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Proteome analysis of round-headed and normal spermatozoa by 2-D fluorescence difference gel electrophoresis and mass spectrometry 被引量:9
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作者 Ting-Ting Liao Zhen Xiang Wen-Bing Zhu Li-Qing Fan 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2009年第6期683-694,共12页
Globozoospermia is a severe form of teratozoospermia characterized by round-headed spermatozoa with an absent acrosome, an aberrant nuclear membrane and midpiece defects. Globozoospermia is diagnosed by the presence o... Globozoospermia is a severe form of teratozoospermia characterized by round-headed spermatozoa with an absent acrosome, an aberrant nuclear membrane and midpiece defects. Globozoospermia is diagnosed by the presence of 100% round-headed spermatozoa on semen analysis, and patients with this condition are absolutely infertile. The objective of this study was to investigate the differences in protein expression between human round- headed and normal spermatozoa. Two-dimensional (2-D) fluorescence difference gel electrophoresis (DIGE) coupled with mass spectrometry (MS) was used in this study. Over 61 protein spots were analysed in each paired normal/round-headed comparison, using DIGE technology along with an internal standard. In total, 35 protein spots identified by tandem mass spectrometry (MS/MS) exhibited significant changes (paired t-test, P 〈 0.05) in the expression level between normal and round-headed spermatozoa. A total of nine proteins were found to be upregulated and 26 proteins were found to be downregulated in round-headed spermatozoa compared with normal spermatozoa. The differentially expressed proteins that we identified may have important roles in a variety of cellular processes and structures, including spermatogenesis, cell skeleton, metabolism and spermatozoa motility. 展开更多
关键词 differential protein GLOBOZOOSPERMIA mass spectrometry (MS) two-dimensional difference gel electrophoresis (2-D DIGE)
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Preparation of protein samples for gel electrophoresis by sequential extraction 被引量:15
2
作者 钟伯雄 翁宏飚 《Journal of Zhejiang University Science》 CSCD 2002年第5期606-610,共5页
Since preparation and solubilization of protein samples are crucial factors in proteome research,the authors established a sequential extraction technique to prepare protein samples from the body wall of the 5th insta... Since preparation and solubilization of protein samples are crucial factors in proteome research,the authors established a sequential extraction technique to prepare protein samples from the body wall of the 5th instar larvae of silkworm.Bombyx mori.Two kinds of protein samples were obtained from the body wall using the method.Between the two types of samples only about 15% proteins were identical;the majority were different,indicating that more species of proteins could be obtained with the sequential extraction method;which will be useful for preparation of protein samples for proteome study. 展开更多
