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BMAP-28对乳腺癌Bcap37细胞的抗肿瘤活性研究
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作者 李昂 王顺 +3 位作者 刘桃源 衣同辉 李淑艳 潘洪明 《中国医学创新》 CAS 2022年第10期13-16,共4页
目的:研究BMAP-28对乳腺癌Bcap37细胞增殖及凋亡的影响。方法:体外培养Bcap37细胞,设置对照组(BMAP-28浓度为0μg/mL)和实验组(BMAP-28浓度分别为20、40、60、80μg/mL)。CCK-8实验检测Bcap37细胞的增殖情况;DAPI染色观察细胞凋亡形态... 目的:研究BMAP-28对乳腺癌Bcap37细胞增殖及凋亡的影响。方法:体外培养Bcap37细胞,设置对照组(BMAP-28浓度为0μg/mL)和实验组(BMAP-28浓度分别为20、40、60、80μg/mL)。CCK-8实验检测Bcap37细胞的增殖情况;DAPI染色观察细胞凋亡形态学变化;流式细胞术检测细胞凋亡率。结果:CCK-8实验测得BMAP-28对Bcap37细胞的增殖具有抑制作用,BMAP-28的IC_(50)=49.19μg/mL。DAPI染色可见随着BMAP-28浓度的增加,细胞凋亡数量增加,凋亡形态明显。流式细胞术显示细胞凋亡率逐渐增高,趋势和DAPI染色结果一致(P<0.01)。结论:BMAP-28能显著抑制乳腺癌Bcap37细胞的增殖,促进癌细胞的凋亡,有望成为临床乳腺癌治疗的新型抗癌药物。 展开更多
关键词 bmap-28 乳腺癌 增殖 凋亡
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Interaction of Human Genes WT1 and CML28 in Leukemic Cells
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作者 毛霞 张冰 +2 位作者 刘龙龙 白雪玲 张东华 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2013年第1期37-42,共6页
The molecular pathogenesis of leukemia is poorly understood. Earlier studies have shown both Wilms' tumor 1 suppressor gene (WT1) and CML28 abnormally expressed in malignant diseases of the hematopoietic system and... The molecular pathogenesis of leukemia is poorly understood. Earlier studies have shown both Wilms' tumor 1 suppressor gene (WT1) and CML28 abnormally expressed in malignant diseases of the hematopoietic system and WT1 played an important role in leukemogenesis. However, the rela- tionship between molecular CML28 and WT1 has not been reported. Here we described the use of small interfering RNA (siRNA) against WT1 and CML28 in leukemic cell line K562 to examine the interac- tion between CML28 and WT1. WT1 and CML28 gene expression in transfected K562 cells was de- tected by using RQ-PCR and Western blotting. K562 cells transfected with WTI-siRNA could greatly decrease both mRNA and protein expression levels of WT1 and CML28. In contrast, CML28-siRNA did not exert effect on WT1. Further, subcellular co-localization assay showed that the two proteins could co-localize in the cytoplasm of K562 cells, but WT1/CML28 complexes were not detected by us- ing immunoprecipitation. It was suggested that there exists the relationship between CML28 and WT1. CML28 may be a downstream target molecule of WT1 and regulated by WT1, which will provide im- portant clues for further study on the role of CML28 and WT1 in leukemic cells. 展开更多
