利用知识发现工具Arrowsmith探讨当归与痛经的相关性

利用知识发现工具Arrowsmith,探讨当归与痛经的相关性,发现当归中部分有效成分对痛经有潜在的治疗作用,另一部分有效成分则不利于痛经的治疗,说明基于文献的知识发现形成的知识关联结果,不仅能为实验室试验或临床观察提供可证实或否定的数据,也能为研究者提供新的研究思路。

基于文献的知识发现工具—Arrowsmith

专业文献间的隐性关联往往与科学发现有着重大意义 ,芝加哥大学Swanson教授于 1986年创立了一种基于非相关文献知识发现的方法 ,通过找寻隐藏关联用于知识发现 ,对其方法实现工具—Arrowsmith软件的设计思想、运行机制、功能及数据处理过程进行了介绍。

Arrowsmith在预测中药副作用研究中的思路探讨

美国芝加哥大学情报学教授Don.R.Swanson创立的情报学知识发现方法是揭示非相关文献及学科间隐秘联系的强有力的工具。本文简要介绍了闭合式的知识发现方法及其实现工具Arrowsmith软件系统,并对其在预测中药不良反应研究中的思路进行探讨。

基于知识发现工具Arrowsmith探求防己与附子配伍减毒机制的研究

目的:探求防己与附子配伍减毒的可能机制。方法:非相关文献知识发现工具ARROWSMITH在线软件。结果:防己中的有效成分粉防己碱对包括L-型钙离子通道在内的钙离子通道具有拮抗作用,而L-型钙离子通道也是附子中乌头碱在引发心率失常过程中起关键作用的离子靶点。结论:防己可能通过其有效成分粉防己碱对心肌细胞膜上的L-型钙离子通道进行阻滞,从而对抗附子中乌头碱引起心肌细胞内钙离子增加而导致的心律失常,进而发挥配伍解毒的作用。基于非相关文献知识发现法得到的知识关联结果,不仅能为研究者提供新的研究思路,亦可为科学研究提供更为全面的数据支持。

基于Arrowsmith探讨虫草素与肠粘膜屏障功能稳定的潜在相关性

目的探讨人工培养的蛹虫草中的虫草素对肠粘膜免疫屏障功能损伤保护作用的可能机制。方法非相关文献知识工具ARROWSMITH软件。结果虫草素在分子或细胞水平对白细胞介素10(IL-10)、自由基、一氧化氮(NO)、血小板聚集等相关因子具有调节作用,而上述指标的不同表达同时也是造成肠粘膜免疫屏障功能损伤的重要相关因素。结论蛹虫草中的虫草素可能通过促进细胞中IL-10的释放、清除自由基、拮抗NO产物的生成、抑制血小板聚集等环节对肠粘膜免疫屏障功能损伤发挥保护作用。基于词频和语义关联的非相关文献知识发现法能为实验室的验证性研究提供参考。

利用知识发现工具Arrowsmith探讨马齿苋与UC相关性

目的:探讨马齿苋治疗溃疡性结肠炎的可能机制。方法:用非相关文献知识工具Arrowsmith软件检索与主题相关的文献并进行分析。结果:经过文献分析发现,马齿苋主要调节NF-κB、肿瘤坏死因子α、白细胞介素-6、蛋白激酶B及肠道菌群等,而这也是IBD的重要相关因素。结论:马齿苋可能通过降低TNF-α、NF-κB、IL-6的水平,提高PI3K/AKT通路活性,对溃疡性结肠炎起治疗作用,非相关文献知识发现可能为实验室的验证性研究提供参考。

基于Arrowsmith探讨亚低温抗辐射损伤研究方向

采用Arrowsmith工具,以Pub Med所收录的文献为分析对象,探讨亚低温疗法与辐射损伤潜在的关联。结果表明,相关度极高的关键词约30个,前5位是akt、pi3k、trpv1、toll receptor、caspase-3基因靶点。

基于Arrowsmith探讨五味子与维生素D轴功能的潜在相关性

目的:通过应用知识发现工具Arrowsmith探讨和分析五味子和维生素D轴两者间可能存在的相关作用机制。方法:应用检索工具Arrowsmith来搜集并分析相关资料文献。结果:维生素D和五味子在几种疾病的病理进展和治疗上存在较高的关联性。结论:中药五味子可能经维生素D轴对相关疾病起到疗效。

基于ARROWSMITH的医学非相关文献知识发现的方法探讨

本文介绍了ARROWSMITH系统的产生背景及结构。依托ARROWSMITH系统平台,以"甲亢"和"痛风"两个不相关疾病为例,对所查非相关文献的知识发现方法及技巧进行了探讨。为情报人员提供寻找知识发现的新途径、从而达到提高知识服务质量的目的。

