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基于16S rDNA和28S rDNA D2基因序列与形态特征联合分析的中国角顶叶蝉亚科系统发育研究(半翅目:叶蝉科)(英文) 被引量:4
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作者 戴仁怀 陈学新 李子忠 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1055-1064,共10页
首次在国内利用28S rDNA D2区段和16S rDNA基因序列,结合50个形态特征对角顶叶蝉亚科(Deltocephalinae)[半翅目(Hemiptera):叶蝉科(Cicadellidae)]19个属进行系统发育分析研究。从无水乙醇浸泡保存的标本中提取基因组DNA并扩增了19个内... 首次在国内利用28S rDNA D2区段和16S rDNA基因序列,结合50个形态特征对角顶叶蝉亚科(Deltocephalinae)[半翅目(Hemiptera):叶蝉科(Cicadellidae)]19个属进行系统发育分析研究。从无水乙醇浸泡保存的标本中提取基因组DNA并扩增了19个内群和1种外群Typhlocybinae[半翅目(Hemiptera):叶蝉科(Cicadellidae)]种类的28S rDNA D2基因片段并测序,同时扩增了16SrDNA基因片段并测序11条,采用了GenBank中1个种类的16S rDNA同源序列。采用PAUP*4.0和MrBayes3.0两个分析软件和3种建树方法,利用同源28S D2 rDNA和16S rDNA两个基因序列与形态特征结合进行系统发育分析研究。分析结果表明,二叉叶蝉族Macrostelini是一个单系,并在角顶叶蝉亚科的系统发育中处于基部的位置,是内群中最原始的族;角顶叶蝉族Deltocephalini中除了纹翅叶蝉属Nakaharanus,其余各属构成单系;殃叶蝉族Euscelini内属的归属比较混乱,可能是一个并系群,属间差异有待进一步研究。隆额叶蝉族Paralimnini与顶带叶蝉族Athysanini是姐妹群。带叶蝉属Scaphoideus与纹翅叶蝉属Nakaharanus是姐妹群,二者与木叶蝉属Phlogotettix的关系最近,三者构成一个单系,建议将三者归为带叶蝉族Scaphoideini。研究结果还表明,小眼叶蝉族Xestocephalini和Balcluthini的系统发育位置不明,有待进一步研究。 展开更多
关键词 半翅目 叶蝉科 角顶叶蝉亚科 16srdna 28s d2rdna 形态特征 系统发育
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基于28S rDNA D2基因片段与形态特征的矛茧蜂亚科系统发育研究(膜翅目:茧蜂科) 被引量:3
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作者 时敏 陈学新 +1 位作者 马云 何俊华 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期153-164,共12页
本研究选取矛茧蜂亚科Doryctinae(昆虫纲Insecta:膜翅目Hymenoptera:茧蜂科Braconidae)的6族15属18种做内群,茧蜂科其它7亚科11属11种做外群,首次结合同源核糖体28S rDNA D2基因序列片段和100个形态学和解剖学特征对该亚科进行了... 本研究选取矛茧蜂亚科Doryctinae(昆虫纲Insecta:膜翅目Hymenoptera:茧蜂科Braconidae)的6族15属18种做内群,茧蜂科其它7亚科11属11种做外群,首次结合同源核糖体28S rDNA D2基因序列片段和100个形态学和解剖学特征对该亚科进行了系统发育学研究。利用“非圆口类”的小腹茧蜂亚科Microgastrinae为根,以PAUP’4.0和MrBayes3.0B4软件分别应用最大简约法(MP)和贝叶斯法对矛茧蜂亚科的分子数据和分子数据与非分子数据的结合体进行了运算分析;并以PAUP’4.0对矛茧蜂亚科的28SrDNAD2基因序列片段的碱基组成与碱基替代情况进行了分析。结果表明:矛茧蜂亚科的28SrDNAD2基因序列片段的GC含量在39.33%~48.28%之间变动,而对于碱基替代情况来讲,矛茧蜂亚科各成员间序列变异位点上颠换(transversion)大于转换(transition)。不同的分析算法所产生的系统发育树都表明矛茧蜂亚科是一个界限分明的单系群;在矛茧蜂亚科内,除了吉丁茧蜂族Siragrini为单系群外,其他族(矛茧蜂族Doryctini和方头茧蜂族Hecabolini)都是并系群。对于矛茧蜂亚科内各属之间的相互亲缘关系,不同算法所得的系统发育树的拓扑结构不完全一致,表明矛茧蜂亚科内(属及族)的系统发育关系还有待于进一步研究。 展开更多