关键词 Wilms' tumor 1 suppressor gene CML28 K562 SIRNA
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牛Cathelicidin B MAP-28基因的克隆及原核表达 被引量:1
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作者 徐鹏 张勇 +1 位作者 常卫华 吴海凤 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期6-10,16,共6页
根据GenBank中公布的牛BMAP-28基因mRNA序列设计引物,利用RT-PCR技术从牛骨髓总RNA中扩增出BMAP-28基因片段,将其克隆到pMD-18载体上,通过PCR、酶切和测序分析鉴定,获得重组克隆载体pMD18-T-BMAP28.以重组质粒为模板,扩增BMAP-28基因的... 根据GenBank中公布的牛BMAP-28基因mRNA序列设计引物,利用RT-PCR技术从牛骨髓总RNA中扩增出BMAP-28基因片段,将其克隆到pMD-18载体上,通过PCR、酶切和测序分析鉴定,获得重组克隆载体pMD18-T-BMAP28.以重组质粒为模板,扩增BMAP-28基因的去信号肽片段,转入原核表达载体PET28a,并转化到Rosetta宿主菌中,用IPTG诱导表达,SDS-PAGE和Western-blot检测表达产物.结果表明:重组克隆载体序列与已发表的BMAP-28基因序列有1个碱基差异,并导致氨基酸替换;经IPTG诱导后,含PET28a-BMAP28重组质粒的大肠杆菌能表达预计大小的融合蛋白,且表达的蛋白有抑菌活性. 展开更多
关键词 CATHELICIDINS bmap-28基金 原核表达
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中国部分地区肿瘤患者UGT1A1*28和UGT1A1*6位点基因多态性分布的差异研究 被引量:9
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作者 来向阳 衡雪源 +6 位作者 车峰远 王守峰 石建华 蔡利娟 张金岭 黄伟 李峥嵘 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第30期3705-3710,共6页
目的调查我国部分地区肿瘤患者UGT1A1^*28和UGT1A1^*6位点基因多态性分布情况,明确二者在肿瘤患者中分布的差异。方法收集2011年8月—2014年4月山东大学附属临沂市人民医院、临沂市肿瘤医院、兰州大学第一附属医院、西安交通大学第一... 目的调查我国部分地区肿瘤患者UGT1A1^*28和UGT1A1^*6位点基因多态性分布情况,明确二者在肿瘤患者中分布的差异。方法收集2011年8月—2014年4月山东大学附属临沂市人民医院、临沂市肿瘤医院、兰州大学第一附属医院、西安交通大学第一附属医院、西京医院应用伊立替康治疗的住院肿瘤患者241例,均进行了UGT1A1^*28位点基因多态性检测,其中177例同时进行了UGT1A1^*6位点基因多态性检测,提取基因组DNA,PCR扩增UGT1A1基因片段,检测UGT1A1^*28和UGT1A1^*6位点基因型分布。结果 241例检测UGT1A1^*28位点基因多态性的患者中,UGT1A1^*28位点基因启动子区TA序列呈6次重复的野生型(TA6/6)即野生型纯合子180例(74.7%),TA序列6次和7次重复的杂合突变型(TA6/7)即突变型杂合子56例(23.2%),TA序列7次重复的纯合突变型(TA7/7)即突变型纯合子5例(2.1%);177例检测UGT1A1^*6位点基因多态性的患者中,UGT1A1^*6位点基因型为野生型(G/G)即野生型纯合子106例(59.9%),杂合突变型(G/A)即突变型杂合子62例(35.0%),纯合突变型(A/A)即突变型纯合子9例(5.1%)。UGT1A1^*28和UGT1A1^*6位点基因型分布比较,差异有统计学意义(P〈0.05)。不同性别、年龄、肿瘤部位、地区来源肿瘤患者UGT1A1^*28位点基因型分布比较,差异均无统计学意义(P〉0.05)。不同性别、年龄、地区来源肿瘤患者UGT1A1^*6位点基因型分布比较,差异均无统计学意义(P〉0.05);不同肿瘤部位患者UGT1A1^*6位点基因型分布比较,差异有统计学意义(P〈0.05)。男性、〈40岁、肠道、山东地区、甘肃地区肿瘤患者UGT1A1^*28与UGT1A1^*6位点基因型分布比较,差异有统计学意义(P〈0.05);女性、40~60岁、〉60岁、肺部、胃部、其他部位、陕西地区、其他地区肿瘤患者UGT1A1^*28与UGT1A1^*6位点基因型分布比较,差异无统计学意义(P〉0.05)。结论国内肿瘤患者中UGT1A1^*28和UGT1A1^*6位点基因野生型纯合子频率均较高,但两位点基因型分布有差异,所以研究UGT1A1基因与伊立替康毒副作用时应联合检测UGT1A1^*28和UGT1A1^*6两个突变位点,并且应同时注意患者的性别、年龄、肿瘤部位及地区来源。 展开更多
