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Genetic Characteristics and Antimicrobial Susceptibility of Arcobacter butzleri Isolates from Raw Chicken Meat and Patients with Diarrhea in China 被引量:2
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作者 WANG Yuan Yuan ZHOU Gui Lan +8 位作者 LI Ying GU Yi Xin HE Mu ZHANG Shuang JI Guo Qiang YANG Jie WANG Miao MA Hong Mei ZHANG Mao Jun 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2021年第12期1024-1028,共5页
Arcobacter is an emerging foodborne pathogen worldwide.In this study,the prevalence,antimicrobial susceptibility and genetic characteristics of Arcobacter from different sources were investigated.Eighteen A.butzleri i... Arcobacter is an emerging foodborne pathogen worldwide.In this study,the prevalence,antimicrobial susceptibility and genetic characteristics of Arcobacter from different sources were investigated.Eighteen A.butzleri isolates were obtained from 60 raw chicken meat samples(16/60,27%)and 150 patients with diarrhea(2/150,1.3%).The resistance ratios to nalidixic acid,ciprofloxacin,clindamycin,chloramphenicol,and florfenicol were 83.33%(15/18),38.89%(7/18),38.89%(7/18),33.33%(6/18)and 33.33%(6/18),respectively.We performed whole genome sequencing of the 18 isolates,and we predicted antibiotic resistance genes and virulence factors by using assembled genomes through blastx analysis.Two resistance genes,blaOXA-464 and tet(H),and the C254T mutation in gyrA,were identified in the genomes of some resistant isolates.Furthermore,virulence genes,such as flgG,flhA,flhB,fliI,fliP,motA,cadF,cjl349,ciaB,mviN,pldA and tlyA,were found in all strains,whereas hecA,hecB and iroE were found in only some strains.Phylogenetic tree analysis of A.butzleri isolates on the basis of the core-genome single nucleotide polymorphisms showed that two isolates from patients with diarrhea clustered together,separately from the isolates from raw chicken and the chicken strains.This study is the first comprehensive analysis of Arcobacter isolated in Beijing. 展开更多
关键词 arcobacter arcobacter butzleri PREVALENCE Whole genome sequence Antimicrobial susceptibility Genomic structure
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Arcobacter butzleri脂蛋白的in silico方法鉴定与功能分析
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作者 孙理云 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期974-978,共5页
目的鉴别已公布基因组序列的Arcobacter butzleri RM4018株的脂蛋白(Lpp)。方法首先从GenBank获取由A.butzleriRM4018基因组推测的蛋白质氨基酸序列,然后利用Lpp预测软件PrositeScan和DOLOP预测05ZYH33株的Lpp,采用SignalP 3.0 HMM、Pre... 目的鉴别已公布基因组序列的Arcobacter butzleri RM4018株的脂蛋白(Lpp)。方法首先从GenBank获取由A.butzleriRM4018基因组推测的蛋白质氨基酸序列,然后利用Lpp预测软件PrositeScan和DOLOP预测05ZYH33株的Lpp,采用SignalP 3.0 HMM、PrediSi、Phobius、LipoP-HMM和TMHMM version 2.0分析预测的Lpp的信号肽,然后经"多数票决法"确定Lpp;最后利用InterProScan和BlastP服务器对鉴定的Lpp进行功能分析。结果鉴定出54种Lpp,占A.butzleri蛋白质组的2.435%。经分析,约28种Lpp的脂蛋白盒基序为〔F〕〔ASTV〕〔GA〕C,约6种为〔L〕〔ASTV〕〔GA〕C。34种蛋白为假定蛋白,功能未知;YP_001489204、YP_001489480和YP_001491078等3种Lpp为酶类,YP_001489759、YP_001489957、YP_001491044、YP_001491046、YP_001491105和YP_001491107等6种与细菌的物质运输/药物抗性有关。YP_001489154是鞭毛成分;YP_001489112是补体结合蛋白,可能与细菌逃避宿主的免疫功能有关。结论这些资料提示一些Lpp可能在A.butzleriRM4018的生理和致病性方面具有作用。 展开更多
关键词 arcobacter butzleri 脂蛋白 生物信息学分析 功能预测
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动物性食品源弓形菌23S rRNA基因PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 毕水莲 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第14期3419-3423,共5页
建立了一种快速、准确检测弓形菌(Arcobacter)的PCR方法。根据弓形菌23S rRNA基因序列设计引物,对弓形菌标准菌株、弓形菌食品分离株及非弓形菌属菌株进行PCR扩增。结果表明,弓形菌标准菌株和35株弓形菌食品分离株扩增后均可得到688 bp... 建立了一种快速、准确检测弓形菌(Arcobacter)的PCR方法。根据弓形菌23S rRNA基因序列设计引物,对弓形菌标准菌株、弓形菌食品分离株及非弓形菌属菌株进行PCR扩增。结果表明,弓形菌标准菌株和35株弓形菌食品分离株扩增后均可得到688 bp的目的条带,11株非弓形菌属菌株均未见任何扩增条带,对弓形菌的最低检测限为1.12×103CFU/mL。该方法操作简单、检测周期短、灵敏度高、特异性好,可用于食品中弓形菌的快速检测。 展开更多
关键词 食源性致病菌 弓形菌(arcobacter) 聚合酶链式反应 23S RRNA基因
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尿液微生物燃料电池研究 被引量:2
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作者 刘柯 李大平 王娟 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期36-40,共5页
尿液是市政污水中氮、磷与COD的主要来源,将尿液从污水系统中分离单独处理可以缓解城市污水处理厂有机物、营养素的超负荷难题.以源分离的尿液为底物,研究微生物燃料电池的产电特征及其污染物去除效果,并进一步考察影响系统产电性能的因... 尿液是市政污水中氮、磷与COD的主要来源,将尿液从污水系统中分离单独处理可以缓解城市污水处理厂有机物、营养素的超负荷难题.以源分离的尿液为底物,研究微生物燃料电池的产电特征及其污染物去除效果,并进一步考察影响系统产电性能的因素.结果显示:在超过6个月的试验过程中,伴随有机物和总氮的减少,系统可保持长期稳定的功率输出.COD和总氮的最高去除率为92.9%和65.6%,系统最大输出功率为388.2 m W/m2,这也是迄今尿液微生物燃料电池所获得的最高功率.阳极碳毡表面菌群分析显示具有电化学活性的Arcobacter和具有发酵功能的Bacteroides为优势菌群.氨氮积累、微生物淤积以及尿液中的物质沉淀等是影响尿液微生物燃料电池性能的主要因素.研究结果表明,尿液微生物燃料电池高效地实现了在污染物去除的同时获得高输出功率,体系中Arcobacter是一种新型的胞外产电菌,其强电化学作用可利用在生物电能的获得过程中. 展开更多
关键词 微生物燃料电池 源分离尿液 生物能源 脱氮 arcobacter
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