关键词 茧蜂科 矛茧蜂亚科 系统发育 28s rdna d2 形态特征
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基于28S rDNA序列的姬小蜂科(膜翅目,小蜂总科)分类 被引量:1
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作者 李捷 周文卿 +5 位作者 张彦周 罗阿蓉 孔维娜 赵飞 康育光 朱朝东 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期301-306,共6页
选择28S rDNA D2区基因,针对GenBank中姬小蜂科总计542条相关序列,借助Blast Align、MUSCLE及TNT等生物信息学软件进行计算分析,提出了一种基于亚科水平的姬小蜂科快速DNA分类鉴定方法。建树结果对目前分类系统中姬小蜂科4亚科分类体系(... 选择28S rDNA D2区基因,针对GenBank中姬小蜂科总计542条相关序列,借助Blast Align、MUSCLE及TNT等生物信息学软件进行计算分析,提出了一种基于亚科水平的姬小蜂科快速DNA分类鉴定方法。建树结果对目前分类系统中姬小蜂科4亚科分类体系(Bouek,1988)予以支持;综合分析结果基本支持对于姬小蜂亚科以及灿小蜂亚科的分族、分属方法。同时对地位不明的两属Anselmella和Ophelimus的分类学地位提出了假设。 展开更多
关键词 姬小蜂科 28s rdna d2 dNA分类学
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西南菌种站20株酵母菌种基于26S rDNA D_1/D_2区序列分析研究 被引量:11
4
作者 张晓娟 王柱 +1 位作者 周光燕 宋萍 《四川食品与发酵》 2008年第3期1-4,共4页
利用26SrDNA基因D1/D2区序列分析法对西南菌种站保藏的20株酵母进行复核鉴定,通过序列比对分析及构建系统发育树,结果显示20株菌株与相关标准菌株的序列相似性在99%以上,表明26SrDNA基因D1/D2区序列分析方法能够应用于酿酒酵母、东方伊... 利用26SrDNA基因D1/D2区序列分析法对西南菌种站保藏的20株酵母进行复核鉴定,通过序列比对分析及构建系统发育树,结果显示20株菌株与相关标准菌株的序列相似性在99%以上,表明26SrDNA基因D1/D2区序列分析方法能够应用于酿酒酵母、东方伊萨酵母、拜尔结合酵母、杰丁毕赤酵母以及胶红酵母等菌种分子生物学鉴定。 展开更多
关键词 酵母 26s rdna d1/d2 序列分析 系统发育树
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基于28S rDNA D2基因片段与形态特征的优茧蜂亚科系统发育研究
5
作者 时敏 朱兰兰 陈学新 《Entomotaxonomia》 CSCD 北大核心 2008年第2期113-130,共18页
本研究选取优茧蜂亚科Euphorinae(膜翅目Hymenoptera:茧蜂科Braconidae)的8族19属23种作为内群,茧蜂其它6个亚科的8属8种作外群,首次结合同源核糖体28S rDNA D2基因序列片段和41个形态学特征对该亚科进行了系统发育学研究。利用"圆... 本研究选取优茧蜂亚科Euphorinae(膜翅目Hymenoptera:茧蜂科Braconidae)的8族19属23种作为内群,茧蜂其它6个亚科的8属8种作外群,首次结合同源核糖体28S rDNA D2基因序列片段和41个形态学特征对该亚科进行了系统发育学研究。利用"圆口类"的内茧蜂亚科Rogadinae、茧蜂亚科Braconinae、矛茧蜂亚科Doryctinae的3个亚科为根,以PAUP*4.0和MrBayes3.0B4软件分别应用最大简约法(MP)和贝叶斯法对优茧蜂亚科的分子数据和分子数据与非分子数据的结合体进行了分析;并以PAUP*4.0对优茧蜂亚科的28S rDNA D2基因序列的片段的碱基组成与碱基替代情况进行了分析。结果表明:优茧蜂亚科的28S rDNA D2基因序列片段的GC%含量在40.00%~49.25%之间变动,而对于碱基替代情况来讲,优茧蜂亚科各个成员间序列变异位点上颠换(transversion)大于转换(transition);不同的分析和算法所产生的系统发育树都表明目前根据形态定义出的优茧蜂亚科Euphorinae不是一个单系群,而是一个与蚁茧蜂亚科Neoneurinae和高腹茧蜂亚科Cenocoelinae混杂在一起的并系群;在优茧蜂亚科内部,悬茧蜂族Meterorini和食甲茧蜂族Microctonini(排除猎户茧蜂属Orionis)为单系群,而宽鞘茧蜂族Centistini、大颚茧蜂族Cosmophorini、优茧蜂族Euphorini、瓢虫茧蜂族Dinocampini为并系群;悬茧蜂族Meterorini在优茧蜂亚科Euphorinae内位于基部位置的观点得到部分的支持,同时食甲茧蜂族Microctonini被判定为相对进化的类群。此外对于优茧蜂亚科内各属之间的相互亲缘关系,不同算法所得到的系统发育属的结果不完全一致,这表明优茧蜂亚科内(属及族)的系统发育关系还有待于进一步研究。 展开更多