关键词 肿瘤 基因 突变 UGT1A1^*28 UGT1A1^*6
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福寿螺18S rRNA和28S rRNA基因片段的克隆与进化分析 被引量:6
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作者 潘颖瑛 董胜张 俞晓平 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期33-36,共4页
为从分子水平上明确入侵我国的福寿螺在分类学上的地位,采用分子克隆和序列比对的方法,对来自菲律宾及我国广东、广西、浙江等不同地理种群福寿螺的18S rRNA基因和28S rRNA基因片段进行扩增、克隆和序列测定,并同瓶螺科、田螺科和环口... 为从分子水平上明确入侵我国的福寿螺在分类学上的地位,采用分子克隆和序列比对的方法,对来自菲律宾及我国广东、广西、浙江等不同地理种群福寿螺的18S rRNA基因和28S rRNA基因片段进行扩增、克隆和序列测定,并同瓶螺科、田螺科和环口螺科相关物种进行系统发育分析。结果表明,获得的福寿螺18S rRNA基因和28S rRNA基因片段长度分别为602bp、325bp,且不同地理种群间碱基序列无差异。通过邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建的系统树基本一致,证实福寿螺隶属于瓶螺科,与田螺科物种亲缘关系较近,而与环口螺科亲缘关系较远。 展开更多
关键词 福寿螺 18S RRNA基因 28S RRNA基因 系统进化分析
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核糖体28S-D3等位基因特异扩增鉴别微小按蚊亲缘种A和C 被引量:4
6
作者 周水森 汤林华 +1 位作者 夏明仪 薛海筹 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2003年第6期408-410,共3页
目的 建立微小按蚊复合体不同亲缘种A和C的分子鉴别方法。方法 用单蚊蚊腿消化提取基因组DNA ,PCR特异扩增 2 8S第 3结构域 (D3 )基因 ,对PCR产物进行纯化、克隆、测序和序列分析 ;基于序列差异设计特异引物 ,进行等位基因特异扩增 (P... 目的 建立微小按蚊复合体不同亲缘种A和C的分子鉴别方法。方法 用单蚊蚊腿消化提取基因组DNA ,PCR特异扩增 2 8S第 3结构域 (D3 )基因 ,对PCR产物进行纯化、克隆、测序和序列分析 ;基于序列差异设计特异引物 ,进行等位基因特异扩增 (PCR -ASA) ,根据扩增片段大小区分微小按蚊不同亲缘种。结果 发现微小按蚊不同亲缘种A和C(GeneBank登录号 :AF416782 ,AF42 5 5 94) ,根据二者序列差异设计的特异引物能在普通琼脂糖凝胶上直观地区分两亲缘种 ,两者除在 3 76bp处有一共同条带外 ,分别在 2 94bp和 112bp处出现各自的特异扩增带。结论 我们建立的ASA分子鉴别方法能有效地将我国微小按蚊不同亲缘种A和C区分开来。 展开更多
关键词 微小按蚊 亲缘种 基因D3 分子鉴别 核糖体 等位基因
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RNA干扰maspin基因对胃癌细胞株MKN-28凋亡的影响 被引量:6
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作者 倪江涛 石海鹏 易永芬 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期571-576,共6页
目的:探讨转染maspin特异性短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)重组质粒对胃癌细胞株MKN-28凋亡的影响。方法:设计并合成针对maspin基因的shRNA,并将其与真核表达载体pGenesil-1.1连接,构建重组质粒pGenesil-maspin。应用RT-PCR和West... 目的:探讨转染maspin特异性短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)重组质粒对胃癌细胞株MKN-28凋亡的影响。方法:设计并合成针对maspin基因的shRNA,并将其与真核表达载体pGenesil-1.1连接,构建重组质粒pGenesil-maspin。