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基于5.8 S rDNA-ITS区域的RFLP分析快速鉴定酵母菌株 被引量:5
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作者 崔志峰 杨霄 汪琨 《浙江工业大学学报》 CAS 2007年第3期241-245,250,共6页
酵母的核糖体5.8 S rDNA及两侧的转录间隔区(ITS)具有显著的种间差异性,可以作为鉴别酵母菌种的分类依据.通过菌落PCR扩增该区域的DNA片段,用3种限制性内切酶CfoⅠ,HaeⅢ和HinfⅠ进行酶切,电泳分析酶切片段的长度多态性(RFLP),然后查找... 酵母的核糖体5.8 S rDNA及两侧的转录间隔区(ITS)具有显著的种间差异性,可以作为鉴别酵母菌种的分类依据.通过菌落PCR扩增该区域的DNA片段,用3种限制性内切酶CfoⅠ,HaeⅢ和HinfⅠ进行酶切,电泳分析酶切片段的长度多态性(RFLP),然后查找数据库快速准确的鉴定酵母菌种.对本研究室保藏的12株酵母菌株进行分析,确认了已知种类的酿酒酵母(Saccha-romyces cerevisiaeAS 2.516)和路德类酵母(Saccharomycodes ludwigiiAS 2.243)的RFLP与数据库的信息完全一致,并对其余10株未知种类的酵母进行了菌种分类鉴定. 展开更多
关键词 酵母菌 5.8srdna-its RFLP 菌种鉴定
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Preliminary Identification of Three New Isolates in Genus Alexandrium(Dinophyceae) from China Sea Area 被引量:1
2
作者 FAN Lijing SUI Zhenghong +1 位作者 MAO Yunxiang GUO Hao 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2007年第1期33-39,共7页
The 5.8 S ribosomal DNA sequences (5.8S rDNA) and their flanking regions, internal transcribed spacer 1 and spacer 2 (ITS1 and ITS2) of three new isolates in genus Alexandrium (Alexandrium sp. qd1, Alexandrium sp. qd2... The 5.8 S ribosomal DNA sequences (5.8S rDNA) and their flanking regions, internal transcribed spacer 1 and spacer 2 (ITS1 and ITS2) of three new isolates in genus Alexandrium (Alexandrium sp. qd1, Alexandrium sp. qd2, Alexandrium sp. gz) from China were amplified, sequenced, and subjected to phylogenetic analysis. Alexandrium sp. gz and Alexandrium sp. qd1 were grouped with high bootstrap values with four strains/species, i.e., A. catenella South Korea strain, A. catenella Japan strain, and two from China, Alexandrium sp. AC03 and Alexandrium sp. AN01 being proposed to be A. catenalla in a previous study. Then Alexandrium sp. gz and Alexandrium sp. qd1 were identified as Alexandrium catenella. As A. catenella was isolated from Qingdao and Guangzhou sea areas, it supposedly distributed at least in these two areas and was genetically different. Alexandrium sp. qd2 differed greatly from species in Alexandrium. It clustered with Symbiodinium californium, Symbiodinium sp. G15 and Gymnodinium sp. Zhao 01 with 100% bootstrap value; so Alexandrium sp. qd2 affiliates to genus Symbiodinium, and is probably a free-living Symbiodinium species. 展开更多
