基于HRM技术开发水稻糊化温度基因ALK功能标记

【目的】糊化温度是影响稻米蒸煮食味品质的重要指标,ALK是控制水稻糊化温度的主效基因,开发可快速高通量鉴定ALK基因型的功能标记有助于提高水稻品质改良的效率。【方法】根据ALK基因4198位、4329位和4330位存在的单碱基差异,设计基于HRM技术检测的基因功能标记。【结果】通过PCR检测结合测序分析,筛选了ALK基因2个功能区域的功能标记ALKH4、ALKH5。利用ALKH4、ALKH5对81份籼稻品种、279份粳稻品种进行了ALK基因型检测,结果发现,16份粳稻和19份籼稻为G-GC基因型;51份粳稻为A-GC基因型;212份粳稻和62份籼稻为G-TT基因型。【结论】基于HRM技术开发的基因功能标记ALKH4、ALKH5可以快速高通量鉴定控制糊化温度ALK不同基因型,具有重要的应用价值。

伴ALK基因融合的婴儿型半球胶质瘤2例临床病理观察

目的 探讨中枢神经系统伴ALK基因融合的婴儿型半球胶质瘤(infant-type hemispheric glioma, IHG)临床病理学、分子学特征、治疗与预后。方法 收集2例IHG的临床资料,采用免疫组化检测GFAP、Olig2、Syn、NeuN、H3K27M、H3K27me3、H3G34V、H3G34R、ALK和BRAF等表达,应用FISH和NGS法检测ALK融合基因,并复习相关文献。结果 例1,男性,15个月,头颅MRI示左侧额颞叶巨大占位。例2(外院会诊病例),男性,18个月,发现额颞叶占位。镜检:例1肿瘤细胞呈弥漫片状分布,部分区域排列呈小结节状,被纤维血管分隔,细胞密度高,细胞核呈圆形、卵圆形,核分裂象易见,伴出血、坏死。例2,肿瘤细胞弥漫分布,部分围绕血管形成假菊形团,部分呈束状排列,细胞轻-中度异型,核圆形、卵圆形,淡染,有小核仁,核分裂象罕见,未见微血管增生和坏死。免疫表型:例1肿瘤细胞GFAP、NeuN局灶阳性,H3K27me3、ALK(细胞质、细胞膜)和ATRX均弥漫阳性,p53部分阳性(30%),Olig2、Syn、H3K27M、H3G34V、H3G34R和BRAF均阴性,Ki67增殖指数20%。例2肿瘤细胞GFAP、ATRX、H3K27me3、ALK(细胞质、细胞膜)和Olig2均弥漫阳性,Syn局灶弱阳性,NeuN、p53均阴性,Ki67增殖指数5%。FISH、NGS检测显示2例均有ALK基因融合,例1为EML4∷ALK融合,例2为LRRFIP1∷ALK融合。随访7个月,例1残余病灶缩小,一般情况良好;例2失访。结论 IHG组织学多表现为高级别胶质瘤或伴间变特征,ALK变异型的异质性较高,也可表现为低级别胶质瘤形态,需与其他高级别胶质瘤、婴儿促纤维增生型节细胞胶质瘤/星形细胞瘤、室管膜瘤等鉴别。

貌似结核性脑膜炎的系统型ALK阴性间变性大细胞淋巴瘤临床分析

目的报道1例首发症状表现为脑膜炎的系统型间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)的诊治经过,以加深对该类疾病的认识。方法分析1例表现为发热、头痛、颅压升高,曾疑诊为结核性脑膜炎的系统型淋巴瘤激酶(ALK)阴性系统型ALCL患者的临床表现与诊治经过。结果本例患者38岁男性,以头痛、持续颅内压升高为突出表现,同时伴有发热、体质量下降、淋巴结增大等全身症状、脑脊液白细胞数量和蛋白含量增高、葡萄糖下降,给予抗病毒、抗结核治疗后病情仍反复,最终通过颈部淋巴结活检,诊断为系统型ALK阴性ALCL。结论系统型ALK阴性ALCL以脑部病变为首发症状者误诊率高,对于不符合常见神经系统疾病病程和转归特点,伴有发热、体质量下降、淋巴结肿大者,应考虑到淋巴瘤可能,积极行病理检查,争取早期诊断,改善患者预后。