应用RT-PCR和Western印迹法检测转染重组质粒后MKN-28细胞中maspin、bcl-2和bax mRNA及蛋白的表达变化,应用FCM法检测转染重组质粒对MKN-28细胞的细胞周期和细胞凋亡的影响。结果:成功构建maspin特异性shRNA重组质粒pGenesil-maspin1、pGenesil-maspin2及pGenesil-HK(阴性对照);pGenesil-maspin成功转染后可明显下调胃癌细胞MKN-28中maspin和bax mRNA及蛋白的表达水平(P<0.01),并上调bcl-2 mRNA和蛋白的表达水平(P<0.01);重组质粒转染后,MKN-28细胞的细胞周期呈现G0/G1期细胞减少(P<0.01),细胞凋亡率下降(P<0.01)。结论:外源性maspin shRNA转染MKN-28细胞后能下调maspin的表达,抑制胃癌细胞的凋亡,且使细胞周期分布发生改变;其分子机制可能与上调bcl-2和下调bax的表达有关。 展开更多
关键词 胃肿瘤 RNA干扰 细胞周期 细胞凋亡 细胞 MKN-28 基因 maspin
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5965例中国消化系统肿瘤患者UGT1A1*6和UGT1A1*28基因多态性分布的研究 被引量:2
8
作者 李艳艳 高静 +5 位作者 王晰程 李健 张小田 齐长松 沈琳 龚继芳 《临床肿瘤学杂志》 CAS 北大核心 2020年第10期865-869,共5页
目的分析中国消化系统肿瘤患者UGT1A1*6和UGT1A1*28基因多态性特点,探讨不同肿瘤患者中基因多态性的差异。方法收集2011年8月至2017年8月在北京大学肿瘤医院消化肿瘤内科接受治疗的5965例消化系统肿瘤患者外周血,提取基因组DNA,运用San... 目的分析中国消化系统肿瘤患者UGT1A1*6和UGT1A1*28基因多态性特点,探讨不同肿瘤患者中基因多态性的差异。方法收集2011年8月至2017年8月在北京大学肿瘤医院消化肿瘤内科接受治疗的5965例消化系统肿瘤患者外周血,提取基因组DNA,运用Sanger测序法检测UGT1A1*6和UGT1A1*28基因多态性。结果5965例肿瘤患者中,UGT1A1*6基因型为野生型(G/G)患者3748例(62.83%),杂合突变型(G/A)患者1947例(32.64%),纯合突变型(A/A)患者270例(4.53%);UGT1A1*28基因型为野生型(TA6/TA6)患者4553例(76.33%),杂合突变型(TA6/TA7、TA6/TA8、TA6/TA5)患者1341例(22.48%),纯合突变型(TA7/TA7)患者71例(1.19%);UGT1A1*6和UGT1A1*28均野生型者2670例(44.76%),仅携带UGT1A1*6或UGT1A1*28突变者2961例(49.64%),同时携带UGT1A1*6与UGT1A1*28突变者334例(5.60%)。UGT1A1*6或UGT1A1*28不同基因型在胃癌、结直肠癌、食管癌、神经内分泌肿瘤、胰腺癌中的分布差异无统计学意义(P>0.05)。在结直肠癌患者中,年老患者UGT1A1*6纯合突变型比例略高(P=0.035),而在胃癌、食管癌、神经内分泌肿瘤、胰腺癌中,基因分型与患者的性别、年龄等特征均无关(P>0.05)。结论中国一半以上的消化系统肿瘤患者携带UGT1A1*6或UGT1A1*28基因变异,患者用药前进行基因多态性检测,为指导临床用药提供重要依据。 展开更多
关键词 消化系统肿瘤 UGT1A1*6 UGT1A1*28 基因多态性
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伞滑刃线虫属部分种群28S RNA基因中D2-D3区的特征 被引量:4
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作者 蒋立琴 郑经武 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期588-594,共7页
对伞滑刃线虫属部分种群包括松材线虫、拟松材线虫、豆伞滑刃线虫、莱奴尔夫伞滑刃线虫和泰国伞滑刃线虫等种的28S RNA基因中D2-D3区进行了系统的研究。经PCR扩增发现,不同的种均产生1个约750 bp的片段。利用限制性内切酶对其进行PCR-R... 对伞滑刃线虫属部分种群包括松材线虫、拟松材线虫、豆伞滑刃线虫、莱奴尔夫伞滑刃线虫和泰国伞滑刃线虫等种的28S RNA基因中D2-D3区进行了系统的研究。经PCR扩增发现,不同的种均产生1个约750 bp的片段。利用限制性内切酶对其进行PCR-RFLP分析,除松材线虫与拟松材线虫的酶切图谱比较接近外,其它伞滑刃线虫种群获得不同的酶切图谱。图谱分析发现,限制性内切酶Bsh1236I能区分2个近似种——松材线虫和拟松材线虫。进一步分析表明:Bsh1236I对28S RNA基因D2-D3区的酶切可用于鉴定本研究中伞滑刃线虫属的不同种群。同时运用clustalx1.8和Mega 2软件对28S RNA基因D2-D3区构建部分伞滑刃线虫属种群的系统树,显示出与形态学基本一致的聚类组群。 展开更多