关键词 PROTEOME Sequential extraction 2d electrophoresis Protein spot match Amino acid sequence
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Analysis of Sperm Membrane Protein Relevant to Antisperm Antibody by Two-Dimensional Gel Electrophoresis and Western Blotting 被引量:3
3
作者 Hao-fei WANG 1, Zhu-qiong XIANG 2, Yi-xing WANG 2 1. Department of Urology, Ruijin Hospital, Shanghai Second Medical University, Shanghai 200025,China 2. Department of Urology, Renji Hospital, Shanghai Second Medical University, Shanghai 200025,China 《Journal of Reproduction and Contraception》 CAS 2003年第3期147-156,共10页
Objective To identify the sperm membrane proteins that are associated with antisperm antibody Methods Using antisperm antibody positive serum through unidimensional polyacrylamide gel electrophoresis and 2-dimensi... Objective To identify the sperm membrane proteins that are associated with antisperm antibody Methods Using antisperm antibody positive serum through unidimensional polyacrylamide gel electrophoresis and 2-dimensional gel electrophoresis followed by Western blot analysis to determine the molecular weights (MW) and isoelectric points (pI) of sperm membrane proteins that are associated with antisperm antibody. Results Eight kinds of MW with more than ten sperm membrane proteins can be recognized by antisperm antibody positive serum, of which the MWs and pI were 23 kD, 31 kD, 32 kD, 34 kD, 41 kD, 51 kD, 60 kD, 78 kD and 5.3, 5.5,5.7, 5.0, 5.3, 5.8, 6.0, 5.5~6.2, 4.6,5.1,5.5~5.8 respectively. The identification ratios of the sperm membrane proteins on 78 kD (60.7%), 60 kD (71.4%), 51 kD (14.9%) and 23 kD (14.29%) were higher. Conclusion The sperm membrane proteins with MW of 78 kD, 60 kD, 51 kD and 23 kD were associated with antisperm antibody and immunological infertility. Two- dimensional gel electrophoresis and Western blotting can precisely identify the sperm membrane proteins that are associated with antisperm antibody. 展开更多
关键词 immunological infertility antisperm antibody sperm membrane protein 2-dimensional gel electrophoresis
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2D-DIGE-HPLC-nESIMS/MS对2,4-二硝基苯磺酸损伤HaCaT细胞差异蛋白质的鉴定 被引量:2
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作者 孙明忠 杨帆 +3 位作者 侯志杰 郭春梅 郭一萌 刘淑清 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期146-151,共6页
