儿童哮喘急性发作的特征基因挖掘及其对哮喘发作的预测前景

目的:应用生物信息学方法对哮喘急性发作患者的基因表达谱芯片进行分析,以探索哮喘急性发作的机制,寻找精准提前识别哮喘急性发作的检测指标。方法:从GEO平台库获取GSE103166芯片数据集,在对数据集进行清洗和整理后,对急性哮喘发作的儿童和非哮喘儿童的表达谱进行差异分析。利用R语言进行富集分析,对差异表达基因(DEGs)进行功能注释。利用基因互作信息,构建DEGs互作网络,并对网络进行结构拆解,筛选出关键基因和调控子网络。结果:GSE103166数据集包含87例儿童(56例急性哮喘发作的儿童和31例非哮喘儿童)鼻拭子样本。筛选出63个显著DEGs,其中上调基因39个,下调基因24个。DEGs主要富集在内吞小泡与内吞小泡膜中,其中CD163是这两个细胞组件唯一显著上调基因。对互作网络进行结构拆解,得出4个主要互作子网络。其中CD163涉及子网络Ⅰ,此网络由CD163、ARG2、CAT、GSTA2、SCNN1G、MT2A组成,其中ARG2、CAT处于调控网络中心。结论:CD163及CD163、ARG2、CAT、GSTA2、SCNN1G、MT2A组成的基因调控网络可能是哮喘急性发作的关键基因与主要调控网络,为精准提前识别哮喘急性发作的检测指标和治疗靶点提供了研究思路。

基于重症支气管哮喘差异表达基因及其治疗中药筛选的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法探讨重症支气管哮喘[简称重症哮喘(SA)]的差异表达基因,分析其作用机制,并筛选潜在具有治疗作用的中药及活性成分。方法:在高通量基因表达(GEO)数据库中选取GSE136587和GSE158752数据集,利用R软件对数据集进行差异分析获得差异表达基因,并进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析,筛选核心基因,寻找关键通路和枢纽基因。最后将核心基因提交至Coremine数据库筛选具有潜在治疗作用的中药,并通过《中华医典》检索相关中药方剂。结果:共筛选出466个差异表达基因。通过STRING平台构建PPI网络共筛选包括25 kDa突触关联蛋白(SNAP25)、谷氨酸离子型受体2(GRIA2)、轴突蛋白1(NRXN1)、钾电压门控通道亚家族A成员1(KCNA1)、突触囊泡蛋白1(SYT1)和嗜铬蛋白A(CHGA)等核心靶点25个。基因本体(GO)功能富集显示SA的生物学过程与细胞趋化性和白细胞迁移等有重要关系,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集的通路主要涉及骨髓白细胞迁移、白细胞趋化性、细胞趋化性、白细胞迁移、对外部刺激反应的正向调节和骨髓白细胞活化等信号通路。采用网络药理学方法基于核心靶点筛选得到具有潜在治疗SA作用的中药367种,其中人参、水牛角、全蝎和黄芪等中药涉及多个核心靶点,与SA具有高度相关性,在《中华医典》中检索具有高度相关性的中药,共得到17个潜在具有治疗效果的中药方剂。结论:通过生物信息学筛选SA的潜在标志物和具有治疗作用的中药,为SA早期诊断和发病机制研究提供新的靶点,为其治疗的中药方剂研发提供思路。

儿童难治性哮喘的影响因素及机制研究

儿童难治性哮喘严重影响儿童肺功能及生活质量。国内尚无儿童难治性哮喘诊疗指南。该文从基因、环境、社会心理因素等方面对儿童难治性哮喘研究进展进行了综述。通过基因检测及生物学指标对儿童难治性哮喘进行早期识别及基于分子水平的个体化治疗,并结合控制环境因素和社会心理因素调节对儿童难治性哮喘防控提供新的思路。

