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基于生物信息学探究ASPM和KIF20A在食管鳞状细胞癌中的表达及临床意义
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作者 李萍 吴蕴生 +3 位作者 朱万钦 刘德东 潘盛兰 李祖茂 《四川医学》 CAS 2024年第3期256-263,共8页
目的探讨ASPM、KIF20A在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的表达及临床意义。方法基于GEO数据库筛选核心基因并预测其在ESCC中的表达水平;KEGG通路富集分析ASPM、KIF20A参与的潜在信号通路;TIMER数据库分析ASPM、KIF20A的表达与免疫细胞浸润的相... 目的探讨ASPM、KIF20A在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的表达及临床意义。方法基于GEO数据库筛选核心基因并预测其在ESCC中的表达水平;KEGG通路富集分析ASPM、KIF20A参与的潜在信号通路;TIMER数据库分析ASPM、KIF20A的表达与免疫细胞浸润的相关性;选取95例ESCC组织与30例癌旁正常组织标本,采用免疫组化检测ESCC和癌旁正常组织中ASPM和KIF20A蛋白质表达情况,分析其表达与临床病理参数及预后的相关性。结果共筛选出核心基因16个,包括ASPM、KIF20A等。GEPIA结果显示,ASPM、KIF20A在ESCC组织中均呈高表达,差异有统计学意义(P<0.05)。KEGG通路富集分析显示两者均与细胞周期相关。TIMER结果显示,ASPM的表达与树突状细胞呈负相关,KIF20A的表达与CD8^(+)T细胞呈负相关。免疫组化结果显示,ESCC组织中ASPM、KIF20A的表达水平显著高于癌旁正常组织(P<0.001)。ASPM的表达与ESCC患者的临床分期(P=0.004)、N分期(P=0.024)具有相关性;KIF20A的表达与ESCC患者的肿块直径(P=0.015)、N分期(P=0.002)相关。Spearman相关性分析显示,ASPM的表达与KIF20A的表达呈正相关(r=0.367,P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,ASPM、KIF20A高表达组患者的生存率低于低表达组患者(均P<0.05)。多因素分析显示,ASPM、KIF20A的表达及N分期均是影响ESCC患者预后的独立因素。结论ASPM、KIF20A高表达与ESCC的进展和预后密切相关,可能是ESCC的重要预后标记物和潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 aspm KIF20A 生物信息学 免疫组化 预后
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ASPM对肝癌QGY-7703细胞的增殖、凋亡和迁移的影响
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作者 石柳 吴小娟 +1 位作者 万云 温建军 《江西医药》 CAS 2021年第8期1242-1245,1254,共5页
目的研究ASPM在肝癌细胞增殖、凋亡及迁移的作用及其机制。方法通过合成siRNA沉默ASPM在肝癌细胞株QGY-7703的表达,再通过CCK8,克隆形成实验检测其生长能力的改变;流式细胞术检测其凋亡水平的改变;Transwell迁移实验检测其迁移能力的改... 目的研究ASPM在肝癌细胞增殖、凋亡及迁移的作用及其机制。方法通过合成siRNA沉默ASPM在肝癌细胞株QGY-7703的表达,再通过CCK8,克隆形成实验检测其生长能力的改变;流式细胞术检测其凋亡水平的改变;Transwell迁移实验检测其迁移能力的改变,qRT-PCR检测EMT相关分子E-cadherin,N-cadherin,Snail以及线粒体相关基因COX1,ND1,ND6,COXIV,TOMM20的的表达水平的改变;通过MitoTracker^(TM) Red CMXRos检测肝癌细胞QGY-7703的线粒体活性,MitoTracker^(TM) Green检测线粒体的数量的改变;ATP检测试剂盒检测细胞内ATP的生成水平的改变;Western blotting检测TGF-β/Smad3信号通路活性的改变。结果沉默ASPM可抑制QGY-7703的增殖能力和克隆形成能力,促进了其凋亡水平;同时,可抑制肝癌细胞QGY-7703的迁移能力,并促进E-cadherin的mRNA表达水平,抑制N-cadherin,Snail的mRNA表达水平;流式结果显示,沉默ASPM后,线粒体ROS的水平明显上升,反应线粒体数目的MitoTracker^(TM) Green的平均荧光强度明显下降,ATP产量也明显下降,而线粒体相关基因COX1,ND1,ND6,COXIV,TOMM20的表达水平明显下降;Western blotting的结果显示,沉默ASPM的表达水平可抑制TGF-β/Smad3信号通路的活性。结论ASPM通过TGF-β/Smad3信号通路导致线粒体的发生及活性增强,从而促进肝癌细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 aspm 肝癌 增殖 迁移 线粒体 TGF-β/Smad3信号通路
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ASPM突变致小头畸形1例报告及文献回顾 被引量:4
