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Camellia sinensis CsMYB4a participates in regulation of stamen growth by interaction with auxin signaling transduction repressor CsAUX/IAA4
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作者 Guoliang Ma Mingzhuo Li +8 位作者 Yingling Wu Changjuan Jiang Yifan Chen Dawei Xing Yue Zhao Yajun Liu Xiaolan Jiang Tao Xia Liping Gao 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第1期188-201,共14页
Subgroup 4(Sg4)members of the R2R3-MYB are generally known as negative regulators of the phenylpropanoid pathway in plants.Our previous research showed that a R2R3-MYB Sg4 member from Camellia sinensis(CsMYB4a)inhibit... Subgroup 4(Sg4)members of the R2R3-MYB are generally known as negative regulators of the phenylpropanoid pathway in plants.Our previous research showed that a R2R3-MYB Sg4 member from Camellia sinensis(CsMYB4a)inhibits expression of some genes in the phenylpropanoid pathway,but its physiological function in the tea plant remained unknown.Here,CsMYB4a was found to be highly expressed in anther and filaments,and participated in regulating filament growth.Transcriptome analysis and exogenous auxin treatment showed that the target of CsMYB4a might be the auxin signal pathway.Auxin/indole-3-acetic acid 4(AUX/IAA4),a repressor in auxin signal transduction,was detected from a yeast two-hybrid screen using CsMYB4a as bait.Gene silencing assays showed that both CsIAA4 and CsMYB4a regulate filament growth.Tobacco plants overexpressing CsIAA4 were insensitive to exogenous a-NAA,consistent with overexpression of CsMYB4a.Protein-protein interaction experiments revealed that CsMYB4a interacts with N-terminal of CsIAA4 to prevent CsIAA4 degradation.Knock out of the endogenous NtIAA4 gene,a CsIAA4 homolog,in tobacco alleviated filament growth inhibition and a-NAA insensitivity in plants overexpressing CsMYB4a.All results strongly suggest that CsMYB4a works synergistically with CsIAA4 and participates in regulation of the auxin pathway in stamen. 展开更多
关键词 aux/iaa4 auxin signaling CsMYB4a Subgroup 4 R2R3-MYB
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中国南瓜CmoAux/IAA基因的克隆和表达特征分析
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作者 任广乾 刘正响 +3 位作者 韩圆圆 陈碧华 李新峥 李庆飞 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第10期30-37,共8页
在前期对中国南瓜败育雌蕊和正常雌蕊进行转录组分析发现,CmoAux/IAA基因可能参与了雌花发育,为进一步探究其生物学功能,利用同源序列克隆法从中国南瓜中克隆得到全长为600 bp的CmoAux/IAA基因,该基因编码199个氨基酸;保守结构域分析结... 在前期对中国南瓜败育雌蕊和正常雌蕊进行转录组分析发现,CmoAux/IAA基因可能参与了雌花发育,为进一步探究其生物学功能,利用同源序列克隆法从中国南瓜中克隆得到全长为600 bp的CmoAux/IAA基因,该基因编码199个氨基酸;保守结构域分析结果表明,其属于Aux/IAA家族,包含结构域Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ;该蛋白无信号肽和跨膜结构。多序列比对和系统进化树分析结果显示,CmoAux/IAA氨基酸序列与印度南瓜XP_022986212.1的氨基酸序列、美洲南瓜XP_023513171.1的氨基酸序列亲缘关系较近,相似度高达98.01%、96.50%。拟南芥原生质体亚细胞定位结果显示,CmoAux/IAA蛋白定位于细胞核和细胞质。实时荧光定量结果显示,该基因具有组织表达特异性,主要在南瓜植株生长点及雌花柱头中表达,柱头中的相对表达量是雄蕊的137倍,在叶和根中不表达,其可能在植株生长点幼嫩组织分化或雌花发育过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 中国南瓜 aux/iaa 基因克隆 生物信息学分析 亚细胞定位
