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分子动力学模拟探讨Annexin A5的N-末端对其结构的影响
被引量:
2
1
作者
司孝磊
王杰
+1 位作者
李家璜
华子春
《药物生物技术》
CAS
2017年第4期283-288,共6页
研究ANX A5的N-末端存在与否对其核心区域结构以及四级结构的影响。ANX家族蛋白的显著特征是含有高度保守的C-端核心序列以及多变的N-末端结构,核心序列由4个重复的同源序列构成,具有明显的同源性,而N-末端的序列及长度在进化过程中表...
研究ANX A5的N-末端存在与否对其核心区域结构以及四级结构的影响。ANX家族蛋白的显著特征是含有高度保守的C-端核心序列以及多变的N-末端结构,核心序列由4个重复的同源序列构成,具有明显的同源性,而N-末端的序列及长度在进化过程中表现出很大的多样性。为了研究N-末端对ANX蛋白的意义,文章以ANX A5为例,采用分子动力学模拟的手段分别对ANX A5单体和三聚体进行了模拟,研究N-末端对ANX A5的核心区域结构以及四级结构的影响。模拟结果显示,N-末端存在与否并不影响ANX A5单体/亚基的结构,对钙离子的结合也没有大的影响;但是N-末端存在与否对ANX A5核心序列四级结构造成了很大的影响,三聚体有加速分散的趋势,从而猜测N-末端对ANX A5的亚基之间聚合有重要作用。综上可得,N-末端存在与否不会对其核心区域的结构稳定以及与Ca^(2+)的结合造成大的影响,但是对于ANX A5三聚体结构的形成是必不可少的。
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关键词
膜联蛋白A5
N-末端
蛋白核心序列
三聚体的形成
四级结构
分子动力学
原文传递
人肝癌细胞转移相关蛋白膜联蛋白Ⅱ的筛查与分析
被引量:
5
2
作者
代智
周俭
+2 位作者
李雪飞
刘银坤
樊嘉
《中华肝脏病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第8期563-566,共4页
目的应用糖组学方法筛查肝癌转移相关的异常核心岩藻糖基化蛋白,分析膜联蛋白Ⅱ(annexinⅡ)与肝癌细胞转移的关系。方法双向电泳(2-DE)、凝集素亲和印迹及沉淀联合质谱筛查并验证肝癌转移相关核心岩藻糖基化蛋白;实时荧光定量PCR...
目的应用糖组学方法筛查肝癌转移相关的异常核心岩藻糖基化蛋白,分析膜联蛋白Ⅱ(annexinⅡ)与肝癌细胞转移的关系。方法双向电泳(2-DE)、凝集素亲和印迹及沉淀联合质谱筛查并验证肝癌转移相关核心岩藻糖基化蛋白;实时荧光定量PCR、细胞免疫荧光和Western blot测定annexinⅡ基因和蛋白表达。结果不同转移潜能人肝癌细胞有核心岩藻糖基化蛋白差异表达,鉴定并验证annexinⅡ岩藻糖基化与肝癌转移相关;它分布于细胞质,在MHCC97-L和MHCC97-H中基因和蛋白质表达较Hep3B高。结论AnnexinⅡ转录、翻译水平和核心岩藻糖基化增加可能与肝癌转移潜能相关。
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关键词
癌
肝细胞
肿瘤转移
annexin
Ⅱ
核心岩藻糖基化
原文传递
题名
分子动力学模拟探讨Annexin A5的N-末端对其结构的影响
被引量:
2
1
作者
司孝磊
王杰
李家璜
华子春
机构
南京大学生命科学学院
常州南京大学高新技术研究院
出处
《药物生物技术》
CAS
2017年第4期283-288,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81630092
No.81573338)
文摘
研究ANX A5的N-末端存在与否对其核心区域结构以及四级结构的影响。ANX家族蛋白的显著特征是含有高度保守的C-端核心序列以及多变的N-末端结构,核心序列由4个重复的同源序列构成,具有明显的同源性,而N-末端的序列及长度在进化过程中表现出很大的多样性。为了研究N-末端对ANX蛋白的意义,文章以ANX A5为例,采用分子动力学模拟的手段分别对ANX A5单体和三聚体进行了模拟,研究N-末端对ANX A5的核心区域结构以及四级结构的影响。模拟结果显示,N-末端存在与否并不影响ANX A5单体/亚基的结构,对钙离子的结合也没有大的影响;但是N-末端存在与否对ANX A5核心序列四级结构造成了很大的影响,三聚体有加速分散的趋势,从而猜测N-末端对ANX A5的亚基之间聚合有重要作用。综上可得,N-末端存在与否不会对其核心区域的结构稳定以及与Ca^(2+)的结合造成大的影响,但是对于ANX A5三聚体结构的形成是必不可少的。
关键词
膜联蛋白A5
N-末端
蛋白核心序列
三聚体的形成
四级结构
分子动力学
Keywords
annexin
A5
N-terminus
annexin core
Formation of trimer
Quaternary structure
Molecular dynamics simulations
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
人肝癌细胞转移相关蛋白膜联蛋白Ⅱ的筛查与分析
被引量:
5
2
作者
代智
周俭
李雪飞
刘银坤
樊嘉
机构
复旦大学附属中山医院肝癌研究所
出处
《中华肝脏病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第8期563-566,共4页
基金
国家“973”项目(001CB510205)和“863”项目(2004CB520802)
文摘
目的应用糖组学方法筛查肝癌转移相关的异常核心岩藻糖基化蛋白,分析膜联蛋白Ⅱ(annexinⅡ)与肝癌细胞转移的关系。方法双向电泳(2-DE)、凝集素亲和印迹及沉淀联合质谱筛查并验证肝癌转移相关核心岩藻糖基化蛋白;实时荧光定量PCR、细胞免疫荧光和Western blot测定annexinⅡ基因和蛋白表达。结果不同转移潜能人肝癌细胞有核心岩藻糖基化蛋白差异表达,鉴定并验证annexinⅡ岩藻糖基化与肝癌转移相关;它分布于细胞质,在MHCC97-L和MHCC97-H中基因和蛋白质表达较Hep3B高。结论AnnexinⅡ转录、翻译水平和核心岩藻糖基化增加可能与肝癌转移潜能相关。
关键词
癌
肝细胞
肿瘤转移
annexin
Ⅱ
核心岩藻糖基化
Keywords
Carcinoma, hepatocellular
Neoplasm metastasis
annexin
Ⅱ
core
-fucosylation
分类号
R686 [医药卫生—骨科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
分子动力学模拟探讨Annexin A5的N-末端对其结构的影响
司孝磊
王杰
李家璜
华子春
《药物生物技术》
CAS
2017
2
原文传递
2
人肝癌细胞转移相关蛋白膜联蛋白Ⅱ的筛查与分析
代智
周俭
李雪飞
刘银坤
樊嘉
《中华肝脏病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007
5
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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