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3-D QSAR study on a set of nitroaromatic compounds
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作者 Xu, M Zhang, AQ +1 位作者 Han, SK Wang, LS 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2002年第3期189-193,共5页
The 3-D relationships between the structures of 25 nitroaromatic compounds and their toxicities have been investigated using the comparative molecular field analysis (CoMFA) method, and a 3-D QSAR model with considera... The 3-D relationships between the structures of 25 nitroaromatic compounds and their toxicities have been investigated using the comparative molecular field analysis (CoMFA) method, and a 3-D QSAR model with considerable prediction ability is obtained. In comparison with traditional 2-D techniques, CoMFA helps to give a better interpretation of toxic mechanism of tested compounds. 展开更多
关键词 nitroaromatic COMPOUND 3-d qsar CoMFA.
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HIV-1整合酶抑制剂的3D-QSAR研究 被引量:2
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作者 仝建波 曹旭 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2019年第6期889-893,共5页
采用Topomer CoMFA方法对26个香豆素衍生物进行三维定量构效关系研究,建立了3 D-QSAR模型,所得优化模型的非交叉相关系数、交互验证系数以及外部验证的复相关系数分别为0.973,0.666和0.960,结果表明该模型具有良好的稳定性和预测能力.... 采用Topomer CoMFA方法对26个香豆素衍生物进行三维定量构效关系研究,建立了3 D-QSAR模型,所得优化模型的非交叉相关系数、交互验证系数以及外部验证的复相关系数分别为0.973,0.666和0.960,结果表明该模型具有良好的稳定性和预测能力.运用这些信息进行分子对接,在理论上验证所构建的模型具有较高的可信性.此外,QSAR的研究结果可为新药合成提供理论参考. 展开更多
关键词 三维定量构效关系 易位体比较分子场 分子对接
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类吗啡类拮抗物的结构与抑食活性的3D-QSAR研究 被引量:2
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作者 李华 许禄 苏锵 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第10期1479-1483,共5页
用比较力场分析研究了 3 ,4 二甲基 4 ( 3 羟基苯基 )哌啶及其衍生物类吗啡拮抗物的结构与抑食活性的关系 ,考察了网格结构和探针原子的影响 .结果表明 。
关键词 三维定量构效关系 类吗啡类拮抗物 减肥药 COMFA
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苯并咪唑类PI3Kδ抑制剂的3D-QSAR研究 被引量:1
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作者 王婷 《长春师范学院学报(自然科学版)》 2013年第5期67-70,共4页
研究苯并咪唑类化合物对PI3Kδ抑制作用的三维定量构效关系。采用CoMFA(比较分子场)方法进行研究,建立CoMFA模型。结果:交叉验证系数q2=0.702,相关系数r2=0.981,F=104.661,标准偏差SD=0.211。结论:苯并咪唑类PI3Kδ抑制剂CoMFA模型具有... 研究苯并咪唑类化合物对PI3Kδ抑制作用的三维定量构效关系。采用CoMFA(比较分子场)方法进行研究,建立CoMFA模型。结果:交叉验证系数q2=0.702,相关系数r2=0.981,F=104.661,标准偏差SD=0.211。结论:苯并咪唑类PI3Kδ抑制剂CoMFA模型具有较好的预测能力,本实验研究的三维定量构效关系,对开发和研制此类抑制剂能够起到重要的指导作用。 展开更多
关键词 PI3K 3D-qsar ZSTK474
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甲状腺激素受体配体化合物的定量构效关系(QSAR)研究 被引量:1
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作者 杨善彬 梁桂兆 +7 位作者 潘元 舒茂 许罗南 杨青林 陈国华 孙家英 田菲菲 李志良 《分子科学学报》 CAS CSCD 2008年第4期228-234,共7页
研究了68个TR(Thyroid Hormone Receptor,甲状腺激素受体)配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系.采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关... 研究了68个TR(Thyroid Hormone Receptor,甲状腺激素受体)配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系.采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关系模型.复相关系数和交互检验复相关系数R2=0.767,Q2=0.625(TRα),R2=0.734,Q2=0.61(TRβ).模型具有良好的稳定性和预测能力,证明了该三维原子场全息相互作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上的适用性,并可应用于潜在和新型的TR配体化合物的设计和开发. 展开更多
关键词 三维原子场全患相互作用矢量(3D—HoVAIF) 甲状腺激素受体(TR)配体 定量构效关系(qsar)
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Synthesis, Biological Activity and 3D-QSAR Study of Novel Pyrrolidine-2,4-dione Derivatives Containing N-Substituted Phenylhydrazine Moiety
