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基于28S rDNA部分序列的指环虫属分子系统分析 被引量:2
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作者 张丽霞 范丽仙 +1 位作者 张东 徐伟江 《云南师范大学学报(自然科学版)》 2021年第2期43-50,共8页
基于核糖体28S部分序列,对来自中国的22种及国外的35种指环虫属(Dactylogyrus Diesing,1850)单殖吸虫进行分子系统发育研究,采用Phylosuite平台构建贝叶斯(bayesian,BI)及最大似然法(maximum likelihood,ML)系统发育树,结果显示非洲的鲤... 基于核糖体28S部分序列,对来自中国的22种及国外的35种指环虫属(Dactylogyrus Diesing,1850)单殖吸虫进行分子系统发育研究,采用Phylosuite平台构建贝叶斯(bayesian,BI)及最大似然法(maximum likelihood,ML)系统发育树,结果显示非洲的鲤科(Cyprinidae)、欧洲的鲤科、亚洲(中国)的鲤科和鲈科(Percoidea)鱼鳃部寄生指环虫属单殖吸虫各自聚为独立的进化支,其中,采自中国的指环虫为并系群.ML树显示亚洲的鲤科鱼类寄生指环虫起源最早,另外指环虫属的早期宿主除魚巴系鱼外还包括雅罗鱼支系.两种系统发育树均未表现出明显的物种区分关系,说明指环虫属的进化分析受到宿主特异性、采集地、进化历史及分子序列的变异度等多方面的影响. 展开更多
关键词 指环虫属 28s rdna 系统发育:适应辐射
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基于部分18S rDNA,28S rDNA和COI基因序列的索科线虫亲缘关系 被引量:12
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作者 汪江一 徐芬 +1 位作者 刘绪生 王国秀 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期835-844,共10页
通过PCR扩增获得我国常见昆虫病原索科线虫6属10种18S rDNA、28S rDNA(D3区)和COI基因序列,结合来自GenBank中6属10种索科线虫的18S rDNA同源序列,用邻接法和最大简约法构建系统进化树。结果显示:12属索科线虫分为三大类群,第一大类群... 通过PCR扩增获得我国常见昆虫病原索科线虫6属10种18S rDNA、28S rDNA(D3区)和COI基因序列,结合来自GenBank中6属10种索科线虫的18S rDNA同源序列,用邻接法和最大简约法构建系统进化树。结果显示:12属索科线虫分为三大类群,第一大类群是三种罗索属线虫(Romanomermis)先聚在一起,再与两索属(Amphimermis)和蛛索属(Aranimermis)线虫聚为一支;在第二大类群中,六索属(Hexamermis)、卵索属线虫(Ovomermis)和多索属(Agamermis)亲缘关系最近,先聚在一起,再与八腱索属(Octomyomermis)和Thaumamermis线虫聚为一支。第三大类群由索属(Mermis)和异索属(Allomermis)线虫以显著水平的置信度先聚在一起,再与蠓索属(Heleidomermis)和施特克尔霍夫索属(Strelkovimermis)线虫聚为一支。从遗传距离看,基于3个基因的数据集均显示索科线虫属内种间差异明显小于属间差异,武昌罗索线虫(R.wuchangensis)和食蚊罗索线虫(R.culicivorax)同属蚊幼寄生罗索属线虫,其种间的遗传距离最小。 展开更多
关键词 昆虫病原索科线虫 系统演化 18S rdna 28s rdna COI基因
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澜沧江大鳞高须鱼寄生指环虫属单殖吸虫一新种
3
作者 邓晋琪 常静 +2 位作者 徐伟江 孟飞燕 范丽仙 《四川动物》 北大核心 2024年第3期317-325,共9页
本文记述了位于云南西双版纳澜沧江水系勐腊(补远江)流域段(101°14′2″E,21°24′36″N,海拔570 m)大鳞高须鱼Hypsibarbus vernayi鳃上寄生的指环虫属Dactylogyrus一未定种。自然感染率为76.2%,感染强度为每片鳃3~10枚。未定... 本文记述了位于云南西双版纳澜沧江水系勐腊(补远江)流域段(101°14′2″E,21°24′36″N,海拔570 m)大鳞高须鱼Hypsibarbus vernayi鳃上寄生的指环虫属Dactylogyrus一未定种。自然感染率为76.2%,感染强度为每片鳃3~10枚。未定种虫体平均大小为640µm×129µm,具2对眼点。后吸器由1对D.wunderi型中央大钩、1个长片状联结片和7对边缘小钩构成。交接器由交接管和支持器构成,交接管基部膨大呈球形,随后变细沿支持器直线延伸;支持器直管状,端部分两支为“并指状”,与交接管相联结,像拇指包绕住交接器。上述特征与我国鲃亚科Barbi-nae鱼类上已记录的指环虫(齿形指环虫D.denticulati、倒刺鲃指环虫D.spinibarbichthi、角鱼指环虫D.epalzeorhyn-chus、条纹指环虫D.lineatus)有明显差异。28S rDNA部分序列分析显示,本未定种与寄生于意大利路库玛雅罗鱼Squalius lucumonis上的尹文指环虫D.yinwenyingae亲缘关系最接近,但碱基相似度只有95%。结合形态和分子特征,本未定种为指环虫属科学上一新种,以采集地命名为补远江指环虫新种D.buyuanjiangensis sp.nov.。 展开更多
