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安徽新安江水牛mtDNA D-Loop区遗传多样性与系统进化研究
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作者 赵拴平 金海 +5 位作者 刘峻 李永胜 金磊 李倩 徐磊 贾玉堂 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第1期1-7,共7页
试验旨在分析安徽省黄山市新安江流域上游地区新安江水牛群体的分子遗传特性,探究其母系起源与遗传多样性。利用PCR扩增和测序技术测定28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列,下载GenBank数据库中24个中国水牛群体的693条D-Loop序列,利用生... 试验旨在分析安徽省黄山市新安江流域上游地区新安江水牛群体的分子遗传特性,探究其母系起源与遗传多样性。利用PCR扩增和测序技术测定28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列,下载GenBank数据库中24个中国水牛群体的693条D-Loop序列,利用生物信息学分析其遗传多样性,构建Neighbor-joining系统发生树和Media-joining网络,探索不同水牛群体的遗传距离。结果显示,28头新安江水牛的mtDNA D-Loop序列共有117个变异位点,构成25种单倍型,其核苷酸多样性为0.02602±0.00303,单倍型多样性为0.989±0.014。新安江水牛群体的变异性水平与中国其他水牛群体接近。N-J系统进化树显示,新安江水牛25个单倍型分为A、B两个支系,具有A支系和B支系2个母系来源,其中A支系占据主导地位。Media-joining进化网络显示,中国水牛主要为沼泽型水牛,分为沼泽型水牛A支系和B支系,B支系又分为b1亚支系和b2亚支系。综上,新安江水牛群体变异水平与中国其他地方水牛群体接近,群体遗传多样性丰富;且新安江水牛属于沼泽型水牛,具有2个线粒体母系来源,与我国其他地方水牛群体具有一定的遗传距离。 展开更多
关键词 水牛 线粒体dna 遗传多样性 单倍型
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Peripheral mitochondrial DNA as a neuroinflammatory biomarker for major depressive disorder
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作者 Jinmei Ye Cong Duan +5 位作者 Jiaxin Han Jinrong Chen Ning Sun Yuan Li Tifei Yuan Daihui Peng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1541-1554,共14页
In the pathogenesis of major depressive disorder, chronic stress-related neuroinflammation hinders favorable prognosis and antidepressant response. Mitochondrial DNA may be an inflammatory trigger, after its release f... In the pathogenesis of major depressive disorder, chronic stress-related neuroinflammation hinders favorable prognosis and antidepressant response. Mitochondrial DNA may be an inflammatory trigger, after its release from stress-induced dysfunctional central nervous system mitochondria into peripheral circulation. This evidence supports the potential use of peripheral mitochondrial DNA as a neuroinflammatory biomarker for the diagnosis and treatment of major depressive disorder. Herein, we critically review the neuroinflammation theory in major depressive disorder, providing compelling evidence that mitochondrial DNA release acts as a critical biological substrate, and that it constitutes the neuroinflammatory disease pathway. After its release, mitochondrial DNA can be carried in the exosomes and transported to extracellular spaces in the central nervous system and peripheral circulation. Detectable exosomes render encaged mitochondrial DNA relatively stable. This mitochondrial DNA in peripheral circulation can thus be directly detected in clinical practice. These characteristics illustrate the potential for mitochondrial DNA to serve as an innovative clinical biomarker and molecular treatment target for major depressive disorder. This review also highlights the future potential value of clinical applications combining mitochondrial DNA with a panel of other biomarkers, to improve diagnostic precision in major depressive disorder. 展开更多
关键词 BIOMARKER cytokine EXOSOMES INFLAMMASOME major depressive disorder MICROGLIA mitochondrial dna mitochondrial dysfunction NEUROINFLAMMATION Toll-like receptor
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DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒在案件中的应用研究