采用Cy2、Cy3和Cy5荧光染料标记蛋白,建立了人角质形成细胞HaCaT受2,4-二硝基苯磺酸(DNBS)刺激前后的双向胶内差异凝胶电泳(2D-DIGE)图谱,每组平行样本数为3。凝胶采用蛋白荧光染料Deep Purple进行后染色(Post-stain)。DeCyder定量分析... 采用Cy2、Cy3和Cy5荧光染料标记蛋白,建立了人角质形成细胞HaCaT受2,4-二硝基苯磺酸(DNBS)刺激前后的双向胶内差异凝胶电泳(2D-DIGE)图谱,每组平行样本数为3。凝胶采用蛋白荧光染料Deep Purple进行后染色(Post-stain)。DeCyder定量分析软件在每块凝胶上平均检测到1 200个以上蛋白斑点,每块胶上都匹配得到的相同蛋白质斑点有846个。其中有7个斑点丰度变化在50%以上,统计学意义显著(P值小于0.05)。利用高效液相色谱-电喷雾串联质谱(HPLC-nESI MS/MS)成功鉴定5个表达上调的斑点分别为X染色体开放阅读框26(Cxorf26)、人辅分子伴侣23(PTGES3)、钙调蛋白(CALM3)、肌球蛋白轻链6(MYL6)和断裂点丛集区蛋白1(BANF1);2个表达下调蛋白斑点被鉴定为转录延伸因子B肽链2(TCEB2)和核糖体蛋白L23(RPL23)。除MYL6被报道与皮肤疾病相关外,其它蛋白与皮肤病变的关系有待研究。该研究得到的7个差异表达蛋白为DNBS类化学致癌物职业接触者皮肤病变研究提供了有价值的线索。 展开更多
关键词 2 4-二硝基苯磺酸 职业暴露 2d—DIGE HPLC—nESI MS/MS HACAT
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蛋白质组学技术分析5-aza-2dC处理白血病细胞HL-60前后的差异表达蛋白质 被引量:3
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作者 谭潭 梁婷 +6 位作者 汤参娥 肖艳华 易红 张鹏飞 彭芳 陈主初 肖志强 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2009年第2期93-99,共7页
目的:研究甲基化转移酶抑制剂5-杂氮-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycitydine,5-aza-2dC)对人急性髓系白血病细胞HL-60细胞蛋白质表达谱的影响,探讨5-aza-2dC抗急性髓系白血病作用的机制。方法:采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离5-aza-2-d... 目的:研究甲基化转移酶抑制剂5-杂氮-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycitydine,5-aza-2dC)对人急性髓系白血病细胞HL-60细胞蛋白质表达谱的影响,探讨5-aza-2dC抗急性髓系白血病作用的机制。方法:采用二维凝胶电泳(2-DE)技术分离5-aza-2-dC处理与未处理HL-60细胞的总蛋白质,PDquest图像分析软件识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质点。然后采用Western印迹检测差异蛋白质半乳糖凝集素1(Galectin-1)在药物处理与未处理HL-60细胞中的表达水平。结果:建立了5-aza-2dC处理与未处理HL-60细胞蛋白质的2-DE图谱,识别了35个差异表达的蛋白质点,鉴定了27个差异表达的蛋白质,其中包括Galectin-1在内的21个蛋白质在5-aza-2dC处理后的HL-60细胞中表达上调,6个蛋白质表达下调或缺失。Western印迹结果证实Galectin-1在5-aza-2dC处理HL-60细胞中表达上调。结论:21个表达上调蛋白质的编码基因可能是HL-60细胞的甲基化失活基因,它们可能与急性髓系白血病发病以及5-aza-2-dC抗人急性髓系白血病细胞作用有关。 展开更多
关键词 蛋白质组学 二维凝胶电泳 5-杂氮-2’-脱氧胞苷 白血病
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MALDI-TOF质谱源后衰变技术鉴定2D胶蛋白点 被引量:1
6
作者 聂松 陈平 梁宋平 《激光生物学报》 CAS CSCD 2003年第4期249-253,共5页
PMF方法由于具有高灵敏度、高通量和容易自动化等优点,在蛋白质组学鉴定中占有重要的地位。然而,许多样品(比如:小分子蛋白,混合物等)仅仅通过PMF方法不能明确鉴定。在这种情况下,在测定PMF的同一个样品上,选择一个酶解片段峰进行PSD测... PMF方法由于具有高灵敏度、高通量和容易自动化等优点,在蛋白质组学鉴定中占有重要的地位。然而,许多样品(比如:小分子蛋白,混合物等)仅仅通过PMF方法不能明确鉴定。在这种情况下,在测定PMF的同一个样品上,选择一个酶解片段峰进行PSD测序,并把这些序列信息输入MS-Tag软件进行搜索,结合PMF方法,表观分子量等电点等参数,能够对胶上的点进行明确的鉴定。本文先用PSD方法对胶上的三个标准蛋白进行鉴定,都得到了非常准确的结果,同时鉴定了胶上的几个未知点。 展开更多
关键词 MALDI—TOF—PSD质谱 蛋白质组学 2dgel
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An improved Coomassie Brilliant Blue (CBB R-250) staining to proteins in gels 被引量:2
7
作者 ZHOUZhi-Dong LIUWang-Yi 《Nuclear Science and Techniques》 SCIE CAS CSCD 2002年第4期251-258,共8页
