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Bmo-miR-2771对家蚕丝胶蛋白基因BmSer-1表达的调控作用 被引量:1
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作者 钱平 蒋涛 +5 位作者 王欣 宋菲 陈晨 范洋洋 唐顺明 沈兴家 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期826-831,共6页
微小RNA(miRNA)可通过抑制mRNA转录或使RNA降解的方式在转录后水平调节靶基因的表达。研究与家蚕丝胶蛋白基因1(BmS er-1)转录后表达有关的miRNA(Bmo-miR)及其作用方式,以丰富丝胶蛋白基因表达的精细调控信息。首先从miRBase 21数据库... 微小RNA(miRNA)可通过抑制mRNA转录或使RNA降解的方式在转录后水平调节靶基因的表达。研究与家蚕丝胶蛋白基因1(BmS er-1)转录后表达有关的miRNA(Bmo-miR)及其作用方式,以丰富丝胶蛋白基因表达的精细调控信息。首先从miRBase 21数据库中获得全部成熟体Bmo-miR,通过生物信息学分析筛选到一个对BmS er-1有潜在调控作用的BmomiR,命名为Bmo-miR-2771。设计茎环引物,采用半定量RT-PCR方法检测Bmo-miR-2771及其预测靶基因BmS er-1在家蚕5龄3 d幼虫头部、脂肪体、前部丝腺、中部丝腺、后部丝腺、中肠等组织器官以及血淋巴细胞中的表达水平,结果显示Bmo-miR-2771特异性地在中部丝腺中表达,并且靶基因BmS er-1在中部丝腺的相对表达量也明显高于其他组织。将构建的表达BmomiR-2771的重组质粒pcD NA3.0(ie1-egfp-pri-miR-2771-SV40)和表达BmS er-1 3'-UTR的重组质粒pG L3(A3-luc-Ser-1 3'UTRSV40)共转染家蚕卵巢培养细胞BmN,并以共转染pcD NA3.0(ie1-egfp-SV40)和pG L3(A3-luc-Ser-1 3'UTR-SV40)的BmN细胞为阳性对照,以海肾荧光素酶表达载体pRL-CMV为内参,检测荧光素酶活性,结果显示实验组的荧光素酶活性相对于阳性对照组显著降低(P<0.05),从细胞水平证实了Bmo-miR-2771对BmS er-1基因表达具有负调控作用。 展开更多
关键词 家蚕 丝胶蛋白基因Ser-1 微小RNA bmo-mir-2771 转录后调控 半定量RT-PCR 双荧光素酶报告基因系统
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Bmo-miR-2755*对丝素蛋白基因BmFib-L和BmP25表达的调控作用 被引量:3
2
作者 范洋洋 陈晨 +4 位作者 王欣 宋菲 唐顺明 易咏竹 沈兴家 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期847-853,共7页
为了研究家蚕miRNA对丝素蛋白基因表达的调控作用,采用生物信息学方法筛选获得对家蚕丝素轻链基因(BmFib-L)和P25蛋白基因(BmP25)有潜在调控作用的Bmo-miR-2755*。利用半定量RT-PCR技术分析Bmo-miR-2755*及其靶基因BmFib-L、BmP2... 为了研究家蚕miRNA对丝素蛋白基因表达的调控作用,采用生物信息学方法筛选获得对家蚕丝素轻链基因(BmFib-L)和P25蛋白基因(BmP25)有潜在调控作用的Bmo-miR-2755*。利用半定量RT-PCR技术分析Bmo-miR-2755*及其靶基因BmFib-L、BmP25在家蚕4~5龄期幼虫后部丝腺和5龄3 d幼虫不同组织器官中的表达水平,结果显示三者在后部丝腺组织中的表达水平都较高,呈现严格的时空特异性。以pcDNA3质粒为载体,构建Bmo-miR-2755*的重组表达载体pcDNA3[ie1-egfpprimiR-2755*-SV40];以pGL3.0-Basic质粒为载体,分别构建BmFib-L 3'UTR、BmP25 3'UTR与荧光素酶报告基因luc融合的重组报告质粒pGL3.0[A3-luc-Fib-L-3'UTR-SV40]和pGL3.0[A3-luc-P25-3'UTR-SV40]。以海肾荧光素酶表达载体pRL-CMV为内参,分别将构建的Bmo-miR-2755*重组表达载体和2个重组报告质粒共转染BmN细胞,通过检测细胞中的荧光素酶活性,明确Bmo-miR-2755*可显著下调BmFib-L基因的表达,并能上调BmP25基因的表达,但上调作用未达显著水平。上述结果为研究家蚕miRNA的功能和阐明蚕丝蛋白基因表达调控分子机制提供了新的实验数据。 展开更多
