一种适合AFLP分析的柑橘DNA提取方法

目的:通过对传统用于AFLP分析的DNA提取方法进行改善调和整得到一种效率较高,DNA损失较少适合于柑橘AFLP分析的DNA提取方法。方法:利用改善后的方法提取了13份参试柑橘材料(无病虫害的鲜叶)的DNA基因组,后用0.8%琼脂糖进行电泳检测,并进行了AFLP试验。结论:结果分别得到了清晰的DNA模板检测图和AFLP指纹图谱,表明该方法提取的DNA无降解且较纯,其质量完全满足AFLP技术的要求,并且在提取效率,减少DNA损失等方面体现出了优势。

稻水象甲AFLP分析中基因组DNA提取方法的研究

为适宜AFLP分析的昆虫基因组DNA提取提供参考,应用SDS法和异硫氰酸胍法对鞘翅目昆虫稻水象甲的无水乙醇浸泡标本进行基因组DNA提取,并对两种方法进行比较。结果表明,异硫氰酸胍法提取的基因组DNA浓度高、纯度好,电泳带型清晰完整,适合于稻水象甲AFLP分子标记研究。

2种方法银染的AFLP片段再扩增效果比较及改进

Bassam银染法和Sanguinetti银染法是AFLP标记最常用的检测方法。本研究比较这2种方法银染的AFLP条带再扩增效果的差异,发现Bassam法银染的AFLP片段再扩增效率达到100%,而用同样的PCR条件,Sanguinetti法银染的AFLP片段不能被扩增,限制了Sanguinetti法在AFLP标记分析中的应用。为提高Sanguinetti法银染的AFLP片段再扩增效率,对Sanguinetti法银染的AFLP片段回收和再扩增条件进行了改进。通过增加Sanguinetti法显色后的胶板漂洗次数、延长漂洗时间、改变AFLP条带浸泡溶液、增加浸泡液体积和增加PCR循环次数,成功地将Sanguinetti法银染的AFLP条带的再扩增效率提高到100%,从而解决了San-guinetti银染法应用的限制因素。

割手密AFLP分子标记技术体系建立与优化

【目的】建立和优化割手密AFLP分子标记技术体系,为割手密遗传多样性分析、遗传图谱构建提供技术支持。【方法】以广西割手密GXS87-16、GXS85-30、GXS79-9、GXS96、GXS112、GXS212为材料,利用改良SDS法提取DNA,并用EcoRⅠ和MseⅠ酶切,连接接头后,采用正交试验设计对影响预扩增反应和选择性扩增反应的主要成分如Mg2+、模板DNA、引物、dNTP、Taq聚合酶浓度进行优化。【结果】样品DNA用限制性内切酶EcoRⅠ和MseⅠ各3U于PCR仪过夜可完全酶切。经正交设计优化,较佳的预扩增体系包含0.4μLdNTPs(20mmol/mL),1.6μLMg2+(25mmol/mL),2.0μLEcoRⅠ-P(5pmol/mL),2.0μLMseⅠ-P(5pmol/mL),1UTaq酶(1U/μL),DNA模板稀释10倍;选择性扩增体系包含0.4μLdNTPs(20mmol/mL),0.8μLMg2+(25mmol/mL),1.0μLEcoRⅠ-AAG(6pmol/mL),1.0μLMseⅠ-CAG(6pmol/mL),3UTaq酶(1U/μL),DNA模板稀释20倍。以对优化反应体系扩增获得的PCR产物用5%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染后,可获得清晰的多态性指纹图谱。【结论】建立的割手密AFLP分子标记技术体系具有扩增条带清晰、多态性丰富的特点,可为构建割手密高密度遗传图谱提供技术支持。

一种简易的cDNA-AFLP分析方法

cDNA -AFLP结合了RFLP和RT- PCR的优点,在无需了解序列信息的同时,集中显示基因组表达序列的多态性差异,灵敏性高,重复性好。但实验室开展常规的cDNA- AFLP研究需要昂贵的设备和大量的投入。本试验改用小面积变性聚丙烯胺凝胶电泳检测扩增产物,银染显带法来完成cDNA- AFLP的全套技术体系,使cDNA -AFLP分析方法更为简便、经济并减少污染。

适于AFLP分析的盾叶薯蓣DNA的提取方法

用传统CTAB法和改良CTAB法提取盾叶薯蓣样品的基因组DNA。结果表明:传统CTAB法与改良CTAB法提取的基因组DNA完整性都比较好,但传统CTAB法获得的DNA含有较多杂质,不能被限制性内切酶消化,改良CTAB法提取的基因组DNA杂质去除彻底,条带清晰,可以完全酶切,并能获得清晰的预扩增图谱和有丰富条带稳定的AFLP指纹,完全适合于盾叶薯蓣分子标记鉴定所需。

运用cDNA-AFLP技术初步鉴定两种方法合成的cDNA的指纹图谱

在植物基因克隆以及构建cDNA文库时,都需要合成高质量的双链cDNA,并要达到一定的数量。然而研究者经常受到试验样品量的限制。特别是比较稀少的植物材料,例如植物的根尖、茎尖或花的雌、雄蕊等,难以获得足够的RNA,以致影响cDNA的合成量,无法开展下游的实验。以PCR为基础合成第二链cD-NA的Smart技术(LD-PCR),能够以50ng的总RNA为反转录模板合成高质量的双链cDNA。但研究者对第二链采用PCR方法是否有些基因信息丢失或丰度上发生很大的变化存有疑虑。针对以上存在的问题,通过置换合成和长距离PCR(LD-PCR)两种方法合成3个月的梭梭幼苗茎尖双链cDNA,EcoRI和MseI限制性内切酶双酶切后,用16对选择性扩增引物对两种cDNA进行cDNA-AFLP的指纹图谱分析。结果表明,置换合成和LD-PCR两种方法合成的cDNA指纹图谱中,分别有条带约495条和470条。其中,相同的条带共计433条,不同的条带分别有62条和37条,分别为各自合成方法总指纹数的12.5%和7.87%,相同的指纹信息达87%以上。这说明两种方法合成的cDNA存在着较大的差异,合成方法对cDNA合成质量的影响较大,为研究人员选用何种cDNA合成方法提供了借鉴。

