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庆阳驴mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析
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作者 施海娜 王永杰 +5 位作者 梁万鹏 耿智广 李世恩 徐振飞 刘刚 刘哲 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期601-613,共13页
[目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,... [目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,并探讨庆阳驴的遗传多样性与母系起源。[结果]在获得的520 bp D-loop碱基序列中,AT含量(57.3%)高于GC含量(42.8%),表现出碱基的偏倚性;检测到38个变异位点,包含8个碱基对的转换;其核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异(K)分别为0.01591、0.895和8.274,与欧洲家驴和中国家驴研究的平均值相比较低,说明该驴品种核苷酸变异较为贫乏。庆阳驴mtDNA D-loop区存在35个单倍型,单倍型之间的遗传距离为0.002~0.042。系统进化结果显示,庆阳驴存在2个线粒体支系,表明其具有2个母系起源,且遗传距离表明,庆阳驴与克罗地亚家驴之间的遗传距离较近。[结论]本研究从分子水平初步揭示庆阳驴核苷酸变异比较贫乏,杂交程度高,mtDNA遗传多态性正逐步丧失,应加强庆阳驴品种的遗传资源保护工作。 展开更多
关键词 庆阳驴 mtdna d-loop 遗传多样性 起源
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腾冲雪鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析 被引量:5
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作者 王荣琼 张自芳 +3 位作者 黄静 钱林东 滕晓红 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2021年第1期75-81,共7页
【目的】阐明腾冲雪鸡群体遗传背景信息。【方法】采用PCR产物直接测序技术对144只腾冲雪鸡样品的mtDNA D-loop区序列变异进行检测,在此基础上结合已发表的云南其他地方鸡数据进行群体遗传学分析。【结果】在所检测的腾冲雪鸡序列中,碱... 【目的】阐明腾冲雪鸡群体遗传背景信息。【方法】采用PCR产物直接测序技术对144只腾冲雪鸡样品的mtDNA D-loop区序列变异进行检测,在此基础上结合已发表的云南其他地方鸡数据进行群体遗传学分析。【结果】在所检测的腾冲雪鸡序列中,碱基T、C、A和G平均含量分别为30.2%、29.8%、27.3%和12.6%,序列A+T平均含量为57.6%;共检测到33个核苷酸多态位点,占检测核苷酸位点总数的6.35%,其中4个为单一信息位点,29个为简约信息位点,数据突变形式主要为转换。在该群体中共发现21种单倍型,单倍型多样度(H)为0.890±0.011,核苷酸多样度(π值)为0.01641±0.00028,序列间平均核苷酸差异数和整个群体平均遗传多样性分别为8.534和0.017±0.004。系统发育分析显示:腾冲雪鸡包含A、B、E、F和G 5个母系世系,各世系所占的比例分别为25.00%、20.83%、15.28%、30.56%和8.33%。【结论】揭示腾冲雪鸡遗传多样性丰富,在世系组成比例上有别于云南其他地方鸡,且与它们有一定遗传分化。 展开更多
关键词 腾冲雪鸡 mtdna d-loop 遗传多样性 母系世系 遗传分化
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云南3个新发掘地方鸡种mtDNA D-loop区序列遗传多样性分析 被引量:2
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作者 王坤 豆腾飞 +4 位作者 李琦华 柳明正 李丰耘 贾俊静 葛长荣 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第10期3232-3241,共10页