关键词 伞滑刃线虫属 28S RNA基因 PCR—RFLP 序列分析 系统学
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基于28S rRNA基因片段的翼形亚纲(Bivalvia:Pteriomorphia)系统发育的初步研究 被引量:1
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作者 薛东秀 王海艳 +2 位作者 张涛 张素萍 徐凤山 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期348-356,共9页
采用从GenBank下载的翼形亚纲11个总科80个种类的28S部分序列,对翼形亚纲11个总科贝类进行系统发育关系研究。在获得的1252个序列位点中,去除插入缺失位点,变异位点共359个,其中简约位点300个。翼形亚纲各总科内各种间的遗传距离为0.01... 采用从GenBank下载的翼形亚纲11个总科80个种类的28S部分序列,对翼形亚纲11个总科贝类进行系统发育关系研究。在获得的1252个序列位点中,去除插入缺失位点,变异位点共359个,其中简约位点300个。翼形亚纲各总科内各种间的遗传距离为0.01—0.14,明显小于各总科间的遗传距离(除蚶总科与拟锉蛤总科,双肌蛤总科与襞蛤总科以及两总科与贻贝总科外)。贝叶斯树和最大似然树均支持翼形亚纲为单系群,并将11个总科分为3个聚类簇:聚类簇Ⅰ为珍珠贝总科(Pterioidea)、牡蛎总科(Ostreoidea)和江珧总科(Pinnoidea),聚类簇Ⅱ为贻贝总科(Mytiloidea)、蚶总科(Arcoidea)和拟锉蛤总科(Limopsoidea),聚类簇Ⅲ为襞蛤总科(Plicatuloidea)、不等蛤总科(Anomioidea)、双肌蛤总科(Dimyoidea)、扇贝总科(Pectinoidea)和锉蛤总科(Limoidea)。根据本研究的结果,并结合其他学者提出的分类系统,构建了包括4目11总科的翼形亚纲分类系统。 展开更多
关键词 翼形亚纲 28S RRNA基因 分子系统学
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家蚕27、28号染色体基因的生物信息学分析 被引量:2
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作者 段彪 查幸福 +3 位作者 沈以红 代方银 夏庆友 向仲怀 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期241-247,共7页
利用家蚕基因组精细图分析第27、28号染色体上的基因结构及其编码蛋白的功能结构域,可为在家蚕资源库中鉴定这两条染色体上的突变基因以及发现新的形态标记提供重要线索。基因预测及结构分析显示:家蚕第27和28号染色体是基因数目最少的... 利用家蚕基因组精细图分析第27、28号染色体上的基因结构及其编码蛋白的功能结构域,可为在家蚕资源库中鉴定这两条染色体上的突变基因以及发现新的形态标记提供重要线索。基因预测及结构分析显示:家蚕第27和28号染色体是基因数目最少的两条染色体,预测基因数目分别是241个和288个,平均每个基因分别具有7.7和5.3个外显子;蛋白质全长编码区序列(CDS)长度主要分布于400-800 bp之间;CDS的GC含量分别是49.72%和46.54%。蛋白质功能结构域分析发现,家蚕第27、28号染色体上基因所编码的蛋白分别具有76和92种结构域,其中最多的3种结构域分别为Sugar_tr、MFS_1、zf-C2H2和UDPGT、DUF、Serpin。将家蚕第27、28号染色体上的预测基因与果蝇突变基因进行同源检索的结果显示,家蚕第27、28号染色体上分别有16和15个基因具有明显的可能突变表型。 展开更多
关键词 家蚕 突变基因 27号连锁群 28号连锁群 生物信息学
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UROC28基因的原核表达及抗UROC28多抗制备和初步应用 被引量:1
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作者 王春杨 杨力军 +4 位作者 吴元明 邵国兴 王禾 陈南春 陈苏民 《第四军医大学学报》 北大核心 2004年第9期829-832,共4页