VDR和GSDMB基因多态性与湖北地区儿童哮喘的易感性研究

目的:探讨湖北地区儿童VDR基因(rs2239185、rs7975232、rs2525046、rs2228570)和GSDMB基因(rs2305480)单核苷酸多态性(SNP)与儿童哮喘的易感性。方法:采用前瞻性研究方法,纳入158例哮喘患儿(哮喘组)和156例健康儿童(对照组),运用Sequenom MassArray质谱芯片微列阵技术对两组对象VDR和GSDMB基因的多个SNP位点进行基因分型,分析上述各位点在两组间分布的差异,筛选湖北地区儿童哮喘易感SNP位点。结果:GSDMB基因rs2305480位点GG、AG、AA 3种基因型频率在哮喘组中分别为64.56%、4.43%、31.01%,在对照组中分别为51.28%、8.97%、39.74%,两组间GG基因型分布频率差异具有统计学意义(P<0.05);GSDMB基因rs2305480位点的等位基因G、A在哮喘组中的分布频率分别为80.06%、19.94%,在对照组中的分布频率分别为71.15%、28.85%,两组间的等位基因A分布频率差异具有统计学意义(P<0.05);GSDMB基因rs2305480位点不同基因分布哮喘患儿白细胞计数、中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比和嗜酸性粒细胞百分比的差异无统计学意义(P>0.05);两组间VDR基因rs2239185、rs7975232、rs2525046、rs2228570位点多态性分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论:GSDMB基因rs2305480位点多态性与我国湖北地区儿童哮喘的易感性相关:VDR基因rs2239185、rs7975232、rs2525046、rs2228570位点多态性与我国湖北地区儿童哮喘易感性无显著相关性。

基于生物信息学探讨支气管哮喘与溃疡性结肠炎“异病同治”机制

目的:通过生物信息学分析确定支气管哮喘(哮喘)和溃疡性结肠炎(UC)共有的潜在生物标志物,并探讨这两种疾病的共同发病机制。方法:从GEO数据库下载包含529例哮喘患者、637例UC患者和147例健康对照者样本的数据集GSE76262、GSE206285、GSE69683和GSE87466,其中GSE76262和GSE206285用作训练数据集,GSE69683和GSE87466作为独立验证数据集。通过limmaR软件包筛选哮喘、UC患者和健康对照者样本的差异表达基因(DEGs),将两种疾病相关DEGs取交集得到哮喘和UC共同DEGs。构建蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络,利用cytoHubba筛选出PPI网络的核心生物标志物,并对其进行功能注释、富集分析和表达验证。结果:共筛选出209个哮喘和UC共同DEGs,其中112个基因上调,97个基因下调。MMP9、CCL2、SELL、CCR7、ICAM1、ITGAX、NFKBIA、CXCR4、AGPS和TLR2被鉴定为哮喘和UC共同的核心生物标志物,RELA和NFKB1是关键转录因子。功能富集分析显示,核心DEGs主要参与趋化因子和细胞因子活性和脂质与动脉粥样硬化。结论:MMP9、CCL2、SELL、CCR7、ICAM1、ITGAX、NFKBIA、CXCR4、AGPS和TLR2是哮喘和UC的潜在核心基因;哮喘和UC共病机制可能涉及趋化因子和细胞因子活性、NF-κB信号通路以及脂质与动脉粥样硬化。

血清lncRNA CASC2、miR-590-5p与支气管哮喘患者气道炎症、气流受限的关系及其预测效能分析

目的探讨血清长链非编码核糖核酸(lncRNA)-癌易感性候选基因2(CASC2)、微小核糖核酸-590-5p(miR-590-5p)与支气管哮喘(BA)患者气道炎症、气流受限的关系及其预测效能分析。方法选择2021年12月至2022年12月我院收治的BA患者145例,将其分为急性发作期组(50例)、慢性持续期组(50例)和临床控制期组(45例),另选取50例同期健康体检者为对照组。检测各组的血清lncRNA CASC2、miR-590-5p表达及气道炎症、气道重塑和肺功能指标水平,并分析其相关性。分析血清lncRNA CASC2与miR-590-5p对BA患者气流受限的预测价值。结果对照组、临床控制期组、慢性持续期组、急性发作期组的lncRNA CASC2与miR-590-5p表达水平和肺功能指标水平依次降低,气道炎症、气道重塑指标水平依次升高(P<0.05)。Pearson分析显示,BA患者的lncRNA CASC2、miR-590-5p表达水平与气道炎症、气道重塑指标呈负相关,与肺功能指标呈正相关(P<0.05)。轻、中、重度气流受限患者的血清lncRNA CASC2与miR-590-5p表达水平依次降低(P<0.05)。受试者工作特征(ROC)曲线分析显示,血清lncRNA CASC2与miR-590-5p表达水平联合预测气流受限的曲线下面积(AUC)高于两指标单独预测。结论血清lncRNA CASC2、miR-590-5p在BA患者中低表达可导致气道炎症、气道重塑及气流受限,联合检测血清lncRNA CASC2、miR-590-5p对气流受限程度有较高的预测价值。