ALK阳性组织细胞增生症5例的临床病理分析及文献复习

目的探讨ALK阳性组织细胞增生症临床病理特征。方法总结5例ALK阳性组织细胞增生症的临床、形态和免疫组化结果,并随访。结果男性2例,女性3例。年龄2个月到21岁。病程2周到5个月。症状主要①感觉和活动受限,皮肤结节,血小板和血红蛋白减少等。②低倍见小淋巴细胞及淡染组织细胞。高倍组织细胞呈卵圆形细胞核、嗜碱性核仁和嗜酸性胞质。可见侵入表皮现象。3例可见坏死。③免疫组化CD68、CD163和ALK阳性。④随访4~26个月,平均随访15.4个月。所有病例均显示ALK基因异常,包括4例KIF5B-ALK融合和1例CLTC-ALK融合。结论ALK阳性组织细胞增生症具有独特的临床和组织形态学谱系,综合形态、免疫组化和分子检测有助于准确诊断和治疗后评估。

ALKBH5和FTO在系统性红斑狼疮外周血中的表达和临床意义

目的探讨N6-甲基腺苷化修饰(m6A)调节因子“擦除基因”去甲基化酶Alk B同源蛋白5(ALKBH5)与脂肪含量和肥胖相关蛋白(FTO)在系统性红斑狼疮(SLE)和类风湿关节炎(RA)患者外周血的表达水平。方法采集SLE、RA患者和健康对照(HC)组外周血2 mL,提取RNA,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测各组FTO和ALKBH5的信使RNA(mRNA)表达水平,收集各组临床实验室数据,分析两者相关性。3组间比较采用单因素方差分析或非参数检验,采用Pearson相关分析FTO和ALKBH5的mRNA表达水平和血液学变量之间的关系。结果SLE患者ALKBH5的mRNA表达水平显著低于HC组和RA组,SLE患者FTO的mRNA表达水平显著低于HC组,和RA组无显著差异。联合ALKBH5和FTO诊断SLE的曲线下面积(AUC)高达0.934(95%CI:0.868~0.979),敏感度和特异度分别为92.16%和86.84%。SLE患者中的ALKBH5 mRNA水平与抗dsDNA、抗核小体水平相关。多因素Logistic回归分析显示,外周血ALKBH5 mRNA水平是SLE发病的危险因素(P<0.001)。结论本研究提示,外周血ALKBH5和FTO可能与SLE的发病有关,是SLE筛查、诊断的潜在生物标志物。

Ventana-D5F3免疫组化和NGS检测肺腺癌ALK阳性比较

Ventana-D5F3免疫组化(IHC)和二代测序技术(NGS)在ALK阳性检测上具有较高的一致性,在临床应用中可以采用IHC进行肺腺癌ALK阳性患者的筛查,而NGS精准检测可以作为有效的补充。在检测方法选择时,需要考虑样本类型、肿瘤细胞比例、检测靶标对检测方法的限制。

ALK基因易位相关性肾细胞癌的临床病理学特征及文献复习

ALK基因易位相关性肾细胞癌(anaplastic lymphoma kinase-translocation renal cell carcinoma,ALK-tRCC)一种罕见的肾脏上皮性肿瘤,约占肾细胞癌的0.3%[1]。本研究报道1例具有多形性组织学形态的ALK-tRCC,极易漏诊或误诊,现总结分析其临床病理特点、免疫表型。