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作者 ZHANG Lizhi REN Zhengjiao +5 位作者 LU Aimin ZHAO Zheng XU Wenqin BAO Qianqian DING Weijie YANG Chunlong 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2015年第2期228-234,共7页
Twenty-seven novel pyrrolidine-2,4-dione derivatives containing N-substituted phenylhydrazine moiety were synthesized. Their structures were confirmed by IH NMR, 13C NMR and MS. The half effective concentration (ECs0... Twenty-seven novel pyrrolidine-2,4-dione derivatives containing N-substituted phenylhydrazine moiety were synthesized. Their structures were confirmed by IH NMR, 13C NMR and MS. The half effective concentration (ECs0) values of the title compounds against the phytopathogenic fungi Rhizoctonia cerealis were evaluated. Com- pounds 61 and 6q displayed good bioactivity with EC50 values of 1.626 and 2.043 μg/mL, respectively. The 3D quantitative structure activity relationship(3D-QSAR) model of CoMFA was established with reliable cross-validated correlation coefficient q2 value of 0.585 and Noncross-validated correlation coefficient r2 value of 0.971. This model provided a tool for guiding further design and synthesis of novel pyrrolidine-2,4-dione derivatives with high fungicidal activity. 展开更多
关键词 Pyrrolidine-2 4-dione N-Substituted phenylhydrazine Antifungal activity 3D quantitative structure activity relationship(3 D-qsar
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吡啶类葡萄糖激酶激动剂的三维定量构效关系分析 被引量:5
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作者 张贝娜 武涛 +3 位作者 宰小丽 陈诚 唐光辉 舒茂 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期492-498,共7页
葡萄糖激酶GK是调节体内葡萄糖代谢和参与血糖动态平衡的主要靶点之一。本文针对46个具有GK激动剂活性的吡啶类衍生化合物进行构效关系研究,研究了其结构与活性的关系。基于分子共同骨架叠合用分子力场分析法(COMFA),比较分子相似指数法... 葡萄糖激酶GK是调节体内葡萄糖代谢和参与血糖动态平衡的主要靶点之一。本文针对46个具有GK激动剂活性的吡啶类衍生化合物进行构效关系研究,研究了其结构与活性的关系。基于分子共同骨架叠合用分子力场分析法(COMFA),比较分子相似指数法(COMSIA)两种经典三维定量构效关系(3D-QSAR)方法,建立相应模型,进行分子结构和抗糖尿病活性分析。COMFA模型的交叉验证系数q^2为0.613,相关系数r^2为0.989;COMSIA模型交叉验证系数q^2为0.621,相关系数r^2为0.982。数据证明两种模型都显示出较好的预测性,为设计新的活性更高的小分子激动剂提供了可靠信息。 展开更多
关键词 葡萄糖激酶 糖尿病 3D-qsar C0MFA C0MSIA
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新型苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲类化合物的比较定量构效关系研究 被引量:5
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作者 王美怡 马翼 +1 位作者 李正名 王素华 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第7期1361-1364,共4页
采用比较分子力场分析(CoMFA)方法,对26个新型苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲类化合物的除草活性进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了三维定量构效关系CoMFA模型(R2=0.948,F=91.364,SE=0.141).结果表明,此类磺酰脲类化合物的... 采用比较分子力场分析(CoMFA)方法,对26个新型苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲类化合物的除草活性进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了三维定量构效关系CoMFA模型(R2=0.948,F=91.364,SE=0.141).结果表明,此类磺酰脲类化合物的除草活性与苯环5位取代基的立体结构和电场性质密切相关.根据CoMFA模型的立体场和静电场三维等值线图不仅直观地解释了结构与活性的关系,而且为进一步设计高活性的目标化合物提供理论依据. 展开更多
关键词 比较分子力场分析(CoMFA) 三维定量构效关系(3D—qsar) 苯环5-(取代)苯甲酰胺基苯磺酰脲 类化合物
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不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂的三维定量构效关系研究 被引量:1
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作者 刘桦 蒲铃铃 +2 位作者 宋海星 曾莉萍 梁桂兆 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期719-727,共9页