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油茶果皮发育相关ARF-Aux/IAA互作分析
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作者 徐嘉娟 刘四黑 +4 位作者 杨冰 魏莹莹 朱亚艳 许杰 王港 《种子》 北大核心 2024年第6期12-20,共9页
生长素在植物生长发育过程中发挥重要调控作用,ARF和Aux/IAA是生长素介导的信号转导通路中的关键调节因子。果皮厚度直接影响油茶的经济产量,不同种质的油茶果皮厚度具有明显的分化,为进一步研究油茶果皮厚度调控机制,通过转录组学和生... 生长素在植物生长发育过程中发挥重要调控作用,ARF和Aux/IAA是生长素介导的信号转导通路中的关键调节因子。果皮厚度直接影响油茶的经济产量,不同种质的油茶果皮厚度具有明显的分化,为进一步研究油茶果皮厚度调控机制,通过转录组学和生物信息学系统分析油茶果皮转录组数据,筛选油茶果皮发育过程中可能存在相互作用的CoARF和CoIAA基因。结果表明,在油茶果皮转录组数据中共鉴定到19个CoARF和17个CoIAA基因,有10对CoARF-CoIAA(8个CoARF基因和6个CoIAA基因)的时空表达存在显著相关性,将其编码蛋白序列分别与拟南芥中的ARFs和IAAs构建系统进化树后发现,CoARF14、CoARF19和CoARF11与起转录抑制作用的AtARFS具有较近的亲缘关系。而CoARF6和CoARF10与起转录激活作用的AtARFS具有较近的亲缘关系。互作蛋白以拟南芥为参考进一步进行同源映射校验后,最终确定CoARF10-CoIAA5、CoARF6-CoIAA2和CoARF14-CoIAA12三对组合可能通过相互作用传递生长素信号参与调控油茶果皮发育。 展开更多
关键词 果皮发育 ARF aux/iaa 互作筛选
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Advances in the study of auxin early response genes:Aux/IAA,GH3,and SAUR
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作者 Dongfang Bao Senqiu Chang +1 位作者 Xiaodong Li Yanhua Qi 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第4期964-978,共15页
Auxin plays a crucial role in all aspects of plant growth and development.Auxin can induce the rapid and efficient expression of some genes,which are named auxin early response genes(AERGs),mainly including the three ... Auxin plays a crucial role in all aspects of plant growth and development.Auxin can induce the rapid and efficient expression of some genes,which are named auxin early response genes(AERGs),mainly including the three families:auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA),Gretchen Hagen 3(GH3),and small auxin-up RNA(SAUR).Aux/IAA encodes the Aux/IAA protein,which is a negative regulator of auxin response.Aux/IAA and auxin response factor(ARF)form a heterodimer and participate in a variety of physiological processes through classical or non-classical auxin signaling pathways.The GH3 encodes auxin amide synthetase,which catalyzes the binding of auxin to acyl-containing small molecule substrates(such as amino acids and jasmonic acid),and regulates plant growth and stresses by regulating auxin homeostasis.SAURs is a class of small auxin up-regulated RNAs.SAUR response to auxin is complex,and the process may occur at the transcriptional,post-transcriptional and protein levels.With the development of multi-omics,significant progress has been made in the study of Aux/IAA,GH3,and SAUR genes,but there are still many unknowns.This review offers insight into the characteristics of Aux/IAA,GH3,and SAUR gene families,and their roles in roots,hypocotyls,leaves,leaf inclinations,flowers,seed development,stress response,and phytohormone crosstalk,and provides clues for future research on phytohormone signaling and the molecular design breeding of crops. 展开更多
