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广西梧州地区近十年传染性法氏囊病病毒vVP2变化特征分析
被引量:
7
1
作者
沈巍巍
陈果
+1 位作者
何秀苗
韦平
《动物医学进展》
北大核心
2017年第3期32-37,共6页
为了解近10年来广西梧州地区鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)分子进化情况,对2013年—2014年间来自该地区传染性法氏囊病(Infectious bursal disease,IBD)的法氏囊样品进行IBDV的分离鉴定,并对分离株以及课题组2006年—2013年间分离的毒株,...
为了解近10年来广西梧州地区鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)分子进化情况,对2013年—2014年间来自该地区传染性法氏囊病(Infectious bursal disease,IBD)的法氏囊样品进行IBDV的分离鉴定,并对分离株以及课题组2006年—2013年间分离的毒株,共24株的VP2高变区(vVP2)进行序列分析和遗传进化分析。结果表明,QX0601等23个分离株在关键氨基酸位点上具有256I、284A、294I等超强毒株(vvIBDV)的分子特征,遗传进化分析表明,这23株分离株与UK661、HK46等超强毒参考株同处一个分支中,亲缘关系较近;QX110603在关键性氨基酸位点上则具有256V、284T、294L等弱毒株的特征,遗传进化分析显示,其与BJ836等致弱株处于同一分支,亲缘关系较近。对所有分离株进行氨基酸位点分析发现,该地区IBDV进化出现了新的特点,212D-212N符合国内近年来的分离株的变化趋势,209T-209A、338R-338H、359T-359R则表现出地域特点,未曾见过相似报道。研究结果表明,具有vvIBDV分子特征的分离株是该地区近10年来主要流行毒株,该地区IBDV毒株在vVP2序列上仍处于不断进化中,且带有地域特点。
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关键词
传染性法氏囊病病毒
vvp2
序列分析
遗传进化分析
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职称材料
传染性法氏囊病快速诊断技术的建立及其应用
被引量:
13
2
作者
龙进学
韦平
阳秀英
《广西大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
2003年第2期103-108,共6页
根据已发表的IBDV各致病型毒株的序列,在病毒结构蛋白VP2编码基因的高变区(VP2variabledo-main,vVP2)两端外侧的保守序列内设计合成了2条寡核苷酸引物,对各种不同致病型的12株参考毒株进行逆转录酶—聚合酶链式反应(RT-PCR)的检测.结果1...
根据已发表的IBDV各致病型毒株的序列,在病毒结构蛋白VP2编码基因的高变区(VP2variabledo-main,vVP2)两端外侧的保守序列内设计合成了2条寡核苷酸引物,对各种不同致病型的12株参考毒株进行逆转录酶—聚合酶链式反应(RT-PCR)的检测.结果12个参考毒株均能扩增出约679bp的目的片段,而对作为阴性对照的常见5种鸡病病原NDV、IBV、CAIV、E.coli、pM均没有扩增出任何片段;应用建立的技术对疑似IBD的34份临床病料进行检测,并同时在基础RT-PCR扩增的片段内设计另一对引物进行Nested-PCR检测.结果基础RT-PCR方法检测到11份阳性,Nested-PCR检测到23份阳性.研究的结果表明建立的IBD的RT-PCR诊断技术具有特异、快捷、敏感的特点.在此基础上设计的Nested-PCR则大大提高了阳性检出率(提高52.1%).
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关键词
IBDV
vvp2
RT—PCR
Nested—PCR
快速诊断
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职称材料
传染性法氏囊病病毒的分离及其VP2高变区序列的比较
被引量:
2
3
作者
张华智
杨霖
+2 位作者
熊忠贤
何秀苗
韦平
《安徽农业科学》
CAS
2013年第5期1961-1963,共3页
[目的]从病鸡中分离传染性法氏囊病病毒(IBDV),并对其VP2基因高变区序列进行比较。[方法]采用鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种SPF鸡胚的方法分离到2株IBDV。对分离株(vVP2)进行扩增和序列测定,分析分离株的关键氨基酸位点特征,并与参考毒株相...
