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λ-DNA通过纳米通道产生电流信号的1/f噪声分析 被引量:1
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作者 顾兴中 刘磊 +1 位作者 王霏 倪中华 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第4期724-728,共5页
利用膜片钳采集了λ-DNA通过纳米通道时的电流信号,分析了电压、通道几何形状与尺寸、盐浓度以及通道材料等因素对信号1/f噪声的影响.研究结果表明,纳米通道内的1/f噪声是由溶液体态离子与壁面电荷综合作用引起的.对于氮化硅纳米通道,... 利用膜片钳采集了λ-DNA通过纳米通道时的电流信号,分析了电压、通道几何形状与尺寸、盐浓度以及通道材料等因素对信号1/f噪声的影响.研究结果表明,纳米通道内的1/f噪声是由溶液体态离子与壁面电荷综合作用引起的.对于氮化硅纳米通道,当电压绝对值增大至一定程度时,通道内部会出现电荷局部拥挤现象,导致局部电阻增大,1/f噪声的功率也随之增大.孔径对氮化硅纳米通道检测信号的1/f噪声影响相对较小.石墨烯的结构电容大并具有极高的载流子迁移率,故其噪声信号明显强于氮化硅纳米通道.研究结果有助于辨识λ-DNA通过纳米通道时产生的高信噪比电流信号. 展开更多
关键词 纳米通道 λ-dna 1 f噪声
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基于Si3N4薄膜的纳米孔制备及λ-DNA分子检测(英文) 被引量:1
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作者 马建 刘磊 倪中华 《传感技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期876-879,共4页
随着纳米加工技术的快速发展,纳米孔传感器越来越多的运用于生物大分子检测。本文利用聚焦离子束微纳加工技术在100 nm厚的氮化硅薄膜上制备出50 nm~60 nm孔径的纳米孔,将带有纳米孔的硅基片密封在两个有机玻璃液池内,在液池两侧加入... 随着纳米加工技术的快速发展,纳米孔传感器越来越多的运用于生物大分子检测。本文利用聚焦离子束微纳加工技术在100 nm厚的氮化硅薄膜上制备出50 nm~60 nm孔径的纳米孔,将带有纳米孔的硅基片密封在两个有机玻璃液池内,在液池两侧加入氯化钾溶液,同时施加一定的偏置电压,利用膜片钳放大器可以实时监测离子穿越纳米孔所产生的离子电流,当在液池的一侧加入λ-DNA后,在电场力的作用下,λ-DNA分子穿越纳米孔由于物理站位作用从而引起离子电流的下降。 展开更多
关键词 纳米孔 聚焦离子束 氮化硅薄膜 过孔 λ-dna
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λ-DNA的提取与纯化
3
作者 刘宝全 赵玉清 +1 位作者 付永秋 范圣第 《生物学教学》 2000年第1期3-3,共1页
关键词 λ-dna 基因工程 溶源菌株 提取 纯化
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纳通道内λ-DNA过孔信号的小波去噪及统计分析 被引量:1
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作者 王霏 倪中华 +3 位作者 陈云飞 刘磊 马建 毕晨 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期50-54,共5页
针对λ噬菌体中的脱氧核糖核酸(λ-DNA)通过纳米通道时的过孔信号噪音大,强度弱且非平稳的缺点,提出了使用具有良好时频域分辨能力的小波分析方法对其进行去噪处理,并对有效去噪后的λ-DNA过孔信号进行了统计分析.首先根据小波去噪原理... 针对λ噬菌体中的脱氧核糖核酸(λ-DNA)通过纳米通道时的过孔信号噪音大,强度弱且非平稳的缺点,提出了使用具有良好时频域分辨能力的小波分析方法对其进行去噪处理,并对有效去噪后的λ-DNA过孔信号进行了统计分析.首先根据小波去噪原理,选择合适的小波函数,确定最佳的分解层数并选取合适的阈值,对实验采集到的含噪声信号进行去噪处理.根据最终去噪效果可得,以sym7为小波基函数、分解层数5层、使用默认软阈值可以有效降低信号中的噪声,提高信噪比.然后,对具有48 000个碱基对(48 kbp)的λ-DNA通过60 nm氮化硅(SiN)纳米孔的特征信号进行了统计分析,分析结果表明,阻塞电流和过孔时间分别符合双峰高斯分布和偏正态分布,这为后续DNA分子的辨识工作提供了依据. 展开更多