钙黏蛋白家族成员3及11号染色体开放阅读框30基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效的研究

目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均接受糖皮质激素吸入治疗,并根据疗效分为疗效良好组和疗效不良组。选取同期体检的48例儿童作为对照组,采用倾向性匹配方法对易感组和对照组性别、年龄等基线资料进行匹配;采用PCR检测CDHR3及EMSY基因的单核苷酸多态性,计算其基因型频率和等位基因频率,基因位点的多态性与儿童支气管哮喘易感风险间的关系采用多因素logistic回归分析。对比疗效良好组和疗效不良组不同基因型分布。结果易感组和对照组经倾向性评分匹配后有36组配对成功(每组36例),匹配后基线资料对比差异无统计学意义(P>0.05)。匹配后易感组和对照组CDHR3基因rs6967330位点、EMSY基因rs12278256位点基因型频率及A等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示:EMSY基因rs12278256位点AA基因型[OR=9.91,95%CI:(1.02,96.65)]、CDHR3基因rs6967330位点AA基因型[OR=10.09,95%CI:(1.08,94.02)]是支气管哮喘易感的危险因素(均P<0.05)。治疗12周后,24例(66.67%)为疗效良好组,其余12例(33.33%)归为疗效不佳组,两组CDHR3基因rs6967330位点基因型分布对比差异无统计学意义(P>0.05);两组EMSY基因rs12278256位点基因型分布对比差异有统计学意义(P<0.05),其中疗效良好组AA基因型分布频率[37.50%(9/24)]明显高于疗效不良组[0(0/12)](P<0.05)。结论CDHR3基因rs3847076位点以及EMSY基因rs12278256位点与儿童支气管哮喘易感有关,EMSY基因rs12278256位点与糖皮质激素治疗疗效相关。

哮喘患儿IL-22、RAD50基因多态性与易感性的关系

目的探讨哮喘患儿白介素-22(IL-22)、RAD50基因多态性与疾病易感性的关系。方法选取2019年1月至2021年1月河南省平顶山市第一人民医院收治的哮喘患儿76例作为观察组,另选取同期体检健康的儿童62例作为对照组,收集两组背景资料,以聚合酶链式反应结合直接测序法检测IL-22(rs17224704位点、rs2227473位点)、RAD50(rs6871536位点、rs17166050位点)基因多态性,并对影响儿童哮喘的发生因素进行回归分析。结果两组出生方式、1岁内抗生素使用次数、饲养宠物、家族过敏史、家族哮喘史、被动吸烟等项目比较差异有统计学意义(P<0.05);两组IL-22基因rs17224704位点、rs2227473位点等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05),RAD50基因rs6871536位点、rs17166050位点基因型、等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05);rs17224704位点、rs2227473位点存在交互作用(P<0.05);Logistic回归分析显示,有家族过敏史、家族哮喘史儿童发生哮喘的风险增加(P<0.05),IL-22基因rs17224704位点携带等位基因A的儿童发生哮喘风险较携带T的儿童增加(P<0.05),RAD50基因rs6871536位点携带等位基因C的儿童发生哮喘风险较携带T的儿童增加(P<0.05)。结论IL-22基因rs17224704位点基因多态性、RAD50基因rs6871536位点基因多态性与儿童哮喘的易感性密切相关。