考虑平抑风光波动的ALK-PEM电解制氢系统容量优化模型

为提高风光资源的利用率,电解水制氢受到了广泛关注,但氢能在生产过程中易受到风光波动性的影响。由此,提出考虑平抑风光波动的碱性-质子交换膜(alkaline-proton exchange membrane,ALK-PEM)电解制氢系统容量优化模型。首先,为降低风光瞬时功率波动对电解制氢系统安全稳定运行的影响,采用EMD算法分析原始风电和光伏功率的瞬时波动特性,并经超级电容(supercapacitor,SC)进行平抑,构建了基于EMD的SC容量配置模型。其次,考虑不同电解槽运行特性因素,将质子交换膜(proton exchange membrane,PEM)电解槽和碱性(alkaline,ALK)电解槽相组合替代单类型电解槽的制氢系统,提出了ALK-PEM电解制氢系统容量优化模型,以提高制氢系统经济效益。最后,以某风电场和光伏电站数据为例,通过仿真计算得到系统的容量规划结果,验证所提模型在平抑波动和提高可再生能源利用率方面的有效性,并提高了制氢系统的经济性。

卡瑞利珠单抗联合培美曲塞和奈达铂治疗EGFR/ALK野生型晚期非鳞状NSCLC的临床观察

目的观察卡瑞利珠单抗联合培美曲塞和奈达铂治疗表皮生长因子受体(EGFR)和间变性淋巴瘤激酶(ALK)野生型晚期非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)的疗效和安全性。方法回顾性收集2021年8月至2023年5月于重庆医科大学附属第一医院就诊的92例EGFR/ALK野生型晚期非鳞状NSCLC患者资料,根据治疗方案的不同分为奈达铂组(46例)和卡铂组(46例)。奈达铂组患者给予注射用卡瑞利珠单抗+注射用奈达铂+注射用培美曲塞二钠;卡铂组患者给予注射用卡瑞利珠单抗+卡铂注射液+注射用培美曲塞二钠。两组均以21 d为1个周期,所有患者至少完成2个周期的治疗。观察两组患者的近期疗效和不良反应发生情况,分析影响患者无进展生存期(PFS)的因素。结果两组患者的客观缓解率、疾病控制率、中位PFS、3~5级治疗相关不良事件(TRAE)发生率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。奈达铂组患者的1~2级肾脏和泌尿系统TRAE、心慌、心包积液发生率均显著低于卡铂,恶心、呕吐和食欲降低发生率显著高于卡铂组(P<0.05)。患者的性别、年龄、有无吸烟史、美国东部肿瘤协作组织评分和TNM分期均不是影响患者PFS的因素(P>0.05)。结论卡瑞利珠单抗联合培美曲塞和奈达铂治疗EGFR/ALK野生型晚期非鳞状NSCLC的疗效显著,安全性较好。

原发性骨髓纤维化合并ALK阴性的间变性大细胞淋巴瘤1例及文献复习

原发性骨髓纤维化(primary myelofibrosis, PMF)其特征是造血干/祖细胞来源的克隆性骨髓增殖,是一种弥漫性骨髓纤维组织增生性疾病。临床症状多样化,常包括体质性症状(发热、乏力、骨痛及盗汗等)、贫血及脾大、髓外造血等。好发于中老年人,发病率约为0.3~0.6/10万[1]。

AlkB同源蛋白5去除前mRNA加工因子6的mRNA甲基化修饰调控肝细胞癌的细胞增殖

目的探讨AlkB同源蛋白5(AlkBhomolog5,ALKBH5)在肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)的细胞增殖中的作用。方法通过癌症基因组图谱数据库分析ALKBH5和前mRNA加工因子6(pre-mRNA processing factor 6,PRPF6)在HCC组织中的表达水平。采用实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法检测ALKBH5和PRPF6在HCC细胞系(Huh7和Hep3B)中的mRNA和蛋白表达水平。荧光原位杂交确定ALKBH5和PRPF6在HCC细胞系(Huh7和Hep3B)中的亚细胞定位。在免疫沉淀复合物中检测PRPF6的N6-甲基腺苷甲基化水平。通过过表达和敲低基因表达的方法,将Huh7细胞和Hep3B细胞分别进行转染,分组为sh-NC组(阴性对照转染细胞)、sh-ALKBH5实验组(ALKBH5干扰序列转染细胞)、sh-ALKBH5+ex-PRPF6实验组(ALKBH5干扰序列转染+PRPF6 pcDNA 3.1过表达质粒转染细胞),并采用CCK-8和染色增殖试验检测各组细胞的增殖情况。裸鼠异种移植瘤实验验证ALKBH5和PRPF6在体内的生物学功能。蛋白质印迹法检测各组细胞中AKT/mTOR通路相关蛋白的表达水平。结果HCC细胞中ALKBH5的表达上调,可以去除PRPF6的甲基化修饰。体外和体内实验结果显示,ALKBH5可通过调节PRPF6的表达参与HCC细胞的恶性增殖。此外,敲低ALKBH5会抑制丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine-threonine kinase,AKT)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)的磷酸化,而PRPF6的过表达则有助于AKT和mTOR的磷酸化。结论ALKBH5能促进HCC细胞的增殖,相关机制是通过ALKBH5/PRPF6/AKT/mTOR轴实现的。