关键词 miRNA 家蚕 bmo-mir-2755* 丝素轻链基因 P25基因 表达调控
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Bmo-miR-375-3p对家蚕丝素蛋白轻链基因BmFib-L表达的调控作用 被引量:1
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作者 范洋洋 钱平 +3 位作者 沈兴家 王欣 蒋涛 唐顺明 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1043-1049,共7页
【目的】探究家蚕Bombyx mori miRNAs对丝素蛋白轻链基因(fibroin light chain gene,Bm FibL)和P25蛋白基因Bm P25表达的调控作用。【方法】分别以Bm Fib-L和Bm P25 mRNA 3'UTR为靶序列,应用在线预测软件RNAhybrid从前期家蚕4和5龄... 【目的】探究家蚕Bombyx mori miRNAs对丝素蛋白轻链基因(fibroin light chain gene,Bm FibL)和P25蛋白基因Bm P25表达的调控作用。【方法】分别以Bm Fib-L和Bm P25 mRNA 3'UTR为靶序列,应用在线预测软件RNAhybrid从前期家蚕4和5龄幼虫后部丝腺(posterior silk gland)sRNA高通量测序获得的29个差异表达bmo-miRNAs中,筛选对Bm Fib-L和Bm P25具有调控作用的候选bmo-miRNAs;采用半定量RT-PCR方法在mRNA水平分析候选bmo-miRNAs及其靶基因Bm Fib-L和Bm P25在4和5龄幼虫期以及5龄第3天幼虫不同组织的表达水平;利用双荧光报告基因检测系统在家蚕细胞Bm N中验证候选bmo-miRNAs对Bm Fib-L和Bm P25表达的调控作用。【结果】筛选到一个在Bm Fib-L和Bm P25 mRNA 3'UTR上都有靶位点的bmo-miR-375-3p(曾称bmo-miR-375*)。在后部丝腺中bmo-miR-375-3p和其预测靶基因Bm Fib-L和Bm P25都有较高的表达水平,提示bmo-miR-375-3p具备调控Bm Fib-L和Bm P25表达的时空条件。miR-375-3p重组表达载体与融合了Bm Fib-L 3'UTR的萤火虫荧光素酶(luciferase)报告基因(luc)表达载体共转染Bm N细胞,报告基因luc的表达水平显著下降;而在miR-375-3p重组表达载体与融合了Bm P25 3'UTR的luc表达载体共转染Bm N细胞中报告基因luc的表达水平下降不显著。【结论】miR-375-3p显著下调Bm Fib-L基因的表达,而对Bm P25基因的表达无明显调控作用。 展开更多
关键词 家蚕 MIRNA bmo-mir-375-3p 丝素轻链基因 P25基因 基因表达调控
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家蚕bmo-miR-217对核型多角体病毒(BmNPV)lef-1基因表达的调控作用 被引量:2
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作者 王明磊 何芬 +4 位作者 王平阳 唐顺明 夏定国 沈兴家 赵巧玲 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期217-224,共8页
昆虫的单链小分子RNA(microRNAs)不仅通过与自身的靶基因互补进行转录后水平调控,从而参与重要的生命过程,并且还可以与病原体靶基因相互作用,在免疫防御方面发挥重要功能。给家蚕5龄眠起幼虫接种家蚕核型多角体病毒(Bm NPV)后72 h,收... 昆虫的单链小分子RNA(microRNAs)不仅通过与自身的靶基因互补进行转录后水平调控,从而参与重要的生命过程,并且还可以与病原体靶基因相互作用,在免疫防御方面发挥重要功能。给家蚕5龄眠起幼虫接种家蚕核型多角体病毒(Bm NPV)后72 h,收集蚕体血淋巴提取总RNA用于高通量测序,经克隆验证获得一条由Bm NPV诱导上调表达的家蚕miRNA(bmo-miR-217),用生物信息学方法预测到bmo-miR-217对应的一个病毒靶基因为lef-1。构建bmo-miR-217及Bm NPV lef-1 3'-UTR的表达载体,并共转染家蚕卵巢培养细胞Bm N,于48 h后通过检测细胞的双荧光素酶相对活性,显示出bmo-miR-217可显著下调Bm NPV lef-1基因的表达(P<0.05)。已知lef-1是Bm NPV侵染复制的必需基因之一,因此抑制其表达是家蚕先天免疫的一种有效策略。 展开更多