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作者 杨乐 陈滢 +4 位作者 吴俞衡 石妍 齐朝阳 孔祥仕 马温华 《刑事技术》 2024年第3期255-261,共7页
本文探讨DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒在案件中应用的可行性。应用DNATyper mtDNASNP60^(TM)试剂盒对100个汉族无关个体和20组全同胞进行mtDNA SNP检验;取25 pg/μL马、牛、羊、猪、鸡、鸭、猫、狗、兔、鼠和大肠杆菌的DNA样品进行... 本文探讨DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒在案件中应用的可行性。应用DNATyper mtDNASNP60^(TM)试剂盒对100个汉族无关个体和20组全同胞进行mtDNA SNP检验;取25 pg/μL马、牛、羊、猪、鸡、鸭、猫、狗、兔、鼠和大肠杆菌的DNA样品进行种属特异性测试;取5、10、20、40μmol/L血红素进行抗抑制性测试;取两个批次的DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒经反复冻融10次后进行稳定性测试;分别应用VeriFiler^(TM)Plus PCR扩增试剂盒和DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒对100份陈旧、腐败、降解检材进行检验。结果表明,100个汉族无关个体均获得清晰的mtDNA SNP分型结果,其检验结果与通过mtDNA测序获得的结果完全一致;100个汉族无关个体含有100种不同的单倍型;20组全同胞中每组个体之间mtDNA SNP分型结果相同;DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒对马、牛、羊、猪、鸡、鸭、猫、狗、兔、鼠和大肠杆菌的DNA样品进行检测,均未出现特异性分型;当血红素浓度≤40μmol/L时,所有mtDNA SNP位点均获得正确分型;两个批次的DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒经反复冻融10次后,所有mtDNA SNP位点均可正确分型;对于100份陈旧、腐败、降解检材,STR检出率为55%,mtDNA SNP的检出率为86%,mtDNA SNP的检出率显著高于STR。当模板DNA浓度大于5 pg/μL时,DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒能得到完整的分型谱图。综上,DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒可应用于陈旧、腐败、降解检材的检验,具有很好的实战应用价值。 展开更多
关键词 法医遗传学 dnaTyper mtdna-SNP60^(TM)试剂盒 线粒体dna 单核苷酸多态性 VeriFiler^(TM)Plus PCR扩增试剂盒 短串联重复序列
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由mtDNA清除THP-1细胞构建的人单核/巨噬细胞系Rho0细胞周期、凋亡、吞噬功能、炎症因子表达变化
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作者 王召宝 李媛 +1 位作者 宋绚丽 赵丽芳 《山东医药》 CAS 2024年第24期29-32,共4页
目的 观察由线粒体DNA(mtDNA)清除人单核细胞白血病细胞(THP-1细胞)构建的人单核/巨噬细胞系Rho0细胞周期、凋亡、吞噬功能、炎症因子表达变化。方法 取THP-1细胞,使用溴化乙锭(EB)清除细胞中mtDNA,构建新的人单核/巨噬细胞Rho0。取Rho... 目的 观察由线粒体DNA(mtDNA)清除人单核细胞白血病细胞(THP-1细胞)构建的人单核/巨噬细胞系Rho0细胞周期、凋亡、吞噬功能、炎症因子表达变化。方法 取THP-1细胞,使用溴化乙锭(EB)清除细胞中mtDNA,构建新的人单核/巨噬细胞Rho0。取Rho0细胞,分别给予1 mg/mL LPS或溶媒刺激24 h(计为Rho0-LPS组、Rho0-溶媒组);另取未经EB处理的THP-1细胞,分别给予1 mg/mL LPS或溶媒刺激24 h(计为Control-LPS组、Control-溶媒组);采用流式细胞术PI染色检测各组细胞周期,流式细胞术Annexin V-FITC/PI法测算各组凋亡细胞数,Red-Zymosan染料吞噬实验评估各组细胞吞噬功能(平均荧光强度)。取Rho0细胞(Rho0组)和取未经EB处理的THP-1细胞(Control组),采用RT-qPCR法检测炎症因子(IL-1α、IL-1β、TNF-α、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12 mRNA)。结果 与Control-溶媒组比较,Rho0-溶媒组G0~G1期、S期、G2/M期比例降低及细胞凋亡数增加和平均荧光强度增强,Control-LPS组细胞凋亡数增加和平均荧光强度增强(P均<0.05);与Rho0-溶媒组比较,Rho0-LPS组G0~G1期比例降低及细胞凋亡数增加(P均<0.05)。与Control组比较,Rho0组IL-1β、TNF-α、IL-8、IL-10 mRNA表达升高(P均<0.05)。结论 清除mtDNA可导致Rho0细胞周期停滞,促进细胞凋亡,增强细胞吞噬功能及促炎功能。 展开更多
关键词 线粒体dna 人单核/巨噬细胞 细胞周期 细胞凋亡 细胞吞噬功能 细胞促炎因子 细胞抑炎因子
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体外受精囊胚培养液中mtDNA拷贝数与囊胚发育潜能的相关性研究
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作者 蔡桂丰 徐楗荧 +4 位作者 阮永铭 曾伟荣 赵琴 许伟标 吴松 《生殖医学杂志》 CAS 2023年第2期202-207,共6页
目的探讨第5/6天发育囊胚(D5/D6囊胚)培养液中线粒体DNA(mtDNA)拷贝数与胚胎质量的关系。方法收集2021年7—12月在珠海市妇幼保健院生殖中心行胚胎植入前遗传学检测(PGT)的10名患者的36枚D5/D6囊胚的活检细胞和培养液样本,应用高通量测... 目的探讨第5/6天发育囊胚(D5/D6囊胚)培养液中线粒体DNA(mtDNA)拷贝数与胚胎质量的关系。方法收集2021年7—12月在珠海市妇幼保健院生殖中心行胚胎植入前遗传学检测(PGT)的10名患者的36枚D5/D6囊胚的活检细胞和培养液样本,应用高通量测序(NGS)方法检测分析囊胚活检细胞的非整倍体性和培养液中mtDNA拷贝数。根据囊胚形态学评价分为高质量、一般质量、低质量囊胚3组,根据囊胚发育时间分为D5和D6囊胚组,根据染色体整倍体性分为整倍体和非整倍体囊胚组,比较各组间囊胚培养液中mtDNA拷贝数的差异。结果36枚囊胚中D5囊胚33枚(D5囊胚组)、D6囊胚3枚(D6囊胚组);高质量囊胚21枚(高质量囊胚组)、一般质量囊胚12枚(一般质量囊胚组)、低质量囊胚3枚(低质量囊胚组);整倍体囊胚19枚(整倍体囊胚组),非整倍体囊胚17枚(非整倍体囊胚组)。高质量囊胚组培养液中mtDNA拷贝数[(150.24±166.24)]略高于一般质量囊胚组[(110.58±92.83)]和低质量囊胚组[(91.00±0.82)],但差异无统计学意义(P>0.05)。D5囊胚组培养液中mtDNA拷贝数[(137.64±143.57)]略高于D6囊胚组[(71.00±54.52)],但差异无统计学意义(P>0.05)。整倍体囊胚组培养液中mtDNA拷贝数[(144.79±162.17)]略高于非整倍体囊胚组[(117.88±107.14)],差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论不同形态学评级、囊胚发育时间和染色体整倍体性囊胚培养液中mtDNA拷贝数无显著差异,胚胎质量与培养液中mtDNA拷贝数的关系有待进一步确认。 展开更多
