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CXCR4 MFAP2 KLF4在分化型甲状腺癌中的表达及对预后的预测价值研究
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作者 顾占国 李军 +1 位作者 梁金屏 石福民 《河北医学》 CAS 2024年第3期423-428,共6页
目的:研究趋化因子4受体(CXCR4)、微纤维相关蛋白2(MFAP2)、Krüppel样因子4(KLF4)在分化型甲状腺癌(DTC)中的表达及对预后的预测价值。方法:选择我院2019年7月至2020年7月收治的113例DTC患者,术中留取其肿瘤组织及癌旁正常组织。... 目的:研究趋化因子4受体(CXCR4)、微纤维相关蛋白2(MFAP2)、Krüppel样因子4(KLF4)在分化型甲状腺癌(DTC)中的表达及对预后的预测价值。方法:选择我院2019年7月至2020年7月收治的113例DTC患者,术中留取其肿瘤组织及癌旁正常组织。采用蛋白免疫印迹法检测DTC组织及癌旁正常组织中CXCR4、MFAP2、KLF4表达水平,分析CXCR4、MFAP2、KLF4表达水平与DTC临床病理特征的关系。对DTC患者进行3年随访,统计3年总生存情况,比较死亡组与存活组CXCR4、MFAP2、KLF4表达水平,采用ROC曲线分析CXCR4、MFAP2、KLF4对DTC预后的预测价值,采用Cox回归模型进行DTC预后单因素和多因素分析。结果:与癌旁正常组织比较,DTC组织CXCR4、MFAP2蛋白表达量显著升高(P<0.05),KLF4蛋白表达量显著降低(P<0.05)。TNM分期Ⅲ期、发生淋巴结转移、肿瘤低分化者CXCR4、MFAP2蛋白表达量显著高于TNM分期Ⅰ+Ⅱ期、未发生淋巴结转移、肿瘤中高分化者(P<0.05),TNM分期Ⅲ期、发生淋巴结转移、肿瘤低分化者KLF4蛋白表达量显著低于TNM分期Ⅰ+Ⅱ期、未发生淋巴结转移、肿瘤中高分化者(P<0.05)。113例DTC患者随访3年期间失访8例,最终获得随访者105例。死亡组患者CXCR4、MFAP2蛋白表达量显著高于存活组(P<0.05),KLF4蛋白表达量显著低于存活组(P<0.05)。绘制ROC曲线发现,CXCR4、MFAP2、KLF4单独或联合预测DTC预后的AUC(95%CI)分别为0.692(0.562~0.823)、0.729(0.590~0.869)、0.766(0.622~0.910)、0.832(0.690~0.975),联合预测的效能显著优于单项检测(P<0.05)。Cox回归分析显示,淋巴结转移、TNM分期Ⅲ期、肿瘤低分化、CXCR4表达升高、MFAP2表达升高、KLF4表达降低是DTC预后的危险因素(P<0.05)。结论:分化型甲状腺癌患者肿瘤组织中CXCR4、MFAP2呈高表达,KLF4呈低表达,其表达水平与淋巴结转移、肿瘤分化程度、TNM分期及3年总生存率相关,三者联合检测有助于预测分化型甲状腺癌预后。 展开更多
关键词 趋化因子4受体 微纤维相关蛋白2 Krüppel样因子4 分化型甲状腺癌 表达水平 预后 预测价值
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理脾降浊方治疗2型糖尿病的网络药理学和蛋白质组学研究
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作者 潘琳琳 相宏杰 +1 位作者 逯艳婷 刘桂荣 《世界中医药》 CAS 北大核心 2024年第12期1708-1719,共12页
目的:研究理脾降浊方(LPJZF)治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在分子机制。方法:首先,基于网络药理学筛选出LPJZF中的活性成分和作用靶点,通过基因表达综合数据库筛选出与T2DM相关的差异表达基因,并运用蛋白质-蛋白质相互作用、基因本体(GO)和... 目的:研究理脾降浊方(LPJZF)治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在分子机制。方法:首先,基于网络药理学筛选出LPJZF中的活性成分和作用靶点,通过基因表达综合数据库筛选出与T2DM相关的差异表达基因,并运用蛋白质-蛋白质相互作用、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析LPJZF在治疗T2DM中的作用靶点和通路。其次,用LPJZF对T2DM大鼠进行干预,采用蛋白质组学鉴定差异蛋白,然后用KEGG和GO分析探究LPJZF干预T2DM的潜在机制。最后,运用分子对接技术评估T2DM潜在靶点与LPJZF活性成分之间的结合亲和力。结果:网络药理学分析共筛选出LPJZF干预T2DM的63个有效成分和135个靶点;蛋白质组学共鉴定出LPJZF干预T2DM的964个差异表达蛋白,以及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、核因子κB和叉头框蛋白O(FoxO)等4条关键通路;分子对接结果显示,T2DM相关蛋白细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤蛋白P53(TP53)、热休克蛋白90 kDa αA类成员1(HSP90AA1)和小鼠双微体2(MDM2)与LPJZF中的黄芩素、芒柄花黄素、山柰酚、汉黄芩素、β-谷甾醇和豆甾醇具有良好的亲和力。结论:LPTZF能有效改善胰岛素抵抗,促进胰腺B细胞再生,是治疗T2DM的有效方剂。 展开更多
关键词 理脾降浊方 2型糖尿病 网络药理学 蛋白质组学 分子对接 活性成分 差异蛋白 胰岛素抵抗
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Bcl-2高表达转基因小鼠脊髓损伤后差异表达蛋白的蛋白质组学分析 被引量:1
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作者 王瑛 孙志扬 +3 位作者 降建新 张夔鸣 许国强 李光 《中国急救医学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期618-624,共7页