关键词 ALEXANDRIUM GYMNODINIUM sYMBIODINIUM ITs 5.8s rdna-its phylogeny
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5.8S rDNA-ITS克隆文库法分析腌制冬瓜的酵母菌多样性 被引量:4
3
作者 孙丽 吴祖芳 沈锡权 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第2期201-206,共6页
应用构建的5.8S r DNA-ITS基因克隆文库法,分析冬瓜腌制体系不同时期酵母菌的多样性、优势菌种及相关指标的变化。结果表明:冬瓜腌制过程中酵母菌种类丰富,随着腌制时间的不同,卤水中酵母菌组成存在较大差异。腌制早期优势酵母菌为普鲁... 应用构建的5.8S r DNA-ITS基因克隆文库法,分析冬瓜腌制体系不同时期酵母菌的多样性、优势菌种及相关指标的变化。结果表明:冬瓜腌制过程中酵母菌种类丰富,随着腌制时间的不同,卤水中酵母菌组成存在较大差异。腌制早期优势酵母菌为普鲁兰类酵母,腌制中、后期,酵母菌群中优势菌种转变为热带假丝酵母。此外,冬瓜腌制过程中酵母菌数量和p H也相应地发生变化。本研究结果为研究酵母菌对浙东传统腌制蔬菜品质的影响提供微生物学基础。 展开更多
关键词 冬瓜 5.8s rdna-its基因克隆文库 酵母菌 多样性
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暗紫红毛菜ITS序列的测定与分析 被引量:1
4
作者 李峰 冯佳 谢树莲 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第9期5116-5117,共2页
[目的]对暗紫红毛菜rDNA内转录间隔区(ITS区)进行序列测定,为其系统发育研究提供新资料。[方法]以产于山西娘子关泉的一株暗紫红毛菜为材料,提取DNA,设计引物,进行PCR扩增,进而测定其ITS区基因序列。[结果]暗紫红毛菜与同科的少精紫菜IT... [目的]对暗紫红毛菜rDNA内转录间隔区(ITS区)进行序列测定,为其系统发育研究提供新资料。[方法]以产于山西娘子关泉的一株暗紫红毛菜为材料,提取DNA,设计引物,进行PCR扩增,进而测定其ITS区基因序列。[结果]暗紫红毛菜与同科的少精紫菜ITS区同源性为75%,与条斑紫菜ITS区同源性为79%。[结论]ITS区序列进化速率相对较快,种类和地理分布的差异是其序列差异产生的原因。 展开更多
关键词 暗紫红毛菜 ITs1-5.8s rdna-its2 序列测定
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黄淮海地区夏玉米纹枯病菌的融合群鉴定 被引量:12
5
作者 夏海波 伍恩宇 于金凤 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期360-367,共8页
从黄淮海地区采集玉米纹枯病标样250余份,分离得到176个丝核菌菌株。融合群测定及5.8SrDNA-ITS区序列分析结果表明,这些菌株分别属于多核丝核菌的AG1-IA、AG1-IB、AG4-HG-I、AG-5、WAG-Z融合群及双核丝核菌的AG-A、AG-Ba融合群。其中AG1... 从黄淮海地区采集玉米纹枯病标样250余份,分离得到176个丝核菌菌株。融合群测定及5.8SrDNA-ITS区序列分析结果表明,这些菌株分别属于多核丝核菌的AG1-IA、AG1-IB、AG4-HG-I、AG-5、WAG-Z融合群及双核丝核菌的AG-A、AG-Ba融合群。其中AG1-IA是优势融合群,占分离菌株总数的64.20%,其次是AG-Ba,占12.50%,再依次分别是WAG-Z(10.23%)、AGI-IB(5.11%)、AG-4-HG-I(3.98%)、AG-5(2.27%)和AG-A(1.70%)。其中AG-Ba融合群是国内首次在玉米上分离得到。从各融合群中选取代表性的菌株进行5.8S rDNA-ITS区序列分析结果表明,隶属不同融合群或亚群的菌株其5.8S rDNA-ITS区序列存在较大的差异,而相同融合群(或亚群)不同菌株之间其序列的一致性可高达97%-100%。 展开更多