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作者 缪勤飞 马红霞 +3 位作者 陈志红 翟琼香 梁明娟 黎雪萍 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期359-362,共4页
目的探讨ASPM基因检查对小头畸形的诊治价值。方法回顾分析1例小头畸形患儿的临床资料以及采用二代测序方法进行小头畸形相关基因全外显子捕获检测结果,同时复习相关文献。结果患儿,女,18月龄,头围37.5 cm(<−3 SD),无明显智力发育异... 目的探讨ASPM基因检查对小头畸形的诊治价值。方法回顾分析1例小头畸形患儿的临床资料以及采用二代测序方法进行小头畸形相关基因全外显子捕获检测结果,同时复习相关文献。结果患儿,女,18月龄,头围37.5 cm(<−3 SD),无明显智力发育异常。基因检测结果显示,患儿ASPM基因存在第18号外显子的c.8815 delA和第3号外显子的c.C1789T变异,生物信息学软件预测为致病性变异。结论ASPM基因18号外显子c.8815delA和第3号外显子c.C1789T变异极可能是导致原发性小头畸形的原因之一,基因检测有助于早期诊断。 展开更多
关键词 小头畸形 aspm基因 遗传
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ASPM调控鼻咽癌细胞周期及抑制细胞增殖的作用及机制探讨 被引量:1
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作者 杨开炎 覃启才 +5 位作者 李旭祥 冯大益 农丰靖 杨秋云 唐凤珠 瞿申红 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第8期1440-1447,共8页
目的:通过生物信息学分析的方法,探讨异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(abnormal spindle-like microcephaly-associated protein,ASPM)在鼻咽癌中的分子功能及作用机制;通过细胞实验,初步验证ASPM在鼻咽癌细胞中的作用。方法:使用R语言的l... 目的:通过生物信息学分析的方法,探讨异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(abnormal spindle-like microcephaly-associated protein,ASPM)在鼻咽癌中的分子功能及作用机制;通过细胞实验,初步验证ASPM在鼻咽癌细胞中的作用。方法:使用R语言的limma包对鼻咽癌的芯片数据集进行基因差异表达分析;使用R语言的clusterProfiler包进行ASPM相关基因的富集分析;通过流式细胞术、CCK8实验、实时定量PCR及蛋白免疫印迹等方法,研究沉默ASPM表达对鼻咽癌细胞周期及细胞增殖的影响。结果:差异表达分析发现ASPM mRNA水平在鼻咽癌数据集中高表达(P<0.001);基因富集分析发现与ASPM相关的基因在鼻咽癌中与细胞周期、DNA复制等信号通路关联;细胞功能实验发现沉默ASPM的表达,鼻咽癌细胞周期停滞于G 1期,鼻咽癌细胞增殖减少;沉默ASPM的表达可以影响鼻咽癌细胞周期及增殖标志物的表达。结论:ASPM可能通过调控鼻咽癌细胞周期及DNA复制等信号通路,导致肿瘤发生与进展;沉默鼻咽癌细胞中ASPM mRNA的表达,可以使细胞周期停滞于G 1期,细胞增殖减少;ASPM可能作为改善鼻咽癌预后的潜在靶点。 展开更多
关键词 鼻咽癌 aspm 富集分析 细胞周期 细胞增殖
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ASPM基因缺陷致新生儿小头畸形6例病例系列报告并文献复习 被引量:1
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作者 俞可欣 梅红芳 +8 位作者 陈辉耀 张坚涛 胡黎园 程国强 卢宇蓝 王慧君 吴冰冰 周文浩 杨琳 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2022年第4期307-311,共5页
背景原发性小头畸形(MCPH)是以头围小、面部畸形和智力障碍为特征的神经系统发育性的罕见遗传性疾病。目的总结“新生儿基因组计划(China Neonatal Genomes Project,CNGP)”中ASPM基因缺陷导致原发性小头畸形(ASPM-MCPH)病例的临床特征... 背景原发性小头畸形(MCPH)是以头围小、面部畸形和智力障碍为特征的神经系统发育性的罕见遗传性疾病。目的总结“新生儿基因组计划(China Neonatal Genomes Project,CNGP)”中ASPM基因缺陷导致原发性小头畸形(ASPM-MCPH)病例的临床特征和基因变异特征,并对HGMD数据库收录的ASPM-MCPH进行整理分析,加深对ASPM-MCPH的认识。设计病例系列报告。方法纳入参与CNGP且基因检测结果为携带ASPM双等位基因致病/可疑致病(P/LP)变异的患儿,整理患儿新生儿期的主要临床信息和基因检测结果。整理HGMD、ClinVar数据库及内部数据库ASPM基因P/LP变异,建立该基因P/LP变异列表,计算基因携带频率。分析HGMD数据库收录变异所属的文献,归纳ASPM-MCPH表型和基因型关联性,进行统计学分析与比较。主要结局指标GNGP数据库ASPM基因致病变异携带率评估。结果携带ASPM基因双等位基因P/LP变异的患儿6例,共12个变异位点,其中6个变异为本研究首次报道。6例患儿产前B超均显示头围偏小,生后诊断小头畸形,但新生儿期其他表型不典型。CNGP患儿ASPM基因P/LP变异携带频率为0.001206403。既往报道中小头畸形、特殊面容和轻中度发育迟缓的表型占比>50%,MR主要表现为脑回异常和脑室扩张;基因型中,无功能变异占96.43%,既往报道中失功能变异与错义变异对发育迟缓程度的影响差异无统计学意义。结论发现ASPM基因6个新的P/LP变异位点,首次提出ASPM基因致病变异NICU人群携带率评估,对产前检查提示头围偏小胎儿建议行基因检测。 展开更多