关键词 auxIN aux/iaa GH3 SAUR STRESS
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红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析
5
作者 刘湘楠 胡祥祥 +2 位作者 乔梦燚 周丹宁 朱畇昊 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第6期68-76,共9页
为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析,研究该基因在红花生长发育中的调控作用,利用生物信息学方法,在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,使用MEGA 7.0做出系统发育进化树。经理... 为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析,研究该基因在红花生长发育中的调控作用,利用生物信息学方法,在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,使用MEGA 7.0做出系统发育进化树。经理化性质分析,红花Aux/IAA蛋白为亲水性蛋白,且79%位于细胞核中,大多数红花Aux/IAA蛋白表现为偏酸性;经聚类分析,将红花Aux/IAA基因分为5个亚族。基因结构分析表明,所有基因均含有1~9个内含子。这些基因在红花的9条染色体上非均匀地分布,其中9号染色体上分布最多,有7个Aux/IAA基因。红花Aux/IAA基因在不同发育期及不同外源激素处理下表达量各不相同。对保守基序作图分析发现,大部分红花Aux/IAA蛋白具有4个共同的保守基序,分别为motif 1、motif 2、motif 3、motif 4,qRT-PCR结果表明,不同浓度盐胁迫处理24 h后,基因CtAux/IAA1相对表达量呈上调趋势,推测此基因可能与提高红花抗盐胁迫能力有关。本研究结果将有助于了解红花Aux/IAA基因家族在生长发育过程中的功能并筛选优良基因。 展开更多
关键词 红花 aux/iaa基因家族 生物信息学分析 盐胁迫
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猕猴桃Aux/IAA基因家族的鉴定与表达 被引量:3
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作者 苏丽艳 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期55-65,共11页
在猕猴桃全基因组范围内鉴定生长素/吲哚乙酸(Aux/IAA)基因家族,利用生物信息学方法分析其理化性质、结构特征及共线性关系等,并采用实时荧光定量PCR分析Aux/IAA家族基因在不同组织及部分家族成员在外源激素胁迫下的表达模式,为揭示该... 在猕猴桃全基因组范围内鉴定生长素/吲哚乙酸(Aux/IAA)基因家族,利用生物信息学方法分析其理化性质、结构特征及共线性关系等,并采用实时荧光定量PCR分析Aux/IAA家族基因在不同组织及部分家族成员在外源激素胁迫下的表达模式,为揭示该家族基因在猕猴桃发育过程中的功能奠定基础。结果表明:(1)猕猴桃基因组含有50个Aux/IAA家族基因,编码氨基酸序列介于125~391 aa,蛋白分子量介于14.06~42.48 kD,等电点介于4.33~9.51;Aux/IAA家族基因不均匀的分布于21条不同染色体上,且分布最多的23号染色体上含有11个基因;聚类分析将其分为9个亚族。(2)大部分Aux/IAA家族基因含有4个不同的保守结构域,多数成员均含有Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ结构域,部分基因缺失Ⅰ结构域;基因结构分析表明该家族基因包含1~5个内含子;基因组内序列分析发现该家族基因含有23对重复基因对,包括20对片段重复和3对串联重复;与拟南芥的组间共线性分析发现有36个基因与拟南芥基因存在共线性关系。(3)亚细胞预测显示该家族基因大部分定位于细胞核;启动子顺式作用元件分析发现该家族启动子包含光、激素以及响应生物与非生物胁迫等相关作用元件。(4)实时荧光定量PCR分析表明,Aux/IAA家族基因有组织表达特异性,各成员对外源激素响应的时间和强度不同,绝大多数基因在激素处理的早期下调表达,而AcIAA1a和AcIAA18a相对表达量呈现上调表达,响应模式的差异也说明了Aux/IAA家族各个基因在调控猕猴桃发育过程中功能上的差异性。研究认为,猕猴桃Aux/IAA家族基因具有功能多样性,且存在基因复制现象的基因部分表现出组织表达模式相似性,推测在功能上可能有冗余,在进化过程中该基因可能受到环境胁迫而导致序列的缺失或基因复制。 展开更多
关键词 猕猴桃 aux/iaa 生物信息学 表达分析
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桑树Aux/IAA基因家族鉴定与IBA处理下表达模式分析 被引量:3
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作者 冯曦 豆浩 +2 位作者 孙佳佳 孙慧娟 毕会涛 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第6期936-948,共13页