利用知识发现工具Arrowsmith探讨桑白皮治疗高血压的潜在机制

目的探讨桑白皮治疗高血压的可能机制。方法利用非相关文献知识发现工具Arrowsmith软件检索。结果经过文献分析发现,桑白皮主要调节与高血压密切相关的T淋巴细胞亚群CD4+CD25+Foxp3的比例、Th2相关炎性因子、NF-κB活性等,从而发挥降压的作用。结论桑白皮可能通过上调CD4+CD25+Foxp3+Treg细胞表达、抑制CD4+T细胞功能亚群Th2、NF-κB活性,从而对高血压起治疗作用,非相关文献知识发现研究可能为实验室的验证性研究提供依据。

基于Arrowsmith从内分泌角度探讨肾虚证本质

目的:从内分泌角度探讨肾虚证本质可能的现代医学机制。方法:利用文献关联检索工具Arrowsmith进行关联文献的检索,并对检索出的文献进行分析讨论。结果及结论:中医肾虚证本质可能与肾上腺皮质功能、维生素D轴功能以及性腺功能均有关系。

基于知识发现工具Arrowsmith探索甜菜碱治疗骨关节炎的潜在机制

目的通过知识发现工具Arrowsmith探索甜菜碱治疗骨关节炎的潜在机制。方法以PubMed数据库中的文献为分析对象,以“甜菜碱”作为集合A的检索词,“骨关节炎”作为集合C的检索词进行检索,检索时间范围为2013年1月1日至2022年1月12日,筛选得到关联词列表B。通过汇总频率较高的词汇得到当前研究热点,基于此探讨甜菜碱治疗骨关节炎的潜在机制。结果关联词列表B共包含2244个关联词,按照相关度的高低排列,统计了排序前40的关联词。通过对关联词的检索、分析,选取了其中相关度最高的四个关联词“脂联素(ADP)”“Toll样受体4/核因子-κB(TLR4/NF-κB)信号通路”“高同型半胱氨酸血症(HHcy)”和“血管内皮生长因子(VEGF)”。结论甜菜碱治疗骨关节炎的机制可能与血浆ADP水平、TLR4/NF-κB信号通路、HHcy以及VEGF相关。

The prediction antidepressant effects of Chai-Hu-Jia-Long-Gu-Mu-Li decoction by Arrowsmith tool

Background:To explore the modern pharmacological mechanism of classic ancient prescription of Chinese medicine Chai-Hu-Jia-Long-Gu-Mu-Li decoction and single drug in classic ancient prescription of Chinese medicine Chai-Hu-Jia-Long-Gu-Mu-Li decoction on antidepressant from the theoretical level.Methods:The literature related search tool Arrowsmith was used with the help of Cytoscape drawing software,the relationship between classic ancient prescription of Chinese medicine Chai-Hu-Jia-Long-Gu-Mu-Li decoction and the antidepressant mechanism was analyzed.Results:Different single drugs in classic ancient prescription of Chinese medicine Chai-Hu-Jia-Long-Gu-Mu-Li decoction may play an antidepressant effect by regulatingβ-catenin,toll-like receptor 4,brain-derived neurotrophic factor,caspase-3,γ-aminobutyric acid A receptor,MAPK,Akt,ERK,AMPK,Wnt,STAT3,CREB,NMDA,iNOS,PKA,matrix metalloproteinase-9,IL-10,ApoE,P38 MAPK,MMP-2,AMPA,PPARγ,TNFα,NF-κB,TGF,CaMKII and EPO.The key antidepressant site is in the hippocampus.Conclusion:The antidepressant effect of classic ancient prescription of Chinese medicine Chai-Hu-Jia-Long-Gu-Mu-Li decoction reflects the action characteristics of multi-components,multi-targets,and multi-pathways of traditional Chinese medicine.Through the search and analysis by Arrowsmith tools,it provides a scientific basis for in-depth interpretation of the antidepressant mechanism and provides research direction and ideas for the research of traditional Chinese medicine compound prescription.

The mechanism of Xuefu Zhuyu decoction in treating erectile dysfunction based on Arrowsmith tool

Arrowsmith,a literature retrieval tool,was used to explore the theoretical pharmacological mechanism of action of Xuefu Zhuyu decoction and its single herb against erectile dysfunction.Cytoscape 3.6.1 software was used to analyze the correlation between the components of Xuefu Zhuyu decoction and the identified mechanism of action.Different herbs in Xuefu Zhuyu decoction may play a therapeutic role by regulating iNOS,COX-2,mTOR,Wnt,AMPK,Nrf2,TLR4,CYP2D6,BDNF,MAPK,Akt,STAT3,PI3K,ERK1,P38MAPK,JNK,VEGF,and other targets.The treatment of erectile dysfunction with Xuefu Zhuyu decoction embodied the multicomponent,multitarget,and multipathway.The Arrowsmith tool retrieval and analysis provided a scientific basis for further elucidation of the mechanism of Xuefu Zhuyu decoction against erectile dysfunction.