ALK阳性组织细胞增生症5例临床病理特征研究

目的探究间变性淋巴瘤激酶(ALK)阳性组织细胞增生症患者的临床病理特征。方法收集5例ALK阳性组织细胞增生症患者的临床病历资料和病理组织。所有组织均经常规苏木精-伊红染色观察组织病理学特征;采用EnVision免疫组化法检测ALK蛋白表达水平;采用荧光原位杂交(FISH)法及二代测序(NGS)法检测ALK基因突变情况。结果5例中,成人3例,儿童2例;女性4例,男性1例。1例肿瘤细胞呈梭形细胞样,1例呈泡沫样组织细胞样,另外3例呈上皮样、组织细胞样。所有病例均强表达组织细胞标志CD163、CD68及ALK蛋白。5例均有ALK基因易位,均为KIF5B-ALK融合基因。结论5例ALK阳性组织细胞增生症的组织学形态谱系涵盖上皮样、泡沫样组织细胞及梭形细胞形态,均强表达组织细胞学标志CD163、CD68及ALK蛋白,均检测到ALK基因断裂,且均为KIF5B-ALK融合基因。

系统性ALK阴性间变性大细胞淋巴瘤的病理诊断

目的探讨系统性ALK阴性间变性大细胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma,ALCL)的临床病理特点、分子特征、治疗和预后。方法回顾性分析18例系统性ALK^(-)ALCL的临床病理特征、免疫表型特点,行HE、免疫组化染色、FISH和NGS检测,并复习相关文献。结果系统性ALK^(-)ALCL好发于老年男性,常位于进展期,以淋巴结病变为主,结外原发部位包括原发胰腺、原发胸椎;形态学显示17例呈普通型,1例呈“霍奇金样”型。免疫表型:肿瘤细胞中CD30均弥漫强阳性(>75%),CD2(16/17)、CD3(13/18)、CD5(4/18)、CD7(8/18)、CD4(14/18)、TIA-1(16/18)、CD8(2/16)、GATA-3(10/12)、EMA(3/5)、MUM1(12/12)、CD43(6/6)和CD56(2/8)不同程度阳性,Ki67增殖指数30%~90%,PD-L1(22C3)(TPS=0~100%),ALK、CD15、CD79α和CD20均阴性;FISH检测:5例TP63缺失,2例DUSP22缺失。NGS检测:16例发生基因突变,基因突变频率0~11个,平均4.2个基因突变;伴TP63重排的ALK^(-)ALCL更易发生于女性,多发于淋巴结,临床分期晚,易伴p53基因异常。结论伴TP63重排的系统性ALK^(-)ALCL与诸多不良因素相关,临床过程多呈侵袭性,预后不佳。