为研究在云南省怒江州及山区发现的3个地方鸡种翻毛鸡(FM)、赤脖鸡(CB)和YN鸡的群体遗传背景,试验采用线粒体DNA(mitochondral DNA,mtDNA)D-loop区序列为遗传标记,对3个鸡种共168个样品进行了检测分析。结果显示,翻毛鸡、赤脖鸡和YN鸡3... 为研究在云南省怒江州及山区发现的3个地方鸡种翻毛鸡(FM)、赤脖鸡(CB)和YN鸡的群体遗传背景,试验采用线粒体DNA(mitochondral DNA,mtDNA)D-loop区序列为遗传标记,对3个鸡种共168个样品进行了检测分析。结果显示,翻毛鸡、赤脖鸡和YN鸡3个地方鸡种共定义了27种单倍型,其单倍型多样度分别为0.947、0.938和0.596;核苷酸多样度分别为0.01268、0.01434、0.00239。系统发生树分析显示,本研究检测的168个样品分布在A、B、C、E、F和G 6个世系中,其中翻毛鸡包含E、F和G 3个世系;赤脖鸡包含A、B、C、E、F和G 6个世系,E、F和G世系为其主要世系;YN鸡包含E、F和G 3个世系,其中E世系是其主要世系。YN鸡主要与印度亚种、白洛克鸡、白来航鸡和新汉夏鸡等蛋鸡品种进化关系较近,而赤脖鸡血缘较杂乱,与滇南亚种、海南亚种、指名亚种、印度尼西亚斗鸡及老挝鸡进化关系较近;翻毛鸡与赤脖鸡共享了较多的单倍型,2个品种间的进化关系较近。本试验结果为新发现的3个云南地方鸡品种的母系起源和遗传评估提供了依据。 展开更多
关键词 翻毛鸡 赤脖鸡 YN鸡 mtdna d-loop 遗传多样性
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晋南驴mtDNA D-loop区部分序列系统进化分析与体型测定 被引量:4
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作者 李慧锋 赵婧微 +5 位作者 陈员玉 程俐芬 曹宁贤 解建平 靳鲁柱 李武峰 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第4期121-128,共8页
[目的]晋南驴是中国优良的中大型地方良种。随着社会经济的发展,这一种质资源的规模已经大为减小。为保护晋南驴种质资源,急需对晋南驴进行系统化分析与测定。[方法]本研究以晋南驴为研究对象,测定了试验驴群的身高、体长、胸围和管围... [目的]晋南驴是中国优良的中大型地方良种。随着社会经济的发展,这一种质资源的规模已经大为减小。为保护晋南驴种质资源,急需对晋南驴进行系统化分析与测定。[方法]本研究以晋南驴为研究对象,测定了试验驴群的身高、体长、胸围和管围等体型性状,并就晋南驴每一个体mtDNA D-loop保守区480 bp的片段进行测序,并使用ClustalX和Dnasp5.10等软件分析了驴群的变异情况。[结果]该驴群mtDNA D-loop区核苷酸多样度为0.02707;核苷酸多态位点97个,多态位点比例为20.21%。共检测到54种单倍型,单倍型多样度为0.867,单倍型比例为54.55%,采用邻近归并法构建的系统发育树分析结果显示该群体的亲缘关系主要分为两支。[结论]晋南驴遗传多样性较为丰富,但该晋南驴群体在亲缘关系上有一定的分化,说明该驴群有一定的混杂,急需开展相应的晋南驴保种工作。 展开更多
关键词 晋南驴 mtdna d-loop 亲缘关系 遗传多样性
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云南水牛mtDNA D-loop遗传多样性研究 被引量:2
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作者 亐开兴 金显栋 +7 位作者 张继才 尹以昌 李红伟 和嘉荣 和占星 罗再仁 雷初朝 黄必志 《中国牛业科学》 2020年第6期1-4,共4页
[目的]探究云南3个水牛品种(德宏水牛、滇东南水牛、盐津水牛)的mtDNA D-loop区的遗传多样性与母系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]本研究共分析了215条云南水牛mtDNA D-loop全序列,检测到107个多态位点,定义了8... [目的]探究云南3个水牛品种(德宏水牛、滇东南水牛、盐津水牛)的mtDNA D-loop区的遗传多样性与母系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]本研究共分析了215条云南水牛mtDNA D-loop全序列,检测到107个多态位点,定义了86种单倍型。结果表明,云南3个水牛品种的mtDNA遗传多样性非常丰富,其中,滇东南水牛的遗传多样性最高(Hd:0.946±0.017,Pi:0.0162±0.0018),盐津水牛的遗传多样性最低(Hd:0.805±0.063,Pi:0.0141±0.0031)。系统发育分析结果表明,在3个云南水牛品种中检测到2个主要支系(A和B支系及其亚支系)及1个稀有支系C,其中A支系为主要支系(79.07%),且经历了强烈的群体扩张。[结论]云南3个水牛品种具有丰富的mtDNA遗传多样性,主要有A与B 2个母系起源。 展开更多