An improved CBB staining with higher sensitivity than that of the typical CBB staining was reported.The main improvement was using a fixing step of 25% trichloroacetic acid(TCA) before CBB staining.For most proteins s... An improved CBB staining with higher sensitivity than that of the typical CBB staining was reported.The main improvement was using a fixing step of 25% trichloroacetic acid(TCA) before CBB staining.For most proteins studied,the sensitivity of the improved CBB staining was about twice as high as that of the typical method.For basic and low molecular weight proteins such as ribosomal proteins,the sensitivity of this improved staining method was about 3.5-28 times that of the typical method.It was speculated that the improved procedure would be suitable for exact quantitative analysis of proteins fractionated by SDS-PAGE,especially for basic and low molecular weight proteins.On the other hand,this new modified method might be also applied to multidisciplinary studies,such as biological researches and nuclear sciences. 展开更多
关键词 蛋白 CBB R-250 凝胶
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Improvement of resolution in 2-D gel analysis by simple pre-treatment of human urine with EDTA
8
作者 Jin-Woo Lee Ju-Young Lee Jinkyu Lim 《Open Journal of Clinical Diagnostics》 2012年第2期40-43,共4页
Regardless of thermodynamic stability, less complex proteome than plasma, convenient and noninvasive sampling of urine, reproducibility and comparability of the data among laboratories are challenges for the urine pro... Regardless of thermodynamic stability, less complex proteome than plasma, convenient and noninvasive sampling of urine, reproducibility and comparability of the data among laboratories are challenges for the urine proteome analysis. Pretreatment of urine with 10 mM EDTA in conjunction with desalting methods to remove interfering molecules significantly improved the presentation of urine proteome on 2-D gels. Statistical analysis of the average ratio of the spot numbers on 2-D gels between EDTA-treated and non-treated samples were 1.35 ± 0.167, 1.26 ± 0.091, and 1.24 ± 0.095 for dialysis, ultrafiltration, and desalting column, respectively, with the p-value of 5.85 × 10–6 for the overall comparison. This result came from the fact that EDTA-treated samples showed better resolutions with less streaks and clearer spots on 2-D gels than the control samples. The results suggest that a simple and non-fractionating EDTA-treatment can be employed to the procedures for the high resolution 2-D gel analysis and other urinary proteomic analysis. 展开更多
关键词 URINE EDTA-Treatment Interfering MOLECULES 2-D gel RESOLUTION
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鳜和鲢肌肉蛋白质氨基酸组成及其蛋白质组成的比较分析(英文) 被引量:26
9
作者 唐建洲 张东裔 +3 位作者 成嘉 刘芳 符贵红 张建社 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期361-368,共8页