目的通过建立B细胞淋巴瘤/白血病-2(B—celllymphoma/leukemia-2,Bcl-2)高表达转基因小鼠与野生型小鼠急性脊髓损伤组织的双向电泳图谱,比较蛋白质组的变化和差异表达,初步探讨Bcl-2保护脊髓损伤的分子机制。方法转基因(A组)... 目的通过建立B细胞淋巴瘤/白血病-2(B—celllymphoma/leukemia-2,Bcl-2)高表达转基因小鼠与野生型小鼠急性脊髓损伤组织的双向电泳图谱,比较蛋白质组的变化和差异表达,初步探讨Bcl-2保护脊髓损伤的分子机制。方法转基因(A组)及同窝非转基因小鼠(B组)各15只,随机分为三组(1d、7d、14d),采用垂直打击(weightdropping,WD)方法,以2.5×3.0g·cm致伤力致伤小鼠脊髓。于术后1d、7d、14d处死,取脊髓标本进行检测:①采用双向凝胶电泳分离脊髓总蛋白,建立双向凝胶电泳图谱;②用ImageMaster软件分析图像,基质辅助激光解析电离飞行时间,质谱(MALDl2TOF2MS)分析获取肽质量指纹图谱(PMF);③用Mascot软件系统和NCBIMS数据库检索确定蛋白质。结果鉴定出差异蛋白质33个,其中1d8个,7d12个,14d13个。与B组小鼠比较,A组小鼠表达上调的蛋白质有热休克蛋白、含缬酪肽蛋白、peroxiredoxin6等,下调的蛋白质为钙蛋白酶、泛素羧基末端水解酶-1等。多数差异蛋白质涉及到应激保护、抗氧自由基损伤、促进神经修复等过程,具有神经保护功能。结论除了抗凋亡作用,Bcl-2蛋白可能还具有抗氧自由基损伤、促进神经修复、加强应激等多方面的神经保护功能。 展开更多
关键词 脊髓损伤 转基因小鼠 B细胞淋巴瘤/白血病-2差异表达蛋白质 蛋白质组学 质谱
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基于转录组测序分析Ppp2ca条件性敲除小鼠的睾丸差异表达基因及相关通路
4
作者 刘兴 陈冰雁 +3 位作者 王丹妮 刘慧君 陈霞 史轶超 《发育医学电子杂志》 2023年第2期81-91,共11页
目的探讨蛋白磷酸酶2催化亚基α(protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha,Ppp2ca)条件性敲除对小鼠睾丸生殖细胞差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)及相关通路的影响。方法基于Cre-loxP原理构建生殖细胞中特异性... 目的探讨蛋白磷酸酶2催化亚基α(protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha,Ppp2ca)条件性敲除对小鼠睾丸生殖细胞差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)及相关通路的影响。方法基于Cre-loxP原理构建生殖细胞中特异性敲除Ppp2ca基因的敲除小鼠(Ppp2ca^(cKO)),通过灭活蛋白磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)催化亚基PP2Ac的功能,以研究PP2A全酶在雄性生殖系统中的作用。敲除雄鼠至8周龄时,记录体质量及睾丸质量,取小鼠睾丸和附睾行组织学检测,同时检测小鼠血清中睾酮水平。收集睾丸组织进行转录组测序、基因本体学(gene ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)生物信息学分析。结果Ppp2ca^(cKO)敲除鼠与Ppp2cactrl对照组小鼠的睾丸质量分别为(0.044±0.003)与(0.119±0.008)g(t=24.550,P<0.001),血清睾酮水平分别为(0.327±0.096)与(0.567±0.050)µg/L(t=3.899,P=0.018),Ppp2ca^(cKO)敲除鼠均低于Ppp2cactrl对照组。苏木精-伊红染色结果显示,在Ppp2ca^(cKO)敲除鼠的睾丸和附睾中均未观察到精子,生精小管中生精细胞数量及层次明显减少且伴有大量的空泡结构。转录组测序结果筛选出DEG共11304个(上调7568个,下调3736个);微小RNA(microRNA,miRNA)36个(上调8个,下调28个);长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)3732个(上调1107个,下调2625个)。Ppp2ca^(cKO)敲除鼠的DEG在多项GO富集类别中具有显著差异,如精子发生、精子细胞发育、精子运动、顶体囊泡、中心体、微管和线粒体外膜。此外,KEGG功能富集结果显示,DEG多与生化代谢途径和信号转导途径相关,主要影响了胞吞作用、肌动蛋白细胞骨架的调节、cAMP信号通路、Wnt信号通路、脂代谢、细胞色素P450、鞘磷脂信号通路等。这些DEG与精子发生密切相关。结论Ppp2ca敲除可引起PP2A功能异常,影响精子发生过程及睾丸发育相关信号通路的活性,导致小鼠精子发生受损,减数分裂阻滞,睾酮水平降低。 展开更多
关键词 精子发生 蛋白磷酸酶2A 蛋白磷酸酶2催化亚基α 转录组测序 基因敲除 差异表达基因
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Influence of Moxibustion Serum on the Expression of Fas bcl-2 mRNA and Protein of EL-4 Lymphoma Cells
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作者 马晓芃 赵粹英 +4 位作者 陈云飞 吴焕淦 施征 洪娴 杨玲 《Journal of Acupuncture and Tuina Science》 2008年第6期331-333,共3页