关键词 云南水牛 mtdna d-loop 遗传多样性
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都安山羊和隆林山羊mtDNA D-loop区遗传多态性研究 被引量:3
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作者 李芳玉 黄光云 +5 位作者 王自豪 滕少花 曹艳红 孙俊丽 雷初朝 廖玉英 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期69-72,共4页
为探究广西都安山羊和隆林山羊2个地方品种的遗传多样性及母系起源,利用PCR测序及生物信息方法,对35只都安山羊和23只隆林山羊的mtDNA D-loop区进行多态性分析,共检测到83个变异位点,定义32种单倍型。都安山羊和隆林山羊的单倍型多样度... 为探究广西都安山羊和隆林山羊2个地方品种的遗传多样性及母系起源,利用PCR测序及生物信息方法,对35只都安山羊和23只隆林山羊的mtDNA D-loop区进行多态性分析,共检测到83个变异位点,定义32种单倍型。都安山羊和隆林山羊的单倍型多样度分别为0.956和0.960,其核苷酸多样度均为0.018,平均核苷酸差异数分别为21.2和21.5,说明都安山羊和隆林山羊具有丰富的遗传多样性。构建的NJ发育树表明,都安山羊和隆林山羊主要分为A与B 2个支系,A支系与弯角野山羊(Capra aegagrus)聚在一起,而旋角野山羊(Capra falconeri)单独聚为一支,揭示弯角野山羊是都安山羊和隆林山羊的母系祖先。 展开更多
关键词 山羊 mtdna d-loop 遗传多样性 支系 母系起源
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西林水牛和富钟水牛mtDNA D-loop序列的遗传多样性研究 被引量:4
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作者 马晓慧 王自豪 +3 位作者 贾鹏 雷初朝 廖玉英 黄光云 《家畜生态学报》 北大核心 2021年第4期19-22,共4页
该研究旨在探究西林水牛和富钟水牛mtDNA的遗传多样性和母系起源。采用PCR扩增、测序及生物信息学方法,测定了60头西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列。结合GenBank数据库已公布的25条西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列联合进行... 该研究旨在探究西林水牛和富钟水牛mtDNA的遗传多样性和母系起源。采用PCR扩增、测序及生物信息学方法,测定了60头西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列。结合GenBank数据库已公布的25条西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列联合进行多态性分析,共检测到60个多态位点,定义了38种mtDNA单倍型。西林水牛和富钟水牛的单倍型多样度分别为0.909±0.028和0.913±0.035,核苷酸多样度分别为0.019±0.004和0.013±0.005,这一结果表明西林水牛和富钟水牛具有丰富的遗传多样性。NJ系统发育树显示,西林水牛和富钟水牛均属于沼泽型水牛,且有A支系和B支系两个母系起源。 展开更多
关键词 水牛 mtdna d-loop 遗传多样性 母系起源
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从大约克猪乳中提取DNA用于mtDNA D-loop序列分析 被引量:1
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作者 张建梅 黄卫平 +3 位作者 金素钰 邹桐 黄林 郑玉才 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第6期568-573,共6页
为阐明一个大约克猪群体的遗传多样性,本实验用Chelex-100方法从来自四川省凉山州的30头大约克猪乳中提取基因组DNA,并用PCR方法扩增mtDNA D-loop区部分序列.结果显示,通过优化PCR循环数等参数,可以扩增出乳源基因组DNA的mtDNA D-loop区... 为阐明一个大约克猪群体的遗传多样性,本实验用Chelex-100方法从来自四川省凉山州的30头大约克猪乳中提取基因组DNA,并用PCR方法扩增mtDNA D-loop区部分序列.结果显示,通过优化PCR循环数等参数,可以扩增出乳源基因组DNA的mtDNA D-loop区,产物可直接测序,获得364 bp的序列.30个大约克猪mtDNA D-loop区单倍型多样度(Hd)为0.618;核苷酸多样度(Pi)为0.00860,显示了较丰富的遗传多样性;检测到11个多态位点,界定了7种单倍型,其中具有Hap3单倍型的个体比例占50%以上.结果表明,乳源基因组DNA可用于mtDNA D-loop区的PCR扩增及直接测序,试验大约克猪母系遗传多样性较高. 展开更多
