合理预测甘氨酸-α-多肽构象稳定性的有效途径

使用B3LYP/6 31G*方法,优化得到了甘氨酸多肽分子 CH3CO(NHCH2CO)nNHCH3(n=1,2,3)的 18 个稳定构象.对构象中存在的非键作用进行了分析,确定了影响构象稳定性的主要非键作用,并估算了相关非键作用的能量.将之应用于判断二肽、三肽、四肽分子构象的相对稳定性,得到了满意的结果.该方法和 B3LYP/6 31G*方法得到的相对能量的线性相关方程为:y=0.887 3 x+0.647 3, 相关系数为R=0.939 7,最大偏差为 3.5 kJ/mol,标准偏差为1.47 kJ/mol.