【目的】在全基因组范围内鉴定桑树Aux/IAA基因家族成员,并研究在IBA处理下对该家族基因表达模式的影响,为深入研究桑树Aux/IAA基因家族的功能提供依据。【方法】通过本地川桑全基因组数据对桑树Aux/IAA基因家族成员进行鉴定分析,包括... 【目的】在全基因组范围内鉴定桑树Aux/IAA基因家族成员,并研究在IBA处理下对该家族基因表达模式的影响,为深入研究桑树Aux/IAA基因家族的功能提供依据。【方法】通过本地川桑全基因组数据对桑树Aux/IAA基因家族成员进行鉴定分析,包括蛋白质理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、蛋白质三级结构及蛋白互作关联分析、启动子顺式作用元件分析。并以“强桑1号”扦插枝为试验材料,对其进行1000 mg·L^(-1) IBA处理和清水对照处理,分析处理后10、20、30、40 d的MnAux/IAA基因家族的表达模式。【结果】MnAux/IAA基因家族共有51个成员,分为8个亚家族,AtIAA基因家族分布在其中6个亚家族中;51个基因家族成员均有外显子和内含子,仅有1个成员无UTR;顺式作用元件表明,MnAux/IAA基因家族对光、激素、逆境胁迫等都有相应的调控作用;蛋白质同族进化序列的基因结构相似度较高,但族间差异较大;IBA处理后,47个基因表达量会有不同程度的提升,而基因MnAux/IAA34、MnAux/IAA33、MnAux/IAA32在表达量上有较大程度的下降。【结论】MnAux/IAA基因家族功能相对稳定,在家族进化过程中无明显变化;IBA具有促进Aux/IAA基因表达的作用;MnAux/IAA34、MnAux/IAA33、MnAux/IAA32与AtARF2同源性较高,推测具有调控叶片衰老的作用。 展开更多
关键词 桑树 aux/iaa基因家族 进化分析 基因表达 生物信息学
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A dose-dependent bimodal switch by homologous Aux/IAA transcriptional repressors 被引量:1
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作者 Hyung-Taeg Cho Minsu Lee +6 位作者 Hee-Seung Choi Kwang-Ho Maeng Kyeonghoon Lee Ha-Yeon Lee Anindya Ganguly Hoonyoung Park Chang-Hoi Ho 《Molecular Plant》 SCIE CSCD 2024年第9期1407-1422,共16页
Combinatorial interactions between different regulators diversify and enrich the chance of transcriptional regulation in eukaryotic cells.However,a dose-dependent functional switch of homologous transcriptional repres... Combinatorial interactions between different regulators diversify and enrich the chance of transcriptional regulation in eukaryotic cells.However,a dose-dependent functional switch of homologous transcriptional repressors has rarely been reported.Here,we show that SHY2,an auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA)repressor,exhibits a dose-dependent bimodal role in auxin-sensitive root-hair growth and gene transcrip-tion in Arabidopsis,whereas other Aux/lAA homologs consistently repress the auxin responses.The co-repressor(TOPLESS[TPL])-binding affinity of a bimodal Aux/IAA was lower than that of a consistently re-pressing Aux/IAA.The switch of a single amino acid residue in the TPL-binding motif between the bimodal form and the consistently repressing form switched their TPL-binding affinity and transcriptional and bio-logical roles in auxin responses.Based on these data,we propose a model whereby competition between homologous repressors with different co-repressor-binding affinities could generate a bimodal output at thetranscriptional anddevelopmental levels. 展开更多
关键词 auxIN aux/iaa dose-dependent regulation root hair transcription TOPLESS(TPL)
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高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析 被引量:18
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作者 王益军 吕燕萍 +2 位作者 谢秦 邓德祥 卞云龙 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期688-694,共7页