关键词 囊胚培养液 胚胎质量 mtdna 高通量测序
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转录因子MYB转录调控MTFR2通过DNA损伤修复促进胃癌细胞化疗耐药性
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作者 李春兴 迪力旦·纳斯尔 +1 位作者 托合提阿吉·巴拉提 阿不都外力·吾守尔 《遵义医科大学学报》 2024年第9期857-867,共11页
目的探究v-myb禽成髓细胞病病毒癌基因同源物(MYB)转录调控线粒体裂变调节因子2(MTFR2)对胃癌(GC)细胞顺铂(DDP)耐药性的影响及分子作用机制。方法TCGA数据库分析GC中差异mRNA并预测上游调控分子,qRT-PCR检测MTFR2和MYB的表达,双荧光素... 目的探究v-myb禽成髓细胞病病毒癌基因同源物(MYB)转录调控线粒体裂变调节因子2(MTFR2)对胃癌(GC)细胞顺铂(DDP)耐药性的影响及分子作用机制。方法TCGA数据库分析GC中差异mRNA并预测上游调控分子,qRT-PCR检测MTFR2和MYB的表达,双荧光素酶和染色质免疫共沉淀(ChIP)实验验证MTFR2和MYB的调控关系,细胞计数盒8(CCK-8)检测细胞活力并计算IC_(50)值,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡,彗星实验检测DNA损伤,蛋白质免疫印迹法检测DNA损伤相关蛋白(γ-H2AX、ATM、p-ATM)的表达。结果MTFR2在GC组织和细胞中显著高表达,敲低MTFR2能够降低细胞增殖,阻滞S期,诱导细胞凋亡,促进DNA损伤和DDP敏感性。生信预测MTFR2存在上游转录因子MYB,MYB在GC组织和细胞中的表达显著上调,双荧光素酶和ChIP验证了MTFR2启动子区域与MYB的结合关系。回复实验发现进一步过表达MTFR2能够逆转敲低MYB对GC细胞增殖和DDP耐药性的抑制作用。结论MYB上调MTFR2的表达通过DNA损伤途径促进GC细胞增殖和DDP耐药,表明靶向MYB/MTFR2调控轴可能是克服GC DDP耐药性的潜在途径。 展开更多
关键词 V-myb禽成髓细胞瘤病毒癌基因同源物 线粒体裂变调节因子2 dna损伤修复 胃癌 顺铂耐药
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线粒体DNA含量及10398位点在健康及宫颈癌人群中的分析
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作者 丰大利 张丽瑾 黄华忠 《中国现代医生》 2024年第21期86-89,共4页
目的探讨血清中线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)含量和10398位点突变情况检测的临床意义。方法收集2020年1月至12月在宜昌市第二人民医院体检的314名健康女性纳入健康体检组,同时收集2020年1月至2023年12月在宜昌市第二人民医院就诊... 目的探讨血清中线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)含量和10398位点突变情况检测的临床意义。方法收集2020年1月至12月在宜昌市第二人民医院体检的314名健康女性纳入健康体检组,同时收集2020年1月至2023年12月在宜昌市第二人民医院就诊的82例宫颈癌患者纳入宫颈癌组。检测两组纳入者的血清样本mtDNA含量及10398位点基因型,并比较两组纳入者的指标差异。结果宫颈癌组患者的mtDNA含量高于健康体检组,差异有统计学意义(P<0.05);两组纳入者在10398位点基因型差异无统计学意义(P>0.05)。健康体检组中≥45岁的女性mtDNA含量更高,差异有统计学意义(P<0.05);mtDNA在不同10398位点的分布差异无统计学意义(P>0.05)。宫颈癌组中≥45岁的患者mtDNA含量更高,差异有统计学意义(P<0.05);不同临床分期、不同病理类型患者的mtDNA含量差异无统计学意义(P>0.05),mtDNA在不同10398位点中的含量差异无统计学意义(P>0.05)。结论mtDNA含量检测对健康体检人群与宫颈癌人群均有一定的意义,两组纳入者的mtDNA含量均与年龄相关,均随着年龄增长而升高;宫颈癌患者的mtDNA含量明显高于健康体检者;10398位点的血清mtDNA含量检测对两组人群的意义不大;宫颈癌人群的mtDNA含量及10398位点分布与病理、临床分期均无关。mtDNA含量检测可考虑作为宫颈癌诊断的血清标志物。 展开更多
关键词 线粒体dna 10398位点突变 宫颈癌 健康人群
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线粒体DNA与心血管疾病相关性的研究进展
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作者 冯露 尤雅丽 +1 位作者 杨倩 王立立 《中华老年多器官疾病杂志》 2024年第5期394-397,共4页
线粒体作为人体的能量工厂,具有自己独立的基因组——线粒体DNA(mtDNA)。心肌作为一种高耗能组织,线粒体的正常供能至关重要,而mtDNA在一定程度上可以影响线粒体的供能。根据最新的全球疾病负担研究,心血管疾病(CVD)是导致死亡的主要原... 线粒体作为人体的能量工厂,具有自己独立的基因组——线粒体DNA(mtDNA)。心肌作为一种高耗能组织,线粒体的正常供能至关重要,而mtDNA在一定程度上可以影响线粒体的供能。根据最新的全球疾病负担研究,心血管疾病(CVD)是导致死亡的主要原因,冠心病是CVD患者主要的死亡原因之一。mtDNA作为一种新发现的生物标志物,与冠心病的发生机制、潜在的治疗靶点、对预后的预测等具有很强的关联性,本文就mtDNA与冠心病相关性的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 线粒体dna 线粒体功能障碍 mtdna突变 冠心病 动脉粥样硬化
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血浆游离mtDNA在急性肺栓塞中的诊断价值及其与病情严重程度及临床常用指标的相关性
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作者 谭娇娜 杨泽华 《检验医学与临床》 CAS 2023年第16期2355-2360,共6页