新疆地方绵羊遗传多样性AFLP检测方法的建立

研究以新疆地方绵羊为试验材料,为建立适合绵羊AFLP多态性分析体系,对其分析过程中DNA提取、酶切连接扩增、电泳及银染效果等相关环节进行了一定改进和检测。本试验通过筛选出的8对引物组合分析了新疆6个地方绵羊的遗传多样性。结果表明经优化后的AFLP体系条带清晰可辨,扩增信号较强,带型稳定,AFLP适合绵羊遗传多样性分析。

资源昆虫角倍蚜遗传多样性及遗传分化的AFLP分析

本研究采用AFLP分子标记技术对资源昆虫角倍蚜Schlechtendalia chinensis6个种群共102个个体的样本进行遗传多样性分析,探讨角倍蚜主要分布区不同种群之间的遗传分化及其变异程度,为合理利用和保护该经济昆虫提供分子方面的证据。结果表明:经过摸索实验筛选出的4对选择性扩增引物共扩增条带126条,多态性条带比例为100%,种群多态性位点比例介于23.81%～66.67%之间;Nei’s基因多样性指数介于0.0942～0.1980之间;Shannon’s多样性数介于0.1381～0.3027之间;AMOVA分析显示57.99%的变异来源于种群内,42.41%的变异来源于种群间(P<0.01);总群体的Fst值为0.4242;NJ聚类树显示角倍蚜6个种群共形成两个大的聚类簇,阳雀、丹寨和汉中种群聚为一支,安县、竹山和龙胜3个种群聚为另一支。总体上,角倍蚜种内的遗传多样性较低,而种群间的遗传分化较大,遗传距离与地理距离之间没有显著的相关关系(P>0.05)。

盐肤木基因组DNA提取方法改进及AFLP体系的建立

经过反复试验,摸索出一种提取高质量植物基因组DNA的方法:改良的4×CTAB法。以盐肤木叶片为实验材料,提取到高质量的基因组DNA,建立了酶切、连接、预扩增、选择性扩增的AFLP反应体系。通过两种引物组合"E+3/M+3"和"E+2/M+3"策略筛选出8对条带分辨率高、多态性好的引物组合,优化了盐肤木的AFLP银染反应体系,得到了清晰的AFLP指纹图谱,为盐肤木种群遗传多样性研究奠定了基础。

玉米抗甘蔗花叶病毒SCAR分子标记开发

【目的】玉米矮花叶病(由甘蔗花叶病毒引起)是中国和欧洲玉米产区的重要病害,开展分子标记辅助育种可以明显提高抗病育种效率。【方法】本文采用改进的BSA法(bulked segregant analysis,BSA)构建玉米抗感自交系DNA池,结合AFLP技术筛选多态性标记,转化后获得实用性强的SCAR标记,并借助100份自交系抗性鉴定结果对SCAR标记进行相关验证。【结果】获得了2个多态性稳定的AFLP标记P66M38-220和P55M51-240,其中将P66M38-220转化为SCAR112标记,此标记与甘蔗花叶病毒抗性高度相关。【结论】改良BSA法是一种发掘性状基因紧密连锁标记的有效方法;开发的SCAR112标记可以用于玉米抗甘蔗花叶病毒的分子标记辅助选择。

提取板栗DNA的CTAB法和SDS法的比较

分别采用十六烷基三乙基溴化铵(CTAB)法和十二烷基磺酸钠(SDS)法提取板栗(Castanea mollis-sima BL.)基因组DNA,取适量DNA进行琼脂糖凝胶电泳,并利用紫外可见分光光度计测定所提取的DNA在260和280 nm的吸光度及其比值,利用Eco RⅠ和MseⅠ双酶切后进行随机扩增长度多态性(AFLP)分析。结果表明,两种方法均能从板栗中提取出一定质量的、比较完整的、纯度比较高的DNA,SDS法提取的板栗DNA的纯度更高、质量更好。

不同种质荔枝基因组DNA提取研究

针对荔枝体细胞富含多酚、多糖、色素以及蛋白质等次生物质的特点,以荔枝叶片为材料,分别采用CTAB法和SDS法对荔枝野生、半野生和栽培种质的基因组DNA进行提取。结果表明,SDS法提取的荔枝基因组DNA效果稳定,获得DNA的机率为100%,DNA纯度高、质量好,可用于AFLP酶切、连接、预扩增和选择性扩增,并获得清晰、稳定的扩增产物;CTAB法提取的荔枝基因组DNA效果不稳定,DNA浓度较低,易出现多糖等次生物质与DNA共沉淀现象,无法检测出DNA。因此,SDS法可用于不同荔枝种质基因组DNA的提取,进行AFLP、SSR、ISSR分析。

妊娠期急性脂肪肝诊治中的科学思维应用

现代科学思维方法中系统思维及模糊思维方法具有普遍适用意义。妊娠期急性脂肪肝临床上极为罕见,并发症多,病死率极高,1例并发腹部卒中的妊娠期急性脂肪肝患者通过科学诊疗转危为安,及时终止妊娠、对症处理、多学科协作联合治疗,积极预防并发症是确保救治成功的关键。本文尝试介绍科学思维方法在该病诊疗中的一些体会。