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家蝇AMP17基因的克隆及其分子特性和表达模式研究
被引量:
9
1
作者
陶如玉
李妍
+3 位作者
马慧玲
付萍
吴建伟
国果
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第11期1079-1083,1098,共6页
目的克隆家蝇AMP17基因并进行、序列分析,对其时空表达模式进行初步探索。方法从微生物诱导的家蝇转录组数据库中筛选差异高表达唾液腺蛋白AMP17基因。以该基因的cDNA文库质粒为模板进行PCR扩增,运用生物信息学方法对其编码蛋白进行结...
目的克隆家蝇AMP17基因并进行、序列分析,对其时空表达模式进行初步探索。方法从微生物诱导的家蝇转录组数据库中筛选差异高表达唾液腺蛋白AMP17基因。以该基因的cDNA文库质粒为模板进行PCR扩增,运用生物信息学方法对其编码蛋白进行结构与功能分析。取家蝇不同生活史时期标本(卵,各龄幼虫,蛹,雄雌成虫)及3龄幼虫不同组织部位(体壁、气管、唾液腺、脂肪体、马氏管及中肠)标本,采用实时荧光定量PCR检测AMP17基因表达情况。结果 PCR扩增得到约495bp的特异性AMP17基因片段。AMP17基因ORF全长495bp,编码164个氨基酸,理论分子质量单位17.4×103,等电点为6.09,整个多肽链表现为亲水性。该蛋白属于分泌蛋白,主要分布在细胞外(包括细胞壁)。磷酸化位点分析该蛋白,有5个丝氨酸、3个苏氨酸、1个色氨酸可能成为蛋白激酶磷酸化位点。其二级结构中主要以α-螺旋,不规则卷曲和延伸链为蛋白最大量的结构元件。时空表达谱显示,家蝇不同发育时期中,以卵期作为参照,AMP17基因在3龄及雄成虫时期表达量高,表达水平排列顺序为3龄幼虫>雄成虫>1龄幼虫>雌成虫>蛹期>2龄幼虫>卵,3龄幼虫时期表达量比卵期上调了20 320.98倍(P<0.01);雄成虫上调了10 936.37倍(P<0.01)。以体壁作为参照,AMP17基因在家蝇3龄幼虫不同组织的表达以马氏管表达最高,比体壁上调了2.40倍(P<0.05);其次为唾液腺,比体壁上调了1.31倍(P<0.01)。结论成功克隆了家蝇AMP17基因并初步探索了其时空表达模式,为进一步研究其功能奠定了基础。
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关键词
家蝇
amp17
基因
生物信息学分析
表达模式
原文传递
题名
家蝇AMP17基因的克隆及其分子特性和表达模式研究
被引量:
9
1
作者
陶如玉
李妍
马慧玲
付萍
吴建伟
国果
机构
贵州医科大学第二附属医院检验科
贵州医科大学基础医学院
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第11期1079-1083,1098,共6页
基金
国家自然科学基金项目(No.81760647
81560337)
文摘
目的克隆家蝇AMP17基因并进行、序列分析,对其时空表达模式进行初步探索。方法从微生物诱导的家蝇转录组数据库中筛选差异高表达唾液腺蛋白AMP17基因。以该基因的cDNA文库质粒为模板进行PCR扩增,运用生物信息学方法对其编码蛋白进行结构与功能分析。取家蝇不同生活史时期标本(卵,各龄幼虫,蛹,雄雌成虫)及3龄幼虫不同组织部位(体壁、气管、唾液腺、脂肪体、马氏管及中肠)标本,采用实时荧光定量PCR检测AMP17基因表达情况。结果 PCR扩增得到约495bp的特异性AMP17基因片段。AMP17基因ORF全长495bp,编码164个氨基酸,理论分子质量单位17.4×103,等电点为6.09,整个多肽链表现为亲水性。该蛋白属于分泌蛋白,主要分布在细胞外(包括细胞壁)。磷酸化位点分析该蛋白,有5个丝氨酸、3个苏氨酸、1个色氨酸可能成为蛋白激酶磷酸化位点。其二级结构中主要以α-螺旋,不规则卷曲和延伸链为蛋白最大量的结构元件。时空表达谱显示,家蝇不同发育时期中,以卵期作为参照,AMP17基因在3龄及雄成虫时期表达量高,表达水平排列顺序为3龄幼虫>雄成虫>1龄幼虫>雌成虫>蛹期>2龄幼虫>卵,3龄幼虫时期表达量比卵期上调了20 320.98倍(P<0.01);雄成虫上调了10 936.37倍(P<0.01)。以体壁作为参照,AMP17基因在家蝇3龄幼虫不同组织的表达以马氏管表达最高,比体壁上调了2.40倍(P<0.05);其次为唾液腺,比体壁上调了1.31倍(P<0.01)。结论成功克隆了家蝇AMP17基因并初步探索了其时空表达模式,为进一步研究其功能奠定了基础。
关键词
家蝇
amp17
基因
生物信息学分析
表达模式
Keywords
Musca domestic
amp17 gene
bioinformatic analysis
patterns of expression
分类号
R384.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家蝇AMP17基因的克隆及其分子特性和表达模式研究
陶如玉
李妍
马慧玲
付萍
吴建伟
国果
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017
9
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已选择
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参考文献
引证文献
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