关键词 纳米通道 λ-dna过孔信号 小波去噪 信噪比 统计分析
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基于单分子成像技术研究λ-DNA分子穿越微米通道端口的电动力学特性 被引量:1
5
作者 王琼 王凯歌 +3 位作者 孟康康 孙聃 韩仝雨 高爱华 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2020年第16期285-295,共11页
操控单个DNA分子,将其有效引入、导出微纳通道是实现DNA生物芯片功能的前提条件.本文利用单分子荧光显微成像技术系统地实时观察分析λ-DNA单分子在电场力驱动下进入/穿出50μm通道端口处的电动力学特性及规律.研究发现:λ-DNA分子能够... 操控单个DNA分子,将其有效引入、导出微纳通道是实现DNA生物芯片功能的前提条件.本文利用单分子荧光显微成像技术系统地实时观察分析λ-DNA单分子在电场力驱动下进入/穿出50μm通道端口处的电动力学特性及规律.研究发现:λ-DNA分子能够顺利进入trans端口并穿出cis端口,外加电场强度存在最大(Emax)和最小(Emin)阈值,只有场强E满足:Emin≤E≤Emax时, λ-DNA分子才能进入trans端口并顺利穿出cis端口;当电场强度小于最小阈值场强时, DNA分子不能进入trans端口;当电场强度大于最大阈值场强时, λ-DNA分子虽可能从trans端口进入通道内部,但不容易从cis端口穿出,而是在迁移至通道内cis端口附近时,运动方向反转、往复、甚至旋转等新现象,并且易于粘附到管壁上;随着场强增大,反转位置距cis端口越大.基于微流体电动力学理论,对λ-DNA分子在微通道端口的不同运动状态的物理机制进行了初步分析.本研究结果对研制基于微纳通道系统的基因芯片实验室及DNA分子传感器具有一定的实际指导意义. 展开更多
关键词 DNA 分子 单分子荧光成像技术 微流通道 反转运动
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体外λ-DNA形成新结构的证据 被引量:3
6
作者 曹恩华 白春礼 +2 位作者 何裕建 方晔 张平城 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1993年第21期1964-1966,共3页
1990年白春礼等人首次用扫描遂道显微镜(STM)直接观察到λ-DNA经热变性后在体外形成一种三链辫状结构。这一结果不同于目前提出的三螺旋模型,即第三条链缠绕于双链DNA的大沟之中。据文献报道,用同型嘌呤和同型嘧啶或以单链DNA和双链DNA... 1990年白春礼等人首次用扫描遂道显微镜(STM)直接观察到λ-DNA经热变性后在体外形成一种三链辫状结构。这一结果不同于目前提出的三螺旋模型,即第三条链缠绕于双链DNA的大沟之中。据文献报道,用同型嘌呤和同型嘧啶或以单链DNA和双链DNA反应所得到的三链物比双链DNA有较低的熔解温度(T_m),在解旋过程中280nm光吸收值明显提高,对DNaseI酶不敏感等特征。 展开更多
关键词 λ-dna 三链DNA 熔解温度 DNA
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亚精胺诱导λ-DNA凝聚现象的AFM研究 被引量:1
7
作者 林璋 王琛 +3 位作者 苏明 田芳 马金 白春礼 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1998年第3期218-222,共5页
生物体内DNA的紧密堆积存在方式与基因表达的自我调控机制有关 ,因此研究体内凝聚诱导物对DNA凝聚所起的作用具有重要意义 .采用原子力显微镜(AFM )研究了这一体系 .研究表明 :亚精胺可直接诱导λ DNA形成一种特殊的结构———环形凝聚... 生物体内DNA的紧密堆积存在方式与基因表达的自我调控机制有关 ,因此研究体内凝聚诱导物对DNA凝聚所起的作用具有重要意义 .采用原子力显微镜(AFM )研究了这一体系 .研究表明 :亚精胺可直接诱导λ DNA形成一种特殊的结构———环形凝聚体 ;环形凝聚体的形成受动力学因素 (时间 ,浓度 )影响较大 ;环形凝聚体由纳米级小颗粒紧密排列而成 ;凝聚机制可能是以这些颗粒为组成单元的螺旋盘绕过程 . 展开更多
