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题名白羊草BiCDPK基因保守区的克隆及序列分析
被引量:1
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作者
王运琦
方志红
任彬琳
李莲芬
董宽虎
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机构
山西省农业科学院畜牧兽医研究所
山西农业大学动物科技学院
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出处
《中国农学通报》
2016年第24期130-135,共6页
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基金
教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目"白羊草抗逆转录因子ERF的克隆与功能鉴定"(20101403110002)
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文摘
为了研究CDPK基因的结构和功能,利用RT-PCR方法从白羊草中克隆得到Bi CDPK基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明:该Bi CDPK基因c DNA长1048 bp,包含387 bp的开放阅读框,编码128个氨基酸。蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主。亚细胞定位于细胞质中,无跨膜结构域,无信号肽。蛋白序列中存在1个丝氨酸磷酸化位点和3个苏氨酸磷酸化位点。进化分析结果表明,克隆的Bi CDPK基因与玉米、小麦和水稻具有较高同源性,相似度分别是97%、86%、86%。为进一步研究Bi CDPK基因的功能奠定了基础。
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关键词
白羊草
bicdpk
基因克隆
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Keywords
Bothriochloa ischaemum
bicdpk
gene clone
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分类号
Q7
[生物学—分子生物学]
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