CRHR1基因rs242941位点多态性与哮喘儿童ICS 长期安全用药的关系

目的研究促肾上腺皮质激素释放激素受体1(CRHR1)基因rs242941位点的多态性与哮喘儿童吸入性糖皮质激素(ICS)长期安全用药的关系。方法选取2018年10月至2020年10月该院收治的100例哮喘儿童,均接受ICS治疗及常规对症治疗。采用TaqMan法检测CRHR1基因rs242941位点多态性,根据基因型分为GG、GT+TT,比较不同基因型患儿的肺功能、哮喘控制测试评分及不良反应发生情况。采用多因素Logistic回归分析影响哮喘儿童ICS安全用药的危险因素。结果CRHR1基因rs242941位点存在3种基因型:GG(72例)、GT(20例)、TT(8例),G和T等位基因频率分别为82%和18%。治疗12周后不同基因型患儿的哮喘控制测试评分、第1秒用力呼气容积(FEV1)、FEV1/用力肺活量(FVC)比值与治疗前比较均明显提升,其中GG基因型患儿改善情况优于GT+TT基因型,GG基因型患儿的症状及体征完全缓解时间明显短于GT+TT基因型,差异有统计学意义(P<0.05)。GG基因型不良反应发生率低于GT+TT基因型,差异有统计学意义(P<0.05)。单因素、多因素Logistic回归分析显示,rs242941位点基因型多态性是影响患者用药安全的独立危险因素(P<0.05)。结论CRHR1基因rs242941位点多态性与哮喘儿童ICS的疗效及长期用药安全性密切关联,其中TT基因型患儿具有更高的ICS不良反应发生风险。

太原市不同污染区域6~12岁儿童哮喘与β_(2) 肾上腺素能受体基因多态性的关系

目的探讨太原市不同污染区儿童哮喘与β_(2)肾上腺素能受体基因多态性的关系。方法选取太原市3个不同空气质量地区的儿童,哮喘患儿共181例,150例健康儿童作为对照组。哮喘组儿童高污染区67例、中污染区61例,低污染区53例,对照组三区各50例。采用ELISA法测血清总IgE水平,提取血清中DNA,采用聚合酶链反应法(PCR)检测β_(2)肾上腺素能受体16、27位点基因多态性,即精氨酸(Arg)16甘氨酸(Gly)位点和谷氨酰胺(Gln)27谷氨酸(Glu)位点基因多态性,统计各基因型和等位基因频率。比较哮喘组与对照组血清总IgE水平的关系,比较哮喘组儿童不同污染区不同基因型血清总IgE水平的差异,同时比较不同污染区域各基因型频率和等位基因频率的分布。结果①哮喘组血清总IgE水平较对照组显著增高,差异有统计学意义(P<0.05),哮喘组儿童检测的β_(2)肾上腺素能受体16、27位点不同基因型之间血清总IgE水平差异无统计学意义。②哮喘组β_(2)肾上腺素能受体16位点基因型Arg/Arg频率较对照组均下降(P<0.05),哮喘组该基因型频率与空气污染程度呈负相关(t=-15.588,P<0.05);Gly/Gly频率哮喘组较对照组均升高(P<0.05),哮喘组该基因型频率与污染程度呈正相关(t=29.445,P<0.05)。③27位点基因型Gln/Glu、Glu/Glu频率哮喘组与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05),高污染区哮喘组Gln/Glu基因型显著高于对照组(P<0.05),中、低污染区哮喘组Gln/Glu基因型显著低于对照组(P>0.05),高、中、低污染区哮喘组Glu/Glu基因型均显著高于对照组(P<0.05),但各基因型频率与污染程度均未见相关性(P>0.05)。结论不同空气质量下,哮喘患者血清总IgE水平与β_(2)肾上腺素能受体16、27基因多态性可能无关;不同空气质量下,哮喘可能与β_(2)肾上腺素能受体16位点基因表达有关,Gly/Gly基因型频率的增加会提高儿童哮喘的发病率;不同空气污染程度下哮喘患者发病率与27位点基因表达无关,所以推测空气污染可能未通过影响27位点基因表达而影响哮喘发病。

