广西两地旋毛虫分离株5SrDNA序列分析

目的应用5SrDNA序列分析,鉴定广西德保、南丹两地旋毛虫分离株。方法PCR扩增2个分离株5SrDNA片段,并对扩增产物进行测序;用相关软件分析序列的同源性、遗传距离,同时构建系统发生树,并与GenBank中旋毛虫相应基因序列进行比较。结果广西德保、南丹2地旋毛虫分离株和GenBank中Trichinella spiralis的5SrDNA碱基序列长度相同,为695bp;变异位点4个,与T.spiralis的相似度分别为99.0%和99.1%,与GenBank中其他相应基因的相似度低于94.2%,2个分离株之间的相似度为98.8%。2个分离株之间及与T.spiralis间的遗传距离最小,均为0.014;而与其他旋毛虫的遗传距离均大于0.056;用邻接法(N-J法)和最大简约法(MP法)构建的2个系统发生树中,2个分离株与T.spiralis位于同一分支,自引导值分别为96及99。结论初步鉴定广西德保和南丹旋毛虫分离株均为T.spiralis。