关键词 大约克猪 mtdna d-loop 遗传多样性
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中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究 被引量:24
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作者 齐国强 昝林森 +3 位作者 张桂香 王志刚 王均辉 韩旭 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期7-11,共5页
对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 ... 对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 0±0.005 6,平均核苷酸差异(Average number of nucleotide differences,k)为18.445 0,表明我国水牛的遗传多态性丰富。构建的NJ进化树显示这10个品种的水牛主要有两个母系起源。 展开更多
关键词 中国地方水牛 mtdna d-loop 遗传多样性 起源
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我国主要地方绵羊品种mtDNA D-loop区PCR-RFLP研究 被引量:25
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作者 李祥龙 张增利 +3 位作者 巩元芳 刘铮铸 贾青 王立泽 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期165-170,共6页
利用5种限制性内切酶(HinfⅠ,MspⅠ,Sau3AⅠ,XspⅠ,TaqⅠ),采用PCRRFLP技术研究了我国9个地方绵羊品种以及2个引入品种共计83只绵羊个体线粒体DNADloop区的多态性。结果表明,我国主要地方绵羊品种线粒体DNADloop区存在两种基本单体型,... 利用5种限制性内切酶(HinfⅠ,MspⅠ,Sau3AⅠ,XspⅠ,TaqⅠ),采用PCRRFLP技术研究了我国9个地方绵羊品种以及2个引入品种共计83只绵羊个体线粒体DNADloop区的多态性。结果表明,我国主要地方绵羊品种线粒体DNADloop区存在两种基本单体型,提示我国主要地方绵羊品种起源于两个母系祖先。线粒体DNADloop区多态度为0.0421%,说明我国地方绵羊品种线粒体DNA多态度较为贫乏。 展开更多
关键词 地方绵羊品种 线粒体DNA d-loop PCR-RFLP
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中国三种实验用小型猪mtDNA D-loop多态性分析 被引量:16
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作者 刘中禄 魏泓 +2 位作者 曾养志 王爱德 甘世祥 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期425-430,共6页
分析中国三种实验用小型猪线粒体DNA (mtDNA)D loop的多态性 ,建立各品种品系猪的遗传标记 ,为各品种品系猪的鉴别提供依据。应用PCR对西双版纳近交系小耳猪、广西巴马小型猪、贵州小型香猪和长白猪血液总DNA样品中mtDNAD loop进行扩增 ... 分析中国三种实验用小型猪线粒体DNA (mtDNA)D loop的多态性 ,建立各品种品系猪的遗传标记 ,为各品种品系猪的鉴别提供依据。应用PCR对西双版纳近交系小耳猪、广西巴马小型猪、贵州小型香猪和长白猪血液总DNA样品中mtDNAD loop进行扩增 ,用 2 3种限制性内切酶消化 ,观察其酶切多态。PCR扩增其mtDNAD loop 5′端 2 2 7bp高变区域 ,应用PCR SSCP和PCR直接测序分析 ,观察其单链构象多态和序列多态。结果显示 :3种小型猪之间未见酶切长度多态、单链构象多态和序列多态 ;与长白猪之间表现出单链构象多态和序列多态。本研究认为 :3种实验用小型猪之间mtDNA多态性贫乏 ,证明其在母系起源和进化上的一致性 ,亲源关系很近 ,应用PCR RFLP、PCR SSCP和PCR直接测序分析 ,尚不能作为 3种实验用小型猪品种品系鉴定的依据 ,但与长白猪等欧系猪比较有一定差异。 展开更多