Dr. Arrowsmith ' s Defiance of Commercialism and His Pursuit of Scientific Truth

Arrowsmith, the most widely reader of Sinclair Lewis's novel, is the dramatic portrayal of a man, Martin Arrowsmith, who passionately devoted to science. Destined to become a physician and a researcher, he discovers that societal forces of commercialism, ignorance, corruption, and greed can be life-threatening obstacles. But he perseveres in his pursuit of scientific truth---even in the face of personal tragedy.Cherishing a spiritual ideal. Through the description o the characteristics of Martin Arrowsmith, Sinclair Lewis greatly attacks the American social reality by singing high praise of the spirits of seeking scientific truth and high medical virtues, while at the same time sharply satiring the commercialism and bureaucratism which dominate most people's minds.

基于Arrowsmith工具探讨逍遥散抗抑郁作用机制

采用文献关联检索工具Arrowsmith从理论层面探讨逍遥散及其单味药抗抑郁的现代药理机制。利用Arrowsmith进行关联文献的检索和发现,从逍遥散单味药、整体复方及共有关联词对文献结果进行分析整理,借助Cytoscape绘图软件对逍遥散组成药材与抗抑郁作用机制进行关联性分析。逍遥散中不同的单味药可能通过调节TLR4、TRPV1、Caspase-3、PPARG、COX-2、NRF2、PI3K、ERK1、MAPK、p38 MAPK等靶点,涉及神经-内分泌-免疫等关键通路影响焦虑、束缚应激、脾虚、学习记忆等发挥抗抑郁作用。逍遥散抗抑郁的关键作用部位在海马区。逍遥散抗抑郁作用体现了中药多成分、多靶点、多途径的作用特点。通过Arrowsmith工具检索分析为深入阐释逍遥散抗抑郁作用机制提供科学依据,为中药复方研究提供研究方向和思路。

利用知识发现工具Arrowsmith探讨龙血竭及其有效成分治疗缺血性脑卒中的潜在作用机制

目的:探讨龙血竭治疗缺血性脑卒中的可能机制。方法:运用非相关文献知识发现工具Arrowsmith在线软件,通过分析龙血竭和缺血性脑卒中两个主题词文献集合的中间词,探求潜在机制。结果:Arrowsmith软件的初步探索结果显示龙血竭及其有效成分对环氧合酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2),瞬时感受器电位香草酸受体1(transient receptor potential vanilloid 1,TRPV_1),一氧化氮合酶(nitric oxide synthase,NOS),电压门控性钾通道1.3(voltage-gated potassium channel 1.3,Kv1.3)及转化生长因子-β_1(transforming growth factor-β_1,TGF-β_1)具有调节作用,同时在缺血性脑卒中过程中上述指标也出现异常表达。结论:龙血竭治疗缺血性脑卒中的机制可能与下调缺血性脑组织中COX-2和诱导型一氧化氮合酶(i NOS)的表达、拮抗TRPV_1和Kv1.3通道、上调内皮型一氧化氮合酶(e NOS)和TGF-β_1的表达有关,可为进一步开展机制验证性研究提供参考。

基于ARROWSMITH探讨淫羊藿与维生素D轴功能的潜在相关性

目的运用Arrowsmith工具来探讨淫羊藿与维生素D轴之间可能的作用机制。方法通过知识发现工具Arrowsmith进行文献资料的相关性分析。结果维生素D与淫羊藿在多种疾病的治疗上有较多关联并且部分作用机制重合。结论中药淫羊藿可能通过维生素D轴来发挥其治疗作用。

基于Arrowsmith的柴胡治疗抑郁症的机制探讨

目的从理论层面探讨柴胡治疗抑郁症可能的现代医学机制。方法利用文献关联检索工具Arrowsmith进行关联文献的检索和发现,并对结果文献进行分析整理。结果柴胡治疗抑郁症效果可能与生长因子,脑源性神经营养因子有关,起作用区域可能在大脑海马CA1区。结论通过Arrowsmtth检索,可以为柴胡治疗抑郁症提供一种研究方向和思路。

利用知识发现工具Arrowsmith探讨天佛参口服液及其有效成分与结肠癌的相关性

目的:探讨天佛参口服液治疗结肠癌的可能机制。方法:运用非相关文献知识工具Arrowsmith软件。结果:Arrowsmith软件的初步探索结果显示天佛参口服液中的有效成分对Toll样受体(toll-like receptors,TLRs),血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF),环氧合酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2)和凋亡相关因子可能具有一定的调节作用,同时上述指标的异常表达也是造成结肠癌的重要相关遗传因素。结论:天佛参口服液在体内外均有显著抑制结肠癌的效应,其机制可能是通过下调结肠癌组织中Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)与COX-2的表达、降低组织中异常高表达的VEGF,促进促凋亡基因的表达与活力等环节发挥治疗结肠癌的作用,能为实验室进一步开展机制验证性研究提供有力的参考。