关键词 单殖吸虫 指环虫属 大鳞高须鱼 28s rdna 新种
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雷帕纹唇鱼寄生似指环虫属单殖吸虫一新种
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作者 常静 孟飞燕 +2 位作者 邓晋琪 徐伟江 范丽仙 《四川动物》 北大核心 2024年第4期448-458,共11页
采用整合分类学研究方法,综合形态特征和28S rDNA序列的遗传学特征,记述和命名了云南南盘江万峰湖流域段雷帕纹唇鱼Osteochilus repang鳃部寄生的似指环虫属Dactylogyroides一新种,以宿主鱼学名命名为纹唇鱼似指环虫新种D.osteochilus s... 采用整合分类学研究方法,综合形态特征和28S rDNA序列的遗传学特征,记述和命名了云南南盘江万峰湖流域段雷帕纹唇鱼Osteochilus repang鳃部寄生的似指环虫属Dactylogyroides一新种,以宿主鱼学名命名为纹唇鱼似指环虫新种D.osteochilus sp.nov.。纹唇鱼似指环虫新种具有1对钩尖互对的中央大钩,7对边缘小钩,1个呈片状且分成相等两半的联结片。交接管呈管状,基部膨大,支持器基部片状,中间有一小孔。本新种在联结片、交接器形态上与该属已记录种显著不同。基于28S rDNA部分序列,似指环虫属属内种的两两相对遗传距离为0.052~0.175,本新种与似指环虫属已记录种D.tripathii(JX993982)的遗传距离为0.076,与D.dorsalis的为0.175。基于28S rDNA部分序列的BI系统发育树的拓扑结构显示,本新种与似指环虫属物种聚为一个进化支,并与指环虫属Dactylogyrus进化支为亲缘关系较近的姐妹群。纹唇鱼似指环虫新种是我国记录的第2个似指环虫属单殖吸虫,研究结果补充了我国单殖吸虫编目,并为似指环虫属的分子系统发育提供了新的科学数据。 展开更多
关键词 单殖吸虫 似指环虫属 新种 28s rdna
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双条拂粉蚧为害番石榴初报
5
作者 苏静惠 吴宗震 +3 位作者 李界秋 刘家勇 胡锦 郑霞林 《广西植保》 2024年第1期1-6,共6页
2022年10月在广西壮族自治区玉林市陆川县乌石镇沙井村和温泉镇四良村发现一种严重为害番石榴(Psidi⁃umguajava L.)的粉蚧,形态学鉴定为双条拂粉蚧[Ferrisiavirgata(Cockerell)],且得到了28S rDNA分子鉴定结果的证实。为广西首次发现该... 2022年10月在广西壮族自治区玉林市陆川县乌石镇沙井村和温泉镇四良村发现一种严重为害番石榴(Psidi⁃umguajava L.)的粉蚧,形态学鉴定为双条拂粉蚧[Ferrisiavirgata(Cockerell)],且得到了28S rDNA分子鉴定结果的证实。为广西首次发现该外来入侵害虫。介绍了该虫自然条件下的为害症状、形态特征、分子鉴定结果,并讨论该虫可能的来源,提出了今后的研究方向。 展开更多
关键词 番石榴 外来入侵物种 危害 形态特征 28s rdna
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基于通用引物的多重PCR对小圆胸小蠹的分子鉴定
6
作者 黄卫东 梁建锋 +3 位作者 彭锋 桑文 陈晓胜 王兴民 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期994-1001,共8页
本研究利用通用引物的多重PCR方法开展小圆胸小蠹Euwallacea fornicatus的分子鉴定,以期探究多重PCR在昆虫分子鉴定中的可行性,并为开展小圆胸小蠹的有效、准确鉴定及综合防治等提供重要依据。使用多重PCR方法扩增了小圆胸小蠹的COI、16... 本研究利用通用引物的多重PCR方法开展小圆胸小蠹Euwallacea fornicatus的分子鉴定,以期探究多重PCR在昆虫分子鉴定中的可行性,并为开展小圆胸小蠹的有效、准确鉴定及综合防治等提供重要依据。使用多重PCR方法扩增了小圆胸小蠹的COI、16S和28S的3个分子片段,并将获得的目的序列在GenBank中进行BLAST比对;利用MEGA 7计算方胸小蠹属不同种间的遗传距离,并基于邻接法和最大似然法分别构建单基因系统发育树。结果表明:多重PCR可以用于小圆胸小蠹分子序列的获取;基于COI和16S的遗传距离分析表明了小圆胸小蠹的种内遗传距离均小于2%;基于单个基因构建的系统发育树均显示本研究扩增的小圆胸小蠹COI和16S序列与GenBank中获取的小圆胸小蠹COI和16S序列聚为一支。多重PCR可以应用于小圆胸小蠹的分子鉴定,该方法不仅可以提高物种鉴定的准确率,还可以减少PCR过程中的时间和DNA消耗。 展开更多
关键词 多重PCR 小圆胸小蠹 分子鉴定 COI 16S rdna 28s rdna
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黄颡鱼寄生东肌吸虫属(复殖吸虫亚纲:东肌吸虫科)3种复殖吸虫的分类学研究 被引量:1
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作者 李寄仟 李云臻 范丽仙 《四川动物》 北大核心 2020年第6期616-629,共14页
