猪ADAR1基因cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析

旨在克隆猪作用于RNA的腺苷脱氨酶1基因(ADAR1)cDNA全长序列,检测该基因在大白猪不同组织及不同日龄背膘中的表达情况。本研究利用RACE(rapid-amplification of cDNA ends)克隆大白猪ADAR1基因mRNA全长序列,并对其进行生物信息学分析;采用荧光定量PCR方法检测ADAR1在不同组织中的表达水平,并探究不同日龄背膘中ADAR1的表达规律。结果表明,猪ADAR1基因cDNA全长6259bp,编码1145个氨基酸,与人、黑猩猩、猕猴、长臂猿、黄牛、山羊和绵羊的氨基酸序列一致性均不低于85%。该基因编码的蛋白具有2个Zα结合结构域,3个双链RNA结合结构域和1个脱氨酶结构域。ADAR1在心、肝、脾、肺、肾、脑、肌肉、小肠和背部脂肪组织以及7、60、120和180日龄个体背膘组织中均表达,其表达量总体上表现出随个体发育先下降后上升的趋势。综上所述,本研究成功克隆了猪ADAR1基因cDNA全长序列,发现其在猪体内广泛表达,并且在不同日龄猪背膘组织中表达水平存在差异,为今后深入研究ADAR1的功能奠定了理论基础。

肺泡巨噬细胞ADAR1基因在急性肺损伤中表达的变化

目的:观察肺泡巨噬细胞(alveolar macrophag-es,AMs)RNA腺苷脱氨酶1(adenosine deaminase act-ing on RNA,ADAR1)基因(ADAR1基因)在急性肺损伤中的变化,探讨该基因在急性肺损伤病理变化中可能发挥的作用。方法:采用气管内滴注脂多糖(li-popolysaccharides,LPS)的方法制备急性肺损伤模型,经瑞氏染色计数急性肺损伤大鼠肺泡灌洗液中AMs、中性粒细胞(polymorphonuclear leukocytes,PMNs)并计算各自所占比例;以RT-PCR方法观察ADAR1基因在急性肺损伤中表达的变化。结果:气管内滴注脂多糖(2.5 mg.kg-1)成功制备的急性肺损伤模型中,肺泡灌洗液中细胞总数随时间变化而变化,由对照组的1.74×106增加至炎症反应6 h时17.13×106,9 h时17.00×106。AMs所占细胞总数的比例则由98%下降为21%,而其绝对数量随时间的推移不断的上升,尤其以6 h和9 h为著。ADAR1基因在急性肺损伤肺泡巨噬细胞中呈现时间依赖性的升高。结论:内毒素诱导的急性肺损伤模型中,AMs绝对数量显著上升,且其中ADAR1基因表达呈时间依赖性的升高,提示ADAR1基因可能在急性肺损伤发病过程及病理发展中发挥了重要的作用。

遗传性对称性色素异常症家系中ADAR1基因的遗传分析

目的研究一个遗传性对称性色素异常症家系的致病基因。方法采用聚合酶链反应(PCR)后酶切测序的方法鉴定ADAR1基因是否存在变异。结果在先证者及其2个患病的儿子中同时检测到了ADAR1基因在编码区发现变异C.1105insA杂合改变,导致其编码的蛋白提前终止T369fsX374。结论 ADAR基因T369fsX变异导致了遗传性对称性色素异常症的发生。

一例散发遗传性对称性色素异常症ADAR1基因新突变

目的:对1例散发遗传性对称性色素异常症患者ADAR1基因中可能存在的突变进行检测。方法:提取1例散发遗传性对称性色素异常症患者及其正常双亲和另外100份无亲缘关系正常人外周血DNA,采用聚合酶链反应方法扩增ADAR1基因的全部外显子及内含子侧翼序列并利用Sanger测序技术进行序列鉴定。结果:患者ADAR1基因检测到第2号外显子存在一个新发的无义突变,即c.1162G>T,第388位密码子翻译终止,(P.E388X),导致该基因翻译的蛋白截短。其正常双亲及无亲缘关系对照外周血中均未发现此突变。结论:ADAR1基因c.1162G>T突变可能与该例患者DSH发病有关,为国内外首次报道。

