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版纳微型猪近交系AURKC的分子特征及其在睾丸中的转录调控研究 被引量:1
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作者 代红梅 刘志朋 +4 位作者 张霞 霍海龙 王配 赵筱 霍金龙 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期88-96,共9页
为研究AURKC基因在版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line, BMI)精子发生中的功能特性及表达调控,本研究利用RNA-seq技术对BMI 12月龄成年公猪的睾丸进行全转录组测序;采用RT-PCR技术从BMI睾丸获得AURKC全长编码序列,并分析其分... 为研究AURKC基因在版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line, BMI)精子发生中的功能特性及表达调控,本研究利用RNA-seq技术对BMI 12月龄成年公猪的睾丸进行全转录组测序;采用RT-PCR技术从BMI睾丸获得AURKC全长编码序列,并分析其分子结构、蛋白保守结构域及功能特性,构建多物种氨基酸序列进化树和蛋白互作网络图;利用睾丸全转录组测序数据,借助相关数据库,对AURKC基因进行功能注释,预测调控的ceRNA(competing endogenous RNA,竞争性内源RNA),并构建转录调控网络。结果表明:AURKC在BMI睾丸中原始平均表达量为721.25,其对应转录本ENSSSCT00000051895.2的平均表达量(TPM)值为18.37,该基因CDS长894 bp(GenBank登录号:OK042305),编码297个氨基酸,位于猪6号染色体,含7个外显子;氨基酸序列N端亲水,C端疏水,含269个氨基酸组成的结构域S_TKC,二级结构中无规则卷曲占比最大;进化分析表明,AURKC氨基酸序列在哺乳动物多物种间具有高度的保守性及进化同源性;蛋白互作网络分析发现AURKC与10个蛋白存在相互作用;功能注释发现AURKC涉及26个GO,包括11个生物学过程,9个分子功能,6个细胞组分;ceRNA网络分析表明AURKC受ssc-miR-28-3p、ssc-miR-202-3p、ssc-miR-1296-5p和ssc-miR-361-5p共4个miRNA靶向调控。本研究可为进一步深入研究AURKC基因在BMI精子发生中的功能及表达调控奠定基础。 展开更多
关键词 版纳微型猪近交系 aurkc 生物信息学分析 蛋白互作 功能注释 调控网络
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广西人群AURKC基因rs1008073和rs2302060位点遗传多态性与畸形精子症的相关性研究
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作者 刘中林 韦玉霞 +4 位作者 庞晓霞 廖碧云 陈兴鸿 杨凤莲 王俊利 《右江民族医学院学报》 2020年第6期723-726,730,共5页
目的探讨广西人群AURKC基因rs1008073和rs2302060位点与畸形精子症遗传易感性关系。方法使用病例-对照研究方法,选取142例畸形精子症患者为病例组,144例精子形态学检查正常患者为对照组,采用多重单碱基延伸PCR(SNaPshot)分型技术对所选... 目的探讨广西人群AURKC基因rs1008073和rs2302060位点与畸形精子症遗传易感性关系。方法使用病例-对照研究方法,选取142例畸形精子症患者为病例组,144例精子形态学检查正常患者为对照组,采用多重单碱基延伸PCR(SNaPshot)分型技术对所选研究对象的AURKC基因多态性位点进行基因分型,比较两组间基因型和等位基因分布频率的差异,再用SHEsis软件分析AURKC基因两个位点的单倍型。结果AURKC基因rs1008073和rs2302060位点的基因型和等位基因型频率在两组间分布差异无统计学意义(P>0.05)。单倍型分析显示,两组间主要有CT和GC两种单倍型,但未发现这两种单倍型与畸形精子症存在相关性。结论广西人群AURKC基因rs1008073和rs2302060位点遗传多态性与畸形精子症的发病风险无相关性。 展开更多
关键词 aurkc基因 畸形精子症 遗传多态性
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男性不育及遗传因素研究进展 被引量:6
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作者 王志强 王剑 陕文生 《河北医药》 CAS 2017年第8期1250-1253,共4页
不育症是一个严重的社会问题,其中男性因素所致的不育约占到所有不育症的一半。我们计划在近期的文献的背景下探讨在人类精子发生过程中起着重要的作用的在Y染色体或者常染色体上的基因。检索以下关键词:男性不育基因,精子发生的遗传学... 不育症是一个严重的社会问题,其中男性因素所致的不育约占到所有不育症的一半。我们计划在近期的文献的背景下探讨在人类精子发生过程中起着重要的作用的在Y染色体或者常染色体上的基因。检索以下关键词:男性不育基因,精子发生的遗传学来获得本文所需信息。结果利用基因敲除小鼠模型阐明的生精功能机制已经取得了显著的进展,但是该信息并未直接应用于人。然而,已经证实几个重要基因的突变可以引起不育。本文中将讨论Y染色体中无精子症区域(AZF)的一些确定可导致不育的基因,和常染色体上的SYKP3,KLHL10,AURKC和SPATA16基因。阐明男性不育的潜在基因,可以帮助我们更好理解不育的起因,从而帮助我们更好地为患者量身定制治疗策略。 展开更多
关键词 男性不育 无精子症因素 aurkc KLHL10 SPATA16 SYCP3
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极光激酶C基因的c.144delC多态性与四川地区特发性男性畸形精子症的相关性研究 被引量:1
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作者 穆雪梅 崔方英 +1 位作者 张卓 丁显平 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1069-1074,共6页
目的:位于极光激酶C(AURKC)基因外显子区域的突变位点c.144del C在北非等地区的男性畸型精子症人群中十分常见,本试验主要探讨这个位点的基因多态性(SNP)与中国四川地区汉族男性畸形精子症的相关性。方法:采用聚合酶链反应(PCR)和二代... 目的:位于极光激酶C(AURKC)基因外显子区域的突变位点c.144del C在北非等地区的男性畸型精子症人群中十分常见,本试验主要探讨这个位点的基因多态性(SNP)与中国四川地区汉族男性畸形精子症的相关性。方法:采用聚合酶链反应(PCR)和二代测序的方法,分析98例畸形精子症患者和162例正常男性中AURKC基因的c.144del C多态性位点与男性不育的相关性。结果:在98例典型男性畸型精子症和162例对照组中,均未发现c.144del C突变位点以及其他有义突变。结论:综合分析本实验数据并结合国外研究得出,四川地区男性畸形精子症可能与AURKC基因的c.144del C突变没有相关性。因此,在中国临床上对畸形精子症的男性人群大规模开展AURKC基因型的检测可能并不是十分必要的。 展开更多
关键词 男性不育 畸形精子症 aurkc基因 突变 多态性
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