本研究报道采自云南澜沧江水系黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco(鲿科Bagridae)东肌吸虫属Orientocreadium Tubangui,1931复殖吸虫3种,包括黄颡东肌吸虫新种O.fulvidraconis sp.nov.以及O.pseudobagri Yamaguti,1934(中国新记录种)和印度... 本研究报道采自云南澜沧江水系黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco(鲿科Bagridae)东肌吸虫属Orientocreadium Tubangui,1931复殖吸虫3种,包括黄颡东肌吸虫新种O.fulvidraconis sp.nov.以及O.pseudobagri Yamaguti,1934(中国新记录种)和印度东肌吸虫O.indicum Pande,1934。黄颡东肌吸虫新种区别于本属其他物种的形态特征包括:体表无棘,口吸盘略小于腹吸盘,虫体末端较圆钝,卵黄腺从卵巢前缘水平分布至后睾丸之后,子宫末段内壁具棘等。基于28S rDNA部分序列的系统发育分析支持东肌吸虫科Orientocreadiidae为单系类群,与Leptophallidae构成姊妹群。黄颡东肌吸虫新种与印度东肌吸虫亲缘关系较近。 展开更多
关键词 复殖吸虫 黄颡鱼 东肌吸虫属 新种 28s rdna
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广西首次发现入侵害虫木瓜秀粉蚧
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作者 胡锦 王小云 +4 位作者 张艳军 刘红梅 王慧 张宏斌 郑霞林 《广西植保》 2022年第4期9-13,共5页
2021年5月,广西东兴市马路镇竹围村和马路村发现一种严重危害番木瓜Carica papaya L.和茄瓜Solanum melon⁃gena L.的粉蚧,形态学鉴定为木瓜秀粉蚧Paracoccus marginatus(Williams&GranaradeWillink),且得到了28S rDNA分子鉴定结果... 2021年5月,广西东兴市马路镇竹围村和马路村发现一种严重危害番木瓜Carica papaya L.和茄瓜Solanum melon⁃gena L.的粉蚧,形态学鉴定为木瓜秀粉蚧Paracoccus marginatus(Williams&GranaradeWillink),且得到了28S rDNA分子鉴定结果的证实。这是广西首次发现世界危险性入侵害虫木瓜秀粉蚧。文章介绍了该虫自然条件下的为害状、形态特征、分子鉴定结果,并讨论该虫可能的来源。 展开更多
关键词 外来入侵物种 危害 形态特征 28s rdna
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荷兰进境铃兰苗中铃兰短体线虫的鉴定 被引量:3
9
作者 王倩倩 顾建锋 +2 位作者 李红梅 杜宇 王暄 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期835-841,共7页
[目的]为了控制检疫性线虫的传入,保障我国花卉苗木产业健康发展,本文对云南口岸进境的荷兰铃兰苗(Convallaria majalis)中截获的一种短体属线虫(Pratylenchus sp.)进行了形态学特征鉴定和分子序列分析,为进出境植物线虫检疫鉴定提供参... [目的]为了控制检疫性线虫的传入,保障我国花卉苗木产业健康发展,本文对云南口岸进境的荷兰铃兰苗(Convallaria majalis)中截获的一种短体属线虫(Pratylenchus sp.)进行了形态学特征鉴定和分子序列分析,为进出境植物线虫检疫鉴定提供参考依据。[方法]通过形态特征观察、形态特征测计值比较,以及基于rDNA28S-D2/D3区序列构建短体属线虫群体系统进化树的方法,对截获的荷兰线虫群体进行种类鉴定。[结果]截获的荷兰线虫群体形态学和分子生物学特征与铃兰短体线虫(P.convallariae)相似,其主要形态特征为:唇区略缢缩,唇环3个;口针粗壮,长15~17μm,基部球呈郁金香球状;受精囊近球形至矩形,内部充满精子;后阴子宫囊长20.0~29.0μm;尾端略平截、粗糙,或常有不规则环纹。系统进化树揭示:该截获群体与铃兰短体线虫美国群体、比利时群体和法国群体聚类形成1个独立分支,序列相似性达98.0%~100%;而穿刺线虫组的其他成员,包括沙丘短体线虫(P.dunensis)、伪短体线虫(P.fallax)、油橄榄短体线虫(P.oleae)、穿刺短体线虫(P.penetrans)和肥尾短体线虫(P.pinguicaudatus),则各自形成了单独的分支。[结论]根据形态学和分子特征分析将截获的荷兰线虫群体鉴定为铃兰短体线虫,我国口岸检疫部门应加强检疫监管,降低该线虫传入的概率。 展开更多
关键词 铃兰短体线虫 形态测计 rdna28s 系统进化 非中国种
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Classical taxonomy,molecular phylogeny and genetic analysis of the genus Exitianus Ball,1929(Hemiptera:Cicadellidae:Deltocephalinae)from Egypt
10
作者 Rabab M.El-Hady Ahmed F.El-Sayed 《Zoological Systematics》 CSCD 2024年第2期143-157,共15页