目的探讨血浆游离线粒体DNA(mtDNA)水平在急性肺栓塞(APE)中的诊断价值及其与病情严重程度和临床常用指标的相关性。方法选取2021年3月至2022年12月山西医科大学第一医院呼吸与危重症医学科收治的90例首次经CT肺动脉造影(CTPA)确诊的AP... 目的探讨血浆游离线粒体DNA(mtDNA)水平在急性肺栓塞(APE)中的诊断价值及其与病情严重程度和临床常用指标的相关性。方法选取2021年3月至2022年12月山西医科大学第一医院呼吸与危重症医学科收治的90例首次经CT肺动脉造影(CTPA)确诊的APE患者为研究对象,分为高危组、中危组、低危组,每组30例,选择同期年龄相似的健康体检者30例作为健康组。记录所有研究对象一般资料,采集所有研究对象入院第1天未经治疗的血浆和全血标本,对其进行血常规、D-二聚体(D-D)、纤维蛋白(原)降解产物(FDP)、心肌肌钙蛋白T(cTnT)、N末端脑钠肽前体(NT-proBNP)等指标检测;提取上述所有受试者血浆游离mtDNA,应用实时荧光定量聚合酶链反应标准曲线法检测血浆游离mtDNA水平,比较各组mtDNA及其他临床常用指标,并分析mtDNA与其他临床常用指标的相关性;使用受试者工作特征(ROC)曲线评价血浆游离mtDNA和其他临床常用指标对APE的诊断价值。结果健康组、低危组、中危组、高危组血浆游离mtDNA水平分别为272(199)、813(529)、2983(3327)和10097(6889)copies/mL,mtDNA水平在高危组、中危组、低危组和健康组中依次降低,两两比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。APE患者血浆游离mtDNA水平与白细胞计数(WBC)、D-D、FDP、cTnT、NT-proBNP呈正相关(r=0.304、0.446、0.532、0.673、0.666,P<0.05);与RBC、血红蛋白(Hb)、红细胞体积分布宽度(RDW)、血小板计数(PLT)无相关关系(P>0.05);mtDNA诊断APE的ROC曲线下面积为0.995,灵敏度为91%,特异度为90%,cut-off值为557 copies/mL。结论APE患者血浆游离mtDNA水平升高,并与疾病危险分层有关;血浆游离mtDNA水平有助于诊断APE,mtDNA也可作为预测APE病情严重程度的一种标志物。 展开更多
关键词 线粒体dna 急性肺栓塞 疾病危险分层
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Mutual promotion of mitochondrial fi ssion and oxidative stress contributes to mitochondrial-DNAmediated infl ammation and epithelial-mesenchymal transition in paraquat-induced pulmonary fibrosis
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作者 Jie Zhang Wen-jing Li +8 位作者 Shi-qiang Chen Ze Chen Chen Zhang Ran Ying Hong-bing Liu Long-wang Chen Ya-hui Tang Zhong-qiu Lu Guang-ju Zhao 《World Journal of Emergency Medicine》 SCIE CAS CSCD 2023年第3期209-216,共8页
BACKGROUND:Pulmonary fibrosis(PF)is one of the main causes of death in patients with paraquat(PQ)poisoning.This study aimed to evaluate the relationship between mitochondrial fi ssion and oxidative stress in PQ-induce... BACKGROUND:Pulmonary fibrosis(PF)is one of the main causes of death in patients with paraquat(PQ)poisoning.This study aimed to evaluate the relationship between mitochondrial fi ssion and oxidative stress in PQ-induced epithelial-mesenchymal transition(EMT)and PF.METHODS:C57BL/6 mice and MLE-12 cells were exposed to PQ to construct a PF model in vivo and in vitro.Histological changes in the lungs were examined by hematoxylin and eosin(H&E)staining.Mitochondrial morphology was detected by MitoTracker®Deep Red FM or transmission electron microscopy(TEM).Western blotting and immunofluorescence were used to determine the expression of protein.The migration ability of the cells was detected by the cell scratch test.Mitochondrial DNA(mtDNA)levels were assessed by real-time polymerase chain reaction(PCR).Enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA)was applied to detect cytokine levels.Superoxide dismutase(SOD)activity and the levels of glutathione(GSH)and malondialdehyde(MDA)were detected by chemichromatometry.RESULTS:PQ exposure caused EMT and PF in vivo and in vitro.PQ destroyed mitochondrial structure and enhanced the expression of dynamin-related protein 1(Drp1),which were accompanied by oxidative stress.Inhibiting mitochondrial fission using mitochondrial division inhibitor-1(Mdivi-1),a selective inhibitor of Drp1,attenuated PQ-induced EMT and oxidative damage.Treatment with N-acetyl-L-cysteine(NAC),an antioxidant,reduced Drp1 expression,attenuated mitochondrial structure damage and inhibited PQ-induced EMT and PF.Both Mdivi-1 and NAC treatment markedly suppressed mtDNA release,the expression of Toll-like receptor 9(TLR9)and phosphorylation(P)-NF-κB p65 as well as cytokines(interleukin 6[IL-6],interleukin-1β[IL-1β],and tumor necrosis factor-α[TNF-α])production.CONCLUSION:Mutual promotion of mitochondrial fission and oxidative stress contributes to EMT in PQ-induced PF,which is associated with the mtDNA/TLR9/NF-κB pathway. 展开更多