Objective: To observe the influence of moxibustion serum of mice on the expression of Fas, bcl-2 mRNA and protein of EL-4 lymphoma cells in vitro. Method: The EL-4 lymphoma cells were cultivated for 24 h in the moxi... Objective: To observe the influence of moxibustion serum of mice on the expression of Fas, bcl-2 mRNA and protein of EL-4 lymphoma cells in vitro. Method: The EL-4 lymphoma cells were cultivated for 24 h in the moxibustion serum of mice. The expression of Fas and bcl-2 mRNA of EL-4 lymphoma cells were detected by in-situ hybridization method, and the protein expression of Fas and bcl-2 were observed by the immuocytochemistry method. Results: The expression of bcl-2 mRNA and protein decreased , and the expression of Fas mRNA and protein increased significantly in EL-4 cells, which were cultivated in the moxibustion serum compared those cultivated in normal mice serum (P〈0.05). Conclusion: Moxibustion serum could down-regulate the bcl-2 mRNA and protein and up-regulate the Fas mRNA and protein of EL-4 cells. 展开更多
关键词 Moxibustion Therapy SERUM NEOPLASMS Fas Antigen bcl-2 protein Mouse Gene expression Mice
原文传递
人支气管上皮组织癌变各阶段2-DE图谱及差异分析 被引量:4
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作者 吴晓英 李萃 +5 位作者 肖志强 李建玲 冯雪萍 易红 李茂玉 陈主初 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第5期522-530,共9页
背景与目的:支气管上皮细胞的癌变是一个多基因参与、多阶段的复杂过程,但癌变机理仍不清楚,应用蛋白质组学技术研究此过程有可能识别癌变相关蛋白质,对揭示肺鳞癌癌变机制具有重要的意义。本研究的目的是优化支气管上皮组织的蛋白质样... 背景与目的:支气管上皮细胞的癌变是一个多基因参与、多阶段的复杂过程,但癌变机理仍不清楚,应用蛋白质组学技术研究此过程有可能识别癌变相关蛋白质,对揭示肺鳞癌癌变机制具有重要的意义。本研究的目的是优化支气管上皮组织的蛋白质样品制备方法,建立人支气管上皮癌变各阶段组织的2-DE图谱并进行差异分析,为鉴定肺鳞癌癌变相关蛋白质奠定基础。方法:收集、筛选人支气管正常上皮、鳞状上皮化生、不典型增生和上皮浸润癌组织标本。改良的脱氧胆酸-三氯醋酸(deoxycholate-trichloroaeticacid,DOC-TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质,应用固相pH梯度双向凝胶电泳分离各阶段组织的总蛋白质,凝胶经银染显色后,用ImageMaster2D软件分析图谱,比较差异表达蛋白质。应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorption/ionizationtime-of-flightmassspectrometry,MALDI-TOF-MS)得到相应的肽质指纹图谱(peptidemassfingerprint,PMF),然后搜索数据库鉴定部分差异蛋白质。结果:应用改良的DOC-TCA法提纯总蛋白质进行双向电泳,获得了分辨率高、重复性好的人支气管上皮组织的双向电泳图谱,支气管正常上皮、鳞状上皮化生、不典型增生和上皮浸润癌组织凝胶的平均蛋白质点数依次为1189.50±39.89、1227. 展开更多
关键词 支气管上皮组织 癌变现象 2-DE图谱 差异分析
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茶树小分子量热激蛋白基因CsHSP17.2的克隆与表达分析 被引量:11
7
作者 王明乐 朱旭君 +3 位作者 王伟东 王炫清 林明露 黎星辉 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期389-394,共6页
[目的]进一步了解茶树小分子量热激蛋白基因Cs HSP17.2在逆境胁迫条件下的分子生物学功能。[方法]利用RT-PCR技术从茶树‘迎霜’中克隆得到Cs HSP17.2基因,运用生物信息学软件分析其核苷酸和编码蛋白,通过Real-time PCR分析其表达模式。... [目的]进一步了解茶树小分子量热激蛋白基因Cs HSP17.2在逆境胁迫条件下的分子生物学功能。[方法]利用RT-PCR技术从茶树‘迎霜’中克隆得到Cs HSP17.2基因,运用生物信息学软件分析其核苷酸和编码蛋白,通过Real-time PCR分析其表达模式。[结果]该基因开放阅读框长度为453 bp,编码150个氨基酸,蛋白质相对分子质量为17.2×103,理论等电点5.56;无信号肽位点,属于非分泌型蛋白;被定位于细胞质中。系统发育树分析表明,茶树Cs HSP17.2与水稻(Gen Bank登录号:P27777)和花生(ABC41131)的进化关系较近,属于小分子量热激蛋白基因家族第Ⅰ亚族。qRT-PCR分析发现,茶树Cs HSP17.2属于组成型基因;高温(38℃)处理1 h能显著提高Cs HSP17.2 mRNA的相对表达量(P<0.05);干旱(100 g·L-1PEG 6000)、高盐(200 mmol·L-1Na Cl)和外源脱落酸(200 mg·L-1ABA)处理条件下,该基因的转录水平均出现不同程度的上调。[结论]克隆得到茶树‘迎霜’小分子量热激蛋白基因Cs HSP17.2,其在花中表达量最高,且响应高温、干旱、高盐和外源脱落酸胁迫。 展开更多