Egyptian species of the leafhopper genus Exitianus Ball,1929,E.capicola(St?l,1855),E.nanus(Distant,1908),and E.pondus Ross,1968 are reviewed.Illustrations,morphological descriptions,and a key for their identification ... Egyptian species of the leafhopper genus Exitianus Ball,1929,E.capicola(St?l,1855),E.nanus(Distant,1908),and E.pondus Ross,1968 are reviewed.Illustrations,morphological descriptions,and a key for their identification are provided.In this study,we used molecular techniques to confirm morphological identification and detect phylogeny among the three Exitianus species.The partial nucleotide sequences of the amplified products obtained were determined by Macrogen Korea.The nucleotide sequences of 28S rDNA and COX genes of the EGY-ARC-9,EGY-ARC-4,and EGY-ARC-5 were determined by Macrogen Korea,blasted into BLAST at the National Center for Biotechnology Information website(NCBI)and compared with those deposited in the GenBank DNA database.The results represented the homology percentage between the partial sequences of the 28S rRNA and COX genes from each species and related species obtained from GenBank DNA database.The morphological identifications of the three Exitianus species were confirmed by molecular characterization and sequencing of 28S rDNA and COX genes and identified as E.capicola,E.nanus,and E.pondus.Also,their sequences of 28srDNA and COX genes were deposited in GenBank with an accession number(LC670610,LC670607,and OQ196105)for 28srDNA gene and(LC775357,LC775358,and LC775359)for the COX gene. 展开更多
关键词 AUCHENORRHYNCHA Chaismini TAXONOMIC 28s rdna PHYLOGENETIC
原文传递
不同DNA条形码在微口线虫属形态相近物种分类上的应用
11
作者 周仁桂 郭玉清 +1 位作者 朱慧兰 施宜佳 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第8期52-62,共11页
为建立和完善海洋线虫相近物种的DNA条形码鉴定方法,本研究以深圳福田红树林湿地自由生活的海洋线虫优势属微口线虫属(Terschellingia)为研究对象,在形态分类鉴定基础上,将DNA条形码技术引入海洋线虫形态相似物种的鉴定,研究线粒体细胞... 为建立和完善海洋线虫相近物种的DNA条形码鉴定方法,本研究以深圳福田红树林湿地自由生活的海洋线虫优势属微口线虫属(Terschellingia)为研究对象,在形态分类鉴定基础上,将DNA条形码技术引入海洋线虫形态相似物种的鉴定,研究线粒体细胞色素氧化酶第一亚基(COⅠ)基因、18S核糖体RNA基因(18S rDNA)和28S rDNA三种基因序列片段的物种分类效果。研究共鉴定出微口线虫属4个不同的形态学种,获得其中3个种的DNA序列。18S rDNA及28S rDNA两种条形码所构建的发育树支持将本属划分成6个类群;Kimura 2 parameter(K2P)种内和种间阈值分别为18S rDNA的0%~2.5%和0.4%~13.7%,28S rDNA的0%和20.5%~84.6%。18S rDNA的MN18F-Nem_18S_R引物对所扩增的序列最适合作为微口线虫属种类鉴定的DNA条形码,并可用于区分物种复合体。28S rDNA序列虽然能成功扩增,但扩增效率相对较低;COⅠ基因片段无法在所有物种中成功扩增,推测现有引物可能不适合用于本属序列的提取。研究结果表明,DNA条形码可以用于自由生活海洋线虫形态相似物种的识别,但不同的单基因片段对相同物种的鉴定结果有明显差异。 展开更多
关键词 海洋线虫 微口线虫属 DNA条形码 18S rdna 28s rdna