关键词 原发性小头畸形 aspm基因 病例报道
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结肠癌中ASPM对细胞增殖、侵袭和凋亡的影响 被引量:4
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作者 安晓静 柏苗苗 +2 位作者 谢振年 伍志强 赵坡 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1177-1182,共6页
目的探讨头小畸形相关基因(abnormal spindle-like microcephaly associated,ASPM)对结肠癌细胞SW116和HCT116增殖、侵袭和凋亡的影响以及对β-catenin的调节作用。方法挑选ASPM含量较高的结肠癌细胞株HCT116和SW116。体外培养结肠癌细... 目的探讨头小畸形相关基因(abnormal spindle-like microcephaly associated,ASPM)对结肠癌细胞SW116和HCT116增殖、侵袭和凋亡的影响以及对β-catenin的调节作用。方法挑选ASPM含量较高的结肠癌细胞株HCT116和SW116。体外培养结肠癌细胞HCT116和SW116,设计siRNA-ASPM序列,转染细胞,分为阴性对照组(negative control,NC)组、siRNA1组和siRNA2组。采用CCK8法检测细胞增殖情况,Transwell实验检测细胞侵袭能力,Annexin V-FITC/PI细胞凋亡检测试剂盒检测细胞的凋亡率。qRT-PCR和Western blot法检测HCT116各组细胞中ASPM和β-catenin mRNA和蛋白的表达。挽救实验探究加入LiCl处理后,结肠癌细胞中ASPM对β-catenin表达的影响。结果siRNA-ASPM转染HCT116和SW116细胞后,siRNA组中ASPM表达量下降(P<0.05)。与NC组相比,siRNA1组、siRNA2组细胞的增殖和侵袭能力均降低,凋亡率升高;siRNA1组、siRNA2组中ASPM和β-catenin蛋白表达明显降低(P<0.05)。挽救实验结果证实,与siRNA-ASPM组相比,LiCl能部分恢复β-catenin mRNA的表达。结论沉默ASPM表达可抑制结肠癌细胞活力,降低细胞侵袭能力并诱导细胞凋亡,其机制可能与抑制Wnt/β-catenin信号通路有关。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 aspm 侵袭力 凋亡 WNT/Β-CATENIN
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ASPM在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌的进展和预后关系的研究 被引量:12
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作者 王俊杰 何振宇 段仁慧 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期29-35,共7页
背景与目的已有的研究表明人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(abnormal spindle-likemicrocephalyassociated protein,ASPM)是一个与肿瘤发生发展相关的蛋白,ASPM的突变会导致常染色体隐性原发性小头畸形。本研究主要是探讨肺腺癌组织... 背景与目的已有的研究表明人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(abnormal spindle-likemicrocephalyassociated protein,ASPM)是一个与肿瘤发生发展相关的蛋白,ASPM的突变会导致常染色体隐性原发性小头畸形。本研究主要是探讨肺腺癌组织中的表达情况与肺癌进展和预后的关系。方法收集90例肺腺癌组织标本和对应的90例肺良性病变组织标本,应用免疫组织化学技术检测其中90对组织中ASPM的表达情况,应用实时荧光定量核酸扩增法和蛋白印迹法的方法检测其中12对组织中ASPM的表达情况。结果肺良性病变组织标本中ASPM表达为阴性,肺腺癌组织中ASPM的表达为阳性结果且表达水平均显著高于肺良性病变肺组织(P<0.05)。伴有淋巴结进展的肺腺癌中ASPM的表达水平与不伴有淋巴结进展的肺癌没有差异,无统计学意义(P>0.05)。肿瘤大小≥4 cm的ASPM表达水平均显著高于肿瘤大小<4 cm(P<0.05)。分层分析结果表明T分期与ASPM表达层度相关(P<0.05)。肺腺癌组织中ASPM的高表达水平与不良预后呈正相关(P<0.05)。结论肺腺癌中ASPM的表达水平明显升高,且与肺腺癌的进展有密切关系。肺腺癌组织中ASPM的表达水平与不良预后呈正相关(P<0.05)。检测肺腺癌中ASPM的表达水平有助于提早的预测肺腺癌的预后。 展开更多
