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致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析 被引量:3
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作者 兰成忠 陈庆河 +5 位作者 汪进仕 胡方平 李本金 赵健 邱荣洲 翁启勇 《福建农业学报》 CAS 2008年第3期235-238,共4页
根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序。结果表明,该片段的长度为451 bp,经序列分... 根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序。结果表明,该片段的长度为451 bp,经序列分析表明,其氨基酸编码序列为441 bp,共编码147个氨基酸。BLAST分析结果显示,该片段核苷酸序列与无毒基因AVR3a核苷酸序列的同源性为99.34%,氨基酸序列比对结果表明,氨基酸序列在第19、80和103位存在着差异,这些核苷酸序列差异以及某些关键氨基酸的改变有可能是导致不同菌株中AVR3a毒性变异的原因。 展开更多
关键词 马铃薯 致病疫霉菌 无毒基因avr3a 毒性 基因克隆 序列分析
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RxLR效应因子Avr3a、Avr4和IPI-O在中国致病疫霉菌株中的组成 被引量:1
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作者 韩淼 汪晓雯 +1 位作者 朱小琼 国立耘 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期347-356,共10页
由致病疫霉(Phytophthora infestans)引起的马铃薯和番茄的晚疫病是一种世界范围内的重要病害。在致病疫霉与寄主的互作过程中,效应因子对于病原物能否成功入侵与定殖起到了关键作用。本研究检测了来自中国马铃薯主产区的37株致病疫霉... 由致病疫霉(Phytophthora infestans)引起的马铃薯和番茄的晚疫病是一种世界范围内的重要病害。在致病疫霉与寄主的互作过程中,效应因子对于病原物能否成功入侵与定殖起到了关键作用。本研究检测了来自中国马铃薯主产区的37株致病疫霉菌中编码Avr3a,Avr4和IPI-O三种效应因子的基因组成,研究发现来自国内的所有供试菌株中只有1株分离自马铃薯的和2株分离自番茄的致病疫霉含有无毒基因Avr3a(编码Avr3a^(KI)),其余菌株均含有avr3a(编码Avr3a^(EM));所有菌株中都仅含有编码截断蛋白的avr4;从37株国内菌株中共检测到了25种ipiO变异型,其中20种为新变异型,聚类分析的结果表明这些变异型仍属于已报道的三类ipiO,而且大部分ipiO变异型为无毒型,可以被抗性基因Rpi-blb1识别。该研究结果表明avr3a和avr4普遍存在于中国致病疫霉菌株中,推测大部分菌株可以克服R3a和R4抗性基因;而ipiO的无毒变异型仍然普遍存在于国内致病疫霉群体中,可以被马铃薯含有的抗性基因Rpi-blb1识别。 展开更多
关键词 致病疫霉 卵菌 RXLR效应因子 avr3a Avr4 IPI-O
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大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)无毒基因Avr1a、Avr1k及Avr3a的分子鉴定 被引量:1
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作者 孙龙 文景芝 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1533-1539,共7页
【目的】为大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)无毒基因Avr1a、Avr1k和Avr3a快速分子检测提供方法,也为P.sojae其它无毒基因的快速分子检测研究提供依据。【方法】依据GenBank中公布的P.sojae无毒基因Avr1a、Avr1k和Avr3a的序列设计引物,... 【目的】为大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)无毒基因Avr1a、Avr1k和Avr3a快速分子检测提供方法,也为P.sojae其它无毒基因的快速分子检测研究提供依据。【方法】依据GenBank中公布的P.sojae无毒基因Avr1a、Avr1k和Avr3a的序列设计引物,分别筛选出特异性引物,在PCR反应体系和扩增条件优化基础上,对已经接种鉴定过无毒基因Avr1a、Avr1k和Avr3a的86株P.sojae进行PCR检测,建立一套P.sojae无毒基因Avr1a、Avr1k和Avr3a的特异性检测体系。将分子鉴定和接种鉴定结果进行比对,将扩增出的真阳性条带和假阳性条带分别进行胶回收和克隆测序,测序结果分别与3个无毒基因的原序列比对,判定分子标记方法是否适于Avr1a、Avr1k和Avr3a的快速检测。【结果】筛选出的特异性引物均能从含有对应无毒基因的菌株中扩增出约550 bp的条带。Avr1a、Avr1k和Avr3a的分子鉴定及接种鉴定结果符合率依次为45.3%、84.9%和97.7%。3个无毒基因的真阳性条带序列与原序列一致性均达97%以上,Avr1a的假阳性条带与原序列一致性在80%左右,其余2个基因的都在30%以下。【结论】利用Avr1a、Avr1k和Avr3a基因序列分别设计引物建立的检测体系可以用于Avr3a的快速检测,不适于Avr1a的快速检测,是否适合Avr1k的快速检测尚不清楚。 展开更多
关键词 大豆疫霉菌 无毒基因 Avr1a Avr1k avr3a 分子鉴定
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一种小型无人机大气数据测量系统设计 被引量:4
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作者 张鹏 徐晓旭 《测控技术》 CSCD 北大核心 2014年第6期44-48,共5页
针对现有的无人机大气数据测量的设备种类稀少、价格昂贵、精度偏低等问题,设计了一个小型无人机大气数据测量系统样机。结合无人机大气数据测量系统的工作原理,选用32位高速处理芯片(AVR32UC3B0256)、新型数字式压力传感器BMP085,以AVR... 针对现有的无人机大气数据测量的设备种类稀少、价格昂贵、精度偏低等问题,设计了一个小型无人机大气数据测量系统样机。结合无人机大气数据测量系统的工作原理,选用32位高速处理芯片(AVR32UC3B0256)、新型数字式压力传感器BMP085,以AVR32 Studio为开发平台,采用去最值滑动平均滤波算法进行数据处理,实时测算出飞行参数。经实验验证,所设计的系统具有实时性、低功耗、小型化、低成本等特点,能较好地完成无人机气压高度、指示空速、温度等大气数据的测量,有较强的现实意义。 展开更多