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Phylogeny,genetics,and the partial life cycle of Oncomegas wageneri in the Gulf of Mexico
12
作者 Andrés MARTINEZ-AQUINO Víctor M.VIDAL-MARTINEZ +3 位作者 F.Sara CECCARELLI Oscar MENDEZ Lilia C.SOLER-JIMENEZ M.Leopoldina AGUIRRE-MACEDO 《Current Zoology》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期275-283,共9页
Despite the diversity and ecological importance of cestodes,there is a paucity of studies on their life stages(i.e.,complete lists of intermediate,paratenic,and definitive hosts)and genetic variation.For example,in th... Despite the diversity and ecological importance of cestodes,there is a paucity of studies on their life stages(i.e.,complete lists of intermediate,paratenic,and definitive hosts)and genetic variation.For example,in the Gulf of Mexico(GoM)98 species of cestodes have been reported to date;however,data on their intraspecific genetic variation and population genetic studies are lacking.The trypanorhynch cestode,Oncomegas wageneri,is found(among other places)off the American Western Atlantic Coast,including the GoM,and has been reported as an adult from stingrays and from several teleost species in its larval form(as plerocerci).This study represents the first report of 2 previously unregistered definitive hosts for O.wageneri,namely the Atlantic sharpnose shark Rhizoprionodon terraenovae and the southern stingray Hypanus americanus.In this work,partial sequences of the 28S(region D1-D2)ribosomal DNA were analyzed to include O.wageneri within an eutetrarhynchoid phylogenetic framework.All O.wageneri individuals(which included plerocerci and adults)were recovered as monophyletic and Oncomegas celatus was identified as the sister species of O.wageneri.Furthermore,population genetic analyses of O.wageneri from the southern GoM were carried out using DNA sequences of the mitochondrial cytochrome c oxi-dase subunit 1(COI)gene,which reflected high genetic variation and a lack of genetic structure among the 9 oceanographic sampling sites.Based on these results,O.wageneri is panmictic in the southern GoM.More extensive sampling along the species entire distribution is necessary to make more accurate inferences of population genetics of O.wageneri. 展开更多
关键词 BARCODE Cyclopsetta chittendeni population genetics Hypanus americanus Oncomegas Rhizoprionodon terraeno-vae 28s rdna(D1-D2)
原文传递
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