关键词 环形凝聚体 亚精胺 AFM DNA λ-dna 凝聚行为
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同步辐射CD分析Gd@C_(82)(OH)_(22)纳米颗粒对λ-DNA结构稳定性的影响
8
作者 宋炎 葛永辉 崔素霞 《核技术》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期129-133,共5页
本文利用同步辐射真空紫外圆二色光谱(SRCD)研究λ噬菌体DNA(λ-DNA)加入内包金属富勒烯Gd@C82(OH)22纳米颗粒后的二级结构变化,推测了纳米颗粒与λ-DNA相互作用机理。研究发现,在SRCD 230–255 nm波长范围内,λ-DNA经Gd@C82(OH)22纳米... 本文利用同步辐射真空紫外圆二色光谱(SRCD)研究λ噬菌体DNA(λ-DNA)加入内包金属富勒烯Gd@C82(OH)22纳米颗粒后的二级结构变化,推测了纳米颗粒与λ-DNA相互作用机理。研究发现,在SRCD 230–255 nm波长范围内,λ-DNA经Gd@C82(OH)22纳米颗粒处理后,在245 nm处的负峰减弱并伴随DNA熔解温度(Tm值)降低。说明λ-DNA及λ-DNA酶切片段受Gd@C82(OH)22纳米颗粒影响,导致二级结构稳定性和热稳定性下降。通过分析SRCD谱在180–200 nm处的信息,发现Gd@C82(OH)22纳米颗粒引起了λ-DNA超螺旋结构的解旋。 展开更多
关键词 λ-dna Gd@C82(OH)22 SRCD DNA二级结构 DNA超螺旋
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Evidence for the Formation of a New Variant Structure of λ-DNA in vitro
9
作者 曹恩华 白春礼 +2 位作者 何裕建 方晔 张平城 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1994年第3期208-211,共4页
In 1990, Bai et al.first directly observed an unusual triple-stranded braid-likeconformation of denatured λ-DNA Hind Ⅲ in vitro with scanning tunneling microscopy(STM). The triple-stranded braid-like conformation pr... In 1990, Bai et al.first directly observed an unusual triple-stranded braid-likeconformation of denatured λ-DNA Hind Ⅲ in vitro with scanning tunneling microscopy(STM). The triple-stranded braid-like conformation presented in this work was dif-ferent from the model of the right-handed triple helix DNA proposed by otherauthors.In the triple helix model, the third strand winds round the major groove ofthe double helix DNA. Several studies indicated that the triple-stranded DNA, whichwas prepared by the reaction of homopurine and homopyrimidine or single-strandedDNA and doube-stranded DNA, had a low melting temperatue (T_m), a highabsorbance at 280 run in the unwinding process and was resistant to DNase 展开更多
关键词 λ-dna TRIPLE stranded DNA MELTING temperature.