关键词 膜翅目 茧蜂科 优茧蜂亚科 系统发育 28s rdna d2 形态特征
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乌头霜霉病病原菌rDNA-ITS和28S rDNA D1/D2区序列分析 被引量:4
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作者 欧洪 李娜 +3 位作者 胡亮 王婷 何静 王光志 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2016年第15期2741-2746,共6页
目的明确四川江油地区栽培乌头霜霉病病原菌乌头霜霉Peronospora aconiti rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列,为病害诊断和防治提供理论基础。方法从病株收集病原菌分生孢子及菌丝,提取DNA,扩增rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2片段序列,进行... 目的明确四川江油地区栽培乌头霜霉病病原菌乌头霜霉Peronospora aconiti rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列,为病害诊断和防治提供理论基础。方法从病株收集病原菌分生孢子及菌丝,提取DNA,扩增rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2片段序列,进行测序分析,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)发育树分析病原菌种类。结果检测出的病原菌rDNA-ITS序列与NCBI数据库中霜霉属P.pulveracea、P.aparines相似度为94%,28 S rDNA D1/D2区序列与霜霉属P.pulveracea、P.ficariae、P.bulbocapni相似度达97%。结论分子rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列鉴定的结论和形态学鉴定的结论一致,乌头霜霉病病原菌为霜霉科霜霉属乌头霜霉Peronospora aconiti Yu,其rDNA-ITS和28 S rDNA D1/D2区序列可用于该病原物的鉴定。 展开更多
关键词 乌头 霜霉病 乌头霜霉 rdna-ITs 28 s d1/d2
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基于28S rDNA D1-D2基因片段与16S rDNA部分序列联合分析的叶肢介系统发育研究 被引量:2
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作者 孙晓燕 夏旭华 杨群 《微体古生物学报》 CSCD 北大核心 2011年第4期370-380,共11页
叶肢介(Conchostraca)的系统发育问题一直是甲壳动物研究中颇具争议的一个课题。本研究测定了我国2种叶肢介(Eocyzicus mongolianus,Eocyzicus orientalis)的28S rDNA D1-D2区基因序列和16S rDNA E-G区序列,并与GenBank中的20种叶肢介... 叶肢介(Conchostraca)的系统发育问题一直是甲壳动物研究中颇具争议的一个课题。本研究测定了我国2种叶肢介(Eocyzicus mongolianus,Eocyzicus orientalis)的28S rDNA D1-D2区基因序列和16S rDNA E-G区序列,并与GenBank中的20种叶肢介序列一起进行系统发育分析。基于28S rDNA D1-D2区和16S rDNA E-G区联合序列,采用最大简约法、最大似然法和贝叶斯演绎法构建的叶肢介12属系统发育树显示,叶肢介可分为三个支系:圆蚌虫科、刺尾部和光尾部;叶肢介是一个并系类群;光尾部位于双甲目的基部;原隶属于刺尾部的圆蚌虫科与枝角目互为姊妹群,两者组成枝角形类(cladoceramorpha)。我们首次采用28S rDNA和16S rDNA得到与Richter等(2007)和Olesen(2009)基于形态分析相一致的谱系关系。这一结果打破了传统的系统分类体系,意味着原来定义"叶肢介目"的形态特征(包裹躯体的双瓣壳、附肢携卵、具1—2对执握肢)并非"叶肢介"特有,而应解释为双甲类的共同衍征,尽管枝角类的这些性状退化或丢失或有所变异;而复眼整体愈合、尾爪强壮并具两排尾刺等特征(枝角形类+刺尾部)应该是单次起源的;直接发育(缺无节幼虫阶段)、周期性孤雌生殖等特征(枝角形类)也应是单次演化的结果。 展开更多