关键词 小型猪 聚合酶链反应 线粒体DNA 控制区 多态性 实验动物
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中国黄牛mtDNA D-loop遗传多样性及起源 被引量:12
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作者 房兴堂 周艳 +2 位作者 陈宏 蔡欣 方南洙 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期928-933,共6页
Complete mitochondrial D-loop sequences of 140 samples obtained from 15 Chinese local cattle breeds were analyzed.The result showed 67 different haplotypes with 113 polymorphic sites.The haplotype diversity and nucleo... Complete mitochondrial D-loop sequences of 140 samples obtained from 15 Chinese local cattle breeds were analyzed.The result showed 67 different haplotypes with 113 polymorphic sites.The haplotype diversity and nucleotide diversity were 0.608-1.000 and 0.002-0.028,respectively,indicating abundant genetic diversity in Chinese cattle.The constructed Neighbor-Joining(NJ) tree revealed that there were two maternal origins of Bos taurus and Bos indicus in Chinese cattle.Among them,the Bos taurus lineage had rich mtDNA genetic diversity,while Bos indicus lineage had poor mtDNA genetic diversity,respectively.It can be concluded that the cattle in Northern China originated from the Bos taurus lineage,while the cattle in Central China and Southern China originated from Bos taurus and Bos indicus lineages.In our study,two mtDNA haplotypes belonging to African cattle were detected,thus providing molecular evidence for an African lineage in Chinese cattle. 展开更多
关键词 中国黄牛 mtdna d-loop 单倍型 起源
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3个群体鳙鱼mtDNA D-loop区段的限制性片段长度多态性分析 被引量:19
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作者 单淇 董仕 +1 位作者 吴海防 谷口顺彦 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期174-180,共7页
鳙鱼(Aristichthys nobilis)采自江西瑞昌、湖南长沙的天然群体以及天津宁河的人工繁殖群体共127尾,对其线粒体DNA的D-loop区段进行PCR扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切。酶切结果显示,在12种内切酶中,8种有酶切位点,2种个体间有变异,为... 鳙鱼(Aristichthys nobilis)采自江西瑞昌、湖南长沙的天然群体以及天津宁河的人工繁殖群体共127尾,对其线粒体DNA的D-loop区段进行PCR扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切。酶切结果显示,在12种内切酶中,8种有酶切位点,2种个体间有变异,为AfaⅠ和HinfⅠ,共得到7种单倍型。依据单倍型频率的组成情况,计算出瑞昌与长沙、宁河群体间的Rogers遗传距离分别为0.728 3和0.500 7,长沙和宁河群体间的Rogers遗传距离为0.813 5。AfaⅠ的酶切类型C和HinfⅠ的酶切类型B组成的单倍型,在长沙群体中占87.5%,而在瑞昌和宁河群体中均为零。由此可以认为鳙鱼瑞昌群体和长沙群体可能是两个隔离的独立群体。 展开更多