哮喘患儿外周血炎症因子及肺功能水平与TLR4基因多态性的相关性研究

目的分析儿童哮喘患者外周血炎症因子及肺功能水平与Toll样受体4(Toll-like receptor 4,TLR4)基因多态性的相关性。方法收集近3年收治急性发作期哮喘患儿172例作为实验组,并根据哮喘患儿发病的严重程度将哮喘分为轻度、中度、重度和危重级,选取同期健康体检儿童136例作为对照组,测定各组受试者肺功能指标第1秒用力呼气容积(FEV1)占用力肺活量(FVC)百分比(FEV1/FVC%)和呼出气一氧化氮(FeNO)水平比,采集研究对象的外周静脉血,应用ELISA法检测白细胞介素4(interleukin-4,IL-4)、γ干扰素(interferon-γ,IFN-γ)表达水平,采用血球计数仪检测外周血嗜酸性粒细胞百分率(Eos),利用化学发光发检测血清总IgE,聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RELP)技术检测TLR4基因Asp299Gly(A/G)和Thr399Ile(C/T)位点单核苷酸多态性,分析以上基因多态性与儿童哮喘的相关性。结果哮喘患儿外周血中IL-4、Eos、IgE及FeNO水平比显著高于对照组,IFN-γ和肺功能指标FEV1/FVC%的水平显著低于对照组(均P<0.05)。实验组及对照组TLR4基因Asp299Gly基因型和等位基因分布相比,差异无统计学意义(P>0.05),而Thr399Ile基因型和等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05),其中实验组T等位基因分布频率显著高于对照组(P<0.05)。TLR4基因Thr399Ile多态性与哮喘患儿外周血Eos、IgE的水平、肺功能指标FEV1/FVC%无相关性(P>0.05),但携带Thr399Ile TT基因型哮喘患儿的IL-4和FeNO水平比高于CC和CT基因型,IFN-γ的水平低于CC和CT基因型(P<0.05)。有序logistic回归分析显示携带Thr399Ile TT基因型哮喘患儿比携带CC和TC基因型者哮喘发病程度更严重,二元logistic回归分析结果显示TLR4基因Thr399Ile多态性与儿童哮喘具有相关性。结论TLR4 SNPs与哮喘患儿体内免疫球蛋白IgE、Eos、肺功能指标FEV1/FVC(%)水平无关,但与哮喘严重程度及IL-4、IFN-γ、FeNO水平比相关,TLR4、IL-4、IFN-γ参与儿童哮喘的过程,并可能是哮喘由轻症进展成重症的关键因子,同时TLR4基因Thr399Ile位点多态性与儿童哮喘存在较大关联。

白细胞介素-4及其受体基因多态性与哮喘儿童血清白细胞介素-4和总免疫球蛋白E含量的相关性

目的探讨白细胞介素-4(IL-4)-基因-589-位点及其受体基因多态性与哮喘患儿IL-4和总免疫球蛋白E(TIgE)含量的相关性。方法选取2017年9月至2020年12月上海市嘉定区中医医院儿科收治的90例哮喘发作患儿作为实验组,另入取同期90名健康体检儿童作为空白组,两组均应用聚合酶链反应(PCR)和DNA测序法进行基因分型。同时采用酶联免疫吸附试验法(ELISA)法检测两组血清IL-4、TIgE水平,比较两组IL-4-基因-589位点C/T和IL-4R-基因-rs1801275位点A/G基因多态性检测结果、血清IL-4在IL-4-基因-589位点C/T和IL-4R-基因-rs1801275位点A/G不同基因型含量变化、血清TIgE在IL-4-基因-589位点C/T和IL-4R-基因-rs1801275位点A/G不同基因型含量变化。结果两组IL-4R-基因-rs1801275位点基因型频率和等位基因频率、IL-4-基因-589位点基因型频率比较差异无统计学意义;实验组C等位基因频率低于空白组,T等位基因频率高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组TT血清IL-4含量均高于CT、CC,CT均高于CC,且实验组CC、CT、TT血清IL-4含量均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组GG血清IL-4含量高于AA、AG,AG高于AA,且实验组AA、AG、GG血清IL-4含量均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组TT血清TIgE含量高于CT、CC,CT高于CC,且实验组CC、CT、TT血清TIgE含量均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05)。两组GG血清TIgE含量均高于AA、AG,AG均高于AA,且实验组AA、AG、GG血清TIgE含量均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论哮喘患儿IL-4基因-589位点和IL-4R-基因-rs1801275位点基因多态性与健康儿童相比未显示出明显差异,TT和GG基因型哮喘患儿IL-4和TIgE水平较其他对应基因型升高,哮喘发作机制需进一步研究。