关键词 叶肢介 系统发育 28s rdna d1-d2 16s rdna 并系群
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直突摇蚊亚科部分属28S rDNA D1序列的分子系统发育关系(双翅目,摇蚊科) 被引量:4
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作者 王茜 王新华 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2011年第1期93-98,共6页
利用28S rDNA D1部分基因序列对直突摇蚊亚科代表性属级阶元进行了分子系统学研究。测定了12个内群属和2种外群的28SrDNAD1片段,并结合GenBank中3个同亚科种类该基因的同源序列进行了分析。采用2种建树方法(距离邻近法NJ和最大俭约法MP... 利用28S rDNA D1部分基因序列对直突摇蚊亚科代表性属级阶元进行了分子系统学研究。测定了12个内群属和2种外群的28SrDNAD1片段,并结合GenBank中3个同亚科种类该基因的同源序列进行了分析。采用2种建树方法(距离邻近法NJ和最大俭约法MP)分析了直突摇蚊亚科内属级分类单元的分子系统发育关系。结果表明,滨海摇蚊属Clunio位于系统发育树的基部,与该属营海洋生活的特殊性一致。心突摇蚊属和真开氏摇蚊属互为姐妹群,流环足摇蚊属和刀突摇蚊属互为姐妹群,此结果与基于形态学的系统发育研究相结果一致。其它属间的系统发育关系因尚无前人研究而有待做进一步研究。本研究同时证明28S rDNA D1基因片段在分析摇蚊科昆虫属级及属内阶元关系上具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 摇蚊科 直突摇蚊亚科 28s rdna d1 分子系统发育
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利用28S rDNA D1/D2区和ITS rDNA序列鉴定甜瓜白粉病病原菌 被引量:12
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作者 刘建利 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期47-51,共5页
为了明确宁夏干旱带压砂甜瓜白粉病病原菌,从病原菌分生孢子中提取DNA,PCR扩增ITS rDNA和28S rDNA D1/D2区段,测序后进行BLAST比对。结果表明,病原菌的ITS rDNA和28S rDNA D1/D2序列与菜豆叉丝单囊壳白粉菌Podosphaera phaseoli、凤仙... 为了明确宁夏干旱带压砂甜瓜白粉病病原菌,从病原菌分生孢子中提取DNA,PCR扩增ITS rDNA和28S rDNA D1/D2区段,测序后进行BLAST比对。结果表明,病原菌的ITS rDNA和28S rDNA D1/D2序列与菜豆叉丝单囊壳白粉菌Podosphaera phaseoli、凤仙花叉丝单囊壳白粉菌P.bal-sam inae、菊科叉丝单囊壳白粉菌P.fusca、苍耳单囊壳白粉菌P.xanthii、瓜类单囊壳白粉菌P.fuligi-nea等叉丝单囊壳属Podosphaera的多个种的ITS rDNA和28S rDNA D1/D2序列之间相似度均大于99%,鉴定甜瓜白粉病病原菌为叉丝单囊壳属Podosphaera。 展开更多
关键词 甜瓜白粉病 ITs rdna 28s rdna d1/d2
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河北省长针线虫新纪录种松长针线虫Longidorus pinus Xu,Ye,Wang & Zhao的形态与分子鉴定
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作者 王宏洪 邵晓勇 +1 位作者 李秀芬 廖金铃 《林业与环境科学》 2019年第1期107-111,共5页
2018年,在河北省保定市园林植物紫荆(Cercis chinensis)根围分离到一种长针线虫。经形态学观察和28S rDNA D2D3区序列分析,将其鉴定为松长针线虫(Longidorus pinus Xu, Ye, Wang&Zhao)。其雌虫主要形态特征为:雌虫体长3 048~3 464... 2018年,在河北省保定市园林植物紫荆(Cercis chinensis)根围分离到一种长针线虫。经形态学观察和28S rDNA D2D3区序列分析,将其鉴定为松长针线虫(Longidorus pinus Xu, Ye, Wang&Zhao)。其雌虫主要形态特征为:雌虫体长3 048~3 464μm,唇区明显缢缩,宽9.5~10.5μm,侧器囊袋状,齿尖针长66.0~69.5μm,导环距体前端27.5~30.0μm,尾长31~33μm,短圆锥形,尾长与肛门处体宽比值=1.5~1.6。松长针线虫河北种群28S rDNA D2D3区与GenBank数据库的山西种群进行序列比对,相似性为99.2%~99.9%。松长针线虫是河北省长针线虫新纪录种。紫荆是松长针线虫的新寄主。 展开更多