关键词 肺腺癌 人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白 免疫组织化学 预后
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ASPM基因在乳腺癌中的表达及临床意义 被引量:2
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作者 吕珊妹 徐文杰 +1 位作者 王艺臻 董学君 《医学研究杂志》 2020年第4期93-99,共7页
目的研究有丝分裂相关基因ASPM(abnormal spindle microtubule assembly)在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨ASPM作用机制。方法利用Oncomine数据库检测ASPM在乳腺癌组织中的表达情况,采用GSE3494数据集和Kaplan-Meier在线分析ASPM表达... 目的研究有丝分裂相关基因ASPM(abnormal spindle microtubule assembly)在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨ASPM作用机制。方法利用Oncomine数据库检测ASPM在乳腺癌组织中的表达情况,采用GSE3494数据集和Kaplan-Meier在线分析ASPM表达与乳腺癌患者的预后关系,并结合TCGA数据库分析ASPM表达与临床病理指标的相关性。利用GSE3494数据集进行基因富集分析(GSEA)预测ASPM相关通路。利用String数据库分析与ASPM相关的蛋白并通过TIMER数据库验证。利用RT-qPCR验证在13对乳腺癌组织与配对的癌旁组织中ASPM的表达情况。结果与正常乳腺组织比较,ASPM在乳腺癌组织中高表达,且高表达组具有较短的总生存期(HR=1.71,P=0.000)。GSE3494和TCGA数据库分析发现ASPM表达与ER、PR水平显著相关(P=0.000),TCGA数据库分析结果显示ASPM表达还跟年龄(P=0.002)以及TNM分期中的T分期(P=0.000)和N分期(P=0.030)显著相关。ASPM高表达样本主要富集在细胞周期、氧化磷酸化、DNA修复、错配修复、剪接体和蛋白酶体等基因集(P<0.01),结合String以及TIMER的结果,ASPM可能与BUB1、CCNA2、TTK、CDC20、CDK1相互结合作用,促进乳腺癌的发生、发展。RT-qPCR结果显示,ASPM在乳腺癌组织中表达上调。结论ASPM基因在乳腺癌组织中高度表达,并与临床病理指标相关,可作为预测乳腺癌预后的标志物进一步研究。 展开更多
关键词 乳腺癌 aspm GEO数据库 TCGA数据库
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ASPM在肿瘤中的作用机制及最新研究进展 被引量:3
9
作者 吴莹莹 金木兰 《诊断病理学杂志》 2021年第2期128-130,共3页
人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白基因(ASPM),位于染色体1q31,全长62528 bp,编码区长10434 bp,由28个外显子构成,最新研究显示,ASPM截断突变是人类2型常染色体隐性原发性小头畸形(MCPH)最常见的病因。ASPM是新近发现的一种肿瘤干细胞... 人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白基因(ASPM),位于染色体1q31,全长62528 bp,编码区长10434 bp,由28个外显子构成,最新研究显示,ASPM截断突变是人类2型常染色体隐性原发性小头畸形(MCPH)最常见的病因。ASPM是新近发现的一种肿瘤干细胞标记物,在增殖旺盛的组织及肿瘤组织中高表达,如胶质母细胞瘤、肝癌、胃癌、胰腺癌和前列腺癌等,并与其转移及预后相关。敲除ASPM基因可以抑制Wnt/β-catenin信号通路,β-catenin过表达能逆转sh ASPM对细胞活性的影响。表明ASPM为Wnt/β-catenin信号通路的上游信号分子。本文主要对ASPM在肿瘤中的发生、发展机制及其与Wnt/β-catenin信号通路相关分子的关系进行综述。 展开更多
关键词 aspm 肿瘤干细胞 肿瘤 WNT/Β-CATENIN信号通路
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ASPM在干细胞及恶性肿瘤中的研究进展 被引量:1
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作者 安晓静 黄勇 赵坡 《诊断病理学杂志》 2020年第1期50-53,共4页
ASPM是常染色体隐性遗传性小头畸形疾病的主要致病基因位点,其功能是调节神经干细胞的分裂和增殖。研究证实,ASPM是肿瘤干细胞标记物,参与维持了肿瘤干细胞的特性;且在多种肿瘤中均表达上调,并与肿瘤的进展和预后密切相关,因此有望成为... ASPM是常染色体隐性遗传性小头畸形疾病的主要致病基因位点,其功能是调节神经干细胞的分裂和增殖。研究证实,ASPM是肿瘤干细胞标记物,参与维持了肿瘤干细胞的特性;且在多种肿瘤中均表达上调,并与肿瘤的进展和预后密切相关,因此有望成为控制肿瘤复发的治疗靶点。本文就ASPM相关领域的研究进展进行总结,并对其应用前景、待解决的问题和面临的挑战进行探讨。 展开更多
关键词 aspm 干细胞 肿瘤 WNT信号通路 结直肠癌