关键词 小分子量热激蛋白 CsHSP17.2 克隆 差异表达 实时荧光定量PCR
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不同临床预后患者胃癌组织中DAB2IP表达的差异 被引量:5
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作者 王瀚 牛跃平 +2 位作者 董峰 高健 徐怀文 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第19期2164-2167,共4页
目的探讨胃癌中人DOC-2/DAB-2交互蛋白(DOC-2/DAB-2 interaction protein,DAB2IP)的表达与临床预后生存时间的关系。方法收集82例正常胃黏膜及胃癌组织,采用免疫组化方法进行蛋白检测,对随访资料进行Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析... 目的探讨胃癌中人DOC-2/DAB-2交互蛋白(DOC-2/DAB-2 interaction protein,DAB2IP)的表达与临床预后生存时间的关系。方法收集82例正常胃黏膜及胃癌组织,采用免疫组化方法进行蛋白检测,对随访资料进行Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析。结果 DAB2IP在正常胃黏膜组织中多以强阳性表达;在胃癌组织中阳性表达较少,多以弱阳性或阴性为主;DAB2IP在胃癌组织中的阳性评分低于正常黏膜,差异有统计学意义(P<0.05)。DAB2IP阳性表达的胃癌患者中位生存时间为40.8个月,明显长于阴性表达患者的中位生存时间(33.7个月),差异有统计学意义(P<0.05)。COX多因素回归分析显示,较低的DAB2IP表达水平和较高的TNM分期是胃癌预后生存时间的独立危险因素(P<0.05)。结论 DAB2IP下调可能在胃癌的发生、发展中起一定的作用,对预测胃癌患者的预后生存时间具有一定的意义。 展开更多
关键词 胃癌 卵巢癌差异表达基因2交互蛋白 DAB2IP 预后
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疏肝和胃降逆汤对胃食管反流病肝胃不和证患者食管黏膜蛋白酶激活受体-2及环氧合酶-2蛋白表达的影响 被引量:20
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作者 马乾章 刘鹏 白光 《世界中医药》 CAS 2018年第10期2496-2499,共4页
目的:探讨疏肝和胃降逆汤对胃食管反流病(GERD)肝胃不和证患者食管黏膜蛋白酶激活受体-2(PAR-2)及环氧合酶-2(COX-2)蛋白表达的影响。方法:选取2015年1月至2016年1月辽宁中医药大学附属医院收治GERD患者178例作为研究对象,以随机数表法... 目的:探讨疏肝和胃降逆汤对胃食管反流病(GERD)肝胃不和证患者食管黏膜蛋白酶激活受体-2(PAR-2)及环氧合酶-2(COX-2)蛋白表达的影响。方法:选取2015年1月至2016年1月辽宁中医药大学附属医院收治GERD患者178例作为研究对象,以随机数表法分为观察组和对照组,每组89例。2组均给予奥美拉唑肠溶片治疗,观察组在此基础上给予疏肝健脾和胃方治疗。观察2组基线期和治疗后12周(治疗后)反流性疾病问卷(RDQ)症状积分及食管黏膜PAR-2及COX-2蛋白表达变化。结果:基线期,2组RDQ症状积分、食管黏膜PAR-2及COX-2蛋白表达基本相同,差异无统计学意义(P> 0. 05);治疗后,观察组RDQ症状积分、食管黏膜PAR-2及COX-2蛋白表达显著低于对照组,差异有统计学意义(P <0. 05)。观察组RDQ症状积分与食管黏膜PAR-2及COX-2蛋白表达正相关(P <0. 05),对照组RDQ症状积分与食管黏膜PAR-2及COX-2蛋白表达无明显相关性(P> 0. 05)。结论:奥美拉唑肠溶片联合温阳活血汤治疗胃食管反流病肝胃不和证具有较好的疗效,其机制可能是通过降低患者食管黏膜PAR-2及COX-2蛋白表达而起治疗作用。 展开更多
关键词 疏肝和胃降逆汤 胃食管反流病 中医辨证 蛋白酶激活受体-2 环氧合酶-2 肝胃不和证 蛋白表达 信号通路
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宁夏回、汉族2型糖尿病患者血浆差异蛋白质初步筛选及脂多糖结合蛋白、载脂蛋白C3的验证 被引量:3
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作者 楚元奎 杨洋 +2 位作者 王俊 刘瑞 廖国玲 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2016年第5期358-361,共4页
目的初步筛选宁夏回、汉族2型糖尿病(T2DM)患者血浆差异蛋白质,并对脂多糖结合蛋白(LBP)和载脂蛋白C3(apo C3)进行验证。方法按照纳入与排除标准,选择2015年8月至10月在宁夏医科大学附属总医院与吴忠市人民医院确诊的T2DM患者142例为研... 目的初步筛选宁夏回、汉族2型糖尿病(T2DM)患者血浆差异蛋白质,并对脂多糖结合蛋白(LBP)和载脂蛋白C3(apo C3)进行验证。方法按照纳入与排除标准,选择2015年8月至10月在宁夏医科大学附属总医院与吴忠市人民医院确诊的T2DM患者142例为研究对象,包括回族72例,汉族70例,以及6例健康人。采用色谱-质谱联用技术和Proteome Discoverer软件与检索数据库NCBI Human-Ref Seq(人参考序列库)进行差异蛋白质筛选和信息分析。用双抗体夹心ELISA法测定血浆中LBP和apo C3表达水平。