛋白带 ,各蛋白带的电泳迁移率毒株间差异不明显 ;15株鸡源 ICBDV结构蛋白 VP2 在不同毒株表达量有较大差异。 结论 :不同传染性腔上囊病病毒株结构蛋白 VP2

SARS-CoV与SARS-CoV-2结构蛋白辅助T细胞表位的预测及比较

目的通过预测分析严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)与SARS-CoV-2结构蛋白中潜在的辅助性T细胞(Th细胞)表位,为新型冠状病毒疫苗的开发设计寻找合适的靶点。方法在美国国家生物技术信息中心的GenBank数据库中检索SARS-CoV与SARS-CoV-2病毒的参考序列,利用序列对比软件MEGA7和GeneDoc对2种病毒的刺突蛋白(S蛋白)、包膜蛋白(E蛋白)、膜蛋白(M蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋白)的氨基酸序列进行比较分析。利用SYFPEITHI、IEDB和NetMHCIIpan在线生物信息学工具预测筛选SARS-CoV和SARS-CoV-2可能的Th细胞表位,并在此基础上寻找2种病毒同源的潜在表位。最后利用ProtScale对含同源表位的蛋白质进行疏水性分析比较。结果2种病毒S蛋白同源性为75%,其他蛋白同源性分别为E蛋白94%、M蛋白90%及N蛋白90%。在线软件预测到SARS-CoV-2有22个潜在的Th细胞表位,SARS-CoV有25个潜在的Th细胞表位。进一步对比获得2对完全同源表位和6对高度同源表位,位于3对蛋白中,且ProtScale对比分析2种病毒相应蛋白的疏水性差异微小。结论对比分析得到8对完全同源或高度同源表位,且含差异氨基酸的对应肽段疏水性差异较小,同源性较高的Th细胞表位可考虑作为SARS-CoV-2疫苗设计的候选表位。

SARS⁃CoV⁃2非结构蛋白16研究进展

在新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)感染过程中,病毒编码的非结构蛋白(NSP)在宿主细胞内先于病毒RNA产生,首先形成复制⁃转录复合体,SARS⁃CoV⁃2基因组依赖复制⁃转录复合体得以在宿主细胞内完成正常复制。该文对在SARS⁃CoV⁃2感染早期出现并参与病毒RNA合成的非结构蛋白16(NSP16)的结构和生物学功能及其药物研究进展进行综述,为SARS⁃CoV⁃2引发疾病的预防和治疗提供新思路。