关键词 PARAQUAT mitochondrial fi ssion Oxidative stress Epithelial-mesenchymal transition mitochondrial dna
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Molecular phylogenetics and population demographic history of Amphioctopus fangsiao,inferred from mitochondrial and microsatellite DNA markers
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作者 Jian Zheng Yan Tang +2 位作者 Ran Xu Xiaoying Zhang Xiaodong Zheng 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2023年第6期39-48,共10页
Amphioctopus fangsiao(Cephalopoda:Octopodidae)is an important commercial species in the coastal waters of China.In recent years,however,the resource of A.fangsiao have declined because of habitat destruction and overf... Amphioctopus fangsiao(Cephalopoda:Octopodidae)is an important commercial species in the coastal waters of China.In recent years,however,the resource of A.fangsiao have declined because of habitat destruction and overfishing.To analyze the genetic variations of A.fangsiao caused by the fluctuation of resources,the population genetic structure of nine sampling locations collected from the Bohai Sea to the South China Sea were investigated,using mtDNA COI fragments and microsatellite DNA.The results of F-statistics,AMOVA,STRUCTURE and PCA analyses showed three phylogeographic clades(Clades A,B and C),revealing limited genetic exchange between north and south populations.These clades diverged in 2.23(Clades A and B)and 3.67(Clades A,B and C)million years ago,during the dramatic environmental fluctuations,such as sea level and temperature changes,have exerted great influence on the survival distribution pattern of global organisms.Our results for low genetic connectivity among A.fangsiao populations provide insights into the development of management strategies,that is,to manage this species as separate management unit. 展开更多
关键词 genetic diversity population genetic structure Amphioctopus fangsiao mitochondrial dna microsatellite dna
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线粒体DNA含量在结直肠癌中的预后价值
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作者 杜杨斌 郭文文 何震宇 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第5期681-687,共7页
目的:探究组织线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)含量和结直肠癌预后相关性。方法:选取117例结直肠癌患者并收集临床病理资料。运用RT-qPCR检测患者癌组织与癌旁组织mtDNA含量,探究mtDNA含量与各项预后指标的相关性。绘制受试者工作特... 目的:探究组织线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)含量和结直肠癌预后相关性。方法:选取117例结直肠癌患者并收集临床病理资料。运用RT-qPCR检测患者癌组织与癌旁组织mtDNA含量,探究mtDNA含量与各项预后指标的相关性。绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线,根据截断值区分患者并绘制无病生存期(disease free survival,DFS)曲线。单因素和多因素Cox回归分析探究术后DFS相关的危险因素。结果:与癌旁组织相比,癌组织mtDNA含量差异无统计学意义(P=0.432);低mtDNA含量与肿瘤位于结肠、低分化、TNM分期差、淋巴结转移相关(P <0.05)。ROC曲线提示mtDNA含量为500.699可作为截断值。单因素和多因素分析显示,mtDNA含量低于500.699(HR=4.285,95%CI:1.938~9.475)、肿瘤低分化(HR=2.886,95%CI:1.428~5.835)是与DFS相关的独立危险因素。结论:结直肠癌患者中,组织mtDNA含量与临床病理特征有关,低mtDNA含量是患者预后相关的独立危险因素。 展开更多
关键词 线粒体dna 结直肠癌 预后 肿瘤复发 无病生存期