结果与健康人对照组比较,汉族与回族均上调的蛋白质有8个,仅汉族上调的蛋白质7个,仅回族上调的蛋白质9个;汉族与回族均下调的蛋白质15个,仅汉族下调的蛋白质14个,仅回族下调的蛋白质6个。汉族组血浆LBP为(26.858±0.911)ng/m L,回族组血浆LBP为(24.538±1.030)ng/m L,2组间比较,差异有统计学意义(t=12.398,P<0.01);汉族组血浆apo C3为(124.920±2.057)ng/m L,回族组血浆apo C3为(147.218±1.572)ng/m L,2组间比较,差异有统计学意义(t=-63.291,P<0.01);回、汉族男、女患者血浆LBP与apo C3差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论宁夏回、汉族T2DM患者血浆中蛋白质存在差异表达,T2DM汉族组血浆LBP较回族组明显升高,T2DM回族组apo C3较汉族组明显升高,且血浆LBP与apo C3的表达与性别无关。 展开更多
关键词 宁夏 回族 汉族 2型糖尿病 差异蛋白质 脂多糖结合蛋白 载脂蛋白C3
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合并与不合并2型糖尿病的下肢动脉硬化闭塞症患者血清差异性蛋白组学分析 被引量:3
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作者 杨晓虎 林裕辉 +1 位作者 徐欣 范隆华 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第30期18-21,共4页
目的通过蛋白组学研究,鉴定合并2型糖尿病的下肢动脉硬化闭塞症(DLASO)患者与不合并2型糖尿病下肢动脉硬化闭塞症(LASO)患者血清的差异性蛋白,为防治2型糖尿病患者发生LASO提供依据。方法收集DLASO、LASO各15例患者的血清,对蛋白进行提... 目的通过蛋白组学研究,鉴定合并2型糖尿病的下肢动脉硬化闭塞症(DLASO)患者与不合并2型糖尿病下肢动脉硬化闭塞症(LASO)患者血清的差异性蛋白,为防治2型糖尿病患者发生LASO提供依据。方法收集DLASO、LASO各15例患者的血清,对蛋白进行提取、定量和酶解,应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)结合二维液相色谱串联质谱(2DLC-MS/MS)技术,鉴定DLASO、LASO患者血清中的蛋白,筛选出DLASO患者与LASO患者的差异表达蛋白。利用PANTHER数据库对鉴定得到的差异性蛋白进行生物学过程、分子作用和细胞组分分析。结果共鉴定出蛋白质338种,筛选出差异性蛋白27种,其中DLASO患者出现表达上调蛋白8种、表达下调蛋白19种。在生物学过程方面,差异性蛋白主要为参与细胞反应(48.1%)、代谢过程(48.1%)和生物黏附(29.6%)的蛋白;在分子作用方面,差异性蛋白主要为参与细胞结合作用(33.3%)、催化活性作用(29.6%)和结构分子活性作用(18.5%)的蛋白;在细胞组分方面,差异性蛋白主要为位于细胞区域(14.8%)、细胞器(14.8%)和细胞外区域(14.8%)的蛋白。结论发现DLASO与LASO患者血清中的差异性蛋白27种,这些差异性蛋白可作为防治DLASO的潜在生物学靶点。 展开更多
关键词 2型糖尿病 下肢动脉硬化闭塞症 蛋白组学 同位素标记 二维液相色谱串联质谱 差异性蛋白
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人类髓样分化蛋白-2的原核表达 被引量:1
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作者 徐发良 顾长国 +1 位作者 胡承香 李磊 《第四军医大学学报》 北大核心 2004年第14期1256-1259,共4页
目的 :在大肠杆菌DH 5α中表达人类髓样分化蛋白 2 (humanmyeloiddifferentiatonprotein 2 ,hMD 2 )与谷胱甘肽巯基转移酶 (glutathione s transferase ,GST)的融合蛋白 (GST/hMD 2 ) ,并对融合蛋白进行免疫学鉴定及初步的变性复性处理 ... 目的 :在大肠杆菌DH 5α中表达人类髓样分化蛋白 2 (humanmyeloiddifferentiatonprotein 2 ,hMD 2 )与谷胱甘肽巯基转移酶 (glutathione s transferase ,GST)的融合蛋白 (GST/hMD 2 ) ,并对融合蛋白进行免疫学鉴定及初步的变性复性处理 .方法 :建立GST/hMD 2表达菌 ,在不同温度下以不同浓度IPTG诱导不同时间后采样 ,用SDS PAGE分析各种组合条件下融合蛋白的表达量和溶解性 ;用Western Blot鉴定融合蛋白免疫性 ;用尿素变性和透析法对融合蛋白进行初步纯化 .结果 :在 37℃经 0 .4mmol/LIPTG诱导 4h后 ,GST/hMD 2可获最高表达量 (约占菌体总蛋白的 2 0 % ) ,未见可溶性表达 ;Western Blot证实GST/hMD 2能与抗MD 2单克隆抗体特异性结合 ;GST/hMD 2溶于 8mol/L尿素 ,梯度透析后纯度提高至4 0 % .结论 :hMD 2可在大肠杆菌DH 展开更多
关键词 髓样分化蛋白-2 基因表达 重组融合蛋白质类 谷胱甘肽转移酶
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姬松茸多糖对2型糖尿病大鼠脂肪分化相关蛋白表达的影响 被引量:1
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作者 杨旭东 张杰 袁晓环 《医学综述》 2010年第16期2557-2558,共2页
目的探讨姬松茸多糖对2型糖尿病大鼠脂肪分化相关蛋白(ADRP)基因表达的影响。方法将Wistar大鼠随机分为正常对照组、模型组、姬松茸多糖组。8周后,聚合酶链反应检测ADRP基因表达水平。结果姬松茸多糖组ADRP基因的表达低于模型组(P<0.... 目的探讨姬松茸多糖对2型糖尿病大鼠脂肪分化相关蛋白(ADRP)基因表达的影响。方法将Wistar大鼠随机分为正常对照组、模型组、姬松茸多糖组。8周后,聚合酶链反应检测ADRP基因表达水平。结果姬松茸多糖组ADRP基因的表达低于模型组(P<0.05)。结论姬松茸多糖可降低2型糖尿病大鼠脂肪分化相关蛋白基因的表达。 展开更多