采用高压液相色谱和二维电泳方法,对鳜和鲢肌肉组织蛋白质组成成分以及肌肉蛋白质双向电泳分布图谱进行了比较研究。研究结果证明,鳜肌肉组织蛋白质干重为34.7%,而鲢肌肉干重为33.6%;鳜肌肉组织中必需氨基酸含量和鲜味氨基酸(天冬氨酸... 采用高压液相色谱和二维电泳方法,对鳜和鲢肌肉组织蛋白质组成成分以及肌肉蛋白质双向电泳分布图谱进行了比较研究。研究结果证明,鳜肌肉组织蛋白质干重为34.7%,而鲢肌肉干重为33.6%;鳜肌肉组织中必需氨基酸含量和鲜味氨基酸(天冬氨酸和甘氨酸)均高于鲢。同时,将两种鱼肌肉蛋白进行2D-gel双向电泳分离,发现鳜和鲢肌肉蛋白质组成和分布也存在明显的差异。本研究将肌肉蛋白质组成成分和蛋白的双向电泳技术结合起来,进行蛋白质组分归类分析,可为进一步研究两种鱼肌肉肉质研究打下基础,为水产业提供有价值的参考,为鱼类的养殖和肉质的改良、利用提供一个指标。 展开更多
关键词 氨基酸 蛋白质组成 二维电泳
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成年和老年小鼠脑蛋白质组双向电泳图谱比较 被引量:19
10
作者 丁勤学 阙海萍 +2 位作者 郭尧君 景书谦 刘少君 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第5期683-687,共5页
使用双向电泳 (2 DE)比较成年和老年小鼠脑蛋白质差异 ,从分子水平初步探索老年脑蛋白整体变化规律 .以固相 pH梯度等电聚焦为第一向 ,SDS 聚丙烯酰胺凝胶水平电泳 (PAGE)为第二向进行 2 DE .图象分析软件Imagemaster 2DElite分析电... 使用双向电泳 (2 DE)比较成年和老年小鼠脑蛋白质差异 ,从分子水平初步探索老年脑蛋白整体变化规律 .以固相 pH梯度等电聚焦为第一向 ,SDS 聚丙烯酰胺凝胶水平电泳 (PAGE)为第二向进行 2 DE .图象分析软件Imagemaster 2DElite分析电泳图谱 .重复性实验结果显示 ,同组样品在三次不同实验中所得蛋白质斑点数目的相对标准差 (变异系数 )为 4 43%± 0 2 5 % ;同一蛋白质斑点在三次实验中等电点、分子质量和蛋白质量的相对标准差分别为 8 76 %± 5 14% ,13 0 0 %± 4 2 2 %和 10 84%± 9 16 % .成年和老年小鼠脑组织 2 DE图谱分别获得 996和 12 5 6个蛋白质斑点 ,其中 8个蛋白质在老年脑组织中含量降低 ,2 0个蛋白质斑点含量增加 .另至少有 4个蛋白质斑点在老年脑组织中缺失 ,14个蛋白质点为老年脑特有 . 展开更多
关键词 老年 脑蛋白 固相PH梯度 双向电泳图谱 蛋白质组 成年 小鼠 脑老化 功能退变
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Plant Proteomics in the Post-genomic Era 被引量:12
11
作者 郭奕明 沈世华 +1 位作者 荆玉祥 匡廷云 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第6期631-641,共11页
Proteomics is one of the most active research fields in the post-genomic era. Here we briefly introduce the scientific background of the origination of proteomics and its content, research method. The new developments... Proteomics is one of the most active research fields in the post-genomic era. Here we briefly introduce the scientific background of the origination of proteomics and its content, research method. The new developments of proteomics at the levels of individual plants, tissues, organs and organells, as well as its applications in the area of plant genetic diversity, mutant characterization, and plant physiology, etc are reviewed. At last, the challenge and prospect of proteomics are discussed. 展开更多
关键词 genome post-genome PROTEOME plant proteomics matrix-assisted laser-desorption/ionizationtime-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF/MS) two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2d-PAGE)
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植物蛋白质组学技术研究进展 被引量:9
12
作者 张根连 范术丽 +2 位作者 宋美珍 庞朝友 喻树迅 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期26-30,共5页
蛋白质组学被认为是后基因组研究中的最主要部分。与基因组学相比较,蛋白质组学的研究内容更为复杂,同时也更为直观地揭示生命过程。近年来新的蛋白质组学研究技术层出不穷,极大地推动了生命科学的研究进展。简要介绍了蛋白质组学的概... 蛋白质组学被认为是后基因组研究中的最主要部分。与基因组学相比较,蛋白质组学的研究内容更为复杂,同时也更为直观地揭示生命过程。近年来新的蛋白质组学研究技术层出不穷,极大地推动了生命科学的研究进展。简要介绍了蛋白质组学的概念、蛋白质组学的研究内容以及一些新的研究技术在植物中的应用等。 展开更多