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ASPM基因纯合变异致原发性小头畸形5型一例及遗传学分析
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作者 孙阁阁 郑玉婷 +3 位作者 任化楠 王莉 刘莉娜 孔祥东 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第6期868-871,共4页
常染色体隐性遗传小头畸形(autosomal recessive primary microcephaly,MCPH)又称原发性小头畸形或真性小头畸形,是以脑容量减少为特征的神经发育障碍疾病,具有遗传异质性,主要临床特征是出生时枕额周长低于年龄和性别匹配平均数的2个... 常染色体隐性遗传小头畸形(autosomal recessive primary microcephaly,MCPH)又称原发性小头畸形或真性小头畸形,是以脑容量减少为特征的神经发育障碍疾病,具有遗传异质性,主要临床特征是出生时枕额周长低于年龄和性别匹配平均数的2个标准差(s)或更多,6个月后低于3个s,并且伴随一定程度非进行性智力退化^([1])。全世界MCPH的发病率在1/250 000~1/30 000^([2])。 展开更多
关键词 aspm基因 全外显子组测序 原发性小头畸形5型 遗传学分析
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小脑症蛋白ASPM和钙调蛋白复合物的纯化和表征
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作者 常梦园 魏晓西 陆青 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1199-1206,共8页
常染色体隐性小脑症(autosomal recessive primary microcephaly,MCPH)是一种与大脑缩小和智力缺陷有关的神经发育障碍.ASPM(abnormal spindle-like microcephaly-associated)是最常见的MCPH致病基因,但其潜在机制尚不清楚.研究发现,钙... 常染色体隐性小脑症(autosomal recessive primary microcephaly,MCPH)是一种与大脑缩小和智力缺陷有关的神经发育障碍.ASPM(abnormal spindle-like microcephaly-associated)是最常见的MCPH致病基因,但其潜在机制尚不清楚.研究发现,钙调蛋白(calmodulin,CaM)通过与ASPM的IQ区域相互作用而对ASPM的功能有重要调控作用.我们纯化了ASPM IQ区域和CaM的复合物,并通过分子排阻色谱结合多角度静态光散射(SEC-MALS)和圆二光谱(CD)实验发现,ASPM和apoCaM的结合比例为1∶8.有趣的是,在Ca^2+存在时,ASPM的IQ区域与Ca^2+CaM的结合比例变为了1∶7.此外,通过比较不同条件下(Ca^2+存在与否)的CD光谱,ASPM-CaM复合物显示出Ca^2+依赖性的热稳定性变化.综上所述,该研究揭示了Ca^2+诱导的ASPM-CaM相互作用的调节机制. 展开更多
关键词 小脑症 aspm CaM CA2+ 相互作用
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ASPM在女性生殖系统恶性肿瘤中的研究进展
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作者 范苗苗 沈文哲 +2 位作者 赵奇 毕佳欣 宋洁 《牡丹江医学院学报》 2023年第1期137-140,共4页
人类异常纺锤体小头畸形相关蛋白基因(abnormal spindle microtubule assembly,ASPM)编码的蛋白是一种纺锤体极/中间体蛋白,在细胞周期的过程中可以调节有丝分裂的进程和细胞质的分裂。研究发现,ASPM在多种癌症中高表达并维持肿瘤细胞... 人类异常纺锤体小头畸形相关蛋白基因(abnormal spindle microtubule assembly,ASPM)编码的蛋白是一种纺锤体极/中间体蛋白,在细胞周期的过程中可以调节有丝分裂的进程和细胞质的分裂。研究发现,ASPM在多种癌症中高表达并维持肿瘤细胞的干细胞特征,从而参与肿瘤细胞的增殖、分化及预后等生物学过程。本文对ASPM的结构和功能以及ASPM在女性生殖系统恶性肿瘤中的发生、发展机制及相关信号通路进行综述。 展开更多
关键词 aspm 生殖系统 恶性肿瘤
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基于TCGA数据库分析ASPM在肺腺癌中的表达及临床意义 被引量:2
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作者 杜强 姚义勇 曾刚 《癌变.畸变.突变》 CAS 2020年第6期457-463,共7页