关键词 立枯丝核菌 融合群 5.8s rdna-its区序列分析
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一株生防木霉菌株的鉴定及其对番茄保护酶的诱导作用 被引量:6
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作者 张丽莉 杨依军 +2 位作者 马力 李景富 王傲雪 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期89-94,共6页
采用形态鉴定和5.8S rDNA-ITS序列分析对土壤中分离得到菌株进行鉴定。结果表明,其形态特征与哈茨木霉非常接近,5.8S rDNA-ITS序列分析表明,其与哈茨木霉的同源性达到99%,因此,鉴定其为哈茨木霉新菌株。用其孢子悬浮液对番茄灰霉病进行... 采用形态鉴定和5.8S rDNA-ITS序列分析对土壤中分离得到菌株进行鉴定。结果表明,其形态特征与哈茨木霉非常接近,5.8S rDNA-ITS序列分析表明,其与哈茨木霉的同源性达到99%,因此,鉴定其为哈茨木霉新菌株。用其孢子悬浮液对番茄灰霉病进行防治,测定植物苯丙氨酸解氨酶(PAL)、多酚氧化酶(PPO)、过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)等诱导性保护酶活性。结果表明,所有保护酶活性均得到不同程度的提高。由此可知,鉴定的哈茨木霉菌株对植物内在的抗病系统具有诱导作用。 展开更多
关键词 哈茨木霉 5.8s rdna-its鉴定 番茄灰霉病 保护酶
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自然发酵乳及传统开菲尔粒中酵母菌的多样性研究 被引量:8
7
作者 李艳 范佳 《河北科技大学学报》 CAS 2014年第6期561-568,共8页
研究自然发酵乳和内蒙古牧区传统开菲尔粒中酵母菌的多样性,目的是探寻酵母菌的主要菌群和种属类型,为筛选可发酵低酒度发酵乳的酵母菌奠定基础。该研究首先进行稀释涂布和划线分离出酵母菌株、然后进行菌落形态和细胞形态的初步分类,... 研究自然发酵乳和内蒙古牧区传统开菲尔粒中酵母菌的多样性,目的是探寻酵母菌的主要菌群和种属类型,为筛选可发酵低酒度发酵乳的酵母菌奠定基础。该研究首先进行稀释涂布和划线分离出酵母菌株、然后进行菌落形态和细胞形态的初步分类,再进行5.8SrDNA-ITS区域RFLP分子鉴定,将分离到的130株酵母菌区分为10种形态类型、6种分子类型,分别为马克思克鲁维酵母菌(Kluyveromyces marxianus)、隐球酵母菌(Cryptococcus sp.)、酿酒酵母菌(Saccharomyces cerevisiae)、热带假丝酵母菌(Candida tropicalis)、陆生伊萨酵母菌(Issatchenkia terricola)和季也蒙毕赤酵母菌(Pichia guilliermondii)。其中马克思克鲁维酵母菌、酿酒酵母菌和季也蒙毕赤酵母菌为优势菌群,具有酿造低酒度发酵乳的潜力。 展开更多
关键词 自然发酵乳 开菲尔粒 优势酵母菌 5.8s rdna-its区域分子鉴定
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一株铁皮石斛内生真菌的分离鉴定 被引量:2
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作者 徐玲 杨晓娜 杨丽华 《保山学院学报》 2016年第2期4-6,共3页
采用组织分离法从野生铁皮石斛根部分离了一株内生真菌DOEF-R1,并根据真菌形态学特征和5.8S rD NA-ITS序列分析及系统发育树构建对菌株进行鉴定;研究结果表明铁皮石斛内生真菌菌株DOEF-R1属于芬芳镰刀菌,该结果可为丰富铁皮石斛内生真... 采用组织分离法从野生铁皮石斛根部分离了一株内生真菌DOEF-R1,并根据真菌形态学特征和5.8S rD NA-ITS序列分析及系统发育树构建对菌株进行鉴定;研究结果表明铁皮石斛内生真菌菌株DOEF-R1属于芬芳镰刀菌,该结果可为丰富铁皮石斛内生真菌资源奠定基础。 展开更多
关键词 铁皮石斛 内生真菌 形态特征 5.8s rdna-its序列分析
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高产葡萄糖氧化酶菌株的分离鉴定及发酵条件优化 被引量:1
9
作者 辛国芹 徐海燕 +3 位作者 汪孟娟 董佩佩 汪祥燕 谷巍 《饲料广角》 2015年第5期34-38,共5页