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DNA分子结构的多态性研究(Ⅲ)——生物大分子探针吖啶橙诱导λ┐DNA由线型向环型的转变 被引量:7
10
作者 冯喜增 林璋 +2 位作者 马金 王琛 白春礼 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1998年第9期1498-1500,共3页
病毒和细胞体内的DNA是以高度紧密的凝聚态存在的.自从在体外发现亚精胺、精胺可诱导无规卷曲的DNA形成有序、独特的凝聚结构形态以来,许多学者深入研究了多价阳离子的诱导特性,以期阐明DNA在病毒内的组装和染色体中凝聚作... 病毒和细胞体内的DNA是以高度紧密的凝聚态存在的.自从在体外发现亚精胺、精胺可诱导无规卷曲的DNA形成有序、独特的凝聚结构形态以来,许多学者深入研究了多价阳离子的诱导特性,以期阐明DNA在病毒内的组装和染色体中凝聚作用的机制[1,2].由于多价阳离子... 展开更多
关键词 λ-dna 吖啶橙 结构 线型 环型 SEM AFM DNA
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DNA分子结构的多态性研究(Ⅰ)——阳离子型表面活性剂诱导λ┐DNA由线圈型向球型的转变 被引量:6
11
作者 冯喜增 林璋 +1 位作者 王琛 白春礼 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1998年第7期1148-1150,共3页
活性细胞众多的遗传信息均通过DNA链的碱基序列按一定的自身调节方式表达出各种蛋白质[1].DNA与各种不同性质的组分,如蛋白质、类脂及无机离子等的相互识别作用是确保细胞处于生理活性状态的重要调节机制.阳离子型表面活性... 活性细胞众多的遗传信息均通过DNA链的碱基序列按一定的自身调节方式表达出各种蛋白质[1].DNA与各种不同性质的组分,如蛋白质、类脂及无机离子等的相互识别作用是确保细胞处于生理活性状态的重要调节机制.阳离子型表面活性剂与带相反电荷的多价离子的相互作用... 展开更多
关键词 表面活性剂 DNA CTAB 结构 线圈型 球型 λ-dna
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λ—DNA变异结构的UV谱研究 被引量:2
12
作者 何裕建 曹恩华 +2 位作者 白春礼 方晔 张平城 《Zoological Research》 CAS CSCD 1993年第S1期47-51,共5页
本文采用紫外分光光谱,对λ—DNA形成三螺旋DNA、辫状DNA等变异结构的条件和特性进行了探讨。结果表明,三链辫状DNA的Tm值为73.5℃,高于双螺旋DNA(43.5±0.5℃)和三螺旋DNA(24±0.5℃)的Tm值;较低的pH值(4.4)和较高的复性温度(4... 本文采用紫外分光光谱,对λ—DNA形成三螺旋DNA、辫状DNA等变异结构的条件和特性进行了探讨。结果表明,三链辫状DNA的Tm值为73.5℃,高于双螺旋DNA(43.5±0.5℃)和三螺旋DNA(24±0.5℃)的Tm值;较低的pH值(4.4)和较高的复性温度(43℃左右)有利于三链辫状DNA的形成。 展开更多
关键词 λ-dna 三链DNA UV谱
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三链λ-DNA的UV,CD,Raman及荧光光谱分析 被引量:1
13
作者 何裕建 曹恩华 +2 位作者 方晔 白春礼 张平城 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1996年第2期90-94,共5页
本文报道了λ-DNA三链结构水溶液的UV,CD,荧光及Raman等光谱特性。比较该三链新结构与单,双链DNA不同的光谱性质,确证了前者不同寻常的结构特征。
关键词 λ-dna三链结构 UV谱 CD谱 荧光光谱 RAMAN谱
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三链DNA的酶解荧光检测 被引量:1