运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合... 运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合验证系数分别为r^2=0.891和r^2=0.973,外部验证复相关系数分别为r2 pred=0.669和r2 pred=0.658,结果表明两种模型都有良好的可信度和预测能力。COMFA和CoMSIA模型在三维等视图上相互对照和验证,得到的结论与分子对接结果一致,确立了分子结构对抑制剂活性影响的具体作用方式,对指导药物的设计与改造,新VEGFR-2抑制剂的合成提供参考。 展开更多
关键词 VEGFR-2抑制剂 电荷场 COMFA COMSIA 3D-qsar模型
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黄酮类化合物的3D-QSAR研究 被引量:6
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作者 陈凝木子 黄齐茂 +3 位作者 郭嘉 池汝安 吴元欣 巨修练 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期183-187,共5页
从NCI数据库中,筛选出67个与矢车菊黄素类似的天然黄酮化合物。采用CoMFA方法研究其构效关系,构建CoMFA模型,其模型相关系数为q^2=0.599,r^2=0.919,验证模型的预测能力和拟合能力较好。通过分子场等势图,可直观分子周围立体和静电特征... 从NCI数据库中,筛选出67个与矢车菊黄素类似的天然黄酮化合物。采用CoMFA方法研究其构效关系,构建CoMFA模型,其模型相关系数为q^2=0.599,r^2=0.919,验证模型的预测能力和拟合能力较好。通过分子场等势图,可直观分子周围立体和静电特征对化合物活性的影响,为设计高活性黄酮衍生物提供理论依据。 展开更多
关键词 微管蛋白 黄酮细胞毒性 三维定量构效关系 比较分子力场分析方法
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3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的三维定量构效关系研究 被引量:1
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作者 李国荣 吴丽阳 +2 位作者 袁牧 季红 张超 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2017年第2期127-131,共5页
目的建立3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。方法采用分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)来研究3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的构效关系。结果建立了合理、可靠的3-羧基香豆素类乳酸... 目的建立3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。方法采用分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)来研究3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂的构效关系。结果建立了合理、可靠的3-羧基香豆素类乳酸转运抑制剂CoMFA(q^2=0.630,r^2=0.994,r_(pred)~2=0.909)和CoMSIA(q^2=0.676,r^2=0.972,r_(pred)~2=0.574)模型。结论构建的3D-QSAR模型揭示了3-羧基香豆素类化合物的结构和生物活性间的关系,可为该类乳酸转运抑制剂的进一步优化设计提供科学依据。 展开更多
关键词 3-羧基香豆素 乳酸转运抑制剂 抗肿瘤剂 分子力场分析法 比较分子相似性指数分析法 三维定量构效关系
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16α取代雌二醇衍生物的三维定量构效关系和分子对接研究 被引量:2
12
作者 钱力 沈勇 +1 位作者 王亚学 郑康成 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1511-1516,共6页
采用比较分子力场方法(CoMFA)及分子对接方法对一系列雌二醇衍生物的3D-QSAR及其与受体作用方式进行研究,建立了3D-QSAR的CoMFA模型,获得了化合物的相对亲合力RBA(Relative Binding Affinity)与静电场及立体场分布之间的关系;CoMFA模型... 采用比较分子力场方法(CoMFA)及分子对接方法对一系列雌二醇衍生物的3D-QSAR及其与受体作用方式进行研究,建立了3D-QSAR的CoMFA模型,获得了化合物的相对亲合力RBA(Relative Binding Affinity)与静电场及立体场分布之间的关系;CoMFA模型的统计学参数为:q^2=0.667,r^2=0.939,SD=0.280,F=49.033,立体场与静电场的贡献分别为56.8%和41.6%。相对亲合力小的化合物一般带有较大的取代基,其对接能量得分较低;相对亲合力大的化合物一般带有较小的取代基,其对接能量得分较高。化合物的对接能量得分和相对亲合力之间有良好的线性关系,其线性相关系数R为0.890。活性口袋周围的环境也与3D-QSAR的立体场分布相匹配。对接结果还显示这类化合物和雌激素的结合主要是通过氢键作用来实现,即3-OH与R394上的氨基以及17-OH与受体残基H524咪唑环上的氮形成的氢键。 展开更多
关键词 雌二醇衍生物 人雌激素受体 3D—qsar 分子对接
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GABA_A/BZ受体激动剂4-喹啉酮衍生物的DISCOtech及CoMFA研究
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作者 王珍菊 程瑾 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1197-1201,共5页
γ-氨基丁酸是重要的抑制性神经传递物质,4-喹啉酮衍生物作用于GABA_A受体具有广泛的生物活性。本文采用DIS- COtech法构建大鼠GABA_A/BZ受体4-喹啉酮衍生物激动剂的药效团模型,同时根据分子骨架叠合规则构建CoMFA模型,模型的交叉验证... γ-氨基丁酸是重要的抑制性神经传递物质,4-喹啉酮衍生物作用于GABA_A受体具有广泛的生物活性。本文采用DIS- COtech法构建大鼠GABA_A/BZ受体4-喹啉酮衍生物激动剂的药效团模型,同时根据分子骨架叠合规则构建CoMFA模型,模型的交叉验证系数为0.681,非交叉验证系数为0.967,药效团模型和CoMFA模型具有一致性。根据模型分析配体-受体间的相互作用,设计一系列化合物并预报了其活性,为设计高活性的化合物提供参考。 展开更多
关键词 GABAA/BZ受体 4-喹啉酮衍生物 药效团模型 3D-qsar COMFA
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