遗传性对称性色素异常症家系的ADAR1基因突变

目的检测一个遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因是否存在突变,并分析其基因型与表现型的关系。方法进行遗传性对称性色素异常症患者家系调查,并收集其家系7名成员及100例无血缘关系正常人的外周血标本,提取DNA,应用PCR扩增ADAR1基因的全部15个外显子并进行测序。结果该家系7名成员中有5名成员存在ADAR1基因2号外显子c.1096-1097delAA缺失突变,先证者的母亲为纯合缺失突变,先证者及其妹妹、舅舅、外甥为杂合缺失突变,其中4例有不同程度的遗传性对称性色素异常症临床表现,先证者的妹妹没有任何的遗传性对称性色素异常症临床表现。结论在我国的遗传性对称性色素异常症家系中首次发现ADAR1基因c.1096-1097delAA缺失突变。

遗传性对称性色素异常症两家系ADAR1基因新突变

目的:检测遗传性对称性色素异常症(DSH)2个家系ADAR1基因的突变。方法:收集DSH 2个家系患者的外周血标本,采用PCR结合DNA直接测序的方法,检测了2个家系成员中共5例患者、5例表型正常者和50例无亲缘关系健康个体ADAR1基因突变情况。结果:家系Ⅰ中患者ADAR1基因12号外显子第3159位碱基G缺失,即c.3159delG,导致一新的移码突变p.L1053fs→1076X;家系Ⅱ中患者ADAR1基因13号外显子第3209位和第3210位碱基之间插入1个碱基C(c.3209insC),导致又一新的移码突变p.L1070fs→1092X,而在2个家系中正常人及50例无亲缘关系的健康个体均未发现相应突变。结论:2个家系DSH患者均存在ADAR1基因新的移码突变,可能由此引起编码蛋白的结构和功能的改变,致皮肤色素异常。

遗传性对称性色素异常症一家系ADAR1基因突变检测

目的:检测1例中国汉族遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因突变情况。方法:收集该家系内的2例患者及2名表型正常者的临床资料和血样,提取外周血基因组DNA,PCR扩增后进行DNA测序。结果:该家系2例患者均存在ADAR1基因第13号外显子c.3232C>T突变(p.R1078C),而在该家系内表型正常的个体以及100名正常对照中均未发现该突变。结论:该DSH家系内ADAR1基因c.3232C>T突变可能与DSH发病有关。

遗传性对称性色素异常症ADAR1基因剪切突变一例

目的:检测一例遗传性对称性色素异常症散发病例ADAR1基因突变。方法:提取患者及100名健康对照外周血DNA,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增ADAR1基因的全部外显子并测序。结果:该患者ADAR1基因11号外显子与11号内含子交界处检测到一新的c.3091+1G>T剪切突变,家族成员及100例无关正常人中未发现突变。应用Mutation Taster进行剪切突变蛋白功能预测分析,提示该突变为致病剪切突变,可能导致编码蛋白的催化结构域丢失。结论:本例患者检测到一个ADAR1基因新的突变位点,丰富了突变谱。

遗传性对称性色素异常症2例基因诊断

目的:鉴定1例遗传性对称性色素异常症(dyschromatosis symmetrica hereditaria,DSH)患者ADAR1(adenosine deaminase acting on RNA1)基因突变,并对该家系中一临床不典型病例进行基因诊断。方法:采集1例DSH患者及家族成员的外周血,应用直接测序的方法检测突变位点。结果:在患者10号内含子区域检测到1个剪接位点突变(c.2886-5T>C)。另外,对该家系中临床表现不典型的患者,基因测序结果支持该病的诊断。结论:该研究检测到1例新的剪接位点突变,异常剪接方式为外显子的删除。并明确了该家系中临床不典型患者的诊断,在Wood灯下进一步确定了其临床表型。

遗传性对称性色素异常症6个新的致病基因突变研究

目的:检测遗传性对称性色素异常症家系中ADAR1基因的突变。方法:收集遗传性对称性色素异常症8个家系成员及1个散发病例共31例患者及12例非患者的血样,应用PCR和直接测序法对其进行ADAR1基因检测。结果:在8个家系的患者和一个散发病例中,检测到7个不同的ADAR1基因突变位点,包括4个错义突变(p.K1105N,p.G1047A,p.F1099L,p.G1068R)、2个移码突变(p.Q779fs-792x,p.P441fs-463x)、1个无义突变(p.R1096x)。结论:在检测到的7个突变位点中,其中6个突变位点为首次报道。另有两个家系未发现突变位点。