目的:探讨异常纺锤体样小头畸形相关基因(ASPM)在肺腺癌中的表达水平,及其与患者临床病理指标和预后的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌组织和癌旁组织mRNA表达水平和临床病例资料,比较ASPM mRNA在癌组织和癌旁组织... 目的:探讨异常纺锤体样小头畸形相关基因(ASPM)在肺腺癌中的表达水平,及其与患者临床病理指标和预后的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌组织和癌旁组织mRNA表达水平和临床病例资料,比较ASPM mRNA在癌组织和癌旁组织中的表达差异,统计学分析ASPM表达水平与肺腺癌患者临床病理指标及预后关系。通过R语言ballgown和ggplot包筛选高低表达ASPM组间差异基因并绘制火山图;利用DAVID工具对差异基因进行GO分析,采用GSEA预测ASPM可能调控的信号通路;STRING和Cytoscape分析关键基因及差异表达基因间的相互作用。结果:ASPM mRNA在肺腺癌中表达水平显著高于癌旁组织(P<0.05);ASPM表达水平与生存期相关,高表达ASPM肺腺癌患者预后较差(P<0.05),是肺腺癌患者预后的独立危险因素,R语言ballgown包筛选出ASPM高低表达组间的差异表达基因共183个,差异表达基因富集到生物过程(BP)、细胞组分(CC)、分子功能(MF)在3个类别共19个亚类和18条KEGG通路;Cytoscape软件发现4个枢纽蛋白。结论:ASPM mRNA在肺腺癌患者中呈高表达且高表达组预后差,可作为判断肺腺癌预后的标志物。 展开更多
关键词 异常纺锤体样小头畸形相关基因 肺腺癌 肿瘤标志物 TCGA数据库
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ASPM基因变异致原发性小头畸形1例患儿的遗传学分析及文献回顾
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作者 王杰 王晓华 +6 位作者 张丽春 黄艳 沙日娜 安槿 武彦廷 郭志远 贾跃旗 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第10期1243-1248,共6页
目的探讨1例原发性小头畸形(MCPH)患儿的临床信息与遗传学特征。方法选取2022年9月以智力低下、小头畸形为首发症状就诊于内蒙古自治区妇幼保健院的患儿为研究对象,回顾性分析患儿产前超声影像信息,对患儿进行家系全外显子组测序。针对... 目的探讨1例原发性小头畸形(MCPH)患儿的临床信息与遗传学特征。方法选取2022年9月以智力低下、小头畸形为首发症状就诊于内蒙古自治区妇幼保健院的患儿为研究对象,回顾性分析患儿产前超声影像信息,对患儿进行家系全外显子组测序。针对患儿母亲此次妊娠进行Sanger测序验证。以"ASPM基因""小头畸形""产前诊断""原发性小头畸形""ASPM""MCPH5""MCPH"、"autosomal recessive microcephaly""prenatal diagnosis""prenatally on ultrasonography"等为关键词,检索年限为建库至2023年9月,在PubMed数据库、万方数据知识服务平台及中国知网中检索相关文献进行分析。本研究通过内蒙古自治区妇幼保健院医学伦理委员会的审查(伦理号:2021-093-1)。结果患儿为4岁男性,胎儿期超声双顶径(BPD)、头围(HC)呈进行性减小。患儿的ASPM基因存在父源c.8044C>T(p.R2682X)和母源c.8652dup(p.A2885Sfs*35)复合杂合变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会相关变异评级与标准指南,c.8044C>T和c.8652dup均被评级为致病性变异(PVS1+PM2_Supporting+PP4;PVS1+PM2_Supporting+PM3)。家系内高风险胎儿超声未见异常,基因检测为正常基因型。文献检索共11篇文献符合条件,加上上述先证者共15例MCPH患儿。胎儿期影像记录的MCPH5病例均发现不同程度的头BPD/HC减小(100.0%,15/15),继续妊娠至出生病例均表现出不同程度的发育迟缓、智力障碍、注意力缺陷(100.0%,8/8),1例有癫痫发作(12.5%,1/8)。检出基因型包括纯合变异(46.2%,6/13),复合杂合变异(53.8%,7/13),变异类型包含无义变异(45%,9/20)和移码变异(55%,11/20)。结论ASPM基因c.8044C>T(p.R2682X)和c.8652dup(p.A2885Sfs*35)复合杂合变异考虑是上述MCPH患儿在胎儿期表现出BPD、HC减小的遗传学病因。 展开更多
关键词 小头畸形 aspm基因 全外显子组测序 产前诊断
原文传递
ASPM基因变异所致的常染色体隐性遗传原发性小头畸形5型家系的诊断及遗传咨询 被引量:2
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作者 张艳 曾丽娜 林荔 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2022年第4期405-408,共4页
目的对一个常染色体隐性遗传原发性小头畸形5型(autosomal recessive primary microcephaly 5,MCPH5)家系进行ASPM致病基因突变位点分析,进一步为家系提供遗传咨询及产前诊断。方法采集先证者及其父母的外周血,以及胎儿的羊水细胞,提取... 目的对一个常染色体隐性遗传原发性小头畸形5型(autosomal recessive primary microcephaly 5,MCPH5)家系进行ASPM致病基因突变位点分析,进一步为家系提供遗传咨询及产前诊断。方法采集先证者及其父母的外周血,以及胎儿的羊水细胞,提取基因组DNA,通过PCR-Sanger测序对先证者ASPM基因的外显子及外显子/内含子衔接区进行序列分析,并在其家系中进行变异验证。结果先证者存在ASPM基因第18外显子c.8214dupT(p.Q2739fs)和第23外显子c.9541C>T(p.R3181X)复合杂合突变,分别来自其父亲及母亲;本次妊娠胎儿羊水细胞染色体核型与SNP Array检测均未见异常,胎儿携带ASPM基因第23外显子c.9541C>T(p.R3181X)杂合突变,出生后表型正常。结论ASPM基因c.8214dupT(p.Q2739fs)与c.9541C>T(p.R3181X)复合杂合突变为常染色体隐性遗传原发性小头畸形5型的致病基因,本研究结果为该家系行遗传咨询与产前诊断提供了依据。 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传原发性小头畸形 aspm基因 产前基因诊断 遗传咨询