TBX21和ADCY9多态性在儿童哮喘发生发展中的临床研究

目的:探究T细胞转录因子(TBX21)和腺苷酸环化酶9抗体(ADCY9)基因多态性在儿童哮喘发生发展中的临床作用。方法:选取2016年7月至2017年1月200例河南地区5岁及以下汉族喘息患儿作为研究组,另选同期100例5岁及以下汉族健康儿童作为对照组。采集两组口腔黏膜脱落细胞,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术对TBX21基因rs2240017多态性位点、ADCY9基因rs2230739多态性位点的基因型进行检测,根据检测结果评估哮喘危险程度,据此将研究组分为低危组、高危组两个亚组,比较低危组、高危组患儿血清免疫球蛋白E(IgE)水平、儿童哮喘预测指数(API)阳性率、过敏性疾病发生率,分析哮喘相关基因多态性危险程度与血清IgE水平、API、过敏性疾病发生率的相关性。所有患儿均随访至6岁明确哮喘诊断,比较低危组、高危组哮喘发生率,发生哮喘患儿均给予吸入糖皮质激素与白三烯受体拮抗剂治疗3个月,比较低危组、高危组哮喘控制情况及肺功能受损情况。结果:研究组与对照组TBX21基因rs2240017多态性位点、ADCY9基因rs2230739多态性位点的基因型检测结果比较,差异有统计学意义(P<0.001);200例喘息患儿TBX21基因rs2240017多态性位点CC、CT、TT基因型占比分别为19.50%、56.00%、24.50%,ADCY9基因rs2230739多态性位点CC、CG、GG基因型占比分别为86.00%、10.00%、4.00%;高危组血清IgE水平、API阳性率及过敏性疾病发生率均高于低危组(P分别为<0.001、<0.001、0.021);喘息患儿哮喘相关基因多态性危险程度与血清IgE水平、API阳性率、过敏性疾病发生率呈正相关(P<0.001);高危组哮喘发生率(81.48%)、肺功能受损率(74.07%)均高于低危组(4.90%、3.50%)(P<0.001);高危组哮喘患儿哮喘控制率(79.55%)与低危组哮喘患儿哮喘控制率(100.00%)比较,差异无统计学意义(P=0.433)。结论:喘息患儿TBX21基因rs2240017位点、ADCY9基因rs2230739位点基因多态性与哮喘发生、肺功能受损具有密切相关性。

重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因的生物信息学

目的通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用。方法从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表达基因。应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索基因之间的相互作用,并通过基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,蛋白质互作(PPI)及关键基因分析,预测差异基因可能参与的分子生物学过程。结果通过芯片分析,共获得247个DEGs,其中127个上调基因,120个下调基因,主要参与的生物学过程包括“细胞迁移的调节”、“神经元的延伸”、“蛋白质泛素化降解”、“负趋化性”和“巨噬细胞自噬调节”。PPI分析发现关键基因为:RHOA、YWHAQ、PP1CC、ATP6V1A、CALM2、PSMA5、RPS3A、PSMC5、MRPL13、SEC61B。结论关键基因(RHOA、YWHAQ、PP1CC、ATP6V1A、CALM2、PSMA5、RPS3A、PSMC5、MRPL13、SEC61B)可能在重症哮喘发生发展过程中发挥了关键作用。

孟鲁司特钠治疗汉族儿童支气管哮喘疗效与ABCC1、SLCO2B1基因单核苷酸多态性的相关性研究

目的探讨白三烯受体拮抗剂(leukotriene receptor antagonists,LTRA)与ATP结合盒亚家族C1(ATP-binding cassette sub-family C member 1,ABCC1)基因rs119774位点、溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2B1(solute carrier organic anion transporter family member 2B1,SLCO2B1)基因rs12422149位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)治疗汉族儿童支气管哮喘疗效的相关性。方法选取2019年4月至2021年12月于福建中医药大学附属厦门市中医院就诊的4~13岁汉族支气管哮喘患儿100例为研究对象,采用一代测序法对患儿的ABCC1基因rs119774位点、SLCO2B1基因rs12422149位点进行检测,分析比较2个位点的SNP分布情况。入组患儿均应用LTRA进行治疗,分别于治疗前与治疗12周时进行肺通气功能及脉冲震荡功能检测,并评估临床症状控制水平,分析患儿疗效与SNP的相关性。统计学方法采用t检验、χ^(2)检验。结果治疗前与治疗12周后,ABCC1基因rs119774位点CC型哮喘患儿应用孟鲁司特钠第1秒用力呼气容积(forced expiratory volume in the first second,FEV_(1))[(87.0±16.5)与(93.2±15.1)L,t=-2.071,P=0.038]、峰值呼气流速(peak expiratory flow,PEF)[(77.1±16.9)与(86.5±16.6)L/s,t=-3.233,P=0.001]和25%肺活量的呼气流速(forced expiratory flow 25,FEF25)[(69.6±18.8)与(78.1±19.9)L/s,t=-1.985,P=0.047]均有明显提高,脉冲震荡各项指标显著改善(P<0.05)。治疗后SLCO2B1基因rs12422149位点AA型肺功能指标PEF高于治疗前[(79.0±16.0)与(93.0±9.4)L/s,t=-2.547,P=0.011],治疗后GG型肺功能各指标显著高于治疗前(P<0.05)。ABCC1治疗前后控制率[59%(59/100)与78%(78/100),78%(78/100),χ^(2)=20.964,P<0.001];治疗前后SLCO2B1基因rs119774位点AA型、AG型、GG型的控制率分别为[59%(59/100)与78%(78/100),78%(78/100),χ^(2)=20.964,P<0.001]、[53%(8/15)与80%(12/15),93%(14/15)χ^(2)=12.786,P=0.002]与[56%(23/41)与78%(32/41),78%(32/41),χ^(2)=6.583,P=0.037]与[73%(32/44)与77%(34/44),73%(32/44),χ^(2)=6.471,P=0.039],均显著改善。结论LTRA治疗汉族支气管哮喘患儿与ABCC1、SLCO2B1基因SNP的效果存在相关性。