关键词 鳙鱼 mtdna d-loop RFLP Rogers遗传距离 核苷酸多样性 核苷酸歧化距离 遗传多样性
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基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析瓢鸡的遗传多样性 被引量:34
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作者 贡潘偏抽 刘丽仙 +6 位作者 李大林 袁跃云 孙利民 杨润 刘文瑜 刘伟 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期211-214,223,共5页
采用PCR产物直接测序技术对云南省镇沅县50只瓢鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明:在所分析的D-loop区序列中(520 bp),T,C,A,G平均含量分别为30.4%,29.6%,27.4%,12.6%;共检测到27个核苷酸多态位... 采用PCR产物直接测序技术对云南省镇沅县50只瓢鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明:在所分析的D-loop区序列中(520 bp),T,C,A,G平均含量分别为30.4%,29.6%,27.4%,12.6%;共检测到27个核苷酸多态位点,其中24个为转换,3个为颠换,序列突变率为5.19%;序列存在13种单倍型,单倍型多样度(H)为0.883±0.028,核苷酸多样度(π值)为0.015 03±0.000 99,表明瓢鸡群体内遗传变异较丰富。瓢鸡样品可划分为A,B,E,F,G等5个世系,在NJ无根系统树上聚为5大枝,揭示瓢鸡在遗传组成上具有5个母系血统来源。 展开更多
关键词 瓢鸡 线粒体DNA D—loop 单倍型 遗传变异 核苷酸多样度
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云南3个地方鸡群体mtDNA D-loop遗传多样性分析 被引量:16
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作者 苗永旺 孙利民 +5 位作者 王素芳 欧阳依娜 张永云 袁峰 和四池 李庆量 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期395-401,共7页
他留乌骨鸡、兰坪绒毛鸡和武定鸡为分布于云南西北部和中部地区的优良地方鸡遗传资源。本研究采用mt DNA母系遗传标记,对这3个地方鸡的群体遗传变异进行了检测和遗传多样性分析。在他留乌骨鸡中检测到33个核苷酸变异位点,共定义16种单倍... 他留乌骨鸡、兰坪绒毛鸡和武定鸡为分布于云南西北部和中部地区的优良地方鸡遗传资源。本研究采用mt DNA母系遗传标记,对这3个地方鸡的群体遗传变异进行了检测和遗传多样性分析。在他留乌骨鸡中检测到33个核苷酸变异位点,共定义16种单倍型,单倍型多样度为0.855±0.036,核苷酸多样度为0.017 15±0.000 58,群体内遗传距离为0.018±0.004;在兰坪绒毛鸡中发现18个核苷酸变异位点,共定义7种单倍型,单倍型多样度为0.545±0.079,核苷酸多样度为0.004 65±0.001 29,群体内遗传距离为0.005±0.001;在武定鸡中观测到36个变异位点,共定义26种单倍型,单倍型多样度为0.922±0.018,核苷酸多样度为0.015 34±0.000 80,群体内遗传距离为0.016±0.003。单倍型中介网络分析显示:他留乌骨鸡和武定鸡均包含A,B,E,F,G和H等6个母系世系,但各世系的构成比存在较大差异:他留乌骨鸡中A,B,E,F,G和H世系的构成比为35.19%,5.55%,5.55%,16.67%,27.78%,9.26%,而在武定鸡中却为34.72%,22.22%,12.50%,12.50%,15.28%,2.78%;兰坪绒毛鸡仅含有A,F和G等3个世系,构成比为2.13%,89.36%,8.51%,云南土著鸡血统占97.87%,主要由F世系构成。上述结果揭示云南3个地方鸡群体存在较大遗传分化,他留乌骨鸡和武定鸡群体变异丰富,兰坪绒毛鸡群体变异较为贫乏,但其母系遗传组成独特。本研究结果支持家鸡多个母系起源的论点。 展开更多
