日照麻鸡ATPATP5A1W基因的克隆和生物信息学分析

ATP5A1W(ATP synthase subunit alpha)基因定位于鸟类W染色体上,其编码产物参与氧化磷酸化,在跨膜质子动力势的推动下合成ATP。本试验以日照麻鸡为试验材料,采用RT-PCR技术克隆ATP5A1W基因,结合生物信息学方法分析其生物学特征。结果表明,克隆得到日照麻鸡ATP5A1W基因c DNA长度为1 695 bp,开放阅读框1 662 bp,编码553个氨基酸。该核苷酸序列与Gen Bank(登录号:XM_429118)上预测的核苷酸序列一致性为100%。进化树分析表明,日照麻鸡ATP5A1W氨基酸序列与绿头鸭和鹅的进化关系较近。鸡ATP5A1W蛋白亚细胞定位于线粒体(78.3%)、细胞质(8.7%)、细胞核(8.7%)和细胞外(4.3%)。预测鸡ATP5A1W蛋白二级结构由42.86%的α-螺旋,19.89%的延伸链,10.49%的β-转角,26.76%的无规则卷曲组成。此研究结果将为开展日照麻鸡ATP5A1W基因的结构和功能提供参考。