遗传性对称性色素异常症一家系A-DAR1基因新突变

目的:确定一遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因的突变位点。方法:提取家系中2例患者、2名表型正常者及50名与本家系无关的正常对照外周血DNA,采用PCR技术扩增ADAR1基因所有编码区并进行测序。结果:该家系中2例患者均存在ADAR1基因错义突变(c.662C>T),导致p.P211R改变,家系中2名未患病的个体和50名健康对照均未发现上述突变。结论:ADAR1基因c.662C>T错义突变是导致该家系发生DSH的致病性突变,在国内外属首次报道。

遗传性对称性色素异常症

遗传性对称性色素异常症是一种较为罕见的常染色体显性遗传病,皮损表现为手足伸侧对称分布的色素沉着斑及色素减退斑。致病基因为位于1q21.3的ADAR1基因。本病发病机制不明,已有研究着重探索基因型与表型之间的关联以及影响疾病发生发展的调控因素。本病应与遗传性泛发性色素异常症、着色性干皮病、白癜风、北村网状肢端色素沉着症等疾病相鉴别。本病尚无特异性疗法,皮瓣移植、CO2点阵激光、308 nm准分子激光在个案报道中有效。

遗传性对称性色素异常症ADAR1基因两个新突变

目的检测遗传性对称性色素异常症（dyschromatosissymmetricahereditaria，DSH）1个家系和1例散发病例的ADAR1基因突变情况，探讨其发病的分子遗传学机制。方法收集1个DSH家系及1例散发病例的临床资料，提取患者及其正常家系成员外周血DNA，应用PCR反应扩增ADAR1基因的15个外显子编码区及其侧翼序列，通过PCR产物直接测序的方法进行ADAR1基因突变检测。结果在DSH家系患者ADAR1基因的第8外显子检测到c．2638delG（p．Asp880ThrfsX15）移码突变；而DSH散发病例ADAR1基因的第10外显子检测到c．2867C〉A（P．Ser956X）无义突变，经查阅国内外文献两个突变均为未报道过的新突变，100名正常对照未检测出上述两个位点突变。结论ADAR1基因c．2638delG（p．Asp880ThrfsX15）突变和c．2867C〉A（p．Ser956X）突变可能分别是DSH家系和散发病例发病的原因。

一个遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因的突变分析

目的检测一个中国汉族遗传性对称性色素异常症（dyschromatosis symmetrical hereditaria，DSH）家系患者ADAR1基因突变。方法收集家系成员的临床资料和血样，PCR扩增ADAR1基因所有编码区并进行测序，分别检测家系中2例患者和2名正常人的突变情况，并选取50名与本家系无关的正常人作为对照；同时检索文献中已报道的有关该病ADAR1基因的突变情况。结果该家系中2例患者均存在ADAR1基因错义突变（C．3463C〉T），导致P．R1155W改变，家另外2名未患病的家系成员和50名健康对照均未发现上述突变。检索文献发现，该位点突变导致该病的已有5个家系报道，这是目前发现突变位点最高的基因。结论ADAR1基因C．3463C〉T错义突变是导致该家系发生DSH的致病性突变，也是目前已知的该基因的热点突变位点。

遗传性对称性色素异常症一家系ADAR1基因突变检测

目的 检测1个遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因突变情况.方法 收集家系成员的临床资料和血样,应用PCR技术扩增ADAR1基因的所有编码区并测序,分别检测该家系中的3例患者及3名正常人的突变情况,并选取50名与本家系无关的正常人作对照.结果 该家系全部患者ADAR1基因第6外显子第2252位和第2253位碱基之间插入1个碱基G（c.2252insG）,碱基的插入造成移码突变,家系中的正常人和50名无血缘关系的正常人未检测到相同突变.结论 ADAR1基因c.2252insG突变可能是导致该家系发生遗传性对称性色素异常症的特异突变.

一个遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因R1155W突变研究

目的研究1个遗传性对称性色素异常症家系的ADAR1基因的突变。方法收集1个遗传性对称性色素异常症家系的血样，采用聚合酶链反应结合DNA直接测序的方法，检测了该家系中2例患者及2名表型正常者和50名无亲缘关系健康个体的ADARj基因突变情况。结果该家系中2例患者均存在ADAR1基因c．3463C〉T突变，导致p．R1155W改变，而在家系内非患者及正常对照者中均未发现该突变。结论本研究中遗传性对称性色素异常症家系中患者ADAR1基因存在错义突变，这可能是导致遗传性对称性色素异常症发病的分子机制之一。