关键词 长针线虫 紫荆 形态学 28s rdna d2d3区 河北省
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BLASTALIGN在同源基因片段检索中的应用 被引量:1
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作者 罗阿蓉 史卫峰 +3 位作者 张彦周 周宏宇 乔慧杰 朱朝东 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2007年第4期861-864,共4页
多序列比对程序的开发在生物信息学中是一个很活跃的研究领域。作为一种新诞生的多序列比对程序,BlastAlign利用blastn算法进行序列比对,并且采用空位替代比对结果中的高变区。目前,该程序主要用于多条基因序列的比对研究。本文则以获... 多序列比对程序的开发在生物信息学中是一个很活跃的研究领域。作为一种新诞生的多序列比对程序,BlastAlign利用blastn算法进行序列比对,并且采用空位替代比对结果中的高变区。目前,该程序主要用于多条基因序列的比对研究。本文则以获取膜翅目小蜂总科28SrDNAD2区基因片段为例,通过应用BlastAlign的序列比对过程,提供一种较为简便和有效的方法,实现从GenBank数据库中检索并筛选特定的同源基因序列,从而克服目前利用关键词或检索式进行检索所存在的局限性。 展开更多
关键词 BlastAlign GENBANK 小蜂总科 28s rdna d2
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抗草甘膦胶红酵母ZM-1(Rhodotorula mucilaginosa ZM-1) 被引量:1
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作者 邱并生 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1401-1401,共1页
农药残留的传统处理方法主要采取化学法或焚烧、掩埋的方法。这些方法的缺点很明显,即副作用大、容易造成二次污染、成本较高、作用很慢等。生物修复主要是利用微生物及其产品来降解污染物,它具有无毒、无残留、成本较低等优点。迄今所... 农药残留的传统处理方法主要采取化学法或焚烧、掩埋的方法。这些方法的缺点很明显,即副作用大、容易造成二次污染、成本较高、作用很慢等。生物修复主要是利用微生物及其产品来降解污染物,它具有无毒、无残留、成本较低等优点。迄今所分离的草甘膦降解菌株主要是一些细菌[1-5], 展开更多
关键词 草甘膦降解菌 26s rdna d1/d2 系统发育分析 降解特性
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定西真空包装宽粉(湿粉)中污染微生物分离鉴定及大蒜素对其抑菌作用研究
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作者 周彦兵 贾鸿震 +5 位作者 李维维 张晓雪 张小燕 洪宾 彭涛 张金虎 《现代食品》 2024年第16期160-163,共4页
本研究以定西真空包装宽粉(湿粉)为研究对象,分离其中的污染微生物,通过16S rDNA和26S rDNA D1/D2区域序列分析鉴定,结果显示,污染微生物有大肠杆菌和酵母菌。并使用有机溶剂法提取大蒜中的大蒜素,采用牛津杯抑菌圈法测定大蒜素对污染... 本研究以定西真空包装宽粉(湿粉)为研究对象,分离其中的污染微生物,通过16S rDNA和26S rDNA D1/D2区域序列分析鉴定,结果显示,污染微生物有大肠杆菌和酵母菌。并使用有机溶剂法提取大蒜中的大蒜素,采用牛津杯抑菌圈法测定大蒜素对污染菌的抑菌作用,结果显示,大蒜素对大肠杆菌和酵母菌均有明显的抑制效果,最低抑菌浓度分别为31.25 mg·mL^(-1)和62.50 mg·mL^(-1),且对大肠杆菌的抑制效果优于酵母菌。 展开更多
关键词 宽粉(湿粉) 16s rdna 26s rdna d1/d2 大蒜素 抑菌 真空包装
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Phylogeny,genetics,and the partial life cycle of Oncomegas wageneri in the Gulf of Mexico