关键词 他留乌骨鸡 兰坪绒毛鸡 武定鸡 mtdna D—loop 遗传多样性 遗传组成
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新疆三种雅罗鱼属鱼类mtDNA D-loop多态性及起源分化分析 被引量:11
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作者 胡文革 王金富 +2 位作者 盛金良 段子渊 马润林 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期414-418,共5页
用PCR-RFLP技术,对新疆分布的准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼的mtDNA D-loop高变区约827bp进行了扩增,用ScaI、HinfI、AluI、DdeI4种限制性内切核酸酶对56个样本的扩增产物酶切和RFLP分析,共检测到6种单倍型。准噶尔雅罗鱼存在... 用PCR-RFLP技术,对新疆分布的准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼的mtDNA D-loop高变区约827bp进行了扩增,用ScaI、HinfI、AluI、DdeI4种限制性内切核酸酶对56个样本的扩增产物酶切和RFLP分析,共检测到6种单倍型。准噶尔雅罗鱼存在2种单倍型:BDAA和BDBA;贝加尔雅罗鱼存在3种:AAAA、ABAA和ACAA;高体雅罗鱼只有1种。初步认为,准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼存在较丰富的群体内变异。用6种单倍型及净遗传距离绘制的UPGMA分子系统树,提示准噶尔雅罗鱼有可能是原始种,贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼是由准噶尔雅罗鱼进化而来。 展开更多
关键词 新疆 雅罗鱼 mtdna D-100p PCR—RFLP 多态性 进化
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山东猪种mtDNA D-loop区部分序列遗传多样性及系统进化研究 被引量:11
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作者 王继英 郭建凤 +3 位作者 孙守礼 王诚 张印 武英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期792-799,共8页
为了解山东省猪种的遗传资源状况,阐明猪种间的亲缘关系,对山东省猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猪、昌潍白猪和鲁烟白猪)及引进猪种(杜洛克、大约克和长白猪)共165个样本的mtDNA D-loop区部分... 为了解山东省猪种的遗传资源状况,阐明猪种间的亲缘关系,对山东省猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猪、昌潍白猪和鲁烟白猪)及引进猪种(杜洛克、大约克和长白猪)共165个样本的mtDNA D-loop区部分序列(1102 bp)进行PCR扩增和序列测定,并采用现代生物信息学软件进行了数据处理分析,结果表明:山东各猪种之间遗传距离较小(0.0005~0.0046),远小于国外猪种杜洛克、长白与山东各猪种间的遗传距离(〉0.14),但大约克与山东各猪种的平均遗传距离较小(0.005)。构建的NJ分子系统进化树将所测样本分为2个独立的支系,第一支由山东各猪种和部分大约克构成,另一支全部为引进猪种。莱芜黑猪和大蒲莲黑猪在NJ系统树上分布集中,各自聚为一小类,其它6个猪种都很分散,说明莱芜黑猪和大蒲莲黑猪母源血统单一,其它6个猪种母源血统遗传复杂,彼此之间基因交流多。 展开更多
关键词 山东省猪种 mtdna d-loop 遗传多样性 系统进化
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广西的尼里-拉菲水牛和摩拉水牛mtDNA D-loop区遗传多样性研究 被引量:1
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作者 李双 汤嘉玉 +5 位作者 王自豪 黄光云 滕少花 曹艳红 雷初朝 孙俊丽 《中国牛业科学》 2020年第5期1-4,共4页