关键词 无人机 大气数据 AVR32UC3B0256 BMP085
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晚疫病过敏反应阻断突变体抗氧化酶与相关基因的变化分析
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作者 徐蜜蔓 贾芝琪 +2 位作者 徐俊芝 王林忠 孙守如 《河南科学》 2014年第2期172-177,共6页
马铃薯抗晚疫病基因R3a和Avr3a互作符合基因对基因假说.为了解R3a和Avr3a基因互作后过敏反应(HR反应)发生机制,本实验利用一个在番茄中构建的MM-R3a-Avr3a系统,以两份筛选到的HR反应被阻断的突变体为材料,研究它们在喷施诱导剂地塞米松(... 马铃薯抗晚疫病基因R3a和Avr3a互作符合基因对基因假说.为了解R3a和Avr3a基因互作后过敏反应(HR反应)发生机制,本实验利用一个在番茄中构建的MM-R3a-Avr3a系统,以两份筛选到的HR反应被阻断的突变体为材料,研究它们在喷施诱导剂地塞米松(DEX)诱导Avr3a基因表达后活性氧爆发、活性氧清除酶和抗氧化基因的变化情况.结果显示:MM-R3a-Avr3a在DEX处理后有O2-产生和H2O2累积并产生整株的HR反应并导致植株死亡,在突变体中也有O2-产生和H2O2累积却没有导致细胞死亡,说明突变基因与HR反应的发生关系密切;DEX处理后抗氧化酶基因SOD、PPO、CAT在转基因番茄MM-R3a-Avr3a和突变体中的变化有明显差异,由此推测番茄突变体中关键基因的突变导致活性氧清除酶和相关基因的表达发生变化.该研究为探索HR反应的发生机制及了解晚疫病抗病基因抗病机理的打下基础. 展开更多
关键词 晚疫病 HR反应 R3a基因 avr3a基因 突变体
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A Phytophthora capsici RXLR Effector Targets and Inhibits a Plant,PPlase to Suppress Endoplasmic Reticulum-Mediated Immunity 被引量:21
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作者 Guangjin Fan Yang Yang +5 位作者 Tingting Li Wenqin Lu Yu DU Xiaoyu Qiang Qujiang Wen Weixing Shan 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2018年第8期1067-1083,共17页
Phytophthora pathogens secrete a large arsenal of effectors that manipulate host processes to create an environment conducive to pathogen colonization. However, the underlying mechanisms by which Phytophthora effector... Phytophthora pathogens secrete a large arsenal of effectors that manipulate host processes to create an environment conducive to pathogen colonization. However, the underlying mechanisms by which Phytophthora effectors manipulate host plant cells still remain largely unclear. In this study, we report that PcAvr3a12, a Phytophthera capsici RXLR effector and a member of the Avr3a effector family, suppresses plant immunity by targeting and inhibiting host plant peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPlase). Overexpression of PcAvr3a 12 in Arabidopsis thaliana enhanced plant susceptibility to P. capsici. FKBP15-2, an endoplasmic reticulum (ER)-Iocalized protein, was identified as a host target of PcAvr3a12 during early P. capsici infection. Analyses of A. thaliana T-DNA insertion mutant (fkbp15-2), RNAi, and overexpression lines consistently showed that FKBP15-2 positively regulates plant immunity in response to Phytophthora infection. FKBP15-2 possesses PPlase activity essential for its contribution to immunity but is directly suppressed by PcAvr3a12. Interestingly, we found that FKBP15-2 is involved in ER stress sensing and is required for ER stress-mediated plant immunity. Taken together, these results suggest that P. capsici deploys an RXLR effector, PcAvr3a12, to facilitate infection by targeting and suppressing a novel ER-Iocalized PPlase, FKBP15-2, which is required for ER stress-mediated plant immunity. 展开更多
关键词 RXLR effector avr3a FKBP ER stress IMMUNITY Phytophthora capsici
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