生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25... 生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因。序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支。该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考。 展开更多
关键词 高粱 生长素 aux/iaa基因家族 比较基因组学
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粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析 被引量:9
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作者 乔麟轶 李欣 +6 位作者 畅志坚 张晓军 詹海仙 郭慧娟 李建波 常建忠 郑军 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2059-2069,共11页
生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/... 生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/IAA基因分布于全部7对染色体上,5个基因分别具有位于同一位点的已知标记。粗山羊草IAA3、IAA11和IAA26的表达具有组织特异性,分别在雌蕊、种子和根中特异表达。系统发育显示,11对粗山羊草-乌拉尔图小麦Aux/IAA蛋白、5对粗山羊草-大麦Aux/IAA蛋白直系同源。共线性分析表明,粗山羊草Aux/IAA基因与短柄草、水稻中同源基因具有很好的共线性。本研究分离的相关基因不仅可用于小麦的遗传改良,也为深入研究小麦Aux/IAA基因提供了信息。 展开更多
关键词 粗山羊草 生长素 aux/iaa基因家族 染色体定位 生物信息学
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黄瓜果实发育早期Aux/IAA家族部分基因的差异表达分析 被引量:7
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作者 王垒 娄丽娜 +2 位作者 闫立英 娄群峰 陈劲枫 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期13-17,共5页
用生物信息学方法获得28个黄瓜Aux/IAA家族基因,选取具有Aux/IAA蛋白典型特征及与单性结实基因SIIAA9亲缘关系较近的6个基因(Csa020459、Csa006680、Csa003118、Csa016715、Csa018571和Csa012115),并以单性结实和非单性结实自交系6401和... 用生物信息学方法获得28个黄瓜Aux/IAA家族基因,选取具有Aux/IAA蛋白典型特征及与单性结实基因SIIAA9亲缘关系较近的6个基因(Csa020459、Csa006680、Csa003118、Csa016715、Csa018571和Csa012115),并以单性结实和非单性结实自交系6401和6429为试材,对这6个基因设计特异引物,在黄瓜果实的cDNA中进行测序验证,同时利用半定量RT-PCR技术在开花当天和花后第2和4天的6401、6429及授粉的6429果实中进行表达分析。结果显示:有5个基因可以检测到表达情况,其中Csa016715在未授粉的6429果实发育过程中表达丰度较低,而在6401和授粉的6429果实中高水平表达。 展开更多
关键词 黄瓜 单性结实 aux/iaa 表达分析 果实发育
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黄瓜果实中ARF和Aux/IAA基因对外源激素的应答 被引量:5
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作者 王垒 陈劲枫 +2 位作者 娄丽娜 娄群峰 贾利 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1127-1131,共5页
以非单性结实黄瓜自交系‘6429’为试验材料,对当天开花的果实进行CPPU、Spd、NAA、2,4-D和IAA等5种生长物质处理,以清水为对照,选取9个ARF基因(Csa019264、Csa019265、Csa009209、Csa009210、Csa021954、Csa012237、Csa012805、Csa015... 以非单性结实黄瓜自交系‘6429’为试验材料,对当天开花的果实进行CPPU、Spd、NAA、2,4-D和IAA等5种生长物质处理,以清水为对照,选取9个ARF基因(Csa019264、Csa019265、Csa009209、Csa009210、Csa021954、Csa012237、Csa012805、Csa015176、Csa010564)和5个Aux/IAA基因(Csa003118、Csa012115、Csa016715、Csa006680、Csa018571)设计特异引物,取开花当天与花后第2、4天的果实及其茎、叶作RT-PCR分析。结果显示,9个ARF基因的表达水平显示出了很大的差异,Csa012805在所有激素处理后的果实中都有较高水平的表达而清水处理中未检测到;5个Aux/IAA基因中的4个在6种处理后的果实及茎叶中都有表达,推测是组成型表达基因,Csa016715在激素处理后的果实中比清水处理的未发育果实中的表达水平高。推测Csa012805和Csa016715这2个基因对黄瓜果实膨大起促进作用。 展开更多
关键词 单性结实 ARF aux/iaa 表达 果实发育
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三月李及其红肉突变体Aux/IAA家族基因鉴定及分析 被引量:4