ADRB2基因调控区多态性对SABA治疗儿童哮喘急性发作疗效的影响

目的探究ADRB2基因调控区多态性对短效β2受体激动剂(SABA)治疗儿童哮喘急性发作疗效的影响。方法选取2016年10月-2020年10月就诊于中国人民解放军北部战区总医院的急性轻中度发作且接受SABA治疗7 d的支气管哮喘患儿127例,检测其基因型分布,比较不同基因型患儿治疗后肺功能指标的改善情况和疗效,并考察基因多态性高阶交互作用对疗效的影响。结果127例患儿中,rs2895795位点TT、TA、AA型分别有80、44、3例,rs11168070位点CC、CG、GG型分别有93、32、2例,rs12654778位点GG、GA、AA型分别有41、64、22例,均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。治疗后,rs2895795位点TA型患儿的最高呼气流量占预计值百分比(PEF%pred)、用力呼气75%肺活量时的瞬间流量占预计值百分比(FEF75%pred)改善率均显著低于TT型(P<0.05);rs11168070位点CG型患儿的PEF%pred、FEF75%pred改善率均显著低于CC型(P<0.05);rs12654778位点GA、AA型患儿的PEF%pred改善率均显著低于GG型(P<0.05)。各位点不同基因型患儿治疗前后呼出气一氧化氮差值比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。rs2895795位点TT型患儿的显效比例是TA+AA型患儿的2.358倍(P<0.05),ADRB2基因多态性高阶交互作用对哮喘患儿的疗效没有明显影响(P>0.05)。结论支气管哮喘患儿ADRB2基因调控区多态性与SABA用于哮喘患儿急性发作的疗效相关,rs2895795、rs11168070、rs12654778位点野生型患儿的肺功能改善更明显,且rs2895795位点TT型患儿接受SABA治疗的效果更好。

