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鲤多拷贝基因Apo-14kDa和ApoE的系统学分析和其在胚胎发育中的功能探索
被引量:
1
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作者
崔润滋
万玉美
+3 位作者
孙金生
汪金兔
徐鹏
孙效文
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期741-755,共15页
本研究首次从鲤(Cyprinus carpio)中得到2种形式的14 kD载脂蛋白(Apo-14kD)和4种形式的载脂蛋白E(ApoE),分别为Apo-14kDa-a和Apo-14kDa-b(同源性为79%)、ApoE-a1和ApoE-a2(同源性为91%)以及ApoE-b1和ApoE-b2(同源性为90%)。系统学分析表...
本研究首次从鲤(Cyprinus carpio)中得到2种形式的14 kD载脂蛋白(Apo-14kD)和4种形式的载脂蛋白E(ApoE),分别为Apo-14kDa-a和Apo-14kDa-b(同源性为79%)、ApoE-a1和ApoE-a2(同源性为91%)以及ApoE-b1和ApoE-b2(同源性为90%)。系统学分析表明,Apo-14kDa-a与多数硬骨鱼的Apo-14kDa同源性高于与Apo-14kDa-b的同源性,而Apo-14kDa-b与草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的Apo-14kDa同源性较高,提示二者在鲤科鱼类中的分化时间较早;ApoE-a和ApoE-b的分化时间也应该处于鲤科鱼类分化的早期阶段,随后进一步分化出4个同源基因。半定量RT-PCR结果显示Apo-14kDa-a基因在肝、头肾中大量表达,肠中微弱表达,其他组织无表达,Apo-14kDa-b基因只在肝表达;ApoE-a1基因和ApoE-a2基因只在肠表达;而ApoE-b1基因和ApoE-b2基因均在脑、皮肤、鳃、肝、精巢、肠、心脏、肌肉、体肾、头肾中表达,但在脾和卵巢发生表达分化。进一步的qRT-PCR检测发现6个基因在不同胚胎发育时期的表达模式也有较大不同,且在不同时期的表达均存在阶段差异性。另外,qRT-PCR分析证实Apo-14kDa基因和ApoE基因均有可能在鲤胚胎发育过程中发挥着重要且显著不同的作用。
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关键词
鲤
载脂蛋白
apo-14kda
APOE
分子系统学
胚胎发育
基因功能
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题名
鲤多拷贝基因Apo-14kDa和ApoE的系统学分析和其在胚胎发育中的功能探索
被引量:
1
1
作者
崔润滋
万玉美
孙金生
汪金兔
徐鹏
孙效文
机构
中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心
天津师范大学生命科学学院
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期741-755,共15页
基金
国家863计划项目(2009AA10Z105
2011AA100401)
+1 种基金
农业部公益性行业科研专项项目(200903045)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2009B002)
文摘
本研究首次从鲤(Cyprinus carpio)中得到2种形式的14 kD载脂蛋白(Apo-14kD)和4种形式的载脂蛋白E(ApoE),分别为Apo-14kDa-a和Apo-14kDa-b(同源性为79%)、ApoE-a1和ApoE-a2(同源性为91%)以及ApoE-b1和ApoE-b2(同源性为90%)。系统学分析表明,Apo-14kDa-a与多数硬骨鱼的Apo-14kDa同源性高于与Apo-14kDa-b的同源性,而Apo-14kDa-b与草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的Apo-14kDa同源性较高,提示二者在鲤科鱼类中的分化时间较早;ApoE-a和ApoE-b的分化时间也应该处于鲤科鱼类分化的早期阶段,随后进一步分化出4个同源基因。半定量RT-PCR结果显示Apo-14kDa-a基因在肝、头肾中大量表达,肠中微弱表达,其他组织无表达,Apo-14kDa-b基因只在肝表达;ApoE-a1基因和ApoE-a2基因只在肠表达;而ApoE-b1基因和ApoE-b2基因均在脑、皮肤、鳃、肝、精巢、肠、心脏、肌肉、体肾、头肾中表达,但在脾和卵巢发生表达分化。进一步的qRT-PCR检测发现6个基因在不同胚胎发育时期的表达模式也有较大不同,且在不同时期的表达均存在阶段差异性。另外,qRT-PCR分析证实Apo-14kDa基因和ApoE基因均有可能在鲤胚胎发育过程中发挥着重要且显著不同的作用。
关键词
鲤
载脂蛋白
apo-14kda
APOE
分子系统学
胚胎发育
基因功能
Keywords
Cyprinus carpio
apolipoprotein
apo-14kda
ApoE
paralogs
molecular phylogeny
embryonic de- velopment
gene function
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲤多拷贝基因Apo-14kDa和ApoE的系统学分析和其在胚胎发育中的功能探索
崔润滋
万玉美
孙金生
汪金兔
徐鹏
孙效文
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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职称材料
已选择
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参考文献
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统计分析
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