关键词 姬松茸多糖 2型糖尿病 基因表达 脂肪分化相关蛋白
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UCP2基因在小尾寒羊内脏中的差异性表达研究 被引量:1
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作者 赵武恒 乔利英 刘文忠 《畜牧与饲料科学》 2014年第7期50-52,57,共4页
解偶联蛋白2(UCP2)是一种具有解偶联功能的蛋白质,普遍认为其与脂肪酸代谢、调节ATP生成有关。利用实时荧光定量PCR技术,对不同月龄(6、8、10月龄)小尾寒羊4种内脏(心脏、脾脏、肾脏、瘤胃)组织中UCP2基因的表达量进行了分析。... 解偶联蛋白2(UCP2)是一种具有解偶联功能的蛋白质,普遍认为其与脂肪酸代谢、调节ATP生成有关。利用实时荧光定量PCR技术,对不同月龄(6、8、10月龄)小尾寒羊4种内脏(心脏、脾脏、肾脏、瘤胃)组织中UCP2基因的表达量进行了分析。结果表明,UCP2基因在6~10月龄小尾寒羊相同内脏中的表达量差异不显著(P>0.05),但在脾脏中的表达量显著(P〈0.05)高于心脏、肾脏和瘤胃,而后三者之间表达量差异不显著(P>0.05)。试验证明了UCP2基因在小尾寒羊内脏组织中有广泛表达,为UCP2基因可能与免疫相关的观点提供了证据,并且说明在6~10月龄的月龄段内,UCP2基因在小尾寒羊内脏组织中的表达受月龄的影响较小。 展开更多
关键词 小尾寒羊 解偶联蛋白2 差异性表达 荧光定量PCR 内脏组织
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冠心病慢性心力衰竭病人住院前后血清NT-proBNP、cTnI、sST2、GDF-15变化及其影响因素 被引量:40
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作者 陈鑫龙 田晶 +6 位作者 张青 杨弘 韩瑞 任嘉 闫晶晶 张岩波 韩清华 《中西医结合心脑血管病杂志》 2021年第10期1622-1626,共5页
目的评估冠心病慢性心力衰竭病人住院前后血清N末端B型脑钠肽前体(NT-proBNP)、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、血清可溶性生长刺激表达基因蛋白2(sST2)、血清分化生长因子-15(GDF-15)的变化情况,并评价其影响因素,为慢性心力衰竭的治疗和干预提... 目的评估冠心病慢性心力衰竭病人住院前后血清N末端B型脑钠肽前体(NT-proBNP)、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、血清可溶性生长刺激表达基因蛋白2(sST2)、血清分化生长因子-15(GDF-15)的变化情况,并评价其影响因素,为慢性心力衰竭的治疗和干预提供一些见解。方法选取山西医科大学第一医院诊断为冠心病慢性心力衰竭病人85例,住院前后分别测定NT-proBNP、cTnI、sST2及GDF-15的含量,评估其住院前后的差异,并分析这些变化的影响因素。结果与入院时相比,出院时NT-proBNP、cTnI、sST2降低(P<0.05),GDF-15降低但差异无统计学意义(P=0.06)。回归分析表明,既往心肌梗死病史和丙氨酸氨基转移酶(ALT)增高者,NT-proBNP降低明显;体质指数(BMI)增加和高龄者,NT-proBNP降低不显著;ALT增高者,cTnI降低显著;应用硝酸酯类药物者,cTnI降低不显著;舒张功能降低、高龄、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)增高者,sST2降低显著(P<0.05);使用β受体阻滞剂和强心剂、心率快、高血压、吸烟的病人,GDF-15降低明显;使用钙拮抗剂的病人,GDF-15降低不明显。结论对慢性心力衰竭进行治疗和干预时,针对不同身体状况的病人,通过生物标志物的反馈,采取相对应的措施,对优化慢性心力衰竭,特别是冠心病慢性心力衰竭病人的治疗和干预有一定帮助。 展开更多
关键词 慢性心力衰竭 冠心病 生物标志物 N末端B型脑钠肽前体 心肌肌钙蛋白I 血清可溶性生长刺激表达基因蛋白2 血清分化生长因子-15 影响因素
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探讨哮喘和SARS-CoV-2的相互作用关系的生物信息学分析
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作者 李婧铱 李宾 +2 位作者 訾晓琳 李晓霞 赵炜明 《标记免疫分析与临床》 CAS 2022年第10期1729-1736,共8页
目的采用生物信息学方法探讨哮喘和SARS-CoV-2感染的相互作用关系及发生的潜在机制,为哮喘和新冠肺炎(COVID-19)进一步治疗提供新线索。方法本文使用的研究数据来源于GEO数据库。利用R语言和Perl语言对数据进行预处理,筛选差异表达基因(... 目的采用生物信息学方法探讨哮喘和SARS-CoV-2感染的相互作用关系及发生的潜在机制,为哮喘和新冠肺炎(COVID-19)进一步治疗提供新线索。方法本文使用的研究数据来源于GEO数据库。利用R语言和Perl语言对数据进行预处理,筛选差异表达基因(DEGs),并获得GO功能富集分析、KEGG、Reactome、WikiPathways和BioCarta通路富集分析。通过Cytoscape软件获得蛋白质相互作用(PPI)网络分析可视化结果。使用RegNetwork数据库筛选与DEGs相互作用的转录因子(TF),再利用NetworkAnalyst构建miRNA-TF-mRNA共调控网络。最后,从DSigDB数据库筛选治疗药物。结果获得哮喘和SARS-CoV-2感染的数据集并且筛选得到25个受两者影响的重叠DEGs。GO功能富集分析和通路富集分析显示,DEGs参与病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体、补体和凝血级联反应通路。miRNA-TF-mRNA共调控网络表明关键基因与相关miRNA和TF之间复杂的调控关系。筛选到作用于DEGs的可能药物分子,包括雷洛昔芬、他莫昔芬和孕酮等。结论在数据分析的基础上,找出哮喘与SARS-CoV-2感染的共同切入点,为分析SARS-CoV-2在肺部疾病中的作用提供了新思路。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 哮喘 差异表达基因 蛋白-蛋白互作 药物分子