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ASPM基因在肾透明细胞癌中的表达及其诊断预后的价值 被引量:3
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作者 陈悦康 王伟 +2 位作者 卢启海 姚远 杨剑文 《临床泌尿外科杂志》 2020年第5期398-402,共5页
目的:探讨人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(abnormal spindle-like microcephaly-associated protein,ASPM)在肾透明细胞癌中的表达情况以及其诊断预后的价值。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的RNA-Se... 目的:探讨人类异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(abnormal spindle-like microcephaly-associated protein,ASPM)在肾透明细胞癌中的表达情况以及其诊断预后的价值。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库的RNA-Seq数据和临床数据,分析ASPM基因与肾透明细胞癌患者临床病理特征以及生存预后的关系。结果:总体534例肾透明细胞癌样本的癌和癌旁组织中的ASPM的表达水平分别为6.62±1.34和3.59±1.41,差异有统计学意义(P<0.001)。72例配对的肾透明细胞癌和癌旁组织中的ASPM表达水平分别为6.89±1.14和3.59±1.41,差异有统计学意义(P<0.001)。ROC曲线分析结果表明,ASPM基因可作为一个灵敏度和特异度较高的肾透明细胞癌诊断指标(敏感性为94.2%,特异性为90.3%,AUC=0.935)。ASPM基因表达与肾透明细胞癌患者临床病理特征的关系显示,ASPM表达与性别、肿瘤分级、T分期、M分期、临床分期均有显著性差异(P<0.001)。生存分析发现总体534例样本中ASPM低表达者和高表达者的总体生存时间分别为(1421.85±984.72)d和(1279.89±976.68)d,比较差异有统计学意义(Log-rank=14.69,P<0.001)。结论:ASPM在肾透明细胞癌中高表达,且临床特征密切相关,其高表达对判断肾透明细胞癌的生存预后及其诊断具有参考价值。 展开更多
关键词 aspm基因 肾透明细胞癌 TCGA 生物信息学
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Recapitulating cortical development with organoid culture in vitro and modeling abnormal spindle-like (ASPM related primary) microcephaly disease 被引量:3
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作者 Rui Li Le Sun +3 位作者 Ai Fang Peng Li Qian Wu Xiaoqun Wang 《Protein & Cell》 SCIE CAS CSCD 2017年第11期823-833,共11页
The development of a cerebral organoid culture in vitro offers an opportunity to generate human brain-like organs to investigate mechanisms of human disease that are specific to the neurogenesis of radial glial (RG)... The development of a cerebral organoid culture in vitro offers an opportunity to generate human brain-like organs to investigate mechanisms of human disease that are specific to the neurogenesis of radial glial (RG) and outer radial glial (oRG) cells in the ventrJcular zone (VZ) and subventricular zone (SVZ) of the developing neocortex. Modeling neuronal progenitors and the organization that produces