结核分枝杆菌AccD5蛋白的生物信息学分析

目的应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌AccD5基因编码蛋白的结构和功能。方法从NCBI数据库获取AccD5基本的基因信息;应用ProtParam软件预测AccD5蛋白的理化性质;利用SignaIP 4.1和TMHMM分析其信号肽和跨膜区;利用在线分析Expasy工具分析蛋白二级结构,建立蛋白三级结构模型;利用BepiPred 1.0Server和SYFPEITHI分析蛋白的B细胞及T细胞抗原表位。结果AccD5蛋白共548个氨基酸,分子式为C2621H4153N727O810S17,分子质量单位(Mr)为59.354 2×103,理论等电点为5.19,脂溶性系数为91.15,不稳定性指数为31.21,亲水性平均系数为-0.16,预测该蛋白为稳定性亲水性蛋白;二级结构中α-螺旋、β-转角、β-折叠、无规则卷曲分别占37.23%、10.58%、22.81%和29.38%,预测的B细胞、CTL细胞抗原表位分别为14个和25个。结论生物信息学分析AccD5为稳定蛋白,含有潜在的B、T细胞抗原表位,为研发治疗结核新药提供了潜在靶标。