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作者 Andrés MARTINEZ-AQUINO Víctor M.VIDAL-MARTINEZ +3 位作者 F.Sara CECCARELLI Oscar MENDEZ Lilia C.SOLER-JIMENEZ M.Leopoldina AGUIRRE-MACEDO 《Current Zoology》 SCIE CAS CSCD 2020年第3期275-283,共9页
Despite the diversity and ecological importance of cestodes,there is a paucity of studies on their life stages(i.e.,complete lists of intermediate,paratenic,and definitive hosts)and genetic variation.For example,in th... Despite the diversity and ecological importance of cestodes,there is a paucity of studies on their life stages(i.e.,complete lists of intermediate,paratenic,and definitive hosts)and genetic variation.For example,in the Gulf of Mexico(GoM)98 species of cestodes have been reported to date;however,data on their intraspecific genetic variation and population genetic studies are lacking.The trypanorhynch cestode,Oncomegas wageneri,is found(among other places)off the American Western Atlantic Coast,including the GoM,and has been reported as an adult from stingrays and from several teleost species in its larval form(as plerocerci).This study represents the first report of 2 previously unregistered definitive hosts for O.wageneri,namely the Atlantic sharpnose shark Rhizoprionodon terraenovae and the southern stingray Hypanus americanus.In this work,partial sequences of the 28S(region D1-D2)ribosomal DNA were analyzed to include O.wageneri within an eutetrarhynchoid phylogenetic framework.All O.wageneri individuals(which included plerocerci and adults)were recovered as monophyletic and Oncomegas celatus was identified as the sister species of O.wageneri.Furthermore,population genetic analyses of O.wageneri from the southern GoM were carried out using DNA sequences of the mitochondrial cytochrome c oxi-dase subunit 1(COI)gene,which reflected high genetic variation and a lack of genetic structure among the 9 oceanographic sampling sites.Based on these results,O.wageneri is panmictic in the southern GoM.More extensive sampling along the species entire distribution is necessary to make more accurate inferences of population genetics of O.wageneri. 展开更多