mature subcortical neuron subtypes during early stages of development is essential for studying human brain developmental diseases. Several previous efforts have shown to grow neural organoid in culture dishes successfully, however we demonstrate a new paradigm that recapitulates neocortical development process with VZ, OSVZ formation and the lamination organization of cortical layer structure. In addition, using patient.specific induced pluripotent stem cells (iPSCs) with dysfunction of the Aspm gene from a primary microcephaly patient, we demonstrate neurogenesis defects result in defective neuronal activity in patient organoids, suggesting a new strategy to study human developmental diseases in central nerve system. 展开更多
关键词 neocortical development cerebralorganoid MICROCEPHALY aspm
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ASPM基因在氯化镉致16HBE细胞氧化损伤中的作用
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作者 周珊珊 张昉 +5 位作者 任亮 段鹏 陈卓航 张双 雷毅雄 杨萍 《毒理学杂志》 CAS CSCD 2019年第3期194-198,共5页
目的研究ASPM基因在氯化镉(CdCl2)致人支气管上皮细胞(16HBE)氧化损伤中的作用。方法分别用0、10、20和30μmol/L CdCl2处理16HBE细胞24 h,以及用30μmol/L CdCl2处理16HBE细胞12、24和48 h。利用qRT-PCR法检测16HBE细胞ASPM基因表达变... 目的研究ASPM基因在氯化镉(CdCl2)致人支气管上皮细胞(16HBE)氧化损伤中的作用。方法分别用0、10、20和30μmol/L CdCl2处理16HBE细胞24 h,以及用30μmol/L CdCl2处理16HBE细胞12、24和48 h。利用qRT-PCR法检测16HBE细胞ASPM基因表达变化情况;采用慢病毒稳定表达技术构建ASPM缺陷细胞株;采用硫代巴比妥酸(TBA)法检测各组细胞内丙二醛(MDA)含量,用水溶性四唑盐法检测细胞中超氧化物歧化酶(SOD)活力。结果与空白对照组(未用CdCl2处理的16HBE细胞)相比,16HBE细胞随着CdCl2染毒剂量与时间的增加,SOD活性出现降低,MDA出现增加的趋势;与空白对照组(未用CdCl2处理的16HBE细胞)相比,实验组ASPM mRNA相对表达量与CdCl2呈现出时间-剂量关系(P<0.05);ASPM基因低表达细胞株构建的基因沉默率为96.9%(P<0.05);与相同CdCl2剂量点和时间点处理的16HBE细胞相比,ASPM缺陷细胞的SOD含量低于16HBE细胞,而MDA含量高于16HBE细胞(P<0.05)。结论 ASPM基因缺陷细胞加剧CdCl2所致氧化损伤,提示ASPM基因在CdCl2致16HBE细胞氧化损伤过程中发挥拮抗作用。 展开更多
关键词 16HBE细胞 超氧化物歧化酶 丙二醛 氯化镉 aspm基因
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产前超声结合NGS在一例MCPH5型胎儿产前诊断中的应用 被引量:1
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作者 曾玉坤 刘渊 +2 位作者 余丽华 刘玲 丁红珂 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第5期863-866,共4页
目的针对有不良孕产史且妊娠超声再次发现胎儿头围偏小家系,探寻致病基因及变异位点,为临床后续进行遗传咨询及产前诊断提供科学依据。方法查询并收集胎儿超声检查结果,采集脐血及夫妻双方外周血样本提取DNA,使用高通量测序的方法结合... 目的针对有不良孕产史且妊娠超声再次发现胎儿头围偏小家系,探寻致病基因及变异位点,为临床后续进行遗传咨询及产前诊断提供科学依据。方法查询并收集胎儿超声检查结果,采集脐血及夫妻双方外周血样本提取DNA,使用高通量测序的方法结合生物信息学分析筛选可能致病的基因及变异位点,并针对相应变异位点进行家系Sanger测序验证。结果胎儿超声结果提示双顶径及头围明显小于孕周,高通量检测结果提示疾病相关基因ASPM存在c.6970dupA杂合复合c.7541delA杂合疑似致病变异。结论通过影像学检测提示信息,结合NGS方法快速诊断MCPH5型胎儿一例。 展开更多
关键词 原发性小头畸形 aspm基因 产前诊断
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