[目的]从病鸡中分离传染性法氏囊病病毒(IBDV),并对其VP2基因高变区序列进行比较。[方法]采用鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种SPF鸡胚的方法分离到2株IBDV。对分离株(vVP2)进行扩增和序列测定,分析分离株的关键氨基酸位点特征,并与参考毒株相应序列进行同源性比较。[结果]2株分离株特征性位点的氨基酸为222A、249Q、254G、256I、279D、284A、294I和299S,属于wIB-DV的特征,与wIBDV参考株具有较高的同源性,其核苷酸和氨基酸同源性分别为96.0%~97.0%和98.7%~99.4%。从遗传进化树来看,2个分离株与参考的vvIBDV也在一个分支。此外,2个分离株表现出与该鸡场常用的疫苗株MB有较高的同源性,其核苷酸和氨基酸同源性分别为96.8%和98.1%,并在遗传进化树中同属于一个大分支,但其特征性位点的氨基酸明显不同。在其他氨基酸位点上,2个分离株均发生了D212N的特有变化。[结论]该鸡群感染的IBDV具有vvIBDV的分子特征,并发生了与疫苗株和参考株不同的分子变化。
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关键词
传染性法氏囊病病毒
超强毒株
vvp2
分子特征
RT-PCR
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职称材料
题名
广西梧州地区近十年传染性法氏囊病病毒vVP2变化特征分析
被引量:
7
1
作者
沈巍巍
陈果
何秀苗
韦平
机构
广西民族大学海洋与生物技术学院/广西高校微生物与植物资源利用重点实验室
广西大学养禽与禽病研究所
出处
《动物医学进展》
北大核心
2017年第3期32-37,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31560706
31660717)
+1 种基金
广西自然科学基金项目(2014GXNSFDA118018)
2014广西民族大学相思湖青年学者创新团队项目
文摘
为了解近10年来广西梧州地区鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)分子进化情况,对2013年—2014年间来自该地区传染性法氏囊病(Infectious bursal disease,IBD)的法氏囊样品进行IBDV的分离鉴定,并对分离株以及课题组2006年—2013年间分离的毒株,共24株的VP2高变区(vVP2)进行序列分析和遗传进化分析。结果表明,QX0601等23个分离株在关键氨基酸位点上具有256I、284A、294I等超强毒株(vvIBDV)的分子特征,遗传进化分析表明,这23株分离株与UK661、HK46等超强毒参考株同处一个分支中,亲缘关系较近;QX110603在关键性氨基酸位点上则具有256V、284T、294L等弱毒株的特征,遗传进化分析显示,其与BJ836等致弱株处于同一分支,亲缘关系较近。对所有分离株进行氨基酸位点分析发现,该地区IBDV进化出现了新的特点,212D-212N符合国内近年来的分离株的变化趋势,209T-209A、338R-338H、359T-359R则表现出地域特点,未曾见过相似报道。研究结果表明,具有vvIBDV分子特征的分离株是该地区近10年来主要流行毒株,该地区IBDV毒株在vVP2序列上仍处于不断进化中,且带有地域特点。
关键词
传染性法氏囊病病毒
vvp2
序列分析
遗传进化分析
Keywords
Infectious bursal disease viruses
vvp2
sequence analysis
phylogenetic analysis
分类号
S852.659.4 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
传染性法氏囊病快速诊断技术的建立及其应用
被引量:
13
2
作者
龙进学
韦平
阳秀英
机构
广西大学动物科技学院
出处
《广西大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
2003年第2期103-108,共6页
基金
教育部科技重点研究项目(项目号02116)
广西大学谭锦球科学基金项目(项目号X022053)
文摘
根据已发表的IBDV各致病型毒株的序列,在病毒结构蛋白VP2编码基因的高变区(VP2variabledo-main,vVP2)两端外侧的保守序列内设计合成了2条寡核苷酸引物,对各种不同致病型的12株参考毒株进行逆转录酶—聚合酶链式反应(RT-PCR)的检测.结果12个参考毒株均能扩增出约679bp的目的片段,而对作为阴性对照的常见5种鸡病病原NDV、IBV、CAIV、E.coli、pM均没有扩增出任何片段;应用建立的技术对疑似IBD的34份临床病料进行检测,并同时在基础RT-PCR扩增的片段内设计另一对引物进行Nested-PCR检测.结果基础RT-PCR方法检测到11份阳性,Nested-PCR检测到23份阳性.研究的结果表明建立的IBD的RT-PCR诊断技术具有特异、快捷、敏感的特点.在此基础上设计的Nested-PCR则大大提高了阳性检出率(提高52.1%).
关键词
IBDV
vvp2
RT—PCR
Nested—PCR
快速诊断
Keywords
IBDV
vvp2
RT-PCR
Nested-PCR
分类号
S831.7 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
传染性法氏囊病病毒的分离及其VP2高变区序列的比较
被引量:
2
3
作者
张华智
杨霖
熊忠贤
何秀苗
韦平
机构
广西民族大学化学与生物转化过程重点实验室
广西钦州市畜牧站
广西大学
出处
《安徽农业科学》
CAS
2013年第5期1961-1963,共3页
基金
广西自然科学基金项目(2012GXNSFAA053060
桂科自0728058)
文摘
[目的]从病鸡中分离传染性法氏囊病病毒(IBDV),并对其VP2基因高变区序列进行比较。[方法]采用鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种SPF鸡胚的方法分离到2株IBDV。对分离株(vVP2)进行扩增和序列测定,分析分离株的关键氨基酸位点特征,并与参考毒株相应序列进行同源性比较。[结果]2株分离株特征性位点的氨基酸为222A、249Q、254G、256I、279D、284A、294I和299S,属于wIB-DV的特征,与wIBDV参考株具有较高的同源性,其核苷酸和氨基酸同源性分别为96.0%~97.0%和98.7%~99.4%。从遗传进化树来看,2个分离株与参考的vvIBDV也在一个分支。此外,2个分离株表现出与该鸡场常用的疫苗株MB有较高的同源性,其核苷酸和氨基酸同源性分别为96.8%和98.1%,并在遗传进化树中同属于一个大分支,但其特征性位点的氨基酸明显不同。在其他氨基酸位点上,2个分离株均发生了D212N的特有变化。[结论]该鸡群感染的IBDV具有vvIBDV的分子特征,并发生了与疫苗株和参考株不同的分子变化。
关键词
传染性法氏囊病病毒
超强毒株
vvp2
分子特征
RT-PCR
Keywords
Infectious bursal disease virus
Strong virulent IBDV
vvp2
Molecular characteristics
RT-PCR
分类号
S852.647 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广西梧州地区近十年传染性法氏囊病病毒vVP2变化特征分析
沈巍巍
陈果
何秀苗
韦平
《动物医学进展》
北大核心
2017
7
下载PDF
职称材料
2
传染性法氏囊病快速诊断技术的建立及其应用
龙进学
韦平
阳秀英
《广西大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
2003
13
下载PDF
职称材料
3
传染性法氏囊病病毒的分离及其VP2高变区序列的比较
张华智
杨霖
熊忠贤
何秀苗
韦平
《安徽农业科学》
CAS
2013
2
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职称材料
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