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Late-onset mitochondrial encephalomyopathy with lactic acidosis and stroke-like episodes syndrome with mitochondrial DNA 3243A>G mutation masquerading as autoimmune encephalitis:A case report
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作者 Jian-Wei Wang Xiao-Bo Yuan Hong-Fang Chen 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第14期3275-3281,共7页
BACKGROUND Here,we present a unique case of mitochondrial encephalomyopathy with lactic acidosis and stroke-like episodes(MELAS)syndrome,which initially appeared to be autoimmune encephalitis and was ultimately confir... BACKGROUND Here,we present a unique case of mitochondrial encephalomyopathy with lactic acidosis and stroke-like episodes(MELAS)syndrome,which initially appeared to be autoimmune encephalitis and was ultimately confirmed as MELAS with the mitochondrial DNA 3243A>G mutation.CASE SUMMARY A 58-year-old female presented with acute-onset speech impediment and auditory hallucinations,symmetrical bitemporal lobe abnormalities,clinical and laboratory findings,and a lack of relevant prodromal history,which suggested diagnosis of autoimmune encephalitis.Further work-up,in conjunction with the patient’s medical history,family history,and lactate peak on brain lesions on magnetic resonance imaging,suggested a mitochondrial disorder.Mitochondrial genome analysis revealed the m.3243A>G variant in the MT-TL1 gene,which led to a diagnosis of MELAS syndrome.CONCLUSION This case underscores the importance of considering MELAS as a potential cause of autoimmune encephalitis even if patients are over 40 years of age,as the symptoms and signs are atypical for MELAS syndrome. 展开更多
关键词 MELAS mitochondrial dna mutation ENCEPHALITIS Case report
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Benchmark Dose Assessment for Coke Oven Emissions-Induced Mitochondrial DNA Copy Number Damage Effects
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作者 YAN Zhao Fan GU Zhi Guang +8 位作者 FAN Ya Hui LI Xin Ling NIU Ze Ming DUAN Xiao Ran Mallah Ali Manthar ZHANG Qiao YANG Yong Li YAO Wu WANG Wei 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2023年第6期490-500,共11页
Objective The study aimed to estimate the benchmark dose(BMD)of coke oven emissions(COEs)exposure based on mitochondrial damage with the mitochondrial DNA copy number(mtDNAcn)as a biomarker.Methods A total of 782 subj... Objective The study aimed to estimate the benchmark dose(BMD)of coke oven emissions(COEs)exposure based on mitochondrial damage with the mitochondrial DNA copy number(mtDNAcn)as a biomarker.Methods A total of 782 subjects were recruited,including 238 controls and 544 exposed workers.The mtDNAcn of peripheral leukocytes was detected through the real-time fluorescence-based quantitative polymerase chain reaction.Three BMD approaches were used to calculate the BMD of COEs exposure based on the mitochondrial damage and its 95%confidence lower limit(BMDL).Results The mtDNAcn of the exposure group was lower than that of the control group(0.60±0.29 vs.1.03±0.31;P<0.001).A dose-response relationship was shown between the mtDNAcn damage and COEs.Using the Benchmark Dose Software,the occupational exposure limits(OELs)for COEs exposure in males was 0.00190 mg/m^(3).The OELs for COEs exposure using the BBMD were 0.00170 mg/m^(3)for the total population,0.00158 mg/m^(3)for males,and 0.00174 mg/m^(3)for females.In possible risk obtained from animal studies(PROAST),the OELs of the total population,males,and females were 0.00184,0.00178,and 0.00192 mg/m^(3),respectively.Conclusion Based on our conservative estimate,the BMDL of mitochondrial damage caused by COEs is0.002 mg/m^(3).This value will provide a benchmark for determining possible OELs. 展开更多
