目的利用肠道病毒分子定型试验,对病毒性脑炎患儿的脑脊液标本进行分子型别鉴定。方法提取患儿脑脊液核酸,利用半巢式聚合酶链反应(Sn-PCR)对肠道病毒VP1区进行特异性扩增并进行序列测定,通过BLAST比对确定肠道病毒的类型,采用Mega6.0...目的利用肠道病毒分子定型试验,对病毒性脑炎患儿的脑脊液标本进行分子型别鉴定。方法提取患儿脑脊液核酸,利用半巢式聚合酶链反应(Sn-PCR)对肠道病毒VP1区进行特异性扩增并进行序列测定,通过BLAST比对确定肠道病毒的类型,采用Mega6.0软件构建基因进化树。结果 BLAST比对显示该病毒是肠道病毒中的柯萨奇病毒B5(Coxsackievirus group B5,CVB5)。从进化树上看,青海分离株04/CVB5/2010/Qinghai/CHN由2009年山东分离株SD2009-067不断演变而来,而与分离株AH-HK19/CHN/2010/CVB5不在同一进化分支,相距甚远,与FJLY/2011096h分离株亲缘性关系较近。结论成功应用Sn-PCR对患儿脑脊液中未知肠道病毒进行鉴定,确定肠道病毒类型是CVB5型,为肠道病毒引起的脑炎疾病的防控提供参考。展开更多
文摘目的利用肠道病毒分子定型试验,对病毒性脑炎患儿的脑脊液标本进行分子型别鉴定。方法提取患儿脑脊液核酸,利用半巢式聚合酶链反应(Sn-PCR)对肠道病毒VP1区进行特异性扩增并进行序列测定,通过BLAST比对确定肠道病毒的类型,采用Mega6.0软件构建基因进化树。结果 BLAST比对显示该病毒是肠道病毒中的柯萨奇病毒B5(Coxsackievirus group B5,CVB5)。从进化树上看,青海分离株04/CVB5/2010/Qinghai/CHN由2009年山东分离株SD2009-067不断演变而来,而与分离株AH-HK19/CHN/2010/CVB5不在同一进化分支,相距甚远,与FJLY/2011096h分离株亲缘性关系较近。结论成功应用Sn-PCR对患儿脑脊液中未知肠道病毒进行鉴定,确定肠道病毒类型是CVB5型,为肠道病毒引起的脑炎疾病的防控提供参考。