基于FAERS数据库对ALK抑制剂相关眼部不良事件信号的挖掘与分析

目的挖掘并分析不同间变性淋巴瘤激酶(ALK)抑制剂相关的眼部不良事件(ADE),为临床安全用药提供参考。方法下载美国食品药品管理局不良事件报告系统(FAERS)数据库2011年第3季度至2024年第1季度数据,提取ALK抑制剂相关眼部ADE报告,采用报告比值比(ROR)法和信息成分(IC)法进行信号检测。统计眼部ADE的中位发生时间,并使用Weibull分布分析ALK抑制剂使用与眼部ADE发生的时间间隔关系。结果共收集到ALK抑制剂相关眼部ADE报告1575份,其中克唑替尼、塞瑞替尼、阿来替尼、布格替尼和洛拉替尼相关眼部ADE报告分别为1107、50、158、110、150份。女性患者占比更高(46.29%),年龄主要分布在18~<65岁(35.17%)。塞瑞替尼未检测到风险信号,克唑替尼、阿来替尼、布格替尼和洛拉替尼共检出13个阳性信号,克唑替尼致眼部ADE报告数量和阳性信号数位列第一,克唑替尼致闪光幻觉的信号强度最高[ROR=43.46,95%CI(36.38,51.91);IC=5.18,95%CI(4.89,5.40)]。大部分眼部ADE中位发生时间在开始用药1个月内,ALK抑制剂致失明的中位发生时间最长,为154.00(114.50,225.50)d。视觉损害、视物模糊、闪光幻觉、玻璃体飞蛾症、复视常发生在用药早期,畏光、视野缺损及失明的发生时间随机,不随用药时间变化而变化。结论不同ALK抑制剂致眼部ADE的风险有所差异,多发生于治疗早期,临床应用时应及时识别并处理ALK抑制剂的眼部ADE。

达拉非尼联合曲美替尼治疗ALK与BRAF基因双突变晚期肺腺癌1例

目的ALK与BRAF基因双突变在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中极为罕见,目前有效的治疗方案尚缺乏临床案例及数据支持,本报道期望为该类患者的治疗提供临床参考。方法报道1例ALK融合与BRAF突变并存的86岁的女性晚期肺腺癌病例,给予达拉非尼联合曲美替尼方案的治疗。结果该患者经达拉非尼联合曲美替尼方案治疗后疗效评价达部分缓解(partial response,PR),且治疗过程中并未出现严重不良反应。结论随着基因检测技术的发展及生物靶向药物的开发,晚期NSCLC患者生存率和生活质量得到提升。该例患者对达拉非尼联合曲美替尼方案有确切疗效,对ALK与BRAF基因双突变NSCLC临床诊治有参考意义。

非小细胞肺癌中PD-L1的表达与EGFR、ALK、KRAS基因突变的相关性及预后分析

目的探讨PD-L1在非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达状态,分析PD-L1与EGFR、ALK、KRAS的相关性及其与NSCLC预后的关系。方法收集2017年1月-2022年4月第一师医院病理科确诊的164例NSCLC患者,采用免疫组化法及运用二代测序技术分别检测PD-L1的表达和EGFR、ALK、KRAS基因状态,分析NSCLC患者中PD-L1的表达与EGFR、KRAS、ALK基因的相关性及预后。结果PD-L1表达与年龄、性别、吸烟、种族、组织学、分期等均无关(P>0.05);根据相关性分析,PD-L1表达与EGFR基因突变呈负相关(R=-0.251,P<0.01),与ALK基因突变呈正相关性(R=0.232,P<0.01),与BRAF基因突变不相关(R=-0.036,P>0.05);通过1年期的生存性分析,PD-L1表达阳性的患者为67.9%,阴性的患者为84.1%。Kaplan-Meier生存分析:PD-L1阳性表达组的患者低于阴性表达组(χ^(2)=4.505,P<0.05)。结论NSCLC患者中PD-L1表达与肿瘤分期、EGFR和ALK基因突变相关,并且PD-L1阴性表达者相对于阳性表达者有更长的生存期。