关键词 家蚕 微小RNA bmo-mir-217 家蚕核型多角体病毒 lef-1基因
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家蚕bmo-miR-0031-3p体内下调丝素轻链基因BmFib-L的表达
5
作者 陈艳花 蒋涛 +3 位作者 王雪珍 钱平 唐顺明 沈兴家 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期229-236,共8页
为了研究家蚕微RNA(microRNA, miRNA)对丝素轻链基因BmFib-L表达的调控作用,以BmFib-L mRNA的3′非翻译区(3′untranslated region, 3′UTR)为靶标,通过RNAhybrid软件分析,筛选出种子序列与BmFib-L 3′UTR完全互补的家蚕miRNA——bmo-mi... 为了研究家蚕微RNA(microRNA, miRNA)对丝素轻链基因BmFib-L表达的调控作用,以BmFib-L mRNA的3′非翻译区(3′untranslated region, 3′UTR)为靶标,通过RNAhybrid软件分析,筛选出种子序列与BmFib-L 3′UTR完全互补的家蚕miRNA——bmo-miR-0031-3p(简称"miR-0031-3p")。分别构建miR-0031-3p表达载体pcDNA3.0[ie1-egfp-pre-miR-0031-3p-SV40]和BmFib-L 3′UTR融合萤光素酶报告基因重组表达质粒pGL3.0[A3-luc-Fib-L-3′UTR-SV40],以海肾萤光素酶表达载体pRL-CMV为内参,共转染BmN细胞,通过检测双萤光素酶活性验证miR-0031-3p的功能;人工合成miR-0031-3p的模拟物(mimic)和抑制物(inhibitor),再进一步验证miR-0031-3p对BmFib-L的调控功能。结果显示,在BmN细胞中,miR-0031-3p显著抑制BmFib-L的表达。为了进一步验证miR-0031-3p在家蚕体内对BmFib-L表达的调控作用,在5龄第2天幼虫体腔内注射转染物,分别在体内过表达和抑制内源性miR-0031-3p,荧光定量分析靶基因表达水平。结果显示,miR-0031-3p在幼虫体内能够下调BmFib-L的表达。该研究结果有利于阐明家蚕miRNA功能和蚕丝蛋白表达调控的分子机制。 展开更多
关键词 微RNA 家蚕 bmo-mir-0031-3p 丝素轻链基因 转录后调控
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Bmo-miR-2788对家蚕丝胶蛋白基因Ser-1的表达调控
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作者 Rehana Kandhro 陈艳花 +2 位作者 钱平 朱娟 沈兴家 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期811-820,共10页
通过生物信息学分析发现,家蚕丝胶蛋白基因BmSer-1的3′非翻译区(3′-UTR)存在微小RNA Bmo-miR-2788的结合位点。半定量PCR结果显示,Bmo-miR-2788在家蚕5龄第4天幼虫的8个受试组织中均有表达,但在中部丝腺中表达水平最高;而BmSer-1仅在... 通过生物信息学分析发现,家蚕丝胶蛋白基因BmSer-1的3′非翻译区(3′-UTR)存在微小RNA Bmo-miR-2788的结合位点。半定量PCR结果显示,Bmo-miR-2788在家蚕5龄第4天幼虫的8个受试组织中均有表达,但在中部丝腺中表达水平最高;而BmSer-1仅在中部丝腺中被检测到。