目的 :在原核细胞大肠杆菌中融合表达UROC2 8基因产物 ,分离、纯化后制备其特异性多克隆抗体 ,并初步应用于肿瘤标本的检测 ,为进一步研究该分子的功能和组织分布等提供条件 .方法 :利用DNA重组技术将UROC2 8基因克隆入融合表达载体pRSE... 目的 :在原核细胞大肠杆菌中融合表达UROC2 8基因产物 ,分离、纯化后制备其特异性多克隆抗体 ,并初步应用于肿瘤标本的检测 ,为进一步研究该分子的功能和组织分布等提供条件 .方法 :利用DNA重组技术将UROC2 8基因克隆入融合表达载体pRSET c质粒 ,并在大肠杆菌BL 2 1中融合表达目的蛋白 ,回收后制备兔抗血清 ,Westernblot鉴定抗体后 ,应用该抗体对前列腺癌石蜡切片进行免疫组化染色 .结果 :His UROC2 8融合蛋白的Mr 约为 2 2 0 0 0 ,与预期相符 ;融合蛋白占菌体总蛋白的 2 0 % .目的蛋白免疫新西兰兔获得多克隆抗体 ,Westernblot结果显示制备的抗UROC2 8多克隆抗体具有较高的特异性 ,无明显交叉反应 ,并成功在前列腺癌组织标本中检测UROC2 8的表达 .结论 :本研究成功构建了UROC2 8融合表达载体 ,并在大肠杆菌中获得高效表达 .制备了该分子的多克隆抗体 ,经初步验证其效价高、特异性好 ,为深入研究UROC2 展开更多
关键词 UROC28基因 融合表达 抗体制备
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川东北地区人群结直肠癌患者UGT1A1* 28基因多态性与伊立替康所致毒副反应的相关性 被引量:1
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作者 皈燕 谢力 +1 位作者 舒晓红 谭榜宪 《现代肿瘤医学》 CAS 2016年第3期421-425,共5页
目的:观察结直肠癌患者UGT1A1*28基因多态性的分布频率,了解UGT1A1*28基因多态性与结直肠癌患者应用伊立替康联合5-氟尿嘧啶化疗毒副反应的相关性。方法:从384例接受伊立替康联合氟尿嘧啶一线化疗的晚期结直肠癌病例中采外周血提取DNA... 目的:观察结直肠癌患者UGT1A1*28基因多态性的分布频率,了解UGT1A1*28基因多态性与结直肠癌患者应用伊立替康联合5-氟尿嘧啶化疗毒副反应的相关性。方法:从384例接受伊立替康联合氟尿嘧啶一线化疗的晚期结直肠癌病例中采外周血提取DNA。采用PCR法扩增目的基因片段,直接测序法分析UGT1A1*28基因多态性。临床观察并评价患者化疗毒副反应分级,统计分析UGT1A1*28基因表型与化疗毒副反应相关性。结果:全部384例患者UGT1A1*28基因多态性分布情况:TA6/6野生基因型287例(74.7%),TA6/7杂合基因型73例(19.0%),TA7/7纯合基因型24例(6.3%)。化疗毒副反应和UGT1A1*28基因多态性进行临床单因素分析显示UGT1A1*28基因纯合型TA7/7、杂合型TA6/7与3-4度白细胞减少、中性粒细胞减少、腹泻、胆红素升高具有明显相关性(P<0.01),UGT1A1*28基因纯合型TA7/7及杂合型TA6/7患者发生中性粒细胞减少的风险较UGT1A1*28基因野生型TA6/6患者高5.625倍(OR=5.625)。UGT1A1*28基因纯合型TA7/7和UGT1A1*28基因杂合型TA6/7患者发生腹泻的风险较UGT1A1*28基因野生型TA6/6患者高6.778倍(OR=6.778)。结论:UGT1A1*28基因纯合型TA7/7及杂合型TA6/7患者应用伊立替康化疗后发生重度中性粒细胞减少、重度腹泻的风险高于UGT1A1*28基因野生型TA6/6,为临床伊立替康用药选择、剂量调整、毒副反应的提前干预提供理论依据。 展开更多
关键词 UGT1A1*28 基因多态性 伊立替康 化疗 中性粒细胞减少 腹泻
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食线虫真菌28S rDNA PCR扩增片段的RFLPs分析 被引量:2
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作者 李文鹏 张克勤 +2 位作者 李明春 Kevin D.Hyde 邢来君 《菌物系统》 CSCD 北大核心 2002年第4期552-558,共7页
本文对16个食线虫真菌(节丛孢属、隔指孢属和单顶孢属)菌株和3个其他相关丝孢菌(顶辐孢属和单端孢属)菌株的28S rDNA 片段进行了扩增, 并用限制性内切酶Sau3A I, Msp I, Rsa I and Hae III对PCR产物进行了消化。采用UPGMA法对 PCR 产物... 本文对16个食线虫真菌(节丛孢属、隔指孢属和单顶孢属)菌株和3个其他相关丝孢菌(顶辐孢属和单端孢属)菌株的28S rDNA 片段进行了扩增, 并用限制性内切酶Sau3A I, Msp I, Rsa I and Hae III对PCR产物进行了消化。采用UPGMA法对 PCR 产物的限制性图谱特征进行了聚类分析。结果表明,捕食性真菌的聚类群与捕食器官类型相对应,顶辐孢属和单端孢属与捕食性真菌的遗传距离较远。该结果与rDNA 的ITS区间、5.8S和18S的序列分析结果一致。 展开更多
关键词 食线虫真菌 28S RDNA PCR扩增片段 RFLPs分析
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冷血和温血动物血吸虫28S rRNA基因的扩增和酶切片段分析 被引量:1
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作者 舒利民 彭宣宪 王三英 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2000年第3期140-144,共5页