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A novel erythroid differentiation related gene EDRF1 upregulating globin gene expression in HEL cells
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作者 王敦成 黎燕 沈倍奋 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2002年第11期1701-1705,154-155,共5页
OBJECTIVE: To further characterize the differentiation inducing properties of EDRF1 and demonstrate its functional pathway involved in regulation of globin gene expression. METHODS: By transfecting EDRF1 sense and ant... OBJECTIVE: To further characterize the differentiation inducing properties of EDRF1 and demonstrate its functional pathway involved in regulation of globin gene expression. METHODS: By transfecting EDRF1 sense and antisense constructs into HEL cells, we identified the expression of globin and erythropoietin receptor genes by Northern blot analysis. RT-PCR and EMSA (electrophoresis mobility shift assay) were performed to monitor the expression and DNA-binding activity of erythroid specific transcription factors GATA-1 and NF-E2. RESULTS: It was shown that when EDRF1 was overexpressed, production of alpha-globin increased. In antisense EDRF1, overexpression of HEL cells, significant loss of alpha-, gamma-globin mRNA synthesis was observed. The transcription of endogenous GATA-1 and NF-E2 mRNA expression were maintained at the same levels compared with control experiments. However, the transcription activity of GATA-1 was severely impaired. Expression of erythropoietin receptor gene was not influenced by EDRF1 gene overexpression. CONCLUSION: The results suggested that EDRF1 regulated alpha- and gamma-globin gene synthesis by modulating DNA-binding activity of GATA-1 transcription factor. 展开更多
关键词 Gene expression Regulation Cell differentiation Cells Cultured DNA-Binding proteins Erythroid-Specific DNA-Binding Factors ERYTHROPOIESIS GATA1 Transcription Factor GLOBINS Humans NF-E2 Transcription Factor NF-E2 Transcription Factor p45 Subunit RNA Messenger Transcription Factors Up-Regulation
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COVID-19与SSc-ILD相关性研究
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作者 周彦 江竞舟 《深圳大学学报(理工版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期171-178,共8页