RNA干扰下调ADAR1基因表达对肝癌细胞增殖能力的影响

目的观察RNA干扰下调ADAR1基因表达对肝癌细胞增殖能力的影响。方法用小分子干扰RNA（siRNA）转染肝癌细胞SMMC-7721，RT-PCR法检测ADAR1mRNA表达，Westernblotting法测定ADAR1蛋白，MTr比色法检测SMMC-7721细胞增殖。结果细胞转染24、48、72小时后，实验组ADAR1mRNA相对表达量分别为0．612±0．086、0．264±0．018、0．156±0．063，对照组分别为1．032±0．107、0．898±0．092、0．968±0．074，差异具有统计学意义（P〈0．05）；对照组与空白组ADAR1mRNA表达差异无统计学意义（P〉0．05）。实验组ADAR1蛋白相对表达量分别为0．684±0．079、0．324±0．042、0．145±0．058，对照组分别为1．002±0．092、0．917±0．068、0．972±0．073，差异均有统计学意义（P〈0．05）；对照组与空白组ADAR1mRNA表达差异无统计学意义（P〉0．05）。细胞转染后SMMC．7721细胞增殖活性明显下降（P〈0．05）。结论ADAR1基因特异性siRNA干扰后，ADAR1mRNA及蛋白相对表达水平显著下降，SMMC-7721细胞的增殖能力亦明显下降。

两个遗传性对称性色素沉着症家系的ADAR1基因变异分析

目的检测两个中国汉族遗传性对称性色素沉着症家系(dyschromatosis symmetrica hereditaria,DSH)ADAR1基因的变异位点。方法收集家系成员的临床资料和血样,应用PCR扩增结合Sanger测序法对两家系的先证者ADAR1的外显子进行基因变异分析,待疑似致病变异确定后,对其他家系成员进行相应位点的验证。同时选取100名与本家系无关的正常人作为对照。结果Sanger测序结果显示家系1先证者及先证者父亲ADAR1基因存在第11外显子c.3002G>C(p.Asp968His)杂合变异。家系2先证者及先证者儿子ADAR1基因存在第12外显子c.3145C>T(p.Gln1049Ter)杂合变异。检索文献发现,两种变异均为未报道过的新变异,100名健康对照均未发现上述变异。结论ADAR1基因c.3002G>C(p.Asp968His)和c.3145C>T(p.Gln1049Ter)变异可能分别为两个DSH家系的疑似致病变异。

HaCaT细胞ADAR1基因沉默对Wnt11表达和A375细胞酪氨酸酶活性的影响

目的探讨遗传性对称性色素异常症致病基因ADARl对Wntll表达和酪氨酸酶活性的影响。方法将HaCaT细胞等细胞数量分为对照组、实验1组、实验2组、实验3组。用3种针对ADARl基因的shRNA质粒分别沉默3个实验组中HaCaT细胞的ADARI基因，用Western印迹法检测4个组HaCaT细胞相关蛋白的表达水平。建立HacaT细胞与黑素瘤细胞A375共培养模型，对实验组（HacaT细胞中的ADARI和Wntll蛋白低表达）与对照组（HaCaT细胞中的ADARl和Wntll蛋白正常表达）的细胞形态和酪氨酸酶活性进行比较。结果蛋白印迹法发现，ADARl基因沉默的HaCaT细胞中的Wntll蛋白条带灰度值明显低于正常HaCaT细胞中的Wntll蛋白条带灰度值，证实HaCaT细胞中的ADARl基因沉默后，Wntll蛋白的表达水平明显下降。在共培养模型中，实验组HaCaT细胞与A375细胞连接处的树突状突起明显少于对照组，实验组A375细胞的酪氨酸酶活性与对照组相比显著降低，减去空白组A值后，实验组A值为0．0168±0．0069，对照组为0．0490±0．0132，P〈0．01。结论HaCaT细胞中ADARl基因沉默可降低Wntll的表达，并影响A375细胞酪氨酸酶活性。

一个遗传性对称性色素异常症家系ADAR1基因突变分析

目的 检测1个遗传性对称性色素异常症家系中ADAR1基因的突变位点。方法 提取一遗传性对称性色素异常症家系成员（5例患者，3例非患者）和100例无血缘关系的健康对照外周血标本，PCR扩增ADAR1基因全部15个外显子序列并测序，参考Genebank中ADAR1基因标准序列对比分析突变位点。结果 该家系5例患者ADAR1基因2号外显子第1 420位碱基C突变为T，为无义突变，即C.1420C 〉 T（p.Arg474X），家系其他健康成员和100例无关健康人中未发现此突变。结论 该遗传性对称性色素异常症家系的致病突变为ADAR1基因C.1420C 〉 T无义突变。