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作者 方智振 姜翠翠 +2 位作者 周丹蓉 潘少霖 叶新福 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期247-255,共9页
为了解Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的生物学功能,通过生物信息学鉴定三月李及其红肉突变体果实转录组中的Aux/IAA家族基因,并分析其在果实成熟过程中的表达模式。结果表明,三月李及其红肉突变体果实转录组中共有26个Aux/IAA家族... 为了解Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的生物学功能,通过生物信息学鉴定三月李及其红肉突变体果实转录组中的Aux/IAA家族基因,并分析其在果实成熟过程中的表达模式。结果表明,三月李及其红肉突变体果实转录组中共有26个Aux/IAA家族成员,大部分为位于细胞核的不稳定亲水蛋白质。系统进化树分析表明,Aux/IAA家族成员可分为A、B两组,共9个亚组。大部分Aux/IAA蛋白质含有4个高度保守的结构域。16个Aux/IAA家族基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达。PsIAA11、PsIAA13、PsIAA14、PsIAA18、PsIAA19和PsIAA25在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异。上述结果表明,Aux/IAA家族基因与李果实成熟密切相关,这为深入研究Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 转录组 aux/iaa家族 生物信息学分析 表达分析
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芸薹属大白菜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析 被引量:7
14
作者 郑小敏 赵敬会 +2 位作者 李荣冲 王瑞雪 张涛 《北方园艺》 CAS 北大核心 2012年第14期109-113,共5页
Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的3类基因家族之一。现主要从基因组水平研究白菜Aux/IAA基因的分布及特征。结果表明:从BRAD共检测到59条白菜Aux/IAA基因,不均等分布在白菜的全部10条染色体上。通过多重... Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的3类基因家族之一。现主要从基因组水平研究白菜Aux/IAA基因的分布及特征。结果表明:从BRAD共检测到59条白菜Aux/IAA基因,不均等分布在白菜的全部10条染色体上。通过多重比对和基序探测结果显示,40条白菜Aux/IAA基因具有4个保守基序,其它基因的保守基序则有不同程度的分化。系统进化分析表明,Aux/IAA基因家族可分为7个亚家族。通过表达模式预测发现,白菜Aux/IAA基因家族表达模式也有较大差异。 展开更多
关键词 芸薹属大白菜 生长素 aux/iaa基因家族 生物信息学分析
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黄瓜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析 被引量:10
15
作者 王垒 陈劲枫 贾利 《中国瓜菜》 CAS 2010年第6期1-4,共4页
Aux/IAA基因家族是一个典型的被生长素诱导而表达的基因家族,可以被生长素快速诱导表达。采用生物信息学方法在黄瓜基因组中确定了28个Aux/IAA基因,除4号染色体外,其他6条染色体均有分布,编码蛋白序列在70~427个氨基酸残基之间,22个黄瓜... Aux/IAA基因家族是一个典型的被生长素诱导而表达的基因家族,可以被生长素快速诱导表达。采用生物信息学方法在黄瓜基因组中确定了28个Aux/IAA基因,除4号染色体外,其他6条染色体均有分布,编码蛋白序列在70~427个氨基酸残基之间,22个黄瓜Aux/IAA蛋白具有完整的4个保守结构域,进化方式多样化。该研究结果有助于黄瓜生长素信号转导途径的解析。 展开更多
关键词 黄瓜 生长素 aux/iaa
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Aux/IAA家族基因GhAux1沉默促进棉花幼苗的生长 被引量:1
16
作者 王丽 王俐锋 +3 位作者 赵盼盼 李用芳 王太霞 李景原 《河南农业科学》 北大核心 2019年第6期46-51,80,共7页
为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA... 为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA)含量和赤霉素(GA4)含量以及GA合成关键酶基因的表达进行了分析。结果表明,成功建立了VIGS体系,注射含pTRV-GhAux1的菌液后15d,GhAux1在沉默植株中的表达量仅为空载体对照的26%;注射含pTRV-GhAux1的菌液后24、27、30d,GhAux1沉默植株的株高较空载体对照分别显著增加了18%、27%、20%,其中注射后27d达到极显著水平;注射含pTRV-GhAux1的菌液后21、24、27d,GhAux1沉默植株的节间内源GA4含量比空载体对照分别增加了33%、20%、33%,且GA合成关键酶基因GhGA20ox1、GhGA20ox2和GhGA3ox1的表达量均显著或极显著增加,而IAA含量仅在注射后27d显著增加。表明GhAux1参与IAA与GA的互作,可调控GA合成途径下游基因的表达,抑制棉花幼苗的生长。 展开更多
关键词 棉花 病毒诱导的基因沉默 aux/iaa Ghaux1 赤霉素
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ARF和Aux/IAA调控果实发育成熟机制研究进展 被引量:13