14
作者 曹恩华 何裕建 +2 位作者 白春礼 张平城 方晔 《Zoological Research》 CAS CSCD 1993年第S1期42-46,共5页
本文将酶解技术和荧光技术相结合,提出了一种简便易行的三链DNA尤其是辫状DNA的检测方法。
关键词 λ-dna 三链DNA DNaseⅠ 溴乙锭 荧光光谱
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体外λ—DNA形成新结构的证据 被引量:2
15
作者 曹恩华 何裕建 +2 位作者 白春礼 方晔 张平城 《Zoological Research》 CSCD 1993年第S1期25-31,共2页
1990年白春礼等人首次用扫描隧道显微镜(STM)直接观察到λ-DNA/HindⅢ经热变性后在体外形成一种三链辫状结构。这一结果不同于目前提出的三螺旋模型,即第3条链缠绕于双链DNA的大沟之中。据文献报道,用同型嘌呤和同型嘧啶或以单链DNA和双... 1990年白春礼等人首次用扫描隧道显微镜(STM)直接观察到λ-DNA/HindⅢ经热变性后在体外形成一种三链辫状结构。这一结果不同于目前提出的三螺旋模型,即第3条链缠绕于双链DNA的大沟之中。据文献报道,用同型嘌呤和同型嘧啶或以单链DNA和双链DNA反应所得到的三链物比双链DNA有较低的熔解温度(Tm),在解旋过程中280nm光吸收值明显提高,对DNaseⅠ酶解有抗性等特征。 展开更多
关键词 λ-dna 熔解温度 DNaseⅠ酶解
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一种单分子操纵DNA-组蛋白复合物的新方法 被引量:1
16
作者 焦卓锋 马秋梅 +2 位作者 王艳伟 冉诗勇 杨光参 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期38-40,45,共4页
介绍了在云母表面一种拉直λ-DNA-组蛋白复合物的新方法.借助原子力显微成像表明,该方法不但对裸λ-DNA的拉直效果较好,而且可以拉直不同浓度的DNA-组蛋白的复合物.利用此方法可以在单分子水平上研究DNA的复制、转录过程以及DNA-蛋白质... 介绍了在云母表面一种拉直λ-DNA-组蛋白复合物的新方法.借助原子力显微成像表明,该方法不但对裸λ-DNA的拉直效果较好,而且可以拉直不同浓度的DNA-组蛋白的复合物.利用此方法可以在单分子水平上研究DNA的复制、转录过程以及DNA-蛋白质相互作用. 展开更多
关键词 λ-dna 组蛋白 原子力显微术 拉直
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盐浓度梯度对DNA通过固态纳米孔的影响(英文)
17
作者 余静文 司伟 +1 位作者 沙菁 陈云飞 《Journal of Southeast University(English Edition)》 EI CAS 2016年第3期307-311,共5页
针对DNA过孔速度过快以及信噪比低等制约固态纳米孔应用于DNA分子检测的问题,通过改变纳米孔两侧盐溶液的浓度,研究了其对DNA的过孔时间以及信噪比的影响.实验结果表明,当纳米孔两侧氯化钾溶液浓度相同时,λ-DNA的过孔时间以及电流堵塞... 针对DNA过孔速度过快以及信噪比低等制约固态纳米孔应用于DNA分子检测的问题,通过改变纳米孔两侧盐溶液的浓度,研究了其对DNA的过孔时间以及信噪比的影响.实验结果表明,当纳米孔两侧氯化钾溶液浓度相同时,λ-DNA的过孔时间以及电流堵塞信号都随着氯化钾浓度的提高而增加.但当纳米孔cis端的KCL浓度保持在1 mol/L,trans端的氯化钾浓度由1 mol/L变为0.1 mol/L时,归一化后的电流信号幅值增加了1个数量级.因此,调整纳米孔两端盐溶液的浓度梯度可以有效降低DNA的过孔速度和提高信噪比,从而大大提高了纳米孔在DNA分子检测方面的灵敏度. 展开更多
关键词 固态纳米孔 盐浓度梯度 λ-dna 信噪比 堵塞电流 过孔时间