药物代谢酶细胞色素P450单核苷酸多态性影响哮喘儿童吸入皮质醇激素疗效研究

目的:探讨哮喘儿童及健康儿童细胞色素P450酶3A5(CYP3A5)基因rs776746和rs15524单核苷酸多态性(SNPs),阐明儿童哮喘易感性及不同基因型哮喘儿童吸入糖皮质激素(ICS)临床疗效间关系。方法:对2016年10月至2020年10月就诊于北部战区总医院东北地区符合纳入标准的79例汉族哮喘患儿(病例组)及100例健康儿童(对照组)行CYP3A5基因rs776746、rs15524位点多态性检测,并对基因型及等位基因分析,连锁分析。对病例组给予吸入用糖皮质激素雾化吸入3个月,于入组时及治疗后测定肺功能及呼出气一氧化氮(FeNO),在治疗后做哮喘控制评分C-ACT/ACT,从而比较不同基因型患病情况及以上检测指标评分差异。结果:rs776746及rs15524位点存在完全连锁不平衡。CYP3A5基因rs776746位点存在T/T、T/C和C/C 3种基因型。不同基因型在病例组与对照组间频存在统计学差异(χ^(2)=9.121,P=0.010),T/C型患哮喘概率是T/T型的6.345倍(P=0.007),C/C型患哮喘概率是T/T型的3.864倍(P=0.04),变异型患哮喘概率是野生型的4.682倍(P=0.011);rs15524位点存在A/A、A/G和G/G 3种基因型。不同基因型在病例组与对照组间频率存在统计学差异(χ^(2)=9.121,P=0.010),A/A型患哮喘概率是G/G型的3.864倍(P=0.044),A/G型患哮喘概率是G/G型的6.345倍(P=0.007),对比病例组与对照组G/G型与A/A+A/G型频率时,发现后者患哮喘概率是前者的4.682倍(P=0.011)。rs776746位点变异型FEF50及FEF75实测值占预计值百分比的改善率明显高于野生型(t=-2.499、-3.256,P=0.024、0.019),rs15524位点变异型FEF50及FEF75实测值占预计值百分比的改善率明显低于野生型(t=3.380、2.325,P=0.015、0.042)。rs776746位点变异型C-ACT/ACT评分明显高于野生型组(t=0.571,P=0.037);rs15524位点野生型与变异型C-ACT/ACT评分差异无统计学意义(t=0.486,P=0.545)。结论:CYP3A5基因rs776746、rs15524位点均是儿童哮喘易感位点,rs776746及rs15524位点野生型或变异型与吸入ICS治疗后小气道功能改善情况有关。rs776746位点野生型或变异型与哮喘控制情况有关。

儿童哮喘IL-13、IL-4、ADRB2及FcER1B基因多态性分析

目的探究儿童哮喘IL-13、IL-4、ADRB2及FcER1B基因多态性分析。方法选取40例蒙古族哮喘儿童为观察组,选取同期蒙古族体检健康儿童40名为对照组,比较两组IL-13基因rs20541位点、IL-4基因rs2243250位点、ADRB2基因rs1042713位点、FCER1B基因rs569108位点分布差异。结果两组间的IL-13基因rs20541位点基因型分布和ADRB2基因rs1042713位点基因型分布存在差异(P<0.05);IL-13基因rs20541位点基因型分布和ADRB2基因rs1042713位点基因型分布与蒙古族哮喘儿童疾病严重程度存在正相关。结论蒙古族哮喘儿童及疾病严重程度可能与IL-13基因rs20541位点基因型分布和ADRB2基因rs1042713位点基因型分布存在关联。

SOCS5基因多态性与哮喘患儿治疗效果及肺功能的关系研究

目的分析细胞因子信号传导抑制因子5(SOCS5)基因多态性与哮喘患儿治疗效果及肺功能的关系。方法选取2021年3月至2022年3月就诊于该院的80例哮喘患儿作为哮喘组,另选取同期在该院行健康体检的80例健康儿童作为健康组。采用单核苷酸多态性(SNP)基因分型检测试剂盒测定SOCS5基因3个不同位点的基因多态性。哮喘组接受沙美特罗替卡松干粉剂治疗,对比不同疗效患儿携带的SOCS5基因型及等位基因分布频率、不同SOCS5基因型患儿治疗前后肺功能的差异。结果哮喘组SOCS5基因rs6737848位点携带C等位基因、CC基因频率高于健康组,差异均有统计学意义(P<0.05);哮喘组、健康组SOCS5基因rs41379147位点、rs3768721位点携带等位基因与基因型分布比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。根据治疗结果,哮喘组患者被分为疗效良好组(52例)和疗效不良组(28例)。疗效不良组SOCS5基因rs6737848位点携带C等位基因、CC基因型频率高于疗效良好组,差异均有统计学意义(P<0.05);疗效不良组、疗效良好组SOCS5基因rs41379147位点、rs3768721位点等位基因与基因型分布比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。Logistic回归分析发现,SOCS5基因rs6737848位点携带CC基因型是哮喘发病和疗效不良的危险因素(P<0.05);3个月后,哮喘组SOCS5基因rs6737848位点携带GG基因型的患儿治疗的FEV1、FEV1/FVC、PEF水平高于CG基因型,CG基因型患儿FEV1、FEV1/FVC、PEF水平高于CC基因型,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论SOCS5基因rs6737848位点多态性与哮喘发生、疗效及肺功能密切相关,其中携带CC基因型可增加哮喘发生风险、降低疗效。