关键词 蛋白质组学 双向凝胶电泳 ITRAQ 生物信息学
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蛋白质组技术及小麦蛋白质组研究进展 被引量:13
13
作者 司晓敏 李巧云 晏月明 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期100-105,共6页
以大规模分析蛋白质作为主要研究内容的蛋白质组学是功能基因组研究的一个主要内容,蛋白质组技术平台的建立为小麦蛋白质的高效分离与鉴定奠定了基础。介绍了蛋白质组研究三大核心技术的基本原理与方法,综述了蛋白质组技术在小麦品质方... 以大规模分析蛋白质作为主要研究内容的蛋白质组学是功能基因组研究的一个主要内容,蛋白质组技术平台的建立为小麦蛋白质的高效分离与鉴定奠定了基础。介绍了蛋白质组研究三大核心技术的基本原理与方法,综述了蛋白质组技术在小麦品质方面的研究进展,并分析了存在的问题与发展前景。 展开更多
关键词 蛋白质组 双向凝胶电泳 质谱 贮藏蛋白 两性蛋白
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水稻种子胚乳蛋白的双向电泳分析技术 被引量:9
14
作者 易克 田云 +2 位作者 徐向利 卢向阳 萧浪涛 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期513-515,共3页
为探讨水稻灌浆期间与籽粒充实相关蛋白表达的变化,建立了一套适于水稻种子胚乳蛋白双向电泳分析技术,探讨了胚乳蛋白的提取、纯化以及双向电泳的一些关键技术.结果表明,通过乙醇铵沉淀、高压等电聚焦和两步平衡等方法可以获得较好的分... 为探讨水稻灌浆期间与籽粒充实相关蛋白表达的变化,建立了一套适于水稻种子胚乳蛋白双向电泳分析技术,探讨了胚乳蛋白的提取、纯化以及双向电泳的一些关键技术.结果表明,通过乙醇铵沉淀、高压等电聚焦和两步平衡等方法可以获得较好的分析结果,获得胚乳蛋白斑点数约350个,等电点范围在3.0~9.0,其中大部分集中在4.0~7.0. 展开更多
关键词 水稻 胚乳蛋白 双向电泳
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大鼠骨组织蛋白质组样品提取方法的建立 被引量:5
15
作者 刘建仁 樊粤光 +4 位作者 王海彬 史风雷 何伟 袁浩 王三英 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期420-424,共5页
蛋白质组学是目前研究的重要热点.该文拟建立大鼠骨组织蛋白质样品提取的最佳方法,用于双向电泳分离,为进一步进行蛋白组学分析奠定基础.实验对3种不同方法制备的样本进行同一条件的二维电泳(2- DE)图谱,比较2- DE的结果.结果发现,丙酮... 蛋白质组学是目前研究的重要热点.该文拟建立大鼠骨组织蛋白质样品提取的最佳方法,用于双向电泳分离,为进一步进行蛋白组学分析奠定基础.实验对3种不同方法制备的样本进行同一条件的二维电泳(2- DE)图谱,比较2- DE的结果.结果发现,丙酮沉淀法最佳.这些结果提示,只有结合骨组织成分特征与双向电泳的具体要求,选择恰当的样品提取液,采用合理的提取步骤,获得蛋白质样品,才能得到清晰高分辨率的电泳图谱,满足蛋白质组学分析需要. 展开更多
关键词 骨组织 提取方法 大鼠 蛋白质组学 2-DE 二维电泳 电泳分离 最佳方法 样品提取 具体要求 双向电泳 成分特征 电泳图谱 高分辨率 蛋白组 提取液 沉淀法 学分
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猫爪草提取物对临床分离结核分枝杆菌蛋白质组表达的影响 被引量:19
16
作者 何颖 乐军 +6 位作者 胡昌华 王洪海 谢建平 唐翠 魏秀莉 刘雪梅 宋洁 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期895-899,共5页
猫爪草已经临床治疗耐药结核病,但其作用机理和有效成分尚不清楚。为研究其可能的作用靶标,采用双向电泳技术比较分析猫爪草提取物作用前后结核分枝杆菌临床分离株的全细胞蛋白表达差异。发现22个蛋白质斑点具有明显差异,对其中3个表达... 猫爪草已经临床治疗耐药结核病,但其作用机理和有效成分尚不清楚。为研究其可能的作用靶标,采用双向电泳技术比较分析猫爪草提取物作用前后结核分枝杆菌临床分离株的全细胞蛋白表达差异。发现22个蛋白质斑点具有明显差异,对其中3个表达明显下调的蛋白质斑点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析,获得了肽质量指纹图谱。数据库检索分析确定这3个点代表的蛋白质分别为硫代硫酸硫转移酶,延长因子Ts和热休克蛋白X,分别参与厌氧硫代谢、蛋白质翻译和蛋白质折叠分泌、转录调控等过程。这有助于深入研究猫爪草对结核分枝杆菌的作用机理,也为发现新的抗结核病治疗药物靶标提供了线索。 展开更多
关键词 猫爪草 结核分枝杆菌 蛋白质组 双向电泳 差异表达
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镉胁迫下嗜温鞘氨醇杆菌降解丁草胺的蛋白质组学研究 被引量:7
17
作者 林晓燕 牟仁祥 +4 位作者 曹赵云 曹珍珍 周蓉 许萍 陈铭学 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期2738-2745,共8页