与系统性硬化症相关间质性肺病(interstitial lung disease associated with systemic sclerosis,SScILD)类似,重症新型冠状肺炎疾病(corona virus disease 2019,COVID-19)患者可能会出现肺部纤维化的临床症状.为研究这2种疾病的病理标... 与系统性硬化症相关间质性肺病(interstitial lung disease associated with systemic sclerosis,SScILD)类似,重症新型冠状肺炎疾病(corona virus disease 2019,COVID-19)患者可能会出现肺部纤维化的临床症状.为研究这2种疾病的病理标志物,利用Beta-Poisson模型鉴定差异表达基因捕捉核糖核酸测序(ribonucleic acid sequencing,RNA-Seq)数据的双峰特征.通过引入Beta-Poisson模型,即用Beta分布替换Gamma-Poisson分布的Gamma分布,构建新的混合分布刻画RNA-Seq数据中双峰特征.分析肺上皮细胞数据集中的新型冠状病毒感染和SSc-ILD疾病的转录组,确定新型冠状病毒和SSc-ILD的共同差异表达基因,使用基因功能与信号通路富集分析和蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络为患有新冠肺炎感染的SSc-ILD疾病找到共同的途径和药物靶点.结果表明,COVID-19和SSc-ILD有50个共同的差异表达基因,这些基因功能主要富集在免疫系统应答和干扰素信号通路等相关信号通路,并且富集在细胞对病毒防御反应和干扰素调节等生物学过程.基于PPI网络检测出hub基因,预测STAT1、ISG15、IRF7、MX1、EIF2AK2、DDX58、OAS1、OAS2、IFIT1和IFIT3是涉及两种疾病的病理表型关键基因.基于关键基因又鉴别了转录因子(transcription factor,TF)、小分子核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)与常见差异表达基因的相互作用.研究结果揭示了COVID-19和SSc-ILD两种疾病的病理标志物,以及相关的疾病治疗分子调控机制,可为治疗两种疾病提供理论研究依据. 展开更多
关键词 生物信息学 多元统计 差异表达基因 新冠病毒 系统性硬化症相关间质性肺病 Beta-Poisson模型 富集分析 蛋白质-蛋白质相互作用
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小麦生理型和遗传型雄性不育系及其保持系小花完整叶绿体蛋白质组分比较研究 被引量:10
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作者 李莉 王书平 +5 位作者 张改生 王亮明 宋瑜龙 张龙雨 牛娜 马守才 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1134-1143,共10页
采用固相pH梯度SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳技术,以小麦遗传型雄性不育系ms(S)-1376、杀雄剂SQ-1诱导的生理型雄性不育系ms(A)-1376,以及对应的保持系(A)-1376(杀雄剂诱导前的正常可育系)所构建的等基因和等生理差异系为试材,比较分析了... 采用固相pH梯度SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳技术,以小麦遗传型雄性不育系ms(S)-1376、杀雄剂SQ-1诱导的生理型雄性不育系ms(A)-1376,以及对应的保持系(A)-1376(杀雄剂诱导前的正常可育系)所构建的等基因和等生理差异系为试材,比较分析了2种分离纯化完整叶绿体的方法。在确立了一套适用的技术方法的基础上,研究了三者在花粉小孢子萌发单核早期小花完整叶绿体蛋白之间的差异。采用30%、45%和60%的不连续蔗糖密度梯度离心的方法能够获得完整且纯度较高的叶绿体,经TCA-丙酮提取蛋白质后,PDQuest软件分析,在分子量14.4~66.2kD,等电点4~7的线性范围内可分辨出2-DE图谱上239个较为清晰的蛋白质点,对其中的6个差异表达蛋白质点进行MALDI-TOF肽质量指纹图谱分析,从生物信息学数据库检索鉴定出6个差异蛋白质点分别是酰基辅酶A脱氢酶结构域蛋白、钙调结合蛋白磷酸酶、多催化功能肽酶、热休克蛋白60、光受体蛋白2及1个未知功能的表达蛋白质。这些蛋白质在供试小麦叶绿体物质能量代谢、叶绿体防卫抵御机制、叶绿体细胞内信号转导及植物极性生长等生理应答反应中起调控作用,它们能在本研究供试两不育系和对应可育系中差异表达,可能与雄性不育相关。 展开更多
关键词 小麦 遗传型和生理型雄性不育 完整叶绿体蛋白质组 差异表达 2D—PAGE MALDI-TOF-MS
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脊髓全横断损伤后差异表达蛋白的蛋白质组学分析 被引量:6
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作者 杨明理 刘新宇 +3 位作者 杨金亮 王黎明 张勇刚 胡火珍 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期212-220,共9页
对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞... 对脊髓全横断损伤前后的大鼠脊髓全蛋白质进行双向凝胶电泳,借助PDQuest软件从中找出差异表达蛋白质点.应用基质辅助激光解吸电离串联质谱,对差异表达的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出18种蛋白质.脊髓损伤3d后表达上调的蛋白质有巨噬细胞游走抑制因子、S期激酶相关蛋白1、热休克蛋白27、多配体蛋白聚糖3、T细胞受体β链可变区、膜联蛋白Ⅲ、腺苷酸激酶1、半乳凝素3、丙酮酸脱氢酶、磷脂酶B、嗜铬粒蛋白A、热休克蛋白70凝结蛋白1;同时表达下调的蛋白质有磷酸丙糖异构酶、神经鞘氨醇磷酸化受体、热休克蛋白10、肽酰-脯氨酰-顺反式异构酶A.多数差异蛋白质涉及到神经细胞的增殖、凋亡、应激反应等过程,为进一步阐明中枢神经系统的损伤和修复机制提供了理论依据. 展开更多
关键词 脊髓损伤 差异表达蛋白质 双向电泳 蛋白质组学 质谱
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