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威宁中华蟾蜍的分子鉴定
被引量:
5
1
作者
熊荣川
田应洲
+2 位作者
李松
陈红
于振
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2014年第12期32-36,共5页
为明确威宁中华蟾蜍的分子分类学地位,对采自贵州省威宁县的蟾蜍标本(标本号:LPSWN01A)进行线粒体12SrRNA基因扩增和双重单系法分析。结果表明:该标本的序列大小为906bp(GenBank登录号:KJ803016),基于数据集A构建的系统发育树中,威宁中...
为明确威宁中华蟾蜍的分子分类学地位,对采自贵州省威宁县的蟾蜍标本(标本号:LPSWN01A)进行线粒体12SrRNA基因扩增和双重单系法分析。结果表明:该标本的序列大小为906bp(GenBank登录号:KJ803016),基于数据集A构建的系统发育树中,威宁中华蟾蜍与7条中华蟾蜍同源序列聚为一个单系(中华蟾蜍支系),威宁中华蟾蜍以较低的最大似然率独立为一个支系;基于数据集B构建的系统发育树中,威宁中华蟾蜍与2个中华蟾蜍华西亚种种群聚为一支,因此推断威宁产蟾蜍属于中华蟾蜍华西亚种(Bufo gararizans andrewsi)。另外,威宁中华蟾蜍与云南怒江种群的遗传距离最近,为0.009 3,说明威宁中华蟾蜍属于中华蟾蜍华西亚种,与之前的传统分类文献记载一致。
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关键词
中华蟾蜍
12S基因
分子鉴定
双重单系法
威宁
贵州
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职称材料
基于线粒体12S基因分析四川地区鸡异刺线虫的种群遗传多态性
被引量:
1
2
作者
王保健
朱俊扬
+6 位作者
简克灵
杨光友
汪涛
赖为民
赵习彬
廖晓霞
古小彬
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期2264-2272,共9页
为探讨四川地区鸡异刺线虫的遗传变异特点和种群遗传结构特征,利用PCR技术扩增了四川7个地区共58株鸡源鸡异刺线虫分离株的线粒体12S基因全序列,经测序后分析其遗传多样性。结果显示,58条鸡异刺线虫12S基因全序列均为699bp,序列中共有3...
为探讨四川地区鸡异刺线虫的遗传变异特点和种群遗传结构特征,利用PCR技术扩增了四川7个地区共58株鸡源鸡异刺线虫分离株的线粒体12S基因全序列,经测序后分析其遗传多样性。结果显示,58条鸡异刺线虫12S基因全序列均为699bp,序列中共有38个变异位点和34个单倍型(HS1-HS34);单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.822和0.003 95。进一步分析表明,7个地理种群遗传分化不明显(Fst=0.007 87),种群间基因交流较频繁(Nm=31.52);分子方差分析(AMOVA)表明,四川地区鸡异刺线虫的遗传分化主要来自于种群内部(99.21%),种群间遗传变异水平较低(0.79%);单倍型网络图和NJ系统发育树显示,鸡异刺线虫7个地理种群的34个单倍型散在分布于不同种群内,分布格局较为混杂,未形成明显的地理分布格局。结果表明,四川地区的鸡异刺线虫遗传多样性较低,遗传分化不明显,还未形成显著的地理遗传结构。
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关键词
鸡异刺线虫
12S
遗传多态性
四川
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职称材料
题名
威宁中华蟾蜍的分子鉴定
被引量:
5
1
作者
熊荣川
田应洲
李松
陈红
于振
机构
六盘水师范学院生命科学系
四川大学生命科学学院
中国科学院成都生物研究所
出处
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2014年第12期32-36,共5页
基金
国家自然科学基金项目"贵州高原瘰螈属
拟小鲵属物种多样性与谱系地理学研究"(31360512)
贵州省科学技术基金项目"无指盘臭蛙雌雄个体转录组差异研究"[黔科合J字LKLS(2013)06]
文摘
为明确威宁中华蟾蜍的分子分类学地位,对采自贵州省威宁县的蟾蜍标本(标本号:LPSWN01A)进行线粒体12SrRNA基因扩增和双重单系法分析。结果表明:该标本的序列大小为906bp(GenBank登录号:KJ803016),基于数据集A构建的系统发育树中,威宁中华蟾蜍与7条中华蟾蜍同源序列聚为一个单系(中华蟾蜍支系),威宁中华蟾蜍以较低的最大似然率独立为一个支系;基于数据集B构建的系统发育树中,威宁中华蟾蜍与2个中华蟾蜍华西亚种种群聚为一支,因此推断威宁产蟾蜍属于中华蟾蜍华西亚种(Bufo gararizans andrewsi)。另外,威宁中华蟾蜍与云南怒江种群的遗传距离最近,为0.009 3,说明威宁中华蟾蜍属于中华蟾蜍华西亚种,与之前的传统分类文献记载一致。
关键词
中华蟾蜍
12S基因
分子鉴定
双重单系法
威宁
贵州
Keywords
Bufo gargarizans
12sgene
molecular identification
dual monophyletic method
Weining
Guizhou
分类号
S932 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
基于线粒体12S基因分析四川地区鸡异刺线虫的种群遗传多态性
被引量:
1
2
作者
王保健
朱俊扬
简克灵
杨光友
汪涛
赖为民
赵习彬
廖晓霞
古小彬
机构
四川农业大学动物医学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期2264-2272,共9页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31402188)
四川农业大学学科"双支计划"(03570422)
文摘
为探讨四川地区鸡异刺线虫的遗传变异特点和种群遗传结构特征,利用PCR技术扩增了四川7个地区共58株鸡源鸡异刺线虫分离株的线粒体12S基因全序列,经测序后分析其遗传多样性。结果显示,58条鸡异刺线虫12S基因全序列均为699bp,序列中共有38个变异位点和34个单倍型(HS1-HS34);单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.822和0.003 95。进一步分析表明,7个地理种群遗传分化不明显(Fst=0.007 87),种群间基因交流较频繁(Nm=31.52);分子方差分析(AMOVA)表明,四川地区鸡异刺线虫的遗传分化主要来自于种群内部(99.21%),种群间遗传变异水平较低(0.79%);单倍型网络图和NJ系统发育树显示,鸡异刺线虫7个地理种群的34个单倍型散在分布于不同种群内,分布格局较为混杂,未形成明显的地理分布格局。结果表明,四川地区的鸡异刺线虫遗传多样性较低,遗传分化不明显,还未形成显著的地理遗传结构。
关键词
鸡异刺线虫
12S
遗传多态性
四川
Keywords
Heterakis gallinarum
12sgene
genetic polymorphisms
Sichuan
分类号
S852.7 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
威宁中华蟾蜍的分子鉴定
熊荣川
田应洲
李松
陈红
于振
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2014
5
下载PDF
职称材料
2
基于线粒体12S基因分析四川地区鸡异刺线虫的种群遗传多态性
王保健
朱俊扬
简克灵
杨光友
汪涛
赖为民
赵习彬
廖晓霞
古小彬
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
下载PDF
职称材料
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