ALK融合肺腺癌小细胞转化1例并文献复习

间变淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合的肺腺癌患者经ALK-酪氨酸激酶抑制剂(ALK-tyrosine kinase inhibitor,ALK-TKI)治疗后可能会产生耐药,其耐药机制尚未完全明确。遵义医科大学附属医院2021年9月收治1例ALK融合的肺腺癌患者,经ALK-TKI治疗后出现耐药,疾病进展后再次活体组织检查(以下简称“活检”),病理类型转化为小细胞肺癌。该患者为54岁女性,首诊主要症状为咳嗽、咳痰、胸痛4个月。胸部CT检查见右上叶后段-右下叶肿瘤性病变并阻塞性肺炎,右肺下叶转移瘤,纵隔、右肺门淋巴结增多、增大,右肺门软组织增厚;支气管镜检查病理活检明确诊断肺腺癌;二代测序基因检测结果提示棘皮动物微管样蛋白4-间变淋巴瘤激酶(echinoderm microtubule associated protein like 4-anaplastic lymphoma kinase,EML4-ALK)融合伴随肿瘤蛋白53(tumor protein 53,TP53)和视网膜母细胞瘤1(retinoblastoma 1,RB1)基因突变。给予二代ALK-TKI阿来替尼靶向治疗,无进展生存期11个月。随后出现疾病进展,考虑对阿来替尼耐药,改为三代ALK-TKI洛拉替尼靶向治疗1个月无效,疾病快速系统性进展,神经元特异性烯醇化酶(neuron specific enolase,NSE)明显升高,短期内新发胸膜、心包、颅内、肝脏、骨转移。二次活检的结果提示为小细胞肺癌,更改治疗方案为化学治疗联合免疫治疗,症状缓解。ALK-TKI治疗ALK融合的晚期非小细胞肺癌耐药机制复杂,病理类型小细胞转化也是耐药机制之一,发生率极低,伴随TP53和RB1基因突变可能是其向小细胞转化的特征,NSE异常升高是腺癌向小细胞转化有预测作用的血清标志物,耐药后及时进行二次活检,根据不同耐药机制选择后续治疗对疾病全程管理非常重要。

罕见ALK基因融合的晚期非小细胞肺癌1例报告

非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是包括鳞状细胞癌、腺癌、大细胞癌等的肺上皮来源的恶性肿瘤。NSCLC发生率约占肺癌总体的85%,常发生在中老年和有既往吸烟史的人群中,具有死亡率高、确诊时多为中晚期等特点。NSCLC常伴随基因突变的发生,近年来随着基因检测技术的蓬勃发展,NSCLC开展以分子分型为基础的靶向治疗愈加完善,大大延长了患者的生存周期。约3%~7%的NSCLC患者会存在间变淋巴瘤激酶(ALK)基因融合,其中最为常见的是EML4-ALK融合.

EGFR和ALK基因异时性突变非小细胞肺癌1例报告并文献复习

多原发肺癌(multiple primary lung cancer,MPLC)指患者有两个或两个以上原发病灶的肺癌,根据发生时间的不同分为同时性多原发肺癌(synchronous MPLC,sMPLC)和异时性多原发肺癌(metachronous MPLC,mMPLC)。近年来,MPLC的检出率逐渐升高,但由于肿瘤的异质性,在鉴别MPLC和肺内转移(intrapulmonary metastasis,IM)上存在许多争议,特别是病理组织学类型相同时。考虑到目前二者在临床治疗策略及预后上的显著差异,对于MPLC和IM的精确诊断是个体化精准治疗的关键。分子遗传学及测序技术为检测肿瘤的克隆性起源提供了有效的策略,其中非小细胞肺癌表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变与间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合突变共存的病例陆续有报道,但ALK基因突变后再发EGFR突变的案例未见提及。本文通过分子遗传学技术准确诊断并回顾性分析了1例ALK突变型男性肺腺癌患者术后4年再发EGFR突变合并多发转移的临床资料,并复习相关文献,以期加深对mMPLC的认识,为该类病例的诊疗提供临床借鉴。

1例晚期ALK阳性肺鳞癌多学科临床决策探讨

间变淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)融合多见于肺腺癌这一病理类型,发生率为5%~7%。由于晚期非小细胞肺癌存在肿瘤异质性,肺鳞癌合并ALK融合亦有发生。多学科协作(multidisciplinary team,MDT)体系结合不同专业建议和循证医学理念,为复杂情况提供个性化治疗建议,尤其适合相对复杂的病案个例。本研究分享1例2022年12月天津医科大学肿瘤医院收治的肺鳞癌ALK基因融合患者MDT诊疗过程。患者初诊为Ⅲb期,序贯放化疗后快速进展,发生肝转移及脑转移,基因检测提示ALK融合,后续给予靶向药物洛拉替尼治疗,患者病灶缩小,治疗效果评估为疾病稳定(stable disease,SD)至今。