关键词 Coke oven emissions mitochondrial dna copy number Benchmark dose Occupational exposure limits
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血浆无细胞线粒体外线粒体DNA与牙周炎临床指标的相关性研究
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作者 杨再目 曹沛 +1 位作者 刘振华 栾庆先 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期288-295,共8页
目的血浆无细胞线粒体外线粒体DNA(cf-exmtDNA)具有促炎潜能,本文探讨血浆cf-exmtDNA与牙周炎临床指标的相关性。方法纳入18~45岁受试者78人,其中牙周健康者11人,牙龈炎患者11人,牙周炎患者56人。检查并记录基线牙周指标、年龄、性别、... 目的血浆无细胞线粒体外线粒体DNA(cf-exmtDNA)具有促炎潜能,本文探讨血浆cf-exmtDNA与牙周炎临床指标的相关性。方法纳入18~45岁受试者78人,其中牙周健康者11人,牙龈炎患者11人,牙周炎患者56人。检查并记录基线牙周指标、年龄、性别、体质指数(BMI)和空腹血糖(FBG)。取4 mL抗凝静脉血,采用二次离心法提取其中cf-exmtDNA,使用实时荧光定量聚合酶链式反应检测cf-exmtDNA拷贝数。比较不同牙周炎症状态组血浆cf-exmtDNA水平,并对血浆cf-exmtDNA与平均探诊深度(mPD)、平均附着水平(mCAL)、平均出血指数(mBI)、平均菌斑指数(mPLI)、年龄、FBG、BMI等指标进行相关性分析以及多重线性回归分析。结果牙周炎组血浆cf-exmtDNA水平显著高于牙周健康组(P=0.042);样本整体血浆cf-exmtDNA水平与年龄(P=0.023)、mPD(P<0.001)、mCAL(P=0.006)、mBI(P=0.026)呈正相关关系;多重回归分析中,血浆cf-exmtDNA水平主要取决于mPD。结论在18~45岁人群中,牙周炎患者血浆cf-exmtDNA水平较牙周健康者显著升高,血浆cf-exmtDNA水平与年龄、mPD、mCAL、mBI呈正相关关系。 展开更多
关键词 牙周炎 无细胞dna 线粒体dna 横断面研究 牙周临床指标
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青海骆驼线粒体DNA D-loop区遗传多样性研究
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作者 高雪 晁生玉 +3 位作者 王启菊 孟克达拉 乌兰巴特尔 贾功雪 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-7,共7页
旨在研究青海骆驼遗传多样性,揭示青海骆驼的母系起源进化。采集柴达木地区3个青海骆驼类群耳组织样品88份并提取基因组DNA,利用PCR扩增和基因测序分析线粒体DNA D-loop序列,并与蒙古、内蒙古双峰驼进行比较。结果表明:D-loop序列中共... 旨在研究青海骆驼遗传多样性,揭示青海骆驼的母系起源进化。采集柴达木地区3个青海骆驼类群耳组织样品88份并提取基因组DNA,利用PCR扩增和基因测序分析线粒体DNA D-loop序列,并与蒙古、内蒙古双峰驼进行比较。结果表明:D-loop序列中共检测到96个多态位点,定义了27种单倍型。3个青海骆驼类群占有16个单倍型,而蒙古双峰驼独有7个单倍型,内蒙古双峰驼独有4个单倍型。系统发育分析显示出两个独立的分支:第一支为青海骆驼3个类群与蒙古双峰驼,且德令哈双峰驼与其他两个类群间存在明显界限;第二支为内蒙古双峰驼。青海骆驼与内蒙古双峰驼的遗传距离均较远,但与蒙古双峰驼的遗传距离较近。因此,青海骆驼母系起源更倾向于蒙古双峰驼而非内蒙古双峰驼。 展开更多
关键词 柴达木双峰驼 线粒体dna 系统发育 遗传多样性 单倍型
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线粒体DNA耗竭综合征7型的多学科诊疗一例
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作者 宋雯洁 樊悦 +5 位作者 李旭 刘雅萍 戴毅 刘兴荣 冯逢 陈晓巍 《罕见病研究》 2024年第3期329-334,共6页
一例3岁4月龄女性患儿,共济失调伴极重度感音神经性听力下降2年,为改善听力就诊于我院。基因检测提示TWNK基因c.1186C>T(p.P396S)和c.1357C>T (p.R453W)复合杂合变异,经多学科团队共同讨论,考虑诊断为线粒体DNA耗竭综合征7型(肝脑... 一例3岁4月龄女性患儿,共济失调伴极重度感音神经性听力下降2年,为改善听力就诊于我院。基因检测提示TWNK基因c.1186C>T(p.P396S)和c.1357C>T (p.R453W)复合杂合变异,经多学科团队共同讨论,考虑诊断为线粒体DNA耗竭综合征7型(肝脑型)可能性大,患者已有神经系统受累,暂无肝功能不全的证据,人工耳蜗植入术疗效不确定,全身麻醉将加快脑病进展、并可能导致多器官功能衰竭,考虑围术期安全性问题,家长暂不考虑听力干预,予辅酶Q10、叶酸、左卡尼汀、复合维生素口服对症支持治疗。 展开更多
关键词 线粒体dna耗竭综合征7型(肝脑型) TWNK基因 感音神经性听力下降 共济失调
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腹膜透析滤出液中游离mtDNA 与腹膜透析患者腹腔微炎症的相关性分析
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作者 邱杰山 暨利军 +3 位作者 王燕翔 王丹萍 陈静静 方燊燊 《中国血液净化》 CSCD 2023年第10期739-743,共5页