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作者 胡晓 侯旭 +2 位作者 袁雪 管丹 刘悦萍 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期37-44,共8页
生长素是调控果实发育成熟的重要植物激素之一。在生长素介导的信号转导机制中,ARF和Aux/IAA扮演重要的角色。ARF与生长素响应基因启动子区域内的生长素响应元件结合,促进或抑制基因的表达。Aux/IAA通过结构域Ⅲ和Ⅳ与ARF特异性结合,从... 生长素是调控果实发育成熟的重要植物激素之一。在生长素介导的信号转导机制中,ARF和Aux/IAA扮演重要的角色。ARF与生长素响应基因启动子区域内的生长素响应元件结合,促进或抑制基因的表达。Aux/IAA通过结构域Ⅲ和Ⅳ与ARF特异性结合,从而调节生长素早期应答基因的转录功能。研究表明,ARF因子参与调控果实形态发育、硬度和糖分积累等,Aux/IAA因子在授粉、果实形态发育等方面作用明显。此外ARF和Aux/IAA之间相互或与自身发生的互作以调控下游基因表达是植物体响应生长素信号的主要机制。介绍了ARF和Aux/IAA的结构特征、在不同植物中的分布状况以及与果实发育成熟的关系,同时讨论了ARF和Aux/IAA互作的研究现状,旨为进一步阐明生长素调控果实发育成熟的机制提供参考。 展开更多
关键词 ARF aux/iaa 果实 发育与成熟 调控机制
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植物AUX/IAA基因家族研究进展 被引量:13
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作者 李俊男 燕晓杰 +1 位作者 李枢航 张荣沭 《中国农学通报》 2018年第15期89-92,共4页
AUX/IAA是生长素早期响应基因家族,其编码的蛋白质能通过与生长素响应因子特异性结合来调控生长素响应基因的表达,在整个植物生长素信号转导过程中具有重要作用。为了深入研究生长素信号转导分子机制,本研究介绍了AUX/IAA基因家族的基... AUX/IAA是生长素早期响应基因家族,其编码的蛋白质能通过与生长素响应因子特异性结合来调控生长素响应基因的表达,在整个植物生长素信号转导过程中具有重要作用。为了深入研究生长素信号转导分子机制,本研究介绍了AUX/IAA基因家族的基因克隆、结构特征和组织表达特异性,概括了AUX/IAA基因家族的分子调控机制,总结了AUX/IAA基因的功能。最后对AUX/IAA基因家族未来的研究方向做了探讨。 展开更多
关键词 生长素 aux/iaa基因家族 信号转导 基因功能 调控机制
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一个属于Aux/IAA基因家族的毛白杨PtIAA1的克隆和序列分析(英文) 被引量:3
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作者 董秀春 樊金会 +1 位作者 于学宁 束怀瑞 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第4期565-571,共7页
基于NCBI数据库中的序列信息,我们利用PCR技术克隆到一个毛白杨(Populustomentosa)PtI-AA1基因。序列分析表明PtIAA1cDNA长度为946个碱基,编码一个由258个氨基酸组成的蛋白,该蛋白与PtIAA1、NtIAA28和AtIAA16蛋白的同源性分别高达97%、... 基于NCBI数据库中的序列信息,我们利用PCR技术克隆到一个毛白杨(Populustomentosa)PtI-AA1基因。序列分析表明PtIAA1cDNA长度为946个碱基,编码一个由258个氨基酸组成的蛋白,该蛋白与PtIAA1、NtIAA28和AtIAA16蛋白的同源性分别高达97%、75%和74%。系统进化分析表明PtIAA1基因可能属于Aux/IAA基因家族中组的成员。与大多数的Aux/IAA基因家族中的基因一样,PtIAA1蛋白是一个短命核蛋白,拥有4个高度保守的区域。 展开更多
关键词 毛白杨(Populus tomentosa) Ptiaa1 aux/iaa基因家族 克隆和序列分析
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谷子Aux/IAA家族基因干旱胁迫响应表达模式分析 被引量:1
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作者 刘晶 王俊杰 +4 位作者 程璐 陈利青 禾璐 候蕊 韩渊怀 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2017年第9期609-615,共7页
[目的]Aux/IAA是重要的蛋白质转录因子,广泛参与植物生长素介导的应答作用,同时参与植物的胁迫和防御响应。本文通过分析Aux/IAA家族基因在干旱胁迫中的表达情况,探索谷子抗旱与Aux/IAA家族基因的关系。[方法]本文对谷子Aux/IAA家族基... [目的]Aux/IAA是重要的蛋白质转录因子,广泛参与植物生长素介导的应答作用,同时参与植物的胁迫和防御响应。本文通过分析Aux/IAA家族基因在干旱胁迫中的表达情况,探索谷子抗旱与Aux/IAA家族基因的关系。[方法]本文对谷子Aux/IAA家族基因理化性质、蛋白亲疏水性、启动子功能元件等进行生物信息学分析,并对抗旱(GG)和干旱敏感(JF16)谷子品种在浇水和干旱胁迫下基因的表达谱数据进行分析。[结果]谷子Aux/IAA家族基因均含有多个与胁迫相关的功能元件,且5个基因编码的蛋白均为亲水性蛋白;干旱胁迫处理后,GG和JF16中5个基因的表达变化趋势有所不同,Seita.5G126200、Seita.1G028400、Seita.3G109400表达量均下调,Seita.1G356800基因的表达量明显上调。[结论]谷子Aux/IAA家族基因参与调控谷子干旱胁迫,其调控过程比较复杂,可作为参与谷子抗旱的候选基因。本研究结果为进一步探究谷子中Aux/IAA与抗旱机制提供一定理论依据。 展开更多
关键词 谷子 aux/iaa 干旱胁迫 生物信息学分析
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