关键词 BARCOdE Cyclopsetta chittendeni population genetics Hypanus americanus Oncomegas Rhizoprionodon terraeno-vae 28s rdna(d1-d2)
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甘肃河西走廊葡萄酒产区高产β-葡萄糖苷酶酵母菌株筛选 被引量:25
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作者 侯晓瑞 王婧 +3 位作者 杨学山 盛文军 祝霞 韩舜愈 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第23期139-143,共5页
以甘肃河西走廊葡萄酒产区成熟葡萄浆果自然发酵过程中分离得到的115株酵母菌株为出发菌株,采用对硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷为底物的平板初筛,摇瓶复筛,对高产β-葡萄糖苷酶酵母菌株进行WL营养培养基和赖氨酸培养基初步分类以及26S r ... 以甘肃河西走廊葡萄酒产区成熟葡萄浆果自然发酵过程中分离得到的115株酵母菌株为出发菌株,采用对硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷为底物的平板初筛,摇瓶复筛,对高产β-葡萄糖苷酶酵母菌株进行WL营养培养基和赖氨酸培养基初步分类以及26S r DNA D1/D2区序列分析。结果表明:6株酵母β-葡萄糖苷酶活性与商业酵母ICV-D254酶活性相似,酶活力可达(51.40±4.74)m U/m L,其中菌株QLFE、MQFEH-1、MQFSC-3、MQFEH-2和MQFSM-3为酿酒酵母属,菌株QLFE-4为梅奇酵母属,与分子鉴定结果一致。 展开更多
关键词 酵母筛选 β-葡萄糖苷酶活性 鉴定 26s rdna d1/d2区序列分析
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大曲中酵母菌种群结构及多样性分析 被引量:19
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作者 惠丰立 柯涛 +2 位作者 褚学英 张彩莹 陶爱丽 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期102-106,共5页
将传统培养方法与分子生物学技术相结合,对大曲中酵母菌种群结构特征及多样性进行研究。从大曲中共获得92株酵母菌纯培养,通过5.8S-ITS RFLP指纹图谱分析后,得到12个不同的类群。从各个类群中随机选取代表菌株进行26S rDNA D1/D2区域序... 将传统培养方法与分子生物学技术相结合,对大曲中酵母菌种群结构特征及多样性进行研究。从大曲中共获得92株酵母菌纯培养,通过5.8S-ITS RFLP指纹图谱分析后,得到12个不同的类群。从各个类群中随机选取代表菌株进行26S rDNA D1/D2区域序列分析和系统发育分析,大曲中酵母菌主要分布在Saccharomyces、Pichia、Zygosaccharomyces、Debaryomyces、Can-dida、Endomyces、Rhodotorula、HanseniasporaI、ssatchenkia9个已知酵母菌属。传统培养方法与分子生物学技术相结合能较好地从分子水平揭示大曲中酵母菌的种群结构及多样性。 展开更多
关键词 大曲 酵母菌 5.8s-ITs限制片段长度多态性 26s rdna d1/d2区域 多样性
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新疆伊犁牧区发酵乳制品中酵母菌的分离和多样性分析 被引量:12
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作者 李宇辉 王俊钢 +2 位作者 刘成江 郭安民 李开雄 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期98-103,共6页
为保护新疆民族传统工艺制作的奶酪中经几千年驯化的优良酵母菌株,从新疆伊犁牧区少数民族家中采集样品20份,分离得到33株酵母菌,并对其进行生理生化鉴定、利用26S rDNA D1/D2区域序列分析对这些菌株进行了分类鉴定和多样性分析。共鉴定... 为保护新疆民族传统工艺制作的奶酪中经几千年驯化的优良酵母菌株,从新疆伊犁牧区少数民族家中采集样品20份,分离得到33株酵母菌,并对其进行生理生化鉴定、利用26S rDNA D1/D2区域序列分析对这些菌株进行了分类鉴定和多样性分析。共鉴定出4属5种,其中唐布拉牧区和那拉提牧区的优势菌株为发酵毕赤氏酵母(Pichia fermentans),托里县和布尔津县采集的样品中的优势菌种为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae);马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是奶酪样品中的共同菌株。 展开更多