用特异性引物扩增日本血吸虫 ( Schistosom a japonicum )、龙江血居吸虫 ( Sangunicola lungensis)的成虫和尾蚴和士耳其斯坦东毕吸虫尾蚴 2 8S r RN A基因片段 ,并且用 Taq I和 Hae III两种限制性内切酶对前两者进行酶切 ,凝胶成像分... 用特异性引物扩增日本血吸虫 ( Schistosom a japonicum )、龙江血居吸虫 ( Sangunicola lungensis)的成虫和尾蚴和士耳其斯坦东毕吸虫尾蚴 2 8S r RN A基因片段 ,并且用 Taq I和 Hae III两种限制性内切酶对前两者进行酶切 ,凝胶成像分析结果表明日本血吸虫和东毕血吸虫在该基因片段扩增产物大小表现高度一致 ,日本血吸虫和龙江血居吸虫在该基因片段的酶切产物存在明显差异 ,在基因水平证实血吸虫类群中 ,寄生温血动物同属裂体科的日本血吸虫、东毕血吸虫与寄生冷血动物的血居科吸虫相比 ,前两者有着非常相近的亲缘关系。龙江血居吸虫成虫在 PCR扩增过程中 ,除了出现 1条 12 2 7bp的主带外 ,还呈现 1条 962 bp的弱带 ,在尾蚴则并未出现 ,单链构象多态性分析 ( SSCP) ,日本血吸虫成虫和尾蚴带型一致 ,龙江血居吸虫成虫呈现出至少 3条条带 ,而其尾蚴表现出清晰的 2条条带 ,进一步证实在发育过程中 ,龙江血居吸虫虫体间存在有该重复序列的变异。 展开更多
关键词 血吸虫 28S RRNA基因 PCR 限制性酶切
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UGT1A1*28和UGT1A1*6基因多态性在结直肠癌患者中的分布调查 被引量:1
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作者 蔡贞 温淑娟 郑磊 《实用检验医师杂志》 2013年第2期72-75,共4页
目的调查结直肠癌患者UGT1A1基因UGT1A1*28和UGT1A1*6基因多态性的分布频率。方法收集我院80例结直肠癌患者外周血标本,提取基因组DNA.PCR扩增UGT1A1基因启动子和第1外显子基因片段,直接测序确定基因型。结果80例结直肠癌患者中.U... 目的调查结直肠癌患者UGT1A1基因UGT1A1*28和UGT1A1*6基因多态性的分布频率。方法收集我院80例结直肠癌患者外周血标本,提取基因组DNA.PCR扩增UGT1A1基因启动子和第1外显子基因片段,直接测序确定基因型。结果80例结直肠癌患者中.UGT1A1六28位点野生型TA6/6为55例(68.75%),杂合突变型TA6/7基因型22例(27.50%),纯和突变型TA7/7有3例(3.75%);UGT1A1*6位点突变型211GG基因型57例(71.25%),211GA基因型22例(27.50%),211AA基因型1例(1.25%)。等位基因出现频率分别为TA6为82.50%.TA7为17.50%.211G为85.00%.211A为15.00%。同时携带TA7和211A等位基因共6例(7.50%)。结论结直肠癌患者中UGT1A1*6和UGT1A1*28分布频率均较高,在测定UGT1A1基因多态性时应同时检测这两个突变位点。 展开更多
关键词 结直肠癌 UGT1A1 基因多态性 UGT1A1*28 UGT1A1*6
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8种唇口目苔藓动物的分子系统发生——基于28S rRNA基因的证据
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作者 郝家胜 《安徽师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第1期51-54,共4页
对我国沿海较为常见的 8种唇口目苔藓动物的 2 8SrRNA基因的部分序列进行了PCR扩增和序列测定 .用排序软件进行序列比对后 ,以腕足动物为外组群 ,运用MEGA遗传分析软件以邻接法 (NJ)和最大似然法 (MP)构建了系统发生树 .结果表明 ,有囊... 对我国沿海较为常见的 8种唇口目苔藓动物的 2 8SrRNA基因的部分序列进行了PCR扩增和序列测定 .用排序软件进行序列比对后 ,以腕足动物为外组群 ,运用MEGA遗传分析软件以邻接法 (NJ)和最大似然法 (MP)构建了系统发生树 .结果表明 ,有囊亚目的 4种苔藓动物 (刺轴拟缘孔苔虫、假缘孔苔虫、拟迷误裂孔苔虫、仿分胞苔虫 )构成一个单系群 ;无囊亚目则是一个复系群 ,其中 2种草苔虫 (匍茎草苔虫、多室草苔虫 )为单系发生 。 展开更多
关键词 分子系统发生 28S RRNA基因 唇口目 苔藓动物 PCR扩增 序列测定 腕足动物
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香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析 被引量:4