为了从蛋白表达水平阐释丁草胺降解菌应答镉胁迫及胁迫情况下降解丁草胺的分子机制,对丁草胺高效降解菌嗜温鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium thalpophilum)在重金属镉胁迫下蛋白质组变化进行研究,设置10 mg·L-1镉胁迫处理和不加镉的对... 为了从蛋白表达水平阐释丁草胺降解菌应答镉胁迫及胁迫情况下降解丁草胺的分子机制,对丁草胺高效降解菌嗜温鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium thalpophilum)在重金属镉胁迫下蛋白质组变化进行研究,设置10 mg·L-1镉胁迫处理和不加镉的对照,7 d后分别取样提取菌株总蛋白,利用双向(2-D)电泳和质谱鉴定技术分析两者之间的差异表达蛋白,并进行差异蛋白功能分析。2-D电泳结果分析共获得93个差异蛋白点,其中上调蛋白49个,下调蛋白44个。选取重复性好且差异最为明显的23个蛋白质点酶解脱盐后进行MALDI-TOF-MS分析,成功鉴定出15个差异蛋白,其中8个为上调蛋白,7个为下调蛋白;差异蛋白分别按GO和COG进行了蛋白功能的生物信息学分类。研究表明:差异显著蛋白主要为参与丁草胺代谢的蛋白、响应镉胁迫敏感蛋白及在镉胁迫下参与丁草胺代谢的蛋白;获得2个镉高度敏感蛋白(蛋白编号分别为A0A0M7HIV1和A0A0D6IIE6)以及1个抗镉胁迫同时参与丁草胺代谢的蛋白(蛋白编号为D4FMF4),推测它们在镉胁迫下丁草胺的降解中起重要作用。 展开更多
关键词 镉胁迫 丁草胺 嗜温鞘氨醇杆菌 双向电泳 蛋白质组学
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适于双向电泳分析的番茄叶片总蛋白提取方法的优化 被引量:29
18
作者 徐幼平 徐秋芳 蔡新忠 《浙江农业学报》 CSCD 2007年第2期71-74,共4页
比较了三氯乙酸(TCA)、酚和十二烷基硫酸钠(SDS)3种提取方法在所获番茄叶片总蛋白产量及其在SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分辨率等方面的区别,并对3种蛋白溶解液以及超声处理在蛋白质溶解中的作用进行了分析探讨。结果表明,TCA提取法最佳,该... 比较了三氯乙酸(TCA)、酚和十二烷基硫酸钠(SDS)3种提取方法在所获番茄叶片总蛋白产量及其在SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分辨率等方面的区别,并对3种蛋白溶解液以及超声处理在蛋白质溶解中的作用进行了分析探讨。结果表明,TCA提取法最佳,该方法提取番茄叶片总蛋白的得率最高、所获蛋白在SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳中形成条带数目最多,最清晰;酚法次之;SDS法最差。由离液剂和去污剂组成的蛋白溶解液复溶蛋白沉淀所获蛋白产量显著高于Tris-NaCl溶解液。还原剂和两性电解质以及超声处理显著增进蛋白质的溶解,提高蛋白产量。采用TCA提取法获得蛋白沉淀,再以溶解液Ⅱ(7 mol/L尿素,2 mol/L硫尿,2%CHAPS,2%SB3-10,65 mmol/L DTT,0.2%两性电解质)溶解,结合超声助溶的方法体系可以获得高得率和高电泳分辨率的番茄叶片总蛋白样品,该方法适用于双向电泳分析等下游操作。 展开更多
关键词 番茄 蛋白 双向电泳 三氯乙酸 两性电解质 超声处理
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缺铁逆境胁迫下水稻叶蛋白质组的双向电泳分析 被引量:17
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作者 柴小清 靳飞 +2 位作者 张艳萍 卫功宏 印莉萍 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2004年第3期46-51,共6页
水稻幼苗经缺铁胁迫诱导处理 1、3、5d后 ,用酚法和TCA 丙酮法提取叶的可溶性蛋白 ,进行双向电泳 (2 DE)分析 .结果显示 :(1 )三种缺铁胁迫的可溶性蛋白 ,在不同的pH范围中 2 DE图谱上的比较 .使用pH3~ 1 0宽范围、线性 (L)的IPG胶... 水稻幼苗经缺铁胁迫诱导处理 1、3、5d后 ,用酚法和TCA 丙酮法提取叶的可溶性蛋白 ,进行双向电泳 (2 DE)分析 .结果显示 :(1 )三种缺铁胁迫的可溶性蛋白 ,在不同的pH范围中 2 DE图谱上的比较 .使用pH3~ 1 0宽范围、线性 (L)的IPG胶条 ,经电泳分离后利用Z3图象分析软件 ,可在SDS PAGE凝胶上检测到 4 5 0个左右的蛋白点 ,酸性蛋白占 89% .选用pH4~ 7窄范围、线性 (L)的IPG胶条 ,经电泳后可在SDS PAGE凝胶上检测到 6 0 0个左右的蛋白点 ,其中缺铁诱导上调表达的有 2 9个点 ,减弱表达的有 1个点 ,诱导特异表达的有 5个点 .(2 )不同方法提取可溶性蛋白的差异 .酚法提取的蛋白再溶性好 ,纯度较高 .TCA 丙酮法简单易操作 ,蛋白损耗少 ,在 2 DE图象上 ,碱性端显示的蛋白点较多 ,但此法的缺点是再溶性差 ,对 2 展开更多
关键词 可溶性蛋白 2-DE 白质 诱导 缺铁胁迫 表达 双向电泳分析 叶蛋白 水稻 SDS-PAGE
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低温胁迫下棉花子叶蛋白质差异表达的双向电泳分析 被引量:16
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作者 邰付菊 李扬 +1 位作者 陈良 李学宝 《华中师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2008年第2期262-266,共5页
采用TCA-丙酮沉淀法,改良优化了棉花蛋白质组研究中的双向电泳技术.通过对根和子叶全细胞蛋白的提取、蛋白的溶解、胶条的选择及电泳等环节的优化,得到了重复性很高、分辨率很好的蛋白质图谱.进一步对5 d苗龄的棉花进行4℃低温处理12 h... 采用TCA-丙酮沉淀法,改良优化了棉花蛋白质组研究中的双向电泳技术.通过对根和子叶全细胞蛋白的提取、蛋白的溶解、胶条的选择及电泳等环节的优化,得到了重复性很高、分辨率很好的蛋白质图谱.进一步对5 d苗龄的棉花进行4℃低温处理12 h后,提取子叶的蛋白质,利用双向电泳技术分离全细胞蛋白.并用PDQuest软件分析比较棉花子叶在低温处理下的蛋白表达谱,得到了49个有显著差异的蛋白点.其中,低温处理上调表达的蛋白点有27个,减弱表达的蛋白点有22个,推测这些差异蛋白点可能与低温胁迫相关. 展开更多
关键词 棉花 低温处理 双向电泳
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