采集果园土样,采用梯度稀释涂布法及平板显色筛选法初步分离得到60株产葡萄糖氧化酶的菌株。采用Underbofler滴定法筛选出一株产酶性能较好的菌株GX-2,并采用正交设计对发酵培养基进行优化,在接种量为4%、温度为30℃、转速为180 r/min... 采集果园土样,采用梯度稀释涂布法及平板显色筛选法初步分离得到60株产葡萄糖氧化酶的菌株。采用Underbofler滴定法筛选出一株产酶性能较好的菌株GX-2,并采用正交设计对发酵培养基进行优化,在接种量为4%、温度为30℃、转速为180 r/min的条件下发酵5d酶活可达9.55U/m L。综合菌落形态、生长特性镜检形态及5.8S r DNA-ITS区序列系统进化分析证明所分离的菌株GX-2为黑曲霉(Aspergillus niger)。 展开更多
关键词 葡萄糖氧化酶 5.8s rdna-its 分离鉴定 黑曲霉
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我国部分地区玉米丝核菌组成及其致病类型分析 被引量:6
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作者 牛福芳 董明明 +2 位作者 赵新兰 马亚男 刘爱新 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期289-294,共6页
采用改进的组织分离法从山东、安徽、江苏、湖北和陕西5省10地市的270份类似玉米纹枯病的标样中,分离到204株丝核菌分离物。根据培养性状将这些丝核菌分为6种类型,DAPI染色显示,它们分别属于多核丝核菌、双核丝核菌和单核丝核菌,其中多... 采用改进的组织分离法从山东、安徽、江苏、湖北和陕西5省10地市的270份类似玉米纹枯病的标样中,分离到204株丝核菌分离物。根据培养性状将这些丝核菌分为6种类型,DAPI染色显示,它们分别属于多核丝核菌、双核丝核菌和单核丝核菌,其中多核丝核菌占97.55%,双核丝核菌占1.47%,单核丝核菌占0.98%。经5.8SrDNA-ITS序列分析,多核丝核菌为AG1-IA、WAG-Z、AG-4-HG-I及AG-54个融合群,各融合群分别占菌株总数的84.80%、5.88%、3.43%和3.43%,其中AG1-IA为主要融合群;双核丝核菌为AG-A融合群;单核丝核菌种类尚不确定。对各融合群的致病类型进行初步比较发现,属于AG1-IA融合群的菌株,可在玉米叶鞘形成典型的云纹状病斑,其它菌株虽可引起玉米发病,但与AG1-IA的症状存在明显差异。 展开更多
关键词 玉米丝核菌 核相 5.8s rdna-its区序列 致病类型
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鱿鱼丝加工中真菌菌相变化规律及优势真菌的分离鉴定 被引量:2
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作者 黄鹏晓 吴祖芳 +2 位作者 沈飚 翁佩芳 刘茜 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2016年第5期98-103,111,共7页
为减少鱿鱼丝加工过程中真菌污染,提高鱿鱼丝产品的质量,将传统的微生物鉴定技术与5.8S r DNA-ITS序列分析法相结合,并通过系统发育树分析,探索鱿鱼丝加工过程中真菌菌相变化规律及优势菌株。结果表明,在鱿鱼丝加工过程中,不同阶段样品... 为减少鱿鱼丝加工过程中真菌污染,提高鱿鱼丝产品的质量,将传统的微生物鉴定技术与5.8S r DNA-ITS序列分析法相结合,并通过系统发育树分析,探索鱿鱼丝加工过程中真菌菌相变化规律及优势菌株。结果表明,在鱿鱼丝加工过程中,不同阶段样品中真菌数量差异显著(p<0.05),在加工终点(即烘干包装后)时真菌数量高达2.61 log cfu/g,其中调味和烘干包装阶段是真菌污染的主要环节。加工终点的鱿鱼丝中分离出6种酵母菌和4种霉菌,经测序并通过National Center for Biotechnology Information(NCBI)数据库比对,确定它们分别属于假丝酵母属(Candida sp.)、隐球酵母属(Cryptococcus sp.)、座囊菌属(Dothideomycetes sp.)、胶红酵母属(Rhodotorula sp.)、丝孢酵母属(Trichosporon sp.)、茎点霉属(Phoma sp.)、青霉属(Penicillium sp.)、曲霉属(Aspergillus sp.)、枝孢霉属(Cladosporium sp.)。其中,青霉菌(M-03)和假丝酵母菌(Y-04)为鱿鱼丝加工过程中的优势菌,在加工终点时的数量分别为1.85 log cfu/g和2.15 log cfu/g。 展开更多
关键词 鱿鱼丝 真菌 发育树 5.8s rdna-its 聚合酶链式反应(PCR)
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