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λDNA体外重包装技术检测环境致突变物新方法及机理的研究 被引量:3
18
作者 曹佳 曹阳 许丽萍 《重庆环境科学》 1996年第2期40-42,共3页
首次报道使用λDNA体外重包装技术检测化学物和环境污染物致封变性取得了成功,辅以酶切和电泳技术,还可初步确定λDNA损伤的机理。
关键词 λDNA 环境污染物 环境致突变物 化学物 检测
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1株asdA缺陷型减毒鼠伤寒沙门氏菌作为核酸疫苗载体的构建与鉴定(英文) 被引量:2
19
作者 于斌 罗语思 +4 位作者 彭晓 袁硕峰 牛憨笨 屈军乐 张科 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期663-668,共6页
目的利用载体-宿主平衡致死系统,将1株香港分离的野生型沙门氏菌(S129)构建为减毒核酸疫苗载体。方法以细菌生化反应和血清学方法鉴定S129为鼠伤寒沙门氏菌;以λ-RED同源重组方法靶向敲除S129株的asdA基因,并以卡那霉素抗性基因代替;通... 目的利用载体-宿主平衡致死系统,将1株香港分离的野生型沙门氏菌(S129)构建为减毒核酸疫苗载体。方法以细菌生化反应和血清学方法鉴定S129为鼠伤寒沙门氏菌;以λ-RED同源重组方法靶向敲除S129株的asdA基因,并以卡那霉素抗性基因代替;通过菌落PCR鉴定后挑取阳性克隆asdA缺陷型减毒鼠伤寒沙门氏菌(asdAΔS129),在含2,6-二氨基庚二酸(2,6-diaminopimelic acid,DAP)或无DAP的LB培养基中培养,与野生株S129对比生长曲线以验证asdAΔS129构建的成功;以S129和asdAΔS129攻击BALB/c小鼠验证asdAΔS129减毒情况;结果菌落PCR鉴定得到阳性克隆,asdAΔS129必需外源性添加DAP方能生长;asdAΔS129不能致死BALB/c小鼠,得到成功的减毒;结论成功将1株野生型沙门氏菌构建成asdA缺陷型减毒核酸疫苗载体,并在体外和体内实验中验证,为下一步的疫苗呈递和肿瘤治疗实验提供了合适的载体。 展开更多
关键词 减毒鼠伤寒沙门氏菌 核酸疫苗载体 λ-RED同源重组
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变铅青链霉菌66中对噬菌ΦHAU3显示抗性的基因(ψHAU3 ̄R)的核苷酸定序和分析 被引量:1
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作者 周秀芬 邓子新 《病毒学报》 CSCD 北大核心 1995年第4期365-370,共6页
杂合质粒pIJ8310是链霉菌低拷贝质粒pIJ9221携带了10.8kb来自变铅青链霉菌JT46菌株,编码对噬菌体ΦHAU3抗性的DNA片段。已知Tn4560插到该克隆中3kb的EcoRI或3.3kb的BamHI片段... 杂合质粒pIJ8310是链霉菌低拷贝质粒pIJ9221携带了10.8kb来自变铅青链霉菌JT46菌株,编码对噬菌体ΦHAU3抗性的DNA片段。已知Tn4560插到该克隆中3kb的EcoRI或3.3kb的BamHI片段(这两个片段之间有2.5kb的重叠区)上,中断了ΦHAU3抗性基因的表达。已将3.0kb的BcoAI片段分别以两种不同的取向克隆到pBluescriptSK(+)上。核苷酸序列分析揭示出一个1.3kb的ORF的存在,其所编码的478个氨基酸组成的蛋白与λ噬菌体的ea59基因所编码的氨基酸序列显示了高度的同源性,其氨基酸序列的同一性高达37%,相似性达58%,而λ噬菌体的ea59基因是编码赖ATP和单键DNA的核酸内切酶I的,该区域与λ的复制无关。此外,这段具有高度同源性的DNA区域的G+C%只有60%,低于变铅青霉菌DNAG+C%的平均值(74%)。 展开更多
关键词 变铅青链霉菌 噬菌体 抗性基因 核苷酸测序
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