目的探讨腹膜透析滤出液中游离线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)与腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者腹膜及腹腔微炎症的相关性。方法收集行PD治疗的患者85例,分为A组(1.5%葡萄糖腹膜透析液治疗组)和B组[高浓度(2袋以上2.5%或4.2... 目的探讨腹膜透析滤出液中游离线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)与腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)患者腹膜及腹腔微炎症的相关性。方法收集行PD治疗的患者85例,分为A组(1.5%葡萄糖腹膜透析液治疗组)和B组[高浓度(2袋以上2.5%或4.25%)葡萄糖腹膜透析液治疗组]。检测血生化指标,腹膜透析滤出液中白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白细胞介素1β(interleukin 1β,IL-1β)及白细胞介素(interleukin 18,IL-18)及mtDNA。比较2组患者上述指标的差异;将mtDNA分别与临床参数做相关性分析;通过多元回归分析明确影响腹膜透析滤出液中mtDNA浓度的危险因素。结果B组患者透析龄长于A组(t=-2.206,P=0.030),血白蛋白(Alb)低于A组(t=2.635,P=0.010),腹膜透析滤出液中IL-6(t=-4.835,P<0.001)、TNF-α(t=-6.557,P<0.001)、IL-1β(t=-2.395,P=0.019)、IL-18(t=-2.318,P=0.023)及游离mtDNA(t=-3.920,P<0.001)均高于A组。腹膜透析滤出液中mtDNA与IL-6(r=0.721,P<0.001)、TNF-α(r=0.418,P<0.001)、IL-1β(r=0.771,P<0.001)、IL-18(r=0.634,P<0.001)及透析龄(r=0.240,P=0.030)均呈正相关,与Alb呈负相关(r=-0.319,P=0.003)。多元回归分析显示腹膜透析液中葡萄糖浓度升高(β=0.358,P=0.005)、长透析龄(β=0.292,P<0.001)及Alb降低(β=-0.272,P=0.027)是腹膜透析滤出液中mtDNA水平升高的危险因素。结论腹膜透析滤出液中mtDNA与PD患者腹膜及腹腔慢性微炎症状态相关。高浓度葡萄糖腹膜透析液、长透析龄及低蛋白血症是导致其水平升高的危险因素。 展开更多
关键词 腹膜透析 腹膜透析滤出液 线粒体dna 微炎症
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崇仁麻鸡mtDNA D-loop区遗传结构与遗传多样性分析
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作者 陈基 王水兴 +3 位作者 孔佰祥 陈树泓 赵少添 吴凌伟 《中国家禽》 北大核心 2023年第12期108-112,共5页
为研究崇仁麻鸡线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区遗传多样性和遗传结构,试验采用PCR产物直接测序的方法,测定崇仁麻mtDNA D-loop区的全序列,并与其他5个红色原鸡亚种进行系统进化关系分析。结果显示:30个样本的mtDNA D-loop... 为研究崇仁麻鸡线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区遗传多样性和遗传结构,试验采用PCR产物直接测序的方法,测定崇仁麻mtDNA D-loop区的全序列,并与其他5个红色原鸡亚种进行系统进化关系分析。结果显示:30个样本的mtDNA D-loop区序列长度范围为1231~1232 bp,共发现27个多态位点,单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异(K)数值分别为0.947、0.00689和8.476。群体中16种单倍型划分为A、B、C和E单倍型类群。研究表明,崇仁麻鸡具有较高的线粒体遗传多样性,可能来源于不同的母系。 展开更多
关键词 崇仁麻鸡 线粒体dna D-LOOP区 系统发育关系
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A Study on the D-loop Region of Mitochondrial DNA (mtDNA) Mutation in Cervical Carcinomas 被引量:1
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作者 XUE Wen-qun CHEN Dao-zhen 《实用临床医药杂志》 CAS 2009年第3期44-47,共4页
Objective Background-study on genesis and development of tumor is mainly concentrated on gene mutation in nucleus.In recent years,however,the role of mitochondrial DNA(mtDNA) mutation in tumor genesis has been given m... Objective Background-study on genesis and development of tumor is mainly concentrated on gene mutation in nucleus.In recent years,however,the role of mitochondrial DNA(mtDNA) mutation in tumor genesis has been given more and more attention,which is the only extra-nucleus DNA in cells of higher animals.Carcinoma of the uterine cervix is a common tumor in gynecology,but there are few reports of mtDNA mutation in this area.The focus of this study was to investigate the mtDNA mutation in tumor tissues of cervical carcinomas and their relationship to tumorigenesis and tumor development.Methods The D-loop region of 24 cervical carcinomas together with the adjacent normal tissues were amplified by PCR and sequenced.Results Among the 24 cervical carcinomas,30 mutations in 9 patients′ specimen were identified with the mutations rate of 37.5%(9/24).There were 8 microsatellite instabilities among the mutations and 13 new polymorphisms which were not reported previously in the Genbank.Conclusions The D-loop region of mitochondrial DNA is a highly polymorphoric and mutable region and the mutation rate is relatively high in patients with cervical carcinomas. 展开更多
关键词 肿瘤 dna 基因突变 基因疗法
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