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作者 李佳 彭德良 黄文坤 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期585-589,共5页
采用线虫通用引物D2A和D3B对9个香蕉穿孔线虫种群的核糖体DNA28S大亚基的D2/D3区进行了扩增,获得的片段长度约为780bp,克隆测序后使用UPGMA法进行聚类分析和构建系统发育树。结果表明9个线虫种群D2/D3区核苷酸序列相似性为99.13%,其中8... 采用线虫通用引物D2A和D3B对9个香蕉穿孔线虫种群的核糖体DNA28S大亚基的D2/D3区进行了扩增,获得的片段长度约为780bp,克隆测序后使用UPGMA法进行聚类分析和构建系统发育树。结果表明9个线虫种群D2/D3区核苷酸序列相似性为99.13%,其中8个群体的序列与越南报道的香蕉穿孔线虫近源种(Radopholus sp.7B VietNam)的D2/D3区核苷酸序列(DQ328712)相似性为97.46%,说明香蕉穿孔线虫D2/D3区具有较大的保守性。聚类分析结果表明,RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p等8个种群聚为一类,亲缘关系很近,RSHN3群体与以上8个群体亲缘关系较远,说明RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p这8个香蕉穿孔线虫种群可能来源于同一地理种群,而RSHN3种群可能来源于另一个地理种群。 展开更多
关键词 香蕉穿孔线虫 28S RRNA基因 D2/D3扩展区域
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菲律宾蛤仔重复序列28S rRNA及组蛋白H3基因的染色体定位 被引量:2
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作者 卢素敏 包振民 +5 位作者 张玲玲 孟庆磊 胡景杰 胡晓丽 刘慧 方建光 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期974-978,共5页
克隆了菲律宾蛤仔的28S rRNA基因(rDNA)及组蛋白H3基因,并应用FISH技术研究了它们在菲律宾蛤仔染色体上的定位情况.28S rDNA定位于一对中部着丝粒染色体的端部,在蛤仔的染色体上有一个位点;组蛋白基因定位于一对亚中部着丝粒染色体长... 克隆了菲律宾蛤仔的28S rRNA基因(rDNA)及组蛋白H3基因,并应用FISH技术研究了它们在菲律宾蛤仔染色体上的定位情况.28S rDNA定位于一对中部着丝粒染色体的端部,在蛤仔的染色体上有一个位点;组蛋白基因定位于一对亚中部着丝粒染色体长臂的端部,在蛤仔的染色体上也有一个位点.28S rDNA基因和组蛋白基因的特异性定位准确地区分了菲律宾蛤仔的两对染色体,这两对染色体可以作为菲律宾蛤仔的染色体标记,为蛤仔统一核型的建立打下良好的基础, 也有利于对贝类细胞遗传学进行研究,同时还可辅助育苗产业的发展. 展开更多
关键词 荧光原位杂交(FISH) 28S RDNA 组蛋白H3基因 菲律宾蛤仔
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薄片牡蛎的核型及18S-28S核糖体rRNA基因的染色体定位 被引量:3
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作者 赵文溪 张楠 +3 位作者 王嫣 石耀华 顾志峰 王爱民 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期20-25,共6页
以薄片牡蛎(Dendostrea folium)成体鳃组织为材料制备有丝分裂中期染色体标本,对其染色体核型进行了分析,并运用荧光原位杂交技术(FISH)将18S-28S核糖体RNA基因定位于中期染色体上。FISH探针是通过PCR扩增介于18S-28S rRNA基因之间的ITS... 以薄片牡蛎(Dendostrea folium)成体鳃组织为材料制备有丝分裂中期染色体标本,对其染色体核型进行了分析,并运用荧光原位杂交技术(FISH)将18S-28S核糖体RNA基因定位于中期染色体上。FISH探针是通过PCR扩增介于18S-28S rRNA基因之间的ITS和5.8S rRNA基因序列,并在PCR扩增过程中掺入了Biotin-11-dUTP进行生物素标记。结果显示,薄片牡蛎的单倍染色体数目为n=10,全部为中部着丝粒染色体。与大多数已知巨蛎属牡蛎的染色体核型相似。ITS探针在薄片牡蛎中期分裂体相上产生两簇FISH信号,分别杂交于2号染色体短臂的近端粒区域。本研究首次报道了薄片牡蛎的中期染色体核型以及18S-28S核糖体RNA基因在染色体上的定位。 展开更多
关键词 薄片牡蛎 染色体 核型 荧光原位杂交 18S-28S RRNA基因
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