分别构建BmSer-13′-UTR和Bmo-miR-2788的表达载体pGL3.0(A3-luc-BmSer-1-3′-UTR-SV40)和pcDNA3.0(ie1-egfp-pri-Bmo-miR-2788-SV40),共转染BmN细胞,结果表明Bmo-miR-2788上调BmSer-1表达(P<0.01);当将上述载体与合成的Bmo-miR-2788抑制剂共转染BmN细胞时,BmSer-1表达显著下调(P<0.05)。为验证Bmo-miR-2788在蚕体内对BmSer-1表达的调控作用,将Bmo-miR-2788表达质粒与其阴性对照(pcDNA3.0)分别注射到家蚕5龄第3天幼虫体内,qRT-PCR分析结果显示,与阴性对照相比,注射Bmo-miR-2788后36 h中部丝腺中的BmSer-1表达显著上调(P<0.01)。上述结果表明Bmo-miR-2788正向调控BmSer-1基因的表达。 展开更多
关键词 MIRNA BmN细胞 丝胶蛋白基因 BmSer-1 bmo-mir-2788 基因调控
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家蚕bmo-miR-3385-3p抑制丝素轻链基因BmFib-L的表达
7
作者 黄静怡 沈广胜 +5 位作者 朱娟 王梅仙 陈艳花 胡超超 鲁月 沈兴家 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期706-715,共10页
为了探究家蚕中miRNA对丝素蛋白轻链基因(BmFib-L)表达的调控作用,以BmFib-L 3'UTR序列为靶序列,用RNAhybrid软件在线预测miRBase数据库中对靶基因具有调控作用家蚕miRNA,筛选到1个候选miRNA bmo-miR-3385-3p;采用荧光定量方法分析m... 为了探究家蚕中miRNA对丝素蛋白轻链基因(BmFib-L)表达的调控作用,以BmFib-L 3'UTR序列为靶序列,用RNAhybrid软件在线预测miRBase数据库中对靶基因具有调控作用家蚕miRNA,筛选到1个候选miRNA bmo-miR-3385-3p;采用荧光定量方法分析miR-3385-3p在幼虫5龄第1~7天后部丝腺和5龄第3天不同组织及BmFib-L在5龄第1~7天后部丝腺的表达水平;构建miR-3385-3p表达载体pcDNA3.0(ie1-egfp-pre-miR-3385-3p-SV40)和含萤火虫荧光素酶报告基因的BmFib-L 3'UTR重组质粒pGL3.0(A3-luc-BmFib-L-3'UTR-SV40),并人工合成miR-3385-3p的模拟物(mimic)和抑制物(inhibitor),以海肾荧光素酶表达载体pRL-CMV为内参,共转染BmN细胞,利用双荧光素酶检测系统验证miR-3385-3p对BmFib-L表达的调控作用。同时,对预测的BmFib-L 3'UTR上miR-3385-3p的靶位点进行了突变,在BmN细胞中进行了验证。进一步采用丝腺离体培养瞬时表达和5龄幼虫体腔注射转染物的方法,通过荧光定量分析后部丝腺靶基因表达水平的变化,验证miR-3385-3p在家蚕体内对BmFib-L表达的调控作用。结果表明,miR-3385-3p和BmFib-L在后部丝腺都有较高的表达水平,miR-3385-3p具备调控BmFib-L的可能性;在BmN细胞中miR-3385-3p对BmFib-L的表达具有显著抑制作用,预测的靶位点突变后miR-3385-3p对BmFib-L基因的表达没有抑制作用。在离体培养丝腺中和幼虫体内miR-3385-3p都显著下调BmFib-L基因的表达。由此证明,BmFib-L是miR-3385-3p的靶基因之一,miR-3385-3p可抑制BmFib-L的表达。 展开更多
关键词 家蚕 MIRNA bmo-mir-3385-3p 丝素轻链基因 基因表达调控
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家蚕miR-14的上调表达与靶基因的预测分析 被引量:1
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作者 刘悦 羊兰翠 +6 位作者 聂作明 陆旋 吕正兵 陈健 于威 吴祥甫 张耀洲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期1263-1271,共9页
