目的探讨含杆状病毒凋亡抑制蛋白重复序列蛋白5(baculoviral inhibitor of apoptosis protein repeat-containing protein 5,BIRC5)基因在胃癌(Gastric cancer,GC)中的表达和临床价值。方法采用GEPIA、BioGPS、Kaplan-Meier Plotter数...目的探讨含杆状病毒凋亡抑制蛋白重复序列蛋白5(baculoviral inhibitor of apoptosis protein repeat-containing protein 5,BIRC5)基因在胃癌(Gastric cancer,GC)中的表达和临床价值。方法采用GEPIA、BioGPS、Kaplan-Meier Plotter数据库分析胃癌组织与癌旁组织之间BIRC5基因表达差异,预测BIRC5的表达水平与胃癌患者生存及预后的关系;基于Coexpedia数据库构建BIRC5在胃癌中的共表达基因网络,使用String数据库取得与BIRC5相关蛋白质网络图和基因本体(GO)功能注释,分析京都基因和基因组百科全书(KEGG)相关通路。采用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,预测BIRC5在免疫浸润细胞中的表达。结果GEPIA、BioGPS、TIMER分析表明:与癌旁组织相比,BIRC5在胃癌组织中的表达较高(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析表明,BIRC5基因表达较低的胃癌患者总生存期(HR=1.28,P<0.05)及进展后生存期(HR=1.28,P<0.05)均延长。BIRC5的共表达基因主要有UBE2C、TPX2、BUB1B、PRC1、CCNB2、KIF2C、SPAG5、CKS1B、CCNB1、CDK1、CENPA、NUSAP1、ANLN、NEK2、PARP1、MAD2L1、CDC20、TCP1。通过String数据库收集BIRC5相关蛋白,参与7种信号传导通路,主要富集于86种生物学过程、5种分子功能和34种细胞学组分。TIMER数据库分析表明,在免疫微环境中,BIRC5mRNA水平较低的巨噬细胞和树突状细胞的胃癌患者生存较好。结论BIRC5基因在胃癌组织中高表达,BIRC5可能降低肿瘤免疫抑制,可作为评价胃癌患者预后的标志物。展开更多
目的:探究TLR10和BIRC5基因的易感性与甲状腺乳头状癌(PTC)的关系。方法:通过使用Agena Mass ARRAY平台对4个单核苷酸多态性(SNP)(rs11466653、rs11096956、rs11096955、rs9904341)进行检测评估,并采用卡方检验、遗传模型分析以及单体...目的:探究TLR10和BIRC5基因的易感性与甲状腺乳头状癌(PTC)的关系。方法:通过使用Agena Mass ARRAY平台对4个单核苷酸多态性(SNP)(rs11466653、rs11096956、rs11096955、rs9904341)进行检测评估,并采用卡方检验、遗传模型分析以及单体型分析等统计分析方法。结果:rs11096956位点(TLR10)的等位基因"C"与rs9904341位点(BIRC5)的等位基因"G"均与增加PTC的发病风险相关(rs11096956:OR=1.26,95%CI=1.09~1.97,P=0.031;rs9904341:OR=1.26,95%CI=1.17~2.04,P=0.019)。在遗传模型下,通过逻辑回归分析发现在共显性模型、显性模型以及加性模型中rs11096956 SNPs位点的多态性与增加PTC的发病风险相关。在共显性模型和显性模型下,rs9904341位点的多态性与PTC风险增加有关。此外,TLR10基因的SNPs位点构成的单倍体型"Trs11466653Trs11096956Crs11096955"与增加PTC的发病风险有关。分层分析显示,rs11096956(TLR10)和rs9904341(BIRC5)位点多态性可显著增加女性PTC的发病风险(P<0.05)。结论:发现表明rs11096956(TLR10)和rs9904341(BIRC5)的变异与PTC风险的增加有关,尤其是在女性人群中。展开更多
文摘目的探讨含杆状病毒凋亡抑制蛋白重复序列蛋白5(baculoviral inhibitor of apoptosis protein repeat-containing protein 5,BIRC5)基因在胃癌(Gastric cancer,GC)中的表达和临床价值。方法采用GEPIA、BioGPS、Kaplan-Meier Plotter数据库分析胃癌组织与癌旁组织之间BIRC5基因表达差异,预测BIRC5的表达水平与胃癌患者生存及预后的关系;基于Coexpedia数据库构建BIRC5在胃癌中的共表达基因网络,使用String数据库取得与BIRC5相关蛋白质网络图和基因本体(GO)功能注释,分析京都基因和基因组百科全书(KEGG)相关通路。采用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库,预测BIRC5在免疫浸润细胞中的表达。结果GEPIA、BioGPS、TIMER分析表明:与癌旁组织相比,BIRC5在胃癌组织中的表达较高(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析表明,BIRC5基因表达较低的胃癌患者总生存期(HR=1.28,P<0.05)及进展后生存期(HR=1.28,P<0.05)均延长。BIRC5的共表达基因主要有UBE2C、TPX2、BUB1B、PRC1、CCNB2、KIF2C、SPAG5、CKS1B、CCNB1、CDK1、CENPA、NUSAP1、ANLN、NEK2、PARP1、MAD2L1、CDC20、TCP1。通过String数据库收集BIRC5相关蛋白,参与7种信号传导通路,主要富集于86种生物学过程、5种分子功能和34种细胞学组分。TIMER数据库分析表明,在免疫微环境中,BIRC5mRNA水平较低的巨噬细胞和树突状细胞的胃癌患者生存较好。结论BIRC5基因在胃癌组织中高表达,BIRC5可能降低肿瘤免疫抑制,可作为评价胃癌患者预后的标志物。
文摘目的:探究TLR10和BIRC5基因的易感性与甲状腺乳头状癌(PTC)的关系。方法:通过使用Agena Mass ARRAY平台对4个单核苷酸多态性(SNP)(rs11466653、rs11096956、rs11096955、rs9904341)进行检测评估,并采用卡方检验、遗传模型分析以及单体型分析等统计分析方法。结果:rs11096956位点(TLR10)的等位基因"C"与rs9904341位点(BIRC5)的等位基因"G"均与增加PTC的发病风险相关(rs11096956:OR=1.26,95%CI=1.09~1.97,P=0.031;rs9904341:OR=1.26,95%CI=1.17~2.04,P=0.019)。在遗传模型下,通过逻辑回归分析发现在共显性模型、显性模型以及加性模型中rs11096956 SNPs位点的多态性与增加PTC的发病风险相关。在共显性模型和显性模型下,rs9904341位点的多态性与PTC风险增加有关。此外,TLR10基因的SNPs位点构成的单倍体型"Trs11466653Trs11096956Crs11096955"与增加PTC的发病风险有关。分层分析显示,rs11096956(TLR10)和rs9904341(BIRC5)位点多态性可显著增加女性PTC的发病风险(P<0.05)。结论:发现表明rs11096956(TLR10)和rs9904341(BIRC5)的变异与PTC风险的增加有关,尤其是在女性人群中。