[目的]探究引入广西南宁的尼里-拉菲水牛和摩拉水牛的mtDNA D-loop区遗传多样性与母系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]对从广西南宁采集的52个江河型水牛(尼里-拉菲水牛25个,摩拉水牛27个)mtDNA D-loop序列与Gen... [目的]探究引入广西南宁的尼里-拉菲水牛和摩拉水牛的mtDNA D-loop区遗传多样性与母系起源。[方法]采用PCR扩增、测序及生物信息学方法。[结果]对从广西南宁采集的52个江河型水牛(尼里-拉菲水牛25个,摩拉水牛27个)mtDNA D-loop序列与GenBank下载的20条尼里-拉菲水牛和23条摩拉水牛序列进行联合分析,共检测到112个变异位点,定义42个单倍型,发现摩拉水牛(Hd:0.934±0.027)与尼里-拉菲水牛的遗传多样性(Hd:0.929±0.017)都很丰富。NJ系统发育树显示尼里-拉菲水牛和摩拉水牛含有江河型和沼泽型水牛mtDNA支系,表明尼里-拉菲水牛和摩拉水牛引入中国后均与沼泽型水牛进行了杂交,在外貌上很难区分。[结论]引入广西南宁的尼里-拉菲水牛和摩拉水牛与沼泽型水牛存在广泛的血缘混杂现象。 展开更多
关键词 尼里-拉菲水牛 摩拉水牛 mtdna d-loop 遗传多样性
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中国部分地方牛种mtDNA D-loop区全序列的遗传多样性与系统进化分析 被引量:7
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作者 马云 于波 +4 位作者 徐永杰 吴海港 梁小娟 付蕾 李芬 《信阳师范学院学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2012年第2期202-205,217,共5页
利用PCR测序及生物信息学分析技术,对我国5个地方黄牛品种、5个地方水牛品种及2个地方牦牛品种的mtDNA D-loop区全序列进行PCR扩增以及核苷酸多样度、单倍型多样度分析,发现中国地方黄牛、水牛与牦牛具有丰富的遗传多样性.对试验牛mtDNA... 利用PCR测序及生物信息学分析技术,对我国5个地方黄牛品种、5个地方水牛品种及2个地方牦牛品种的mtDNA D-loop区全序列进行PCR扩增以及核苷酸多样度、单倍型多样度分析,发现中国地方黄牛、水牛与牦牛具有丰富的遗传多样性.对试验牛mtDNA D-loop区全序列与牛亚科代表性物种黄牛、水牛、家牦牛、野牦牛、欧洲普通牛、印度瘤牛以及摩拉水牛相应序列进行系统发育分析.结果显示:黄牛与牦牛的亲缘关系较近,它们与水牛的亲缘关系较远;中国水牛属于沼泽型水牛,也有少量江河型水牛渐渗入中国水牛群体;中国黄牛为普通牛和瘤牛的混合母系起源;进化树显示高原牦牛与野牦牛的亲缘关系较近,环湖牦牛与家牦牛的亲缘关系较近. 展开更多
关键词 黄牛 水牛 牦牛 mtdna d-loop 系统进化
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3种中国鲤mtDNA D-Loop序列的多态性与系统进化研究 被引量:10
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作者 梁宏伟 邹桂伟 +3 位作者 罗相忠 王长忠 呼光富 李忠 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2009年第3期55-59,65,共6页
【目的】探讨长江野生鲤、荷包红鲤和兴国红鲤3种中国鲤的遗传变异、亲缘关系及系统进化。【方法】对3种鲤的D-Loop序列进行扩增并测序,分析其遗传多样性,并与GenBank中获取的另外5种鲤鱼的D-Loop序列一起构建进化树。【结果】3种鲤的... 【目的】探讨长江野生鲤、荷包红鲤和兴国红鲤3种中国鲤的遗传变异、亲缘关系及系统进化。【方法】对3种鲤的D-Loop序列进行扩增并测序,分析其遗传多样性,并与GenBank中获取的另外5种鲤鱼的D-Loop序列一起构建进化树。【结果】3种鲤的碱基组成中A+T含量均高于C+G含量;T碱基含量最高,平均为33.5%;C碱基最低,平均为13.7%。在检测的3种鲤上共发现37个突变位点,其中有2个插入,28个转换,7个颠换,碱基的替换有明显偏倚。单倍型多样性指数最高的是长江野生鲤(0.984±0.019),最低的是荷包红鲤(0.113±0.072);核苷酸多样性指数以长江野生鲤最高,为0.00623,荷包红鲤最低,为0.00012。长江野生鲤的遗传多样性较兴国红鲤和荷包红鲤丰富,荷包红鲤的遗传多样性最低。聚类分析表明,8种鲤属鱼聚为2大支,德国鲤单独为一类,其余7种聚为一类。【结论】荷包红鲤和兴国红鲤虽都原产于江西省,但2种鲤最初是独立从野生鲤中通过体色变异分化而来的。 展开更多
关键词 长江野生鲤 荷包红鲤 兴国红鲤 mtdna d-loop
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