【目的】了解家蚕细胞中上调miRNA的方法及靶基因预测,为家蚕miRNA的功能研究提供方法参考。【方法】构建家蚕miR-14的真核表达载体pSK-hr3-ie1-EGFP-pri-mir-14并在家蚕BmN细胞中表达,同时通过转染化学合成的miRNA mimics上调BmN细胞中... 【目的】了解家蚕细胞中上调miRNA的方法及靶基因预测,为家蚕miRNA的功能研究提供方法参考。【方法】构建家蚕miR-14的真核表达载体pSK-hr3-ie1-EGFP-pri-mir-14并在家蚕BmN细胞中表达,同时通过转染化学合成的miRNA mimics上调BmN细胞中miR-14的水平。首先通过PCR扩增miR-14的前体及其侧翼序列(pri-mir-14)并克隆至真核表达载体pSK-hr3-ie1-EGFP的EGFP基因下游。分别将重组质粒pSK-hr3-ie1-EGFP-pri-mir-14、对照质粒pSK-hr3-ie1-EGFP、bmo-miR-14 mimics和negative control mimcs转染至家蚕BmN细胞,观察EGFP及FAM在细胞中的荧光情况,以检测其转染效率,qRT-PCR方法检测bmo-miR-14在细胞中的水平。分别采用RNAhybrid和miRanda预测bmo-miR-14的靶基因。【结果】重组表达载体pSK-hr3-ie1-EGFP-pri-mir-14与miRNA模拟物bmo-miR-14 mimics都能上调BmN细胞中的miR-14水平,与对照相比分别提高了2.1、984倍。利用生物信息学方法预测bmo-miR-14靶基因,RNAhybrid和miRanda分别预测得到153和171个潜在bmo-miR-14靶基因,其中两者共同预测的靶基因有49个。GO分析结果显示,预测的49个靶基因的分子功能集中于结合和催化;而生物学过程集中于细胞过程和代谢过程。【结论】通过转染重组质粒及化学合成miRNA mimics,使细胞中相应的miRNA上调,可用于bmo-miR-14后续的功能研究。 展开更多
关键词 家蚕 bmo-mir-14 表达上调 靶基因 预测
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家蚕miR-0047对丝胶蛋白基因BmSer-1表达的调控作用研究 被引量:2
9
作者 钱平 蒋涛 +4 位作者 何平 陈晨 唐旭东 唐顺明 沈兴家 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期922-928,共7页
对家蚕中部丝腺小RNA高通量测序获得若干新miRNA,生物信息学分析发现Bmo-miR-0047可能对家蚕丝胶蛋白基因Bm Ser-1有调控作用。设计特异性茎环引物,利用半定量RT-PCR检测分析家蚕5龄3 d幼虫丝腺(包括前、中、后部丝腺)、头部、脂肪体、... 对家蚕中部丝腺小RNA高通量测序获得若干新miRNA,生物信息学分析发现Bmo-miR-0047可能对家蚕丝胶蛋白基因Bm Ser-1有调控作用。设计特异性茎环引物,利用半定量RT-PCR检测分析家蚕5龄3 d幼虫丝腺(包括前、中、后部丝腺)、头部、脂肪体、表皮、中肠、马氏管、精巢/卵巢、血淋巴细胞和气管等12个器官组织中Bmo-miR-0047的表达情况。结果显示,中部丝腺中Bmo-miR-0047的相对表达量明显高于其他组织,说明在家蚕5龄幼虫期Bmo-miR-0047对Bm Ser-1基因的表达调控存在时空特异性。为了进一步分析Bmo-miR-0047对Bm Ser-1基因表达的调控作用,构建重组表达载体pc DNA3.0(ie1-egfp-pri-miR-0047-SV40)和p GL3(A3-luc-Bm Ser-1 3'UTR-SV40),并以海肾荧光素酶报告质粒pRL-CMV为内参,利用家蚕卵巢培养细胞Bm N进行共转染。转染后检测发现实验组Bm N细胞中的荧光素酶活性与对照组相比显著减弱,表明Bmo-miR-0047在体外培养细胞中对Bm Ser-1基因的表达具有负调控作用。 展开更多
关键词 家蚕 微小RNA bmo-mir-0047 丝胶蛋白基因Ser-1 转录后调控
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bmo-miR-0001 and bmo-miR-0015 down-regulate expression of Bombyx mori fibroin light chain gene in vitro 被引量:2
10
作者 Chen CHEN Yang-yang FAN +5 位作者 Xin WANG Fei SONG Tao JIANG Ping QIAN Shun-ming TANG Xing-jia SHEN 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期127-135,共9页
Based on bioinformatic analysis, we selected two novel micro RNAs(miRNAs), bmo-miR-0001 and bmomiR-0015, from high-throughput sequencing of the Bombyx mori larval posterior silk gland(PSG). Firstly, we examined th... Based on bioinformatic analysis, we selected two novel micro RNAs(miRNAs), bmo-miR-0001 and bmomiR-0015, from high-throughput sequencing of the Bombyx mori larval posterior silk gland(PSG). Firstly, we examined the expression of bmo-miR-0001 and bmo-miR-0015 in 12 different tissues of the 5th instar Day-3 larvae of the silkworm. The results showed that the expression levels of both bmo-miR-0001 and bmo-miR-0015 were obviously higher in the PSG than in other tissues, implying there is a spatio-temporal condition for bmo-miR-0001 and bmo-miR-0015 to regulate the expression of Bm Fib-L. To test this hypothesis, we constructed pri-bmo-miR-0001 expressing the plasmid pc DNA3.0 [ie1-egfp-pri-bmo-miR-0001-SV40] and pri-bmo-miR-0015 expressing the plasmid pc DNA3.0 [ie1-egfp-pribmo-miR-0015-SV40]. Finally, the Bm N cells were harvested and luciferase activity was detected. The results showed that luciferase activity was reduced significantly(P〈0.05) in Bm N cells co-transfected by pc DNA3.0 [ie1-egfp-pri-bmomiR-0001-SV40] or pc DNA3.0 [ie1-egfp-pri-bmo-miR-0015-SV40] with p GL3.0 [A3-luc-Fib-L-3'UTR-SV40], suggesting that both bmo-miR-0001 and bmo-miR-0015 can down-regulate the expression of Bm Fib-L in vitro. 展开更多
关键词 Bombyx mori MicroRNA bmo-mir-0001 bmo-mir-0015 BmFib-L Regulation of expression
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我们的画
11
《中华少年》 2005年第6期32-33,共2页
关键词 指导老师:2771 雪莲:902 小字:711
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钓翁
12
作者 王志保 《钓鱼》 2004年第22期43-43,共1页
关键词 钓竿:6332 物我两忘:5177 演绎:3293 平端:2931 蜻蜓:2771 画卷:1508 添加:1415 瞬间:1303
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