关键词 奶酪 酵母菌 生化鉴定 26s rdna d1 d2 生物多样性
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宁夏御马葡萄酒厂野生酵母菌株的分离筛选及分子鉴定 被引量:17
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作者 王国平 宋育阳 +1 位作者 裴颖芳 刘延琳 《中国酿造》 CAS 北大核心 2009年第8期38-41,共4页
利用26S rDNA D1/D2区序列分析法,对分离自宁夏御马葡萄园的22株野生酵母菌进行了鉴定,同时构建了22株供试菌株与相关模式菌株的系统发育树,分析了供试菌株与已知酵母菌的亲缘关系及其分类地位。结果表明:供试菌株被鉴定为5属7种,分别... 利用26S rDNA D1/D2区序列分析法,对分离自宁夏御马葡萄园的22株野生酵母菌进行了鉴定,同时构建了22株供试菌株与相关模式菌株的系统发育树,分析了供试菌株与已知酵母菌的亲缘关系及其分类地位。结果表明:供试菌株被鉴定为5属7种,分别是酿酒酵母、巴氏酵母、葡萄汁有孢汉生酵母、克鲁维毕赤酵母、美极梅奇酵母和核果梅奇酵母。 展开更多
关键词 葡萄酒相关酵母菌 26s rdna d1/d2 序列分析 分类鉴定
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几株酵母菌的分子系统学鉴定 被引量:9
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作者 王泽举 王汝瑱 +2 位作者 孙悦 杨莹 刘延琳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第15期195-200,共6页
通过对酵母菌5.8S核糖体RNA的ITS区域PCR扩增及限制性酶切片段多态性(RFLP)的图谱分析以和26S rDNA D1/D2区及5.8S-ITS区的序列分析,共鉴定13株分离自新疆鄯善地区的葡萄酒相关酵母菌。5.8S-ITS区的4种内切酶(HaeⅢ、Hin6Ⅰ、HinfⅠ、Al... 通过对酵母菌5.8S核糖体RNA的ITS区域PCR扩增及限制性酶切片段多态性(RFLP)的图谱分析以和26S rDNA D1/D2区及5.8S-ITS区的序列分析,共鉴定13株分离自新疆鄯善地区的葡萄酒相关酵母菌。5.8S-ITS区的4种内切酶(HaeⅢ、Hin6Ⅰ、HinfⅠ、AluⅠ)的酶切分析产出4种特异性图谱。根据26S rDNA D1/D2区的序列分析和BLAST比对,将供试菌株鉴定为4个属4个种,分别为Saccharomyces cerevisiae、Candida zemplinina、Hanseniaspora uvarum、Pichia kluyveri var.kluyveri;而根据5.8S-ITS-RFLP及5.8S-ITS序列分析,将供试菌种鉴定为Saccharomyces cerevisiae、Candida zemplinina、Hanseniaspora uvarum、Issatchenkia terricola 4个属4个种。3种方法对供试的10个菌株的鉴定结果一致,而对另外3株的鉴定结果不同。 展开更多
关键词 葡萄酒相关酵母 分子系统学 鉴定 5 8s-ITs-RFLP 26s rdna d1 d2序列分析 5 8s-ITs序列分析
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一株能产类胡萝卜素的粘性红酵母的分离与鉴定 被引量:10
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作者 王蓉 伍时华 +3 位作者 赵东玲 黄翠姬 易弋 庞春秋 《中国调味品》 CAS 北大核心 2015年第4期16-20,共5页
通过YPD液体培养基富集培养和稀释涂YPD琼脂平板从苹果皮上分离一株产类胡萝卜素的酵母WP3。基于形态学,生理生化和18SrDNA,ITS区和26SrDNA D1/D2区序列分析确定这株酵母为粘性红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)。
关键词 粘性红酵母